MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 49466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017474	TAC	2	6	315558	315563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822011
5002	NC_017474	GAT	2	6	315587	315592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822011
5003	NC_017474	CAGC	2	8	315688	315695	25 %	0 %	25 %	50 %	385822011
5004	NC_017474	AGA	3	9	315754	315762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822012
5005	NC_017474	GGC	2	6	315877	315882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822012
5006	NC_017474	CTG	3	9	315909	315917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822012
5007	NC_017474	AGC	2	6	315936	315941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822012
5008	NC_017474	GTT	3	9	316058	316066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822012
5009	NC_017474	AGC	2	6	316075	316080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822012
5010	NC_017474	ATT	2	6	316109	316114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822012
5011	NC_017474	CTG	2	6	316176	316181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822012
5012	NC_017474	CGC	2	6	316335	316340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385822012
5013	NC_017474	TTG	2	6	316344	316349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822012
5014	NC_017474	GAT	2	6	316478	316483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822013
5015	NC_017474	GCA	2	6	316505	316510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822013
5016	NC_017474	GTT	2	6	316512	316517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822013
5017	NC_017474	TCAC	2	8	316537	316544	25 %	25 %	0 %	50 %	385822013
5018	NC_017474	TTA	2	6	316549	316554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822013
5019	NC_017474	TTA	2	6	316616	316621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822013
5020	NC_017474	TA	3	6	316642	316647	50 %	50 %	0 %	0 %	385822013
5021	NC_017474	T	6	6	316745	316750	0 %	100 %	0 %	0 %	385822013
5022	NC_017474	CAA	2	6	316768	316773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822013
5023	NC_017474	GGC	2	6	316781	316786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822013
5024	NC_017474	CAC	2	6	316787	316792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385822013
5025	NC_017474	CGC	2	6	316852	316857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385822013
5026	NC_017474	TGC	2	6	316876	316881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822013
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5029	NC_017474	GCA	2	6	316919	316924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822013
5030	NC_017474	AGCG	2	8	316996	317003	25 %	0 %	50 %	25 %	385822013
5031	NC_017474	TTGA	2	8	317013	317020	25 %	50 %	25 %	0 %	385822013
5032	NC_017474	AGC	2	6	317050	317055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822013
5033	NC_017474	GCTG	2	8	317063	317070	0 %	25 %	50 %	25 %	385822013
5034	NC_017474	CAG	2	6	317081	317086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822013
5035	NC_017474	TGA	2	6	317153	317158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822013
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5037	NC_017474	GAT	3	9	317193	317201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822014
5038	NC_017474	ATG	2	6	317287	317292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822014
5039	NC_017474	CCA	2	6	317306	317311	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385822014
5040	NC_017474	ATT	2	6	317346	317351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822014
5041	NC_017474	TGG	2	6	317434	317439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385822014
5042	NC_017474	GCC	2	6	317440	317445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385822014
5043	NC_017474	TGGTT	2	10	317501	317510	0 %	60 %	40 %	0 %	385822014
5044	NC_017474	GC	3	6	317519	317524	0 %	0 %	50 %	50 %	385822014
5045	NC_017474	T	7	7	317556	317562	0 %	100 %	0 %	0 %	385822014
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5047	NC_017474	TTGT	2	8	317593	317600	0 %	75 %	25 %	0 %	385822014
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5051	NC_017474	CAT	2	6	317726	317731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822015
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5053	NC_017474	CAG	2	6	317902	317907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822015
5054	NC_017474	CCA	2	6	317939	317944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385822015
5055	NC_017474	TGAT	2	8	317957	317964	25 %	50 %	25 %	0 %	385822015
5056	NC_017474	ATC	2	6	318023	318028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822015
5057	NC_017474	GCA	2	6	318156	318161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822015
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5060	NC_017474	ACG	2	6	318338	318343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822015
5061	NC_017474	CAG	2	6	318344	318349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822015
5062	NC_017474	TCG	2	6	318350	318355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822015
5063	NC_017474	CTG	2	6	318375	318380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822015
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5069	NC_017474	GCT	2	6	318588	318593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822016
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5092	NC_017474	AAG	3	9	320354	320362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822018
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5101	NC_017474	TATT	2	8	320783	320790	25 %	75 %	0 %	0 %	385822018
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5105	NC_017474	CAA	2	6	320918	320923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822018
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5109	NC_017474	TTA	2	6	321180	321185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822018
5110	NC_017474	TTGA	2	8	321286	321293	25 %	50 %	25 %	0 %	385822018
5111	NC_017474	GTT	2	6	321348	321353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822018
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5113	NC_017474	TTGCTG	2	12	321418	321429	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385822018
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5119	NC_017474	A	6	6	321778	321783	100 %	0 %	0 %	0 %	385822018
