MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II plasmid pBD-II

Total Repeats: 912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017476	AATA	2	8	29577	29584	75 %	25 %	0 %	0 %	385824873
502	NC_017476	GTT	2	6	29667	29672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824873
503	NC_017476	T	6	6	29671	29676	0 %	100 %	0 %	0 %	385824873
504	NC_017476	GCC	2	6	29738	29743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824874
505	NC_017476	GCT	2	6	29824	29829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824874
506	NC_017476	ATG	2	6	29859	29864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824874
507	NC_017476	GT	3	6	29884	29889	0 %	50 %	50 %	0 %	385824874
508	NC_017476	T	7	7	29951	29957	0 %	100 %	0 %	0 %	385824874
509	NC_017476	CCA	2	6	29984	29989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824874
510	NC_017476	TTG	2	6	30054	30059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824874
511	NC_017476	GTTGCG	2	12	30098	30109	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385824874
512	NC_017476	TGGGCT	2	12	30172	30183	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385824874
513	NC_017476	TCA	2	6	30211	30216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824874
514	NC_017476	AATT	2	8	30228	30235	50 %	50 %	0 %	0 %	385824874
515	NC_017476	ATAATC	2	12	30243	30254	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385824874
516	NC_017476	GAC	2	6	30261	30266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824874
517	NC_017476	TTC	2	6	30303	30308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824874
518	NC_017476	CCG	2	6	30338	30343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824874
519	NC_017476	GCC	2	6	30523	30528	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824874
520	NC_017476	CCA	2	6	30557	30562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824874
521	NC_017476	CTG	2	6	30588	30593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824874
522	NC_017476	ATG	2	6	30607	30612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824874
523	NC_017476	TA	3	6	30635	30640	50 %	50 %	0 %	0 %	385824874
524	NC_017476	CAA	2	6	30785	30790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824874
525	NC_017476	TAA	2	6	30825	30830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824874
526	NC_017476	CCG	2	6	30831	30836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824874
527	NC_017476	CAC	2	6	30837	30842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824874
528	NC_017476	AATT	2	8	30851	30858	50 %	50 %	0 %	0 %	385824874
529	NC_017476	CTG	2	6	30966	30971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824874
530	NC_017476	TGG	2	6	30989	30994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824874
531	NC_017476	AGT	2	6	31089	31094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824874
532	NC_017476	ATA	2	6	31119	31124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824874
533	NC_017476	TGG	2	6	31148	31153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824874
534	NC_017476	AT	3	6	31213	31218	50 %	50 %	0 %	0 %	385824874
535	NC_017476	AAC	2	6	31221	31226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824874
536	NC_017476	TTC	2	6	31275	31280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824874
537	NC_017476	TGAC	2	8	31289	31296	25 %	25 %	25 %	25 %	385824874
538	NC_017476	TCA	2	6	31327	31332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824874
539	NC_017476	CAG	2	6	31341	31346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824874
540	NC_017476	TTA	2	6	31406	31411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824874
541	NC_017476	TCG	2	6	31427	31432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824874
542	NC_017476	CTC	2	6	31518	31523	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824874
543	NC_017476	CGT	2	6	31524	31529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824874
544	NC_017476	GCT	2	6	31615	31620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824874
545	NC_017476	CAA	2	6	31667	31672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824874
546	NC_017476	AGA	2	6	31673	31678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824874
547	NC_017476	T	7	7	31742	31748	0 %	100 %	0 %	0 %	385824874
548	NC_017476	TTG	2	6	31800	31805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824874
549	NC_017476	ATC	2	6	31854	31859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824874
550	NC_017476	GGC	2	6	31863	31868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824874
551	NC_017476	CCG	2	6	31908	31913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824874
552	NC_017476	AAG	2	6	31921	31926	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824874
553	NC_017476	CAAA	2	8	32011	32018	75 %	0 %	0 %	25 %	385824874
554	NC_017476	A	6	6	32224	32229	100 %	0 %	0 %	0 %	385824874
555	NC_017476	T	7	7	32388	32394	0 %	100 %	0 %	0 %	385824874
556	NC_017476	ACC	2	6	32523	32528	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824874
557	NC_017476	AAC	2	6	32548	32553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824874
558	NC_017476	CAT	2	6	32579	32584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824874
559	NC_017476	CGG	2	6	32618	32623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824874
560	NC_017476	GCT	2	6	32635	32640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824874
