MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus salivarius CECT 5713 plasmid pHN1

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017479	AGTA	2	8	3692	3699	50 %	25 %	25 %	0 %	385839615
2	NC_017479	ATAA	2	8	3939	3946	75 %	25 %	0 %	0 %	385839615
3	NC_017479	AAAT	2	8	4112	4119	75 %	25 %	0 %	0 %	385839615
4	NC_017479	AATG	2	8	4505	4512	50 %	25 %	25 %	0 %	385839616
5	NC_017479	ATTA	2	8	4569	4576	50 %	50 %	0 %	0 %	385839616
6	NC_017479	AAAT	2	8	4612	4619	75 %	25 %	0 %	0 %	385839616
7	NC_017479	AAAT	2	8	4838	4845	75 %	25 %	0 %	0 %	385839616
8	NC_017479	TGAT	2	8	7655	7662	25 %	50 %	25 %	0 %	385839617
9	NC_017479	ATTT	2	8	9640	9647	25 %	75 %	0 %	0 %	385839618
10	NC_017479	AGCG	2	8	10503	10510	25 %	0 %	50 %	25 %	385839618
11	NC_017479	GTGG	2	8	11133	11140	0 %	25 %	75 %	0 %	385839619
12	NC_017479	TTAA	2	8	11294	11301	50 %	50 %	0 %	0 %	385839619
13	NC_017479	GAAC	2	8	11512	11519	50 %	0 %	25 %	25 %	385839619
14	NC_017479	CAAA	2	8	11607	11614	75 %	0 %	0 %	25 %	385839619
15	NC_017479	AAGG	2	8	12639	12646	50 %	0 %	50 %	0 %	385839620
16	NC_017479	AAAG	2	8	12755	12762	75 %	0 %	25 %	0 %	385839620
17	NC_017479	AGAA	2	8	12835	12842	75 %	0 %	25 %	0 %	385839620
18	NC_017479	CGCA	2	8	12928	12935	25 %	0 %	25 %	50 %	385839620
19	NC_017479	GCAA	2	8	13021	13028	50 %	0 %	25 %	25 %	385839620
20	NC_017479	TGGT	2	8	13068	13075	0 %	50 %	50 %	0 %	385839620
21	NC_017479	AGTT	2	8	13772	13779	25 %	50 %	25 %	0 %	385839620
22	NC_017479	ATTA	2	8	14380	14387	50 %	50 %	0 %	0 %	385839620
23	NC_017479	GAAA	2	8	16526	16533	75 %	0 %	25 %	0 %	385839621
24	NC_017479	TTAA	2	8	16542	16549	50 %	50 %	0 %	0 %	385839621
25	NC_017479	AAAG	2	8	16616	16623	75 %	0 %	25 %	0 %	385839621
26	NC_017479	TGGT	2	8	16819	16826	0 %	50 %	50 %	0 %	385839621
27	NC_017479	AGAT	2	8	17179	17186	50 %	25 %	25 %	0 %	385839622
28	NC_017479	ATTA	2	8	17241	17248	50 %	50 %	0 %	0 %	385839622
29	NC_017479	AATT	2	8	18478	18485	50 %	50 %	0 %	0 %	385839623
30	NC_017479	GATT	2	8	19066	19073	25 %	50 %	25 %	0 %	385839623
31	NC_017479	TATT	2	8	19267	19274	25 %	75 %	0 %	0 %	385839623
32	NC_017479	CCAG	2	8	19323	19330	25 %	0 %	25 %	50 %	385839624
33	NC_017479	GTTA	2	8	19545	19552	25 %	50 %	25 %	0 %	385839624
34	NC_017479	AATT	2	8	19901	19908	50 %	50 %	0 %	0 %	385839624
35	NC_017479	AAAT	2	8	20009	20016	75 %	25 %	0 %	0 %	385839624
36	NC_017479	AAAT	2	8	20033	20040	75 %	25 %	0 %	0 %	385839624
37	NC_017479	TCGG	2	8	21725	21732	0 %	25 %	50 %	25 %	385839625
38	NC_017479	TCCG	2	8	21908	21915	0 %	25 %	25 %	50 %	385839625
39	NC_017479	TGGT	2	8	21936	21943	0 %	50 %	50 %	0 %	385839625
40	NC_017479	CTGA	2	8	24724	24731	25 %	25 %	25 %	25 %	385839626
41	NC_017479	AACT	2	8	24761	24768	50 %	25 %	0 %	25 %	385839626
42	NC_017479	GTCG	2	8	24859	24866	0 %	25 %	50 %	25 %	385839626
