MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 49466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_017474	CAA	2	6	187431	187436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821891
3003	NC_017474	CAGC	2	8	187585	187592	25 %	0 %	25 %	50 %	385821891
3004	NC_017474	GCA	2	6	187989	187994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821892
3005	NC_017474	T	6	6	188008	188013	0 %	100 %	0 %	0 %	385821892
3006	NC_017474	T	6	6	188085	188090	0 %	100 %	0 %	0 %	385821892
3007	NC_017474	GAT	2	6	188102	188107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821892
3008	NC_017474	GGT	2	6	188220	188225	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821892
3009	NC_017474	CGG	3	9	188290	188298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821892
3010	NC_017474	TTA	2	6	188338	188343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821892
3011	NC_017474	GCG	2	6	188355	188360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821892
3012	NC_017474	TGTT	2	8	188395	188402	0 %	75 %	25 %	0 %	385821892
3013	NC_017474	TTG	2	6	188418	188423	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821892
3014	NC_017474	ATC	2	6	188449	188454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821892
3015	NC_017474	CAG	2	6	188556	188561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821892
3016	NC_017474	CGT	2	6	188626	188631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821893
3017	NC_017474	GTTT	2	8	188694	188701	0 %	75 %	25 %	0 %	385821893
3018	NC_017474	GTT	2	6	188768	188773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821893
3019	NC_017474	GTT	2	6	188791	188796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821893
3020	NC_017474	GGT	2	6	188939	188944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821893
3021	NC_017474	GGCATT	2	12	188951	188962	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385821893
3022	NC_017474	GCG	2	6	188966	188971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821893
3023	NC_017474	ATC	2	6	188990	188995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821893
3024	NC_017474	TGC	2	6	189058	189063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821893
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3026	NC_017474	TCAC	2	8	189125	189132	25 %	25 %	0 %	50 %	385821893
3027	NC_017474	ATTG	2	8	189139	189146	25 %	50 %	25 %	0 %	385821893
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3029	NC_017474	TG	3	6	189194	189199	0 %	50 %	50 %	0 %	385821893
3030	NC_017474	ATT	2	6	189218	189223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821893
3031	NC_017474	TGC	2	6	189238	189243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821893
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3033	NC_017474	GGC	2	6	189313	189318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821893
3034	NC_017474	GGC	2	6	189364	189369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821893
3035	NC_017474	CAG	2	6	189431	189436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821893
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3040	NC_017474	ATGGCG	2	12	189822	189833	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385821894
3041	NC_017474	GCA	2	6	189902	189907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821894
3042	NC_017474	CAG	2	6	189918	189923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821894
3043	NC_017474	T	6	6	189945	189950	0 %	100 %	0 %	0 %	385821894
3044	NC_017474	GAT	3	9	190067	190075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821894
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3048	NC_017474	CAT	2	6	190413	190418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821895
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3050	NC_017474	ACTA	2	8	190571	190578	50 %	25 %	0 %	25 %	385821895
3051	NC_017474	CCAG	2	8	190600	190607	25 %	0 %	25 %	50 %	385821895
3052	NC_017474	GCA	2	6	190613	190618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821895
3053	NC_017474	TCA	2	6	190631	190636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821895
3054	NC_017474	A	6	6	190664	190669	100 %	0 %	0 %	0 %	385821895
3055	NC_017474	GCCAA	2	10	190718	190727	40 %	0 %	20 %	40 %	385821895
3056	NC_017474	CAGC	2	8	190730	190737	25 %	0 %	25 %	50 %	385821895
3057	NC_017474	GAA	2	6	190740	190745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821895
3058	NC_017474	GAT	2	6	190766	190771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821895
3059	NC_017474	TGT	2	6	190822	190827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821895
3060	NC_017474	GTT	2	6	190876	190881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821895
3061	NC_017474	GTC	2	6	191208	191213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821896
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3063	NC_017474	TGA	2	6	191342	191347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821896
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3092	NC_017474	ATC	2	6	193445	193450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821899
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3094	NC_017474	CTGGG	2	10	193484	193493	0 %	20 %	60 %	20 %	385821899
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3102	NC_017474	AAG	2	6	193877	193882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821899
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3105	NC_017474	GAC	2	6	194021	194026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821899
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3115	NC_017474	CTGG	2	8	194348	194355	0 %	25 %	50 %	25 %	385821900
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3119	NC_017474	GTT	2	6	194620	194625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821900
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3242	NC_017474	AAG	2	6	201018	201023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821907
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3362	NC_017474	GTT	2	6	208024	208029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821913
3363	NC_017474	CAT	2	6	208046	208051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821913
3364	NC_017474	TTGA	2	8	208061	208068	25 %	50 %	25 %	0 %	385821913
3365	NC_017474	TTAT	2	8	208310	208317	25 %	75 %	0 %	0 %	385821914
3366	NC_017474	TGC	2	6	208336	208341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821914
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3369	NC_017474	T	6	6	208511	208516	0 %	100 %	0 %	0 %	385821914
3370	NC_017474	TGC	2	6	208589	208594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821914
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3375	NC_017474	AAATC	2	10	208819	208828	60 %	20 %	0 %	20 %	385821914
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3392	NC_017474	A	6	6	210420	210425	100 %	0 %	0 %	0 %	385821915
3393	NC_017474	CAT	2	6	210529	210534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821915
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3482	NC_017474	GGC	2	6	215332	215337	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821919
3483	NC_017474	TTC	2	6	215433	215438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821919
3484	NC_017474	TAA	2	6	215448	215453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821919
3485	NC_017474	ATT	2	6	215518	215523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821919
3486	NC_017474	TCAG	2	8	215672	215679	25 %	25 %	25 %	25 %	385821919
3487	NC_017474	CA	4	8	215768	215775	50 %	0 %	0 %	50 %	385821919
3488	NC_017474	AC	3	6	215860	215865	50 %	0 %	0 %	50 %	385821919
3489	NC_017474	ATC	2	6	215920	215925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821919
3490	NC_017474	ATG	2	6	216016	216021	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821919
3491	NC_017474	GCT	2	6	216037	216042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821919
3492	NC_017474	ATG	2	6	216106	216111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821919
3493	NC_017474	TAA	2	6	216195	216200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821919
3494	NC_017474	TGG	2	6	216436	216441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821919
3495	NC_017474	AAT	2	6	216466	216471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821919
3496	NC_017474	GA	3	6	216682	216687	50 %	0 %	50 %	0 %	385821920
3497	NC_017474	GAC	2	6	216716	216721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821920
3498	NC_017474	GTT	2	6	216761	216766	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821920
3499	NC_017474	ATTT	2	8	216820	216827	25 %	75 %	0 %	0 %	385821920
3500	NC_017474	TTG	2	6	216873	216878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821920

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