MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 49466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017474	GTC	2	6	29970	29975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821730
502	NC_017474	GCC	2	6	30018	30023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821730
503	NC_017474	TGT	2	6	30051	30056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821730
504	NC_017474	CTT	2	6	30084	30089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821730
505	NC_017474	TA	3	6	30129	30134	50 %	50 %	0 %	0 %	385821730
506	NC_017474	TTG	2	6	30176	30181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821730
507	NC_017474	A	7	7	30184	30190	100 %	0 %	0 %	0 %	385821730
508	NC_017474	TAA	2	6	30198	30203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821730
509	NC_017474	AAC	2	6	30238	30243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821730
510	NC_017474	AGC	2	6	30271	30276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821731
511	NC_017474	AATG	2	8	30277	30284	50 %	25 %	25 %	0 %	385821731
512	NC_017474	AGC	2	6	30301	30306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821731
513	NC_017474	CAA	2	6	30312	30317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821731
514	NC_017474	ATA	2	6	30341	30346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821731
515	NC_017474	TTG	2	6	30348	30353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821731
516	NC_017474	ACA	2	6	30362	30367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821731
517	NC_017474	GCC	2	6	30374	30379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821731
518	NC_017474	AAC	2	6	30526	30531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821731
519	NC_017474	TGT	3	9	30532	30540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821731
520	NC_017474	ATT	2	6	30883	30888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821731
521	NC_017474	GAA	2	6	30965	30970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821731
522	NC_017474	TACA	2	8	31131	31138	50 %	25 %	0 %	25 %	385821731
523	NC_017474	AT	3	6	31150	31155	50 %	50 %	0 %	0 %	385821731
524	NC_017474	AAT	2	6	31210	31215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821731
525	NC_017474	AGC	2	6	31294	31299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821731
526	NC_017474	TAC	2	6	31302	31307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821731
527	NC_017474	CAA	2	6	31311	31316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821731
528	NC_017474	CTG	2	6	31333	31338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821731
529	NC_017474	CCA	2	6	31364	31369	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821731
530	NC_017474	AT	3	6	31375	31380	50 %	50 %	0 %	0 %	385821731
531	NC_017474	GTT	2	6	31515	31520	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821731
532	NC_017474	GCA	2	6	31529	31534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821731
533	NC_017474	CAA	2	6	31594	31599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821731
534	NC_017474	TGA	2	6	31605	31610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821731
535	NC_017474	TTGC	2	8	31827	31834	0 %	50 %	25 %	25 %	385821731
536	NC_017474	TGC	2	6	31958	31963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821731
537	NC_017474	CGC	2	6	31983	31988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821731
538	NC_017474	CAAA	2	8	32016	32023	75 %	0 %	0 %	25 %	385821731
539	NC_017474	GCC	2	6	32024	32029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821731
540	NC_017474	TAT	2	6	32103	32108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821731
541	NC_017474	ATT	2	6	32119	32124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821731
542	NC_017474	CTAC	2	8	32207	32214	25 %	25 %	0 %	50 %	385821731
543	NC_017474	TTG	2	6	32310	32315	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821731
544	NC_017474	TTG	2	6	32375	32380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821731
545	NC_017474	T	6	6	32509	32514	0 %	100 %	0 %	0 %	385821732
546	NC_017474	TGTTTT	2	12	32524	32535	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	385821732
547	NC_017474	GGA	2	6	32538	32543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385821732
548	NC_017474	A	6	6	32590	32595	100 %	0 %	0 %	0 %	385821732
549	NC_017474	TCA	2	6	32633	32638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821732
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551	NC_017474	GGC	2	6	32684	32689	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821732
552	NC_017474	GAT	2	6	32694	32699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821732
553	NC_017474	TGG	2	6	32765	32770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821732
554	NC_017474	GGC	2	6	32802	32807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821732
555	NC_017474	TTC	2	6	32821	32826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821732
556	NC_017474	AAGGTT	2	12	32863	32874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821732
557	NC_017474	CTT	2	6	32954	32959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821732
558	NC_017474	GTGC	2	8	32974	32981	0 %	25 %	50 %	25 %	385821732
559	NC_017474	AGT	2	6	33028	33033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821732
560	NC_017474	ATG	2	6	33049	33054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821732
561	NC_017474	CAA	2	6	33099	33104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821732
562	NC_017474	TAC	2	6	33119	33124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821732
563	NC_017474	GCC	2	6	33146	33151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821732
564	NC_017474	CGG	2	6	33252	33257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821732
565	NC_017474	GCAA	2	8	33268	33275	50 %	0 %	25 %	25 %	385821732
566	NC_017474	AAGCC	2	10	33296	33305	40 %	0 %	20 %	40 %	385821732
567	NC_017474	GTC	2	6	33697	33702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821733
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569	NC_017474	ACT	2	6	33756	33761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821733
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572	NC_017474	CAT	2	6	33897	33902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821733
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595	NC_017474	CAA	2	6	34717	34722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821734
596	NC_017474	T	6	6	34726	34731	0 %	100 %	0 %	0 %	385821734
597	NC_017474	GT	3	6	34736	34741	0 %	50 %	50 %	0 %	385821734
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601	NC_017474	GGC	2	6	34885	34890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821734
602	NC_017474	CAT	2	6	34905	34910	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821734
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605	NC_017474	CT	3	6	35027	35032	0 %	50 %	0 %	50 %	385821734
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607	NC_017474	CG	3	6	35139	35144	0 %	0 %	50 %	50 %	385821734
608	NC_017474	GCG	2	6	35252	35257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821735
609	NC_017474	AAG	2	6	35306	35311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821735
610	NC_017474	CAA	2	6	35373	35378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821735
611	NC_017474	GTG	2	6	35435	35440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821735
612	NC_017474	TGA	2	6	35502	35507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821735
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619	NC_017474	TGT	2	6	35844	35849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821735
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622	NC_017474	A	6	6	36109	36114	100 %	0 %	0 %	0 %	385821736
623	NC_017474	ATT	2	6	36130	36135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821736
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627	NC_017474	GGC	2	6	36375	36380	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821736
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751	NC_017474	GAAAA	2	10	46873	46882	80 %	0 %	20 %	0 %	385821750
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