MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II plasmid pBD-II

Total Repeats: 649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017476	CCT	2	6	421	426	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824841
2	NC_017476	ATG	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824842
3	NC_017476	TGC	3	9	850	858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824842
4	NC_017476	ACC	2	6	944	949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824842
5	NC_017476	GTT	2	6	1003	1008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824842
6	NC_017476	GCA	2	6	1244	1249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824842
7	NC_017476	TTG	2	6	1732	1737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824842
8	NC_017476	CGT	2	6	1792	1797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824842
9	NC_017476	CTG	2	6	1931	1936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824842
10	NC_017476	TGC	2	6	1949	1954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824842
11	NC_017476	CCA	2	6	1973	1978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824842
12	NC_017476	TTC	2	6	2006	2011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824842
13	NC_017476	ATG	3	9	2232	2240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
14	NC_017476	TCC	2	6	2302	2307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824843
15	NC_017476	TTG	2	6	2311	2316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824843
16	NC_017476	ATG	2	6	2320	2325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
17	NC_017476	TGC	2	6	2329	2334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824843
18	NC_017476	TGA	2	6	2378	2383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
19	NC_017476	TTC	2	6	2394	2399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824843
20	NC_017476	AGT	2	6	2407	2412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
21	NC_017476	CGG	2	6	2444	2449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824843
22	NC_017476	AAT	2	6	2529	2534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824843
23	NC_017476	GGT	2	6	2583	2588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824843
24	NC_017476	CTG	2	6	2616	2621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824843
25	NC_017476	GTT	2	6	2647	2652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824843
26	NC_017476	GAG	2	6	3035	3040	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385824843
27	NC_017476	CAC	2	6	3101	3106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824843
28	NC_017476	GTA	2	6	3153	3158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
29	NC_017476	TCA	2	6	3277	3282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824843
30	NC_017476	CAT	2	6	3479	3484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824843
31	NC_017476	CAT	2	6	3530	3535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824843
32	NC_017476	GCA	2	6	3545	3550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824843
33	NC_017476	ATC	2	6	3561	3566	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824843
34	NC_017476	CAT	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824843
35	NC_017476	GTT	2	6	3614	3619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824843
36	NC_017476	CAG	2	6	3635	3640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824843
37	NC_017476	GTT	2	6	3643	3648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824843
38	NC_017476	GCT	2	6	3707	3712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824843
39	NC_017476	CAA	2	6	3815	3820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824843
40	NC_017476	GTT	2	6	3896	3901	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824843
41	NC_017476	GTC	2	6	4009	4014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824843
42	NC_017476	GGT	2	6	4181	4186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824843
43	NC_017476	ACC	2	6	4230	4235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824843
44	NC_017476	ATG	2	6	4295	4300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824843
45	NC_017476	AAT	2	6	4362	4367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824843
46	NC_017476	GGC	2	6	4377	4382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824843
47	NC_017476	ACC	2	6	4430	4435	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824844
48	NC_017476	GAC	2	6	4450	4455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824844
49	NC_017476	GCA	2	6	4467	4472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824844
50	NC_017476	TCA	2	6	4499	4504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824844
51	NC_017476	TCG	2	6	5127	5132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824846
52	NC_017476	ATC	2	6	5195	5200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824846
53	NC_017476	CGG	2	6	5231	5236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824846
54	NC_017476	CGG	2	6	5563	5568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824847
55	NC_017476	GCT	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824847
56	NC_017476	CAC	2	6	5986	5991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824847
57	NC_017476	CAC	2	6	6100	6105	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824847
58	NC_017476	CAA	2	6	6181	6186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824847
59	NC_017476	TGA	2	6	6240	6245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824847
60	NC_017476	TGA	2	6	6253	6258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824847
61	NC_017476	AGA	2	6	6289	6294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824847
62	NC_017476	TGG	2	6	6344	6349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824847
63	NC_017476	GTT	2	6	6406	6411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824848
64	NC_017476	GTT	2	6	6486	6491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824848
65	NC_017476	GCT	2	6	6669	6674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824848
66	NC_017476	AAT	2	6	6786	6791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824848
67	NC_017476	CTT	2	6	6946	6951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824848
