MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 49466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2502	NC_017474	CTA	2	6	155870	155875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821857
2503	NC_017474	AGCG	2	8	155939	155946	25 %	0 %	50 %	25 %	385821857
2504	NC_017474	CAAT	2	8	155966	155973	50 %	25 %	0 %	25 %	385821857
2505	NC_017474	AAG	2	6	156046	156051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821857
2506	NC_017474	GTC	2	6	156060	156065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821857
2507	NC_017474	GTAAG	2	10	156084	156093	40 %	20 %	40 %	0 %	385821857
2508	NC_017474	TGA	2	6	156153	156158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821857
2509	NC_017474	TGA	2	6	156422	156427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821858
2510	NC_017474	ACA	2	6	156537	156542	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821858
2511	NC_017474	CGAA	2	8	156564	156571	50 %	0 %	25 %	25 %	385821858
2512	NC_017474	CAG	2	6	156592	156597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821858
2513	NC_017474	TGA	2	6	156628	156633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821858
2514	NC_017474	TGTT	2	8	156676	156683	0 %	75 %	25 %	0 %	385821858
2515	NC_017474	CAA	2	6	156701	156706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821858
2516	NC_017474	GCA	2	6	156710	156715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821858
2517	NC_017474	GCA	2	6	156745	156750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821858
2518	NC_017474	GCG	2	6	156798	156803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821858
2519	NC_017474	AGCG	2	8	156871	156878	25 %	0 %	50 %	25 %	385821858
2520	NC_017474	CG	3	6	156889	156894	0 %	0 %	50 %	50 %	385821858
2521	NC_017474	GGC	2	6	157020	157025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821858
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2523	NC_017474	GAA	2	6	157067	157072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821858
2524	NC_017474	GAG	2	6	157098	157103	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385821858
2525	NC_017474	TGGC	2	8	157170	157177	0 %	25 %	50 %	25 %	385821858
2526	NC_017474	CGG	2	6	157218	157223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821858
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2528	NC_017474	CA	3	6	157340	157345	50 %	0 %	0 %	50 %	385821858
2529	NC_017474	AAAG	2	8	157409	157416	75 %	0 %	25 %	0 %	385821858
2530	NC_017474	CACAA	2	10	157518	157527	60 %	0 %	0 %	40 %	385821858
2531	NC_017474	ATC	2	6	157585	157590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821858
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2533	NC_017474	GCAG	2	8	157782	157789	25 %	0 %	50 %	25 %	385821859
2534	NC_017474	AAG	2	6	157942	157947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821859
2535	NC_017474	GTTG	2	8	157985	157992	0 %	50 %	50 %	0 %	385821859
2536	NC_017474	CGG	2	6	158036	158041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821859
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2541	NC_017474	AGA	2	6	158351	158356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821859
2542	NC_017474	GAT	2	6	158363	158368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821859
2543	NC_017474	AGGCTC	2	12	158381	158392	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385821859
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2548	NC_017474	AATT	2	8	159047	159054	50 %	50 %	0 %	0 %	385821860
2549	NC_017474	AATC	2	8	159075	159082	50 %	25 %	0 %	25 %	385821860
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2552	NC_017474	TGG	2	6	159235	159240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821860
2553	NC_017474	CGT	2	6	159412	159417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821860
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2555	NC_017474	CAG	2	6	159486	159491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821860
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2559	NC_017474	TGA	2	6	159621	159626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821860
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2562	NC_017474	CCCG	2	8	159735	159742	0 %	0 %	25 %	75 %	385821860
2563	NC_017474	TTGC	2	8	159801	159808	0 %	50 %	25 %	25 %	385821860
2564	NC_017474	TGG	2	6	160146	160151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821861
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2566	NC_017474	CATT	2	8	160158	160165	25 %	50 %	0 %	25 %	385821861
2567	NC_017474	TGA	3	9	160177	160185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821861
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2570	NC_017474	A	7	7	160488	160494	100 %	0 %	0 %	0 %	385821861
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2581	NC_017474	ATCAA	2	10	160959	160968	60 %	20 %	0 %	20 %	385821862
2582	NC_017474	AATT	2	8	160973	160980	50 %	50 %	0 %	0 %	385821862
2583	NC_017474	GAAA	2	8	161042	161049	75 %	0 %	25 %	0 %	385821862
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2601	NC_017474	ATTG	2	8	162088	162095	25 %	50 %	25 %	0 %	385821863
2602	NC_017474	TGGC	2	8	162111	162118	0 %	25 %	50 %	25 %	385821863
2603	NC_017474	CCG	2	6	162183	162188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821863
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2617	NC_017474	CAAT	2	8	162685	162692	50 %	25 %	0 %	25 %	385821863
2618	NC_017474	TTG	2	6	162809	162814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821863
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2745	NC_017474	GAC	2	6	170731	170736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821868
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2857	NC_017474	A	6	6	177837	177842	100 %	0 %	0 %	0 %	385821875
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2984	NC_017474	TGC	2	6	186593	186598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821889
2985	NC_017474	GCA	2	6	186616	186621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821889
2986	NC_017474	GGCT	2	8	186622	186629	0 %	25 %	50 %	25 %	385821889
2987	NC_017474	GCAT	2	8	186657	186664	25 %	25 %	25 %	25 %	385821889
2988	NC_017474	GTTG	2	8	186671	186678	0 %	50 %	50 %	0 %	385821889
2989	NC_017474	CCG	2	6	186680	186685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821889
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2992	NC_017474	GA	3	6	186847	186852	50 %	0 %	50 %	0 %	385821890
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