MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 49466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_017474	ATC	2	6	216977	216982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821920
3503	NC_017474	CGAG	2	8	217001	217008	25 %	0 %	50 %	25 %	385821920
3504	NC_017474	ATT	2	6	217035	217040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821920
3505	NC_017474	AAATG	2	10	217042	217051	60 %	20 %	20 %	0 %	385821920
3506	NC_017474	TGA	2	6	217081	217086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821920
3507	NC_017474	GCT	2	6	217096	217101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821920
3508	NC_017474	GAT	2	6	217103	217108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821920
3509	NC_017474	CAG	2	6	217146	217151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821920
3510	NC_017474	A	6	6	217202	217207	100 %	0 %	0 %	0 %	385821920
3511	NC_017474	GCT	2	6	217490	217495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821920
3512	NC_017474	TCA	2	6	217530	217535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821920
3513	NC_017474	CAAAA	2	10	217562	217571	80 %	0 %	0 %	20 %	385821920
3514	NC_017474	A	6	6	217633	217638	100 %	0 %	0 %	0 %	385821921
3515	NC_017474	TTG	2	6	217654	217659	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821921
3516	NC_017474	CGA	2	6	217699	217704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821921
3517	NC_017474	GCG	2	6	217728	217733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821921
3518	NC_017474	ACTGG	2	10	217754	217763	20 %	20 %	40 %	20 %	385821921
3519	NC_017474	A	6	6	217766	217771	100 %	0 %	0 %	0 %	385821921
3520	NC_017474	GAC	2	6	217806	217811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821921
3521	NC_017474	GCG	2	6	218009	218014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821921
3522	NC_017474	TGA	2	6	218018	218023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821921
3523	NC_017474	CGG	3	9	218104	218112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821921
3524	NC_017474	GTT	2	6	218159	218164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821921
3525	NC_017474	ATT	2	6	218382	218387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821921
3526	NC_017474	GAA	2	6	218426	218431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821921
3527	NC_017474	ATGA	2	8	218445	218452	50 %	25 %	25 %	0 %	385821921
3528	NC_017474	TAT	2	6	218459	218464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821921
3529	NC_017474	GAA	2	6	218517	218522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821921
3530	NC_017474	CAG	2	6	218569	218574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821921
3531	NC_017474	GGC	2	6	218597	218602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821921
3532	NC_017474	AAG	2	6	218614	218619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821921
3533	NC_017474	AGGT	2	8	218665	218672	25 %	25 %	50 %	0 %	385821921
3534	NC_017474	ATG	2	6	218720	218725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821922
3535	NC_017474	TGA	2	6	218769	218774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821922
3536	NC_017474	AATA	2	8	218812	218819	75 %	25 %	0 %	0 %	385821922
3537	NC_017474	T	6	6	218895	218900	0 %	100 %	0 %	0 %	385821922
3538	NC_017474	GAA	2	6	218917	218922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821922
3539	NC_017474	TTA	2	6	218936	218941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821922
3540	NC_017474	CCATG	2	10	218958	218967	20 %	20 %	20 %	40 %	385821922
3541	NC_017474	TTG	2	6	218981	218986	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821922
3542	NC_017474	TTA	2	6	219016	219021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821922
3543	NC_017474	GAC	2	6	219037	219042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821922
3544	NC_017474	CGA	2	6	219057	219062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821922
3545	NC_017474	AAC	2	6	219165	219170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821922
3546	NC_017474	AATGAC	2	12	219189	219200	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385821922
3547	NC_017474	GCT	2	6	219219	219224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821922
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3550	NC_017474	ATG	2	6	219458	219463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821922
3551	NC_017474	ATT	2	6	219469	219474	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821922
3552	NC_017474	AGCCAA	2	12	219495	219506	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385821922
3553	NC_017474	GAA	2	6	219531	219536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821922
3554	NC_017474	TCAG	2	8	219564	219571	25 %	25 %	25 %	25 %	385821922
3555	NC_017474	GGC	2	6	219770	219775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821923
3556	NC_017474	TACG	2	8	219794	219801	25 %	25 %	25 %	25 %	385821923
3557	NC_017474	ATG	2	6	219806	219811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821923
3558	NC_017474	AAG	2	6	219960	219965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821923
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3560	NC_017474	GGT	2	6	220022	220027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821923
3561	NC_017474	GTCG	2	8	220145	220152	0 %	25 %	50 %	25 %	385821923
3562	NC_017474	CTA	2	6	220194	220199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821923
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3585	NC_017474	ACTCA	2	10	221697	221706	40 %	20 %	0 %	40 %	385821925
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3589	NC_017474	TGGT	2	8	222273	222280	0 %	50 %	50 %	0 %	385821926
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3601	NC_017474	GAT	2	6	222799	222804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821926
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3603	NC_017474	GCTG	2	8	222906	222913	0 %	25 %	50 %	25 %	385821926
3604	NC_017474	GCC	2	6	222923	222928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821926
3605	NC_017474	GAA	2	6	223007	223012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821926
3606	NC_017474	TGA	2	6	223056	223061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821926
3607	NC_017474	GAA	2	6	223076	223081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821926
3608	NC_017474	GGC	2	6	223130	223135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821926
3609	NC_017474	AT	3	6	223246	223251	50 %	50 %	0 %	0 %	385821927
3610	NC_017474	ACT	2	6	223271	223276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821927
3611	NC_017474	TTTG	2	8	223291	223298	0 %	75 %	25 %	0 %	385821927
3612	NC_017474	TGG	2	6	223456	223461	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821927
3613	NC_017474	CG	3	6	223524	223529	0 %	0 %	50 %	50 %	385821927
3614	NC_017474	TCA	2	6	223530	223535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821927
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3617	NC_017474	GCG	2	6	223907	223912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821927
3618	NC_017474	TTGGCG	2	12	223977	223988	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385821927
3619	NC_017474	TGAC	2	8	224046	224053	25 %	25 %	25 %	25 %	385821927
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3987	NC_017474	A	6	6	244370	244375	100 %	0 %	0 %	0 %	385821944
3988	NC_017474	TGA	2	6	244426	244431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821944
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3990	NC_017474	CAA	2	6	244466	244471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821944
3991	NC_017474	TCA	2	6	244476	244481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821944
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