MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 49466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_017474	CCT	2	6	63493	63498	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385821765
1003	NC_017474	CAG	2	6	63542	63547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821765
1004	NC_017474	CTGG	2	8	63604	63611	0 %	25 %	50 %	25 %	385821765
1005	NC_017474	GCC	2	6	63647	63652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821765
1006	NC_017474	ATG	2	6	63720	63725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821765
1007	NC_017474	ATTG	2	8	63759	63766	25 %	50 %	25 %	0 %	385821765
1008	NC_017474	CATGCC	2	12	63776	63787	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385821765
1009	NC_017474	AGC	2	6	63791	63796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821765
1010	NC_017474	ATCA	2	8	63797	63804	50 %	25 %	0 %	25 %	385821765
1011	NC_017474	AGC	2	6	63855	63860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821765
1012	NC_017474	CAA	2	6	63926	63931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821765
1013	NC_017474	GCT	2	6	64069	64074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821765
1014	NC_017474	CCT	2	6	64134	64139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385821766
1015	NC_017474	AGC	2	6	64171	64176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821766
1016	NC_017474	ACA	2	6	64271	64276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821766
1017	NC_017474	GCT	2	6	64286	64291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821766
1018	NC_017474	ACA	2	6	64328	64333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821766
1019	NC_017474	GAT	2	6	64491	64496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821766
1020	NC_017474	CAG	2	6	64513	64518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821766
1021	NC_017474	CAG	2	6	64543	64548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821766
1022	NC_017474	GGC	2	6	64582	64587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821766
1023	NC_017474	GGT	2	6	64615	64620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821766
1024	NC_017474	CGA	2	6	64668	64673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821766
1025	NC_017474	TTG	2	6	64676	64681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821766
1026	NC_017474	AAT	2	6	64720	64725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821766
1027	NC_017474	ATCAGA	2	12	64889	64900	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385821766
1028	NC_017474	GCT	2	6	64910	64915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821766
1029	NC_017474	TGT	2	6	64940	64945	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821766
1030	NC_017474	GCC	2	6	64948	64953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821766
1031	NC_017474	TCT	2	6	64985	64990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821766
1032	NC_017474	TTC	2	6	65038	65043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821766
1033	NC_017474	TG	3	6	65094	65099	0 %	50 %	50 %	0 %	385821766
1034	NC_017474	GCC	2	6	65194	65199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821766
1035	NC_017474	ATC	2	6	65222	65227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821766
1036	NC_017474	GACA	2	8	65268	65275	50 %	0 %	25 %	25 %	385821766
1037	NC_017474	GTT	2	6	65367	65372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821766
1038	NC_017474	GCA	2	6	66023	66028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821767
1039	NC_017474	TG	3	6	66062	66067	0 %	50 %	50 %	0 %	385821767
1040	NC_017474	GCA	2	6	66124	66129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821767
1041	NC_017474	CAA	2	6	66149	66154	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821767
1042	NC_017474	AAT	2	6	66230	66235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821767
1043	NC_017474	AG	3	6	66289	66294	50 %	0 %	50 %	0 %	385821767
1044	NC_017474	GAC	2	6	66340	66345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821767
1045	NC_017474	ATT	2	6	66384	66389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821767
1046	NC_017474	ACA	2	6	66406	66411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821767
1047	NC_017474	TA	3	6	66435	66440	50 %	50 %	0 %	0 %	385821767
1048	NC_017474	GTT	2	6	66470	66475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821767
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1050	NC_017474	CAATAA	2	12	66539	66550	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385821767
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1052	NC_017474	A	6	6	66576	66581	100 %	0 %	0 %	0 %	385821767
1053	NC_017474	TTA	2	6	66793	66798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821768
1054	NC_017474	AG	3	6	66874	66879	50 %	0 %	50 %	0 %	385821768
1055	NC_017474	AT	3	6	66885	66890	50 %	50 %	0 %	0 %	385821768
1056	NC_017474	T	6	6	66938	66943	0 %	100 %	0 %	0 %	385821768
1057	NC_017474	CAA	2	6	67088	67093	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821769
1058	NC_017474	AACTGA	2	12	67128	67139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385821769
1059	NC_017474	TCA	2	6	67147	67152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821769
1060	NC_017474	CGT	2	6	67166	67171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821769