561	NC_017476	GTTATT	2	12	32724	32735	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385824874
562	NC_017476	ATTG	2	8	32804	32811	25 %	50 %	25 %	0 %	385824874
563	NC_017476	AAC	2	6	32832	32837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824874
564	NC_017476	TTAT	2	8	33602	33609	25 %	75 %	0 %	0 %	385824875
565	NC_017476	ATTC	2	8	33614	33621	25 %	50 %	0 %	25 %	385824875
566	NC_017476	TGAT	2	8	33651	33658	25 %	50 %	25 %	0 %	385824875
567	NC_017476	AGG	2	6	33718	33723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385824875
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569	NC_017476	CAA	2	6	33854	33859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824875
570	NC_017476	ACA	2	6	33910	33915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824875
571	NC_017476	TGA	2	6	33918	33923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824875
572	NC_017476	TTA	2	6	34063	34068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824875
573	NC_017476	GAC	2	6	34094	34099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824875
574	NC_017476	TTG	2	6	34122	34127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824875
575	NC_017476	GTG	2	6	34140	34145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824875
576	NC_017476	TGG	2	6	34234	34239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824875
577	NC_017476	CCCATC	2	12	34245	34256	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	385824875
578	NC_017476	T	6	6	34292	34297	0 %	100 %	0 %	0 %	385824875
579	NC_017476	TGCCGA	2	12	34330	34341	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385824875
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582	NC_017476	ATT	2	6	34381	34386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824875
583	NC_017476	GCT	2	6	34406	34411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824875
584	NC_017476	TGG	2	6	34567	34572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824876
585	NC_017476	TCA	2	6	34633	34638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824876
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588	NC_017476	TCT	2	6	34779	34784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824876
589	NC_017476	CCG	2	6	34794	34799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824876
590	NC_017476	ATG	2	6	34821	34826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824876
591	NC_017476	GGT	2	6	34832	34837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824876
592	NC_017476	GATT	2	8	34845	34852	25 %	50 %	25 %	0 %	385824876
593	NC_017476	GAA	2	6	34919	34924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824876
594	NC_017476	CCAA	2	8	34964	34971	50 %	0 %	0 %	50 %	385824876
595	NC_017476	ACA	2	6	35046	35051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824876
596	NC_017476	TTC	2	6	35103	35108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824876
597	NC_017476	TGG	2	6	35128	35133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824876
598	NC_017476	GTC	2	6	35159	35164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824876
599	NC_017476	GAT	2	6	35171	35176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824876
600	NC_017476	A	6	6	35187	35192	100 %	0 %	0 %	0 %	385824876
601	NC_017476	TGG	2	6	35215	35220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824876
602	NC_017476	TATC	2	8	35321	35328	25 %	50 %	0 %	25 %	385824876
603	NC_017476	TAC	2	6	35354	35359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824876
604	NC_017476	AAC	2	6	35372	35377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824876
605	NC_017476	A	6	6	35396	35401	100 %	0 %	0 %	0 %	385824876
606	NC_017476	GGAC	2	8	35443	35450	25 %	0 %	50 %	25 %	385824876
607	NC_017476	AAC	2	6	35472	35477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824876
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610	NC_017476	AGG	2	6	36003	36008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385824877
611	NC_017476	A	7	7	36038	36044	100 %	0 %	0 %	0 %	385824877
612	NC_017476	CATT	2	8	36049	36056	25 %	50 %	0 %	25 %	385824877
613	NC_017476	TAA	2	6	36246	36251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824877
614	NC_017476	AAT	2	6	36337	36342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824878
615	NC_017476	CTG	2	6	36360	36365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824878
616	NC_017476	GAG	2	6	36394	36399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385824878
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619	NC_017476	GCC	2	6	37037	37042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824880
620	NC_017476	AAT	2	6	37094	37099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824880
621	NC_017476	CTC	2	6	37426	37431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824881
622	NC_017476	CAG	2	6	37460	37465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824881
623	NC_017476	AGT	2	6	37593	37598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824882
624	NC_017476	TAA	2	6	37615	37620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824882
625	NC_017476	ACCA	2	8	37622	37629	50 %	0 %	0 %	50 %	385824882
626	NC_017476	TGT	2	6	37692	37697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824882
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628	NC_017476	TCT	2	6	37802	37807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824883
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