MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 49466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4502	NC_017474	TGCTT	2	10	282757	282766	0 %	60 %	20 %	20 %	385821980
4503	NC_017474	CAAA	2	8	282868	282875	75 %	0 %	0 %	25 %	385821980
4504	NC_017474	GCG	2	6	282906	282911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821980
4505	NC_017474	CGT	2	6	282978	282983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821980
4506	NC_017474	TGA	2	6	282985	282990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821980
4507	NC_017474	TTC	2	6	283022	283027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821980
4508	NC_017474	ATC	2	6	283043	283048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821980
4509	NC_017474	CGG	2	6	283057	283062	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821980
4510	NC_017474	TTG	2	6	283126	283131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821980
4511	NC_017474	GTT	2	6	283147	283152	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821980
4512	NC_017474	TG	3	6	283209	283214	0 %	50 %	50 %	0 %	385821980
4513	NC_017474	GC	3	6	283229	283234	0 %	0 %	50 %	50 %	385821980
4514	NC_017474	CGG	2	6	283330	283335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821980
4515	NC_017474	AGC	2	6	283376	283381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821980
4516	NC_017474	ATG	2	6	283410	283415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821980
4517	NC_017474	GATTG	2	10	283439	283448	20 %	40 %	40 %	0 %	385821980
4518	NC_017474	GGC	2	6	283834	283839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821981
4519	NC_017474	TTA	2	6	283866	283871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821981
4520	NC_017474	TCA	2	6	283984	283989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821981
4521	NC_017474	AAG	2	6	284010	284015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821981
4522	NC_017474	GAA	2	6	284141	284146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821981
4523	NC_017474	GTT	2	6	284150	284155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821981
4524	NC_017474	TAC	2	6	284262	284267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821981
4525	NC_017474	GTT	2	6	284297	284302	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821981
4526	NC_017474	AAG	2	6	284310	284315	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821981
4527	NC_017474	ATG	2	6	284425	284430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821981
4528	NC_017474	CTG	2	6	284566	284571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821981
4529	NC_017474	TTC	2	6	284630	284635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821981
4530	NC_017474	CTG	2	6	284689	284694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821981
4531	NC_017474	GCA	2	6	284719	284724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821981
4532	NC_017474	TGTTT	2	10	284747	284756	0 %	80 %	20 %	0 %	385821981
4533	NC_017474	CAA	2	6	284775	284780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821981
4534	NC_017474	ATT	2	6	284899	284904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821981
4535	NC_017474	TGA	2	6	285001	285006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821981
4536	NC_017474	GCG	2	6	285040	285045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821981
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4538	NC_017474	ATC	2	6	285292	285297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821982
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4541	NC_017474	CAT	2	6	285449	285454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821982
4542	NC_017474	GTG	2	6	285534	285539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821982
4543	NC_017474	AAG	2	6	285670	285675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821982
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4545	NC_017474	A	6	6	285724	285729	100 %	0 %	0 %	0 %	385821982
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4552	NC_017474	GCG	2	6	285858	285863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821982
4553	NC_017474	AAC	2	6	285881	285886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821982
4554	NC_017474	GAA	2	6	286159	286164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821983
4555	NC_017474	TTG	2	6	286194	286199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821983
4556	NC_017474	CTG	2	6	286202	286207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821983
4557	NC_017474	TGAGTC	2	12	286218	286229	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385821983
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4560	NC_017474	T	6	6	286275	286280	0 %	100 %	0 %	0 %	385821983
4561	NC_017474	T	7	7	286301	286307	0 %	100 %	0 %	0 %	385821983
4562	NC_017474	TGA	2	6	286405	286410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821983
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4564	NC_017474	GAT	2	6	286493	286498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821983
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4566	NC_017474	ATG	2	6	286788	286793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821983
4567	NC_017474	GGC	2	6	286802	286807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821983
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4569	NC_017474	GCG	2	6	286868	286873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821983
4570	NC_017474	TAT	2	6	286922	286927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821983
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4572	NC_017474	ATG	2	6	287001	287006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821983
4573	NC_017474	GCTA	2	8	287119	287126	25 %	25 %	25 %	25 %	385821983
4574	NC_017474	A	6	6	287138	287143	100 %	0 %	0 %	0 %	385821983
4575	NC_017474	GTGCC	2	10	287169	287178	0 %	20 %	40 %	40 %	385821983
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4580	NC_017474	TGCCG	2	10	287332	287341	0 %	20 %	40 %	40 %	385821983
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4588	NC_017474	GGC	2	6	287841	287846	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821983
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4601	NC_017474	TTGATG	2	12	289061	289072	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385821984
4602	NC_017474	CAA	2	6	289090	289095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821984
4603	NC_017474	TGACGG	2	12	289122	289133	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385821984
4604	NC_017474	GAT	2	6	289624	289629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821985
4605	NC_017474	TGC	2	6	289765	289770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821985
4606	NC_017474	TTG	2	6	289827	289832	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821985
4607	NC_017474	TGA	2	6	289843	289848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821985
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4609	NC_017474	GCGCAT	2	12	289966	289977	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385821985
4610	NC_017474	GAT	3	9	290035	290043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821985
4611	NC_017474	TTAC	2	8	290053	290060	25 %	50 %	0 %	25 %	385821985
4612	NC_017474	T	6	6	290168	290173	0 %	100 %	0 %	0 %	385821985
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4615	NC_017474	TTG	2	6	290274	290279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821985
4616	NC_017474	CG	3	6	290300	290305	0 %	0 %	50 %	50 %	385821985
4617	NC_017474	A	6	6	290420	290425	100 %	0 %	0 %	0 %	385821986
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4856	NC_017474	TCAA	2	8	304801	304808	50 %	25 %	0 %	25 %	385822000
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4985	NC_017474	GTATT	2	10	314403	314412	20 %	60 %	20 %	0 %	385822011
4986	NC_017474	ATG	2	6	314589	314594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822011
4987	NC_017474	CGC	2	6	314602	314607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385822011
4988	NC_017474	ATG	2	6	314636	314641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822011
4989	NC_017474	CAG	2	6	314657	314662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822011
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4993	NC_017474	GATG	2	8	314851	314858	25 %	25 %	50 %	0 %	385822011
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