MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 6495

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017473	CGGT	2	8	142	149	0 %	25 %	50 %	25 %	385818535
2	NC_017473	ACAG	2	8	164	171	50 %	0 %	25 %	25 %	385818535
3	NC_017473	CAGC	2	8	333	340	25 %	0 %	25 %	50 %	385818535
4	NC_017473	TTTA	2	8	522	529	25 %	75 %	0 %	0 %	385818535
5	NC_017473	GCCT	2	8	826	833	0 %	25 %	25 %	50 %	385818535
6	NC_017473	GGTT	2	8	859	866	0 %	50 %	50 %	0 %	385818535
7	NC_017473	TGTC	2	8	886	893	0 %	50 %	25 %	25 %	385818535
8	NC_017473	ACGT	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	385818535
9	NC_017473	GAAA	2	8	1207	1214	75 %	0 %	25 %	0 %	385818535
10	NC_017473	ACGT	2	8	2961	2968	25 %	25 %	25 %	25 %	385818537
11	NC_017473	GGCC	2	8	3772	3779	0 %	0 %	50 %	50 %	385818538
12	NC_017473	AATC	2	8	3923	3930	50 %	25 %	0 %	25 %	385818539
13	NC_017473	TGAC	2	8	4343	4350	25 %	25 %	25 %	25 %	385818539
14	NC_017473	AAGA	2	8	5055	5062	75 %	0 %	25 %	0 %	385818541
15	NC_017473	CCAG	2	8	5107	5114	25 %	0 %	25 %	50 %	385818541
16	NC_017473	GCTG	2	8	5237	5244	0 %	25 %	50 %	25 %	385818541
17	NC_017473	CCTG	2	8	6302	6309	0 %	25 %	25 %	50 %	385818541
18	NC_017473	TGTT	2	8	6976	6983	0 %	75 %	25 %	0 %	385818541
19	NC_017473	ATGA	2	8	7225	7232	50 %	25 %	25 %	0 %	385818542
20	NC_017473	GATT	2	8	7497	7504	25 %	50 %	25 %	0 %	385818542
21	NC_017473	CGGT	2	8	7595	7602	0 %	25 %	50 %	25 %	385818542
22	NC_017473	CTTG	2	8	8832	8839	0 %	50 %	25 %	25 %	385818542
23	NC_017473	ACGG	2	8	9234	9241	25 %	0 %	50 %	25 %	385818542
24	NC_017473	TTTC	2	8	9962	9969	0 %	75 %	0 %	25 %	385818543
25	NC_017473	GACA	2	8	10133	10140	50 %	0 %	25 %	25 %	385818543
26	NC_017473	ATCA	2	8	10458	10465	50 %	25 %	0 %	25 %	385818543
27	NC_017473	TTGG	2	8	10984	10991	0 %	50 %	50 %	0 %	385818544
28	NC_017473	CGTA	2	8	11805	11812	25 %	25 %	25 %	25 %	385818546
29	NC_017473	AACC	2	8	11973	11980	50 %	0 %	0 %	50 %	385818546
30	NC_017473	AAGA	2	8	12486	12493	75 %	0 %	25 %	0 %	385818547
31	NC_017473	TTGG	2	8	12999	13006	0 %	50 %	50 %	0 %	385818548
32	NC_017473	AGTT	2	8	13382	13389	25 %	50 %	25 %	0 %	385818548
33	NC_017473	AAAG	2	8	13720	13727	75 %	0 %	25 %	0 %	385818548
34	NC_017473	TTTA	2	8	14043	14050	25 %	75 %	0 %	0 %	385818548
35	NC_017473	GCAG	2	8	14070	14077	25 %	0 %	50 %	25 %	385818548
36	NC_017473	TTTC	2	8	14240	14247	0 %	75 %	0 %	25 %	385818548
37	NC_017473	GATT	2	8	14918	14925	25 %	50 %	25 %	0 %	385818549
38	NC_017473	GCTG	2	8	15396	15403	0 %	25 %	50 %	25 %	385818550
39	NC_017473	CAAT	2	8	15836	15843	50 %	25 %	0 %	25 %	385818550
40	NC_017473	ACTT	2	8	16276	16283	25 %	50 %	0 %	25 %	385818550
41	NC_017473	CTGG	2	8	16580	16587	0 %	25 %	50 %	25 %	385818550
42	NC_017473	TTCT	2	8	17123	17130	0 %	75 %	0 %	25 %	385818551
43	NC_017473	CAAT	2	8	17161	17168	50 %	25 %	0 %	25 %	385818551
44	NC_017473	ACAA	2	8	18416	18423	75 %	0 %	0 %	25 %	385818553
45	NC_017473	AAAG	2	8	18594	18601	75 %	0 %	25 %	0 %	385818553
46	NC_017473	TGTT	2	8	18813	18820	0 %	75 %	25 %	0 %	385818553