1061	NC_017474	T	6	6	67181	67186	0 %	100 %	0 %	0 %	385821769
1062	NC_017474	AAT	2	6	67210	67215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821769
1063	NC_017474	T	6	6	67256	67261	0 %	100 %	0 %	0 %	385821769
1064	NC_017474	AAG	2	6	67326	67331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821770
1065	NC_017474	GAT	2	6	67333	67338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821770
1066	NC_017474	CAG	2	6	67356	67361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821770
1067	NC_017474	TGG	2	6	67407	67412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821770
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1069	NC_017474	AGC	2	6	67572	67577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821770
1070	NC_017474	GGC	2	6	67615	67620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821770
1071	NC_017474	CG	3	6	67636	67641	0 %	0 %	50 %	50 %	385821770
1072	NC_017474	TGT	2	6	67756	67761	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821770
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1074	NC_017474	GTGA	2	8	67835	67842	25 %	25 %	50 %	0 %	385821770
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1079	NC_017474	TTGCT	2	10	67995	68004	0 %	60 %	20 %	20 %	385821770
1080	NC_017474	TGT	2	6	68098	68103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821770
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1082	NC_017474	TGG	2	6	68277	68282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821770
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1084	NC_017474	CCTA	2	8	68331	68338	25 %	25 %	0 %	50 %	385821770
1085	NC_017474	ACA	2	6	68348	68353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821770
1086	NC_017474	CGA	2	6	68520	68525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821770
1087	NC_017474	TGC	2	6	68539	68544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821770
1088	NC_017474	ATG	2	6	68663	68668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821770
1089	NC_017474	CGG	2	6	68695	68700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821770
1090	NC_017474	TAC	2	6	68703	68708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821770
1091	NC_017474	AGCGCA	2	12	68737	68748	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821770
1092	NC_017474	ACG	2	6	68784	68789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821770
1093	NC_017474	GATG	2	8	68836	68843	25 %	25 %	50 %	0 %	385821770
1094	NC_017474	CTG	2	6	68856	68861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821770
1095	NC_017474	CAG	2	6	68875	68880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821770
1096	NC_017474	AAT	2	6	68930	68935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821770
1097	NC_017474	TTACGG	2	12	69068	69079	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385821770
1098	NC_017474	C	6	6	69084	69089	0 %	0 %	0 %	100 %	385821770
1099	NC_017474	GAC	2	6	69106	69111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821770
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1102	NC_017474	TAAA	2	8	69151	69158	75 %	25 %	0 %	0 %	385821770
1103	NC_017474	AAG	2	6	69394	69399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821771
1104	NC_017474	AAC	2	6	69601	69606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821772
1105	NC_017474	AGC	2	6	69608	69613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821772
1106	NC_017474	TGC	2	6	69614	69619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821772
1107	NC_017474	TGACCA	2	12	69629	69640	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385821772
1108	NC_017474	CTG	2	6	69652	69657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821772
1109	NC_017474	GTG	2	6	69733	69738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821772
1110	NC_017474	CAA	2	6	69780	69785	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821772
1111	NC_017474	GAC	2	6	69801	69806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821772
1112	NC_017474	CGTTT	2	10	69895	69904	0 %	60 %	20 %	20 %	385821772
1113	NC_017474	GTT	2	6	69959	69964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821772
1114	NC_017474	CAA	2	6	69989	69994	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821772
1115	NC_017474	GCA	2	6	70014	70019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821772
1116	NC_017474	GCC	2	6	70081	70086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821772
1117	NC_017474	CGG	2	6	70093	70098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821772
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1119	NC_017474	GCC	2	6	70345	70350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821773
1120	NC_017474	GCC	2	6	70414	70419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821773
1121	NC_017474	TGG	2	6	70427	70432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821773
1122	NC_017474	CCA	2	6	70466	70471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821773
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1124	NC_017474	CGG	2	6	70574	70579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821773
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1500	NC_017474	TCG	2	6	94804	94809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821797

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