68	NC_017476	TAT	2	6	7027	7032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824848
69	NC_017476	GCC	2	6	7181	7186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824848
70	NC_017476	CAT	3	9	7567	7575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824849
71	NC_017476	TCA	2	6	7594	7599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824849
72	NC_017476	CTT	2	6	7604	7609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824849
73	NC_017476	AAC	2	6	7657	7662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824849
74	NC_017476	GTT	2	6	7715	7720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824849
75	NC_017476	GCT	2	6	7736	7741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824849
76	NC_017476	ATT	2	6	7804	7809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824849
77	NC_017476	TTA	2	6	7820	7825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824850
78	NC_017476	TGC	2	6	7881	7886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824850
79	NC_017476	GCA	2	6	7900	7905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824850
80	NC_017476	GGT	2	6	8067	8072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824850
81	NC_017476	TTG	2	6	8129	8134	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824850
82	NC_017476	TTA	2	6	8293	8298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824850
83	NC_017476	TGC	2	6	8425	8430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824851
84	NC_017476	TCC	2	6	8442	8447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824851
85	NC_017476	TTG	2	6	8571	8576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824851
86	NC_017476	GCG	2	6	8602	8607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824851
87	NC_017476	GCT	2	6	8608	8613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824851
88	NC_017476	TTA	2	6	8644	8649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824851
89	NC_017476	CAC	2	6	8677	8682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824851
90	NC_017476	ACC	2	6	8709	8714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824851
91	NC_017476	TTG	2	6	8776	8781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824851
92	NC_017476	GGC	2	6	8844	8849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824851
93	NC_017476	AAC	2	6	8883	8888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824851
94	NC_017476	AAT	2	6	8946	8951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824851
95	NC_017476	ATT	2	6	8979	8984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824851
96	NC_017476	CAC	2	6	8987	8992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824851
97	NC_017476	CTG	2	6	8996	9001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824851
98	NC_017476	AGC	2	6	9072	9077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824851
99	NC_017476	TTA	2	6	9148	9153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824851
100	NC_017476	TTC	2	6	9255	9260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824851
101	NC_017476	TGG	2	6	9267	9272	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824851
102	NC_017476	GGA	2	6	9312	9317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385824851
103	NC_017476	ATG	2	6	9374	9379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824851
104	NC_017476	TGA	2	6	9384	9389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824851
105	NC_017476	CTG	2	6	9408	9413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824851
106	NC_017476	ACT	2	6	9555	9560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824851
107	NC_017476	CTG	2	6	9569	9574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824851
108	NC_017476	TTG	2	6	9695	9700	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824851
109	NC_017476	ATC	2	6	9783	9788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824851
110	NC_017476	TTC	2	6	9811	9816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824851
111	NC_017476	TCA	2	6	9823	9828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824851
112	NC_017476	CAT	2	6	9876	9881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824851
113	NC_017476	TCG	2	6	9919	9924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824851
114	NC_017476	TCA	2	6	9934	9939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824851
115	NC_017476	TGT	2	6	9999	10004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824851
116	NC_017476	CTT	2	6	10071	10076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824851
117	NC_017476	TCA	2	6	10181	10186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824851
118	NC_017476	GCT	2	6	10331	10336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824851
119	NC_017476	TCA	2	6	10337	10342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824851
120	NC_017476	CTT	2	6	10545	10550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824851
121	NC_017476	CTA	2	6	10585	10590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824851
122	NC_017476	CCA	2	6	10696	10701	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824851
123	NC_017476	GCC	2	6	10704	10709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824851
124	NC_017476	ACT	2	6	10767	10772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824851
125	NC_017476	ATG	2	6	10794	10799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824851
126	NC_017476	TTA	2	6	10804	10809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824851
127	NC_017476	AGC	2	6	10810	10815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824851
128	NC_017476	ATT	2	6	10827	10832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824852
129	NC_017476	ATC	2	6	10976	10981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824852
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133	NC_017476	GCG	2	6	11113	11118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824852
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249	NC_017476	AAT	2	6	20334	20339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824862
250	NC_017476	ACC	2	6	20353	20358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824862
251	NC_017476	CGA	2	6	20466	20471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824862
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