47	NC_017473	GACT	2	8	19170	19177	25 %	25 %	25 %	25 %	385818554
48	NC_017473	AAAC	2	8	19256	19263	75 %	0 %	0 %	25 %	385818554
49	NC_017473	ATAA	2	8	20484	20491	75 %	25 %	0 %	0 %	385818556
50	NC_017473	GACT	2	8	22471	22478	25 %	25 %	25 %	25 %	385818559
51	NC_017473	CAAC	2	8	22752	22759	50 %	0 %	0 %	50 %	385818559
52	NC_017473	CAAA	2	8	24428	24435	75 %	0 %	0 %	25 %	385818560
53	NC_017473	AGAC	2	8	24747	24754	50 %	0 %	25 %	25 %	385818560
54	NC_017473	AAGA	2	8	25170	25177	75 %	0 %	25 %	0 %	385818560
55	NC_017473	CTGC	2	8	25937	25944	0 %	25 %	25 %	50 %	385818560
56	NC_017473	TAGT	2	8	26171	26178	25 %	50 %	25 %	0 %	385818560
57	NC_017473	AGCC	2	8	26570	26577	25 %	0 %	25 %	50 %	385818561
58	NC_017473	TTAC	2	8	27326	27333	25 %	50 %	0 %	25 %	385818562
59	NC_017473	TGGT	2	8	27432	27439	0 %	50 %	50 %	0 %	385818562
60	NC_017473	AATT	2	8	27788	27795	50 %	50 %	0 %	0 %	385818563
61	NC_017473	AATT	2	8	28004	28011	50 %	50 %	0 %	0 %	385818563
62	NC_017473	ATTT	2	8	28222	28229	25 %	75 %	0 %	0 %	385818563
63	NC_017473	ATTG	2	8	28768	28775	25 %	50 %	25 %	0 %	385818564
64	NC_017473	AACA	2	8	29925	29932	75 %	0 %	0 %	25 %	385818566
65	NC_017473	AATG	2	8	30277	30284	50 %	25 %	25 %	0 %	385818567
66	NC_017473	TACA	2	8	31131	31138	50 %	25 %	0 %	25 %	385818567
67	NC_017473	TTGC	2	8	31827	31834	0 %	50 %	25 %	25 %	385818567
68	NC_017473	CAAA	2	8	32016	32023	75 %	0 %	0 %	25 %	385818567
69	NC_017473	CTAC	2	8	32207	32214	25 %	25 %	0 %	50 %	385818567
70	NC_017473	GTGC	2	8	32974	32981	0 %	25 %	50 %	25 %	385818568
71	NC_017473	GCAA	2	8	33268	33275	50 %	0 %	25 %	25 %	385818568
72	NC_017473	ATTT	2	8	33927	33934	25 %	75 %	0 %	0 %	385818569
73	NC_017473	AGCA	2	8	34816	34823	50 %	0 %	25 %	25 %	385818570
74	NC_017473	TTCA	2	8	37153	37160	25 %	50 %	0 %	25 %	385818572
75	NC_017473	GTAT	2	8	38871	38878	25 %	50 %	25 %	0 %	385818575
76	NC_017473	GATT	2	8	39306	39313	25 %	50 %	25 %	0 %	385818575
77	NC_017473	AAGG	2	8	39388	39395	50 %	0 %	50 %	0 %	385818575
78	NC_017473	GCCG	2	8	39958	39965	0 %	0 %	50 %	50 %	385818575
79	NC_017473	TACT	2	8	42191	42198	25 %	50 %	0 %	25 %	385818579
80	NC_017473	ATGA	2	8	44101	44108	50 %	25 %	25 %	0 %	385818581
81	NC_017473	AAAT	2	8	50900	50907	75 %	25 %	0 %	0 %	385818582
82	NC_017473	CTAT	2	8	51893	51900	25 %	50 %	0 %	25 %	385818583
83	NC_017473	CTAG	2	8	52115	52122	25 %	25 %	25 %	25 %	385818583
84	NC_017473	ACTA	2	8	52400	52407	50 %	25 %	0 %	25 %	385818584
85	NC_017473	AAAT	2	8	52742	52749	75 %	25 %	0 %	0 %	385818584
86	NC_017473	TAGG	2	8	52780	52787	25 %	25 %	50 %	0 %	385818584
87	NC_017473	TGAT	2	8	53516	53523	25 %	50 %	25 %	0 %	385818585
88	NC_017473	CAAA	2	8	53577	53584	75 %	0 %	0 %	25 %	385818585
89	NC_017473	AAAT	2	8	53886	53893	75 %	25 %	0 %	0 %	385818585
90	NC_017473	TATT	2	8	54496	54503	25 %	75 %	0 %	0 %	385818585
91	NC_017473	TTGA	2	8	54793	54800	25 %	50 %	25 %	0 %	385818585
92	NC_017473	CCGC	2	8	55216	55223	0 %	0 %	25 %	75 %	385818586
93	NC_017473	TGAG	2	8	55939	55946	25 %	25 %	50 %	0 %	385818586
