MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN2

Total Repeats: 134

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017480	ATC	2	6	816	821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839805
2	NC_017480	TTG	2	6	854	859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839805
3	NC_017480	TAA	2	6	863	868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839805
4	NC_017480	AAT	2	6	903	908	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839805
5	NC_017480	ATC	2	6	923	928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839805
6	NC_017480	CGT	2	6	1008	1013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839805
7	NC_017480	TCG	2	6	1060	1065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839805
8	NC_017480	ACT	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839805
9	NC_017480	TTG	2	6	1118	1123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839805
10	NC_017480	AAT	2	6	1134	1139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839805
11	NC_017480	ATC	2	6	1214	1219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839805
12	NC_017480	TTG	2	6	1385	1390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839805
13	NC_017480	TTC	2	6	1808	1813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839805
14	NC_017480	CTT	2	6	1971	1976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839805
15	NC_017480	ATC	2	6	1977	1982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839805
16	NC_017480	GGC	2	6	2007	2012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385839805
17	NC_017480	CCT	2	6	2087	2092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385839805
18	NC_017480	TGT	2	6	2118	2123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839805
19	NC_017480	CAC	2	6	3189	3194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839806
20	NC_017480	TTG	2	6	3256	3261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839806
21	NC_017480	TGT	2	6	3350	3355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839806
22	NC_017480	GTG	2	6	3366	3371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839806
23	NC_017480	TTC	2	6	3382	3387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839806
24	NC_017480	GCC	2	6	3449	3454	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385839806
25	NC_017480	ACT	2	6	3455	3460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839806
26	NC_017480	CTG	2	6	4185	4190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839807
27	NC_017480	CCA	2	6	4197	4202	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839807
28	NC_017480	TCA	2	6	4307	4312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839807
29	NC_017480	GGT	2	6	4361	4366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839807
30	NC_017480	TAA	2	6	4387	4392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839807
31	NC_017480	CGC	2	6	4400	4405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385839807
32	NC_017480	TTG	2	6	4408	4413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839807
33	NC_017480	TCA	2	6	4484	4489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839807
34	NC_017480	TGT	2	6	4529	4534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839807
35	NC_017480	TTA	2	6	4613	4618	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839807
36	NC_017480	CTT	2	6	5025	5030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839807
37	NC_017480	TTG	2	6	5119	5124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839807
38	NC_017480	TTA	2	6	6175	6180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839808
39	NC_017480	GCT	2	6	6205	6210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839808
40	NC_017480	TCA	2	6	6217	6222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839808
41	NC_017480	CAA	2	6	6281	6286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839808
42	NC_017480	GTT	2	6	6510	6515	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839808
43	NC_017480	CAT	2	6	6533	6538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839808
44	NC_017480	TTC	2	6	6649	6654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839808
45	NC_017480	GTT	2	6	6704	6709	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839808
46	NC_017480	TAG	2	6	6736	6741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839808
47	NC_017480	GTT	2	6	6791	6796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839808
48	NC_017480	TAA	2	6	6828	6833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839808
49	NC_017480	TAA	2	6	6876	6881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839808
50	NC_017480	AAT	2	6	6905	6910	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839808
51	NC_017480	TCA	2	6	7046	7051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839809
52	NC_017480	GCC	2	6	7065	7070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385839809
53	NC_017480	CTT	2	6	7113	7118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839809
54	NC_017480	GTT	2	6	7425	7430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839809
55	NC_017480	ATG	2	6	8118	8123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839810
56	NC_017480	CGG	2	6	8126	8131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385839810
57	NC_017480	GAA	2	6	8202	8207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839810
58	NC_017480	TGA	2	6	8339	8344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839810
59	NC_017480	AGA	2	6	8354	8359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839810
60	NC_017480	GGT	2	6	8502	8507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839810
61	NC_017480	TCT	2	6	8667	8672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839810
62	NC_017480	GAA	2	6	8685	8690	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839810
63	NC_017480	GCC	2	6	8789	8794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385839810
64	NC_017480	TTG	2	6	8841	8846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839810
65	NC_017480	TTC	2	6	9034	9039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839811
66	NC_017480	CTA	2	6	9195	9200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839811
67	NC_017480	GAA	2	6	9209	9214	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839811
68	NC_017480	TCA	2	6	9234	9239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839811