5120	NC_017474	ATG	2	6	322103	322108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822019
5121	NC_017474	GCT	2	6	322244	322249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822019
5122	NC_017474	ATC	2	6	322250	322255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822019
5123	NC_017474	CAT	2	6	322258	322263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822019
5124	NC_017474	A	6	6	322292	322297	100 %	0 %	0 %	0 %	385822019
5125	NC_017474	ATGAA	2	10	322299	322308	60 %	20 %	20 %	0 %	385822019
5126	NC_017474	CTT	2	6	322321	322326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385822019
5127	NC_017474	AGA	2	6	322739	322744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822020
5128	NC_017474	GTCA	2	8	322779	322786	25 %	25 %	25 %	25 %	385822020
5129	NC_017474	TGCT	2	8	322850	322857	0 %	50 %	25 %	25 %	385822020
5130	NC_017474	AAG	2	6	322861	322866	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822020
5131	NC_017474	TGGT	2	8	322904	322911	0 %	50 %	50 %	0 %	385822020
5132	NC_017474	CTT	2	6	322959	322964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385822020
5133	NC_017474	ATT	2	6	323057	323062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822020
5134	NC_017474	GGC	2	6	323106	323111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822020
5135	NC_017474	TGA	2	6	323220	323225	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822020
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5138	NC_017474	TAT	2	6	323460	323465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822020
5139	NC_017474	ATG	3	9	323474	323482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822020
5140	NC_017474	CAT	2	6	323515	323520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822020
5141	NC_017474	GAT	2	6	323557	323562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822020
5142	NC_017474	CG	3	6	323632	323637	0 %	0 %	50 %	50 %	385822020
5143	NC_017474	TTGA	2	8	323707	323714	25 %	50 %	25 %	0 %	385822020
5144	NC_017474	A	6	6	323803	323808	100 %	0 %	0 %	0 %	385822021
5145	NC_017474	TTA	2	6	323816	323821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822021
5146	NC_017474	AGA	2	6	323901	323906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822021
5147	NC_017474	A	6	6	323934	323939	100 %	0 %	0 %	0 %	385822021
5148	NC_017474	GAA	2	6	323964	323969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822021
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5150	NC_017474	AAC	2	6	324035	324040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822021
5151	NC_017474	GCG	2	6	324176	324181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822021
5152	NC_017474	T	6	6	324185	324190	0 %	100 %	0 %	0 %	385822021
5153	NC_017474	GAA	2	6	324378	324383	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822022
5154	NC_017474	TGA	2	6	324494	324499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822022
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5158	NC_017474	ACA	2	6	324650	324655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822022
5159	NC_017474	GGC	2	6	324720	324725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822022
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5182	NC_017474	TGTC	2	8	326076	326083	0 %	50 %	25 %	25 %	385822023
5183	NC_017474	GACCAT	2	12	326251	326262	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385822023
5184	NC_017474	ACGT	2	8	326276	326283	25 %	25 %	25 %	25 %	385822023
5185	NC_017474	CAG	2	6	326323	326328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822023
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5228	NC_017474	TTC	2	6	329154	329159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385822026
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5231	NC_017474	GAC	2	6	329220	329225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822026
5232	NC_017474	GGT	2	6	329258	329263	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385822026
5233	NC_017474	TGC	2	6	329272	329277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822026
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5237	NC_017474	TCG	2	6	329377	329382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822027
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5239	NC_017474	TTGCTT	2	12	329475	329486	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385822027
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5241	NC_017474	TGC	2	6	329662	329667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822027
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5350	NC_017474	TTG	2	6	336956	336961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822036
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5354	NC_017474	TGGA	2	8	337144	337151	25 %	25 %	50 %	0 %	385822036
5355	NC_017474	TTTA	2	8	337200	337207	25 %	75 %	0 %	0 %	385822036
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5483	NC_017474	CAA	2	6	345505	345510	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822046
5484	NC_017474	AGC	2	6	345587	345592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822046
5485	NC_017474	TGA	2	6	345689	345694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822046
5486	NC_017474	ATTAC	2	10	345742	345751	40 %	40 %	0 %	20 %	385822046
5487	NC_017474	GAT	2	6	345770	345775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822046
5488	NC_017474	AAG	2	6	345858	345863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822046
5489	NC_017474	CAC	2	6	345878	345883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385822046
5490	NC_017474	ATC	2	6	345933	345938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822046
5491	NC_017474	TCTG	2	8	345940	345947	0 %	50 %	25 %	25 %	385822046
5492	NC_017474	CGAT	2	8	345952	345959	25 %	25 %	25 %	25 %	385822046
5493	NC_017474	ATT	2	6	345961	345966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822046
5494	NC_017474	TCA	2	6	346000	346005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822046
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5497	NC_017474	ACGG	2	8	346250	346257	25 %	0 %	50 %	25 %	385822047
5498	NC_017474	CAT	2	6	346259	346264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822047
5499	NC_017474	TTA	2	6	346384	346389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822047
5500	NC_017474	AAC	2	6	346415	346420	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822047

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