94	NC_017473	CAAA	2	8	56266	56273	75 %	0 %	0 %	25 %	385818586
95	NC_017473	TGCG	2	8	56547	56554	0 %	25 %	50 %	25 %	385818586
96	NC_017473	GTTA	2	8	56755	56762	25 %	50 %	25 %	0 %	385818587
97	NC_017473	TTTG	2	8	57065	57072	0 %	75 %	25 %	0 %	385818587
98	NC_017473	GTCA	2	8	57455	57462	25 %	25 %	25 %	25 %	385818588
99	NC_017473	GTTG	2	8	58456	58463	0 %	50 %	50 %	0 %	385818588
100	NC_017473	TTAA	2	8	58701	58708	50 %	50 %	0 %	0 %	385818588
101	NC_017473	TGGC	2	8	58749	58756	0 %	25 %	50 %	25 %	385818588
102	NC_017473	GCTG	2	8	58915	58922	0 %	25 %	50 %	25 %	385818588
103	NC_017473	CTGT	2	8	59130	59137	0 %	50 %	25 %	25 %	385818588
104	NC_017473	AGGT	2	8	59247	59254	25 %	25 %	50 %	0 %	385818588
105	NC_017473	TTGG	2	8	59429	59436	0 %	50 %	50 %	0 %	385818588
106	NC_017473	TCGT	2	8	59773	59780	0 %	50 %	25 %	25 %	385818588
107	NC_017473	CAGT	2	8	60337	60344	25 %	25 %	25 %	25 %	385818588
108	NC_017473	CTTT	2	8	60403	60410	0 %	75 %	0 %	25 %	385818588
109	NC_017473	TAAG	2	8	61681	61688	50 %	25 %	25 %	0 %	385818590
110	NC_017473	GTTG	2	8	62011	62018	0 %	50 %	50 %	0 %	385818591
111	NC_017473	GACA	2	8	62128	62135	50 %	0 %	25 %	25 %	385818591
112	NC_017473	CATC	2	8	62199	62206	25 %	25 %	0 %	50 %	385818591
113	NC_017473	CTGG	2	8	63604	63611	0 %	25 %	50 %	25 %	385818593
114	NC_017473	ATTG	2	8	63759	63766	25 %	50 %	25 %	0 %	385818593
115	NC_017473	ATCA	2	8	63797	63804	50 %	25 %	0 %	25 %	385818593
116	NC_017473	GACA	2	8	65268	65275	50 %	0 %	25 %	25 %	385818594
117	NC_017473	TGCC	2	8	71699	71706	0 %	25 %	25 %	50 %	385818595
118	NC_017473	TTGT	2	8	71708	71715	0 %	75 %	25 %	0 %	385818595
119	NC_017473	AAGT	2	8	72064	72071	50 %	25 %	25 %	0 %	385818595
120	NC_017473	GCAA	2	8	73244	73251	50 %	0 %	25 %	25 %	385818596
121	NC_017473	GCCA	2	8	73712	73719	25 %	0 %	25 %	50 %	385818597
122	NC_017473	GATA	2	8	73936	73943	50 %	25 %	25 %	0 %	385818597
123	NC_017473	TGCT	2	8	74024	74031	0 %	50 %	25 %	25 %	385818597
124	NC_017473	CTTT	2	8	74184	74191	0 %	75 %	0 %	25 %	385818598
125	NC_017473	AATT	2	8	74201	74208	50 %	50 %	0 %	0 %	385818598
126	NC_017473	GTTT	2	8	74874	74881	0 %	75 %	25 %	0 %	385818598
127	NC_017473	AATC	2	8	75048	75055	50 %	25 %	0 %	25 %	385818599
128	NC_017473	CAAG	2	8	75384	75391	50 %	0 %	25 %	25 %	385818599
129	NC_017473	AAGC	2	8	75780	75787	50 %	0 %	25 %	25 %	385818599
130	NC_017473	CAGG	2	8	76550	76557	25 %	0 %	50 %	25 %	385818600
131	NC_017473	AAAG	2	8	76794	76801	75 %	0 %	25 %	0 %	385818601
132	NC_017473	ATGA	2	8	77501	77508	50 %	25 %	25 %	0 %	385818601
133	NC_017473	GAAA	2	8	77557	77564	75 %	0 %	25 %	0 %	385818601
134	NC_017473	CAAC	2	8	77877	77884	50 %	0 %	0 %	50 %	385818601
135	NC_017473	AGTG	2	8	79481	79488	25 %	25 %	50 %	0 %	385818604
136	NC_017473	GACA	2	8	79587	79594	50 %	0 %	25 %	25 %	385818604
137	NC_017473	ATCA	2	8	79693	79700	50 %	25 %	0 %	25 %	385818604
138	NC_017473	ACTG	2	8	80367	80374	25 %	25 %	25 %	25 %	385818605
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