43	NC_017479	GATC	2	8	25081	25088	25 %	25 %	25 %	25 %	385839626
44	NC_017479	AAAG	2	8	25461	25468	75 %	0 %	25 %	0 %	385839626
45	NC_017479	CTTG	2	8	25966	25973	0 %	50 %	25 %	25 %	385839627
46	NC_017479	TTGA	2	8	26274	26281	25 %	50 %	25 %	0 %	385839627
47	NC_017479	TTGA	2	8	26832	26839	25 %	50 %	25 %	0 %	385839628
48	NC_017479	TTTA	2	8	27155	27162	25 %	75 %	0 %	0 %	385839628
49	NC_017479	ATGG	2	8	27295	27302	25 %	25 %	50 %	0 %	385839628
50	NC_017479	TTTC	2	8	27447	27454	0 %	75 %	0 %	25 %	385839628
51	NC_017479	TTTA	2	8	28547	28554	25 %	75 %	0 %	0 %	385839629
52	NC_017479	AAAG	2	8	28909	28916	75 %	0 %	25 %	0 %	385839630
53	NC_017479	ATTT	2	8	29080	29087	25 %	75 %	0 %	0 %	385839630
54	NC_017479	TATC	2	8	29131	29138	25 %	50 %	0 %	25 %	385839630
55	NC_017479	AATG	2	8	29184	29191	50 %	25 %	25 %	0 %	385839630
56	NC_017479	GGTC	2	8	29613	29620	0 %	25 %	50 %	25 %	385839631
57	NC_017479	CAAT	2	8	29803	29810	50 %	25 %	0 %	25 %	385839631
58	NC_017479	ATTG	2	8	29934	29941	25 %	50 %	25 %	0 %	385839631
59	NC_017479	ATCA	2	8	30376	30383	50 %	25 %	0 %	25 %	385839632
60	NC_017479	AGTT	2	8	30603	30610	25 %	50 %	25 %	0 %	385839632
61	NC_017479	ATTT	2	8	31236	31243	25 %	75 %	0 %	0 %	385839633
62	NC_017479	TTTA	2	8	31522	31529	25 %	75 %	0 %	0 %	385839633
63	NC_017479	AACA	2	8	31617	31624	75 %	0 %	0 %	25 %	385839633
64	NC_017479	ACAA	2	8	33676	33683	75 %	0 %	0 %	25 %	385839634
65	NC_017479	TTGA	2	8	33684	33691	25 %	50 %	25 %	0 %	385839634
66	NC_017479	GCTA	2	8	33884	33891	25 %	25 %	25 %	25 %	385839634
67	NC_017479	ACTT	2	8	33906	33913	25 %	50 %	0 %	25 %	385839634
68	NC_017479	TACG	2	8	33935	33942	25 %	25 %	25 %	25 %	385839634
69	NC_017479	AACA	2	8	34281	34288	75 %	0 %	0 %	25 %	385839634
70	NC_017479	ATCA	2	8	34781	34788	50 %	25 %	0 %	25 %	385839635
71	NC_017479	GATG	2	8	34927	34934	25 %	25 %	50 %	0 %	385839635
72	NC_017479	GACC	2	8	35311	35318	25 %	0 %	25 %	50 %	385839635
73	NC_017479	TAGT	2	8	35452	35459	25 %	50 %	25 %	0 %	385839635
74	NC_017479	GGCC	2	8	35747	35754	0 %	0 %	50 %	50 %	385839636
75	NC_017479	GTGG	2	8	36022	36029	0 %	25 %	75 %	0 %	385839636
76	NC_017479	CCAG	2	8	36814	36821	25 %	0 %	25 %	50 %	385839636
77	NC_017479	CTAG	2	8	36840	36847	25 %	25 %	25 %	25 %	385839636
78	NC_017479	CAGG	2	8	38016	38023	25 %	0 %	50 %	25 %	385839637
79	NC_017479	TTTC	2	8	38146	38153	0 %	75 %	0 %	25 %	385839637
80	NC_017479	TCTT	2	8	39033	39040	0 %	75 %	0 %	25 %	385839638
81	NC_017479	GGGC	2	8	42652	42659	0 %	0 %	75 %	25 %	385839640
82	NC_017479	CACT	2	8	42825	42832	25 %	25 %	0 %	50 %	385839640
83	NC_017479	TGGC	2	8	43860	43867	0 %	25 %	50 %	25 %	385839641
84	NC_017479	TGGT	2	8	44303	44310	0 %	50 %	50 %	0 %	385839641
85	NC_017479	CTTG	2	8	44326	44333	0 %	50 %	25 %	25 %	385839641

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.