69	NC_017480	GCA	2	6	9250	9255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839811
70	NC_017480	ACC	2	6	9435	9440	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839811
71	NC_017480	ATC	2	6	9758	9763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839812
72	NC_017480	GTG	2	6	9851	9856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839812
73	NC_017480	TCA	2	6	9900	9905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839812
74	NC_017480	TCA	2	6	9921	9926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839812
75	NC_017480	CAT	2	6	10012	10017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839812
76	NC_017480	TAC	2	6	10256	10261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839812
77	NC_017480	ATC	2	6	10262	10267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839812
78	NC_017480	TAG	2	6	10457	10462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839812
79	NC_017480	ATT	2	6	10961	10966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839813
80	NC_017480	TCA	2	6	11014	11019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839813
81	NC_017480	CTA	2	6	11165	11170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839813
82	NC_017480	AGG	2	6	11328	11333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385839813
83	NC_017480	TGG	2	6	11379	11384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839813
84	NC_017480	ATC	2	6	11413	11418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839813
85	NC_017480	TTA	2	6	11680	11685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839814
86	NC_017480	TTG	2	6	11801	11806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839814
87	NC_017480	TGT	2	6	11913	11918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839814
88	NC_017480	TCG	2	6	12133	12138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839814
89	NC_017480	GTG	2	6	12178	12183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839814
90	NC_017480	ACT	2	6	13563	13568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839815
91	NC_017480	ATT	2	6	13620	13625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839815
92	NC_017480	TTG	2	6	13782	13787	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839815
93	NC_017480	GTT	2	6	13812	13817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839815
94	NC_017480	TAA	2	6	13822	13827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839815
95	NC_017480	CAA	2	6	13840	13845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385839815
96	NC_017480	CTT	2	6	13865	13870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839815
97	NC_017480	TTA	2	6	13941	13946	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839815
98	NC_017480	GGT	2	6	14077	14082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839815
99	NC_017480	CTC	2	6	14423	14428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385839816
100	NC_017480	GAA	2	6	14551	14556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839816
101	NC_017480	CTG	2	6	14633	14638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839816
102	NC_017480	GTG	2	6	14653	14658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839816
103	NC_017480	GAT	2	6	14680	14685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839816
104	NC_017480	ACG	2	6	14819	14824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839816
105	NC_017480	TTC	2	6	14835	14840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839816
106	NC_017480	CCG	2	6	14885	14890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385839816
107	NC_017480	CTT	2	6	14956	14961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839816
108	NC_017480	ATA	2	6	14975	14980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839816
109	NC_017480	CGT	2	6	15003	15008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839816
110	NC_017480	TAG	2	6	15027	15032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839816
111	NC_017480	CTT	2	6	15067	15072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839816
112	NC_017480	TAA	3	9	15253	15261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839816
113	NC_017480	TTC	2	6	15307	15312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839816
114	NC_017480	TTG	2	6	15323	15328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385839816
115	NC_017480	GCG	2	6	15359	15364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385839816
116	NC_017480	AGT	2	6	15537	15542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385839816
117	NC_017480	TTC	2	6	15650	15655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839816
118	NC_017480	ATA	3	9	15693	15701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839816
119	NC_017480	TTA	2	6	15758	15763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385839816
120	NC_017480	ACC	2	6	19095	19100	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385839817
121	NC_017480	AAG	2	6	19260	19265	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839817
122	NC_017480	AAT	2	6	19311	19316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839817
123	NC_017480	GAC	2	6	19320	19325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385839817
124	NC_017480	GTC	2	6	19465	19470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839817
125	NC_017480	CTT	2	6	19526	19531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385839817
126	NC_017480	AAG	2	6	19699	19704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839817
127	NC_017480	GGT	2	6	19805	19810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839817
128	NC_017480	GAA	2	6	19811	19816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839817
129	NC_017480	TGG	2	6	19843	19848	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385839817
130	NC_017480	AAT	2	6	19890	19895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385839817
131	NC_017480	CGT	3	9	19923	19931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839817
132	NC_017480	ACT	2	6	19988	19993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385839817
133	NC_017480	GCT	2	6	20016	20021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385839817
134	NC_017480	AGA	2	6	20078	20083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385839817

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.