MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 49082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_017473	ACGA	2	8	3032979	3032986	50 %	0 %	25 %	25 %	385821650
49002	NC_017473	AAT	2	6	3033072	3033077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821650
49003	NC_017473	CGT	2	6	3033147	3033152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821650
49004	NC_017473	CGG	2	6	3033231	3033236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821650
49005	NC_017473	CGC	2	6	3033253	3033258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821650
49006	NC_017473	TTA	2	6	3033313	3033318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385821650
49007	NC_017473	GAT	2	6	3033345	3033350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821650
49008	NC_017473	ACA	2	6	3033385	3033390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821650
49009	NC_017473	GCC	2	6	3033418	3033423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821650
49010	NC_017473	CGA	2	6	3033449	3033454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821650
49011	NC_017473	TGC	2	6	3033518	3033523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821650
49012	NC_017473	GCT	2	6	3033532	3033537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821650
49013	NC_017473	AT	3	6	3033604	3033609	50 %	50 %	0 %	0 %	385821650
49014	NC_017473	CAC	2	6	3033635	3033640	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821650
49015	NC_017473	CAC	2	6	3033660	3033665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385821650
49016	NC_017473	GCC	2	6	3033681	3033686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821650
49017	NC_017473	CG	3	6	3033760	3033765	0 %	0 %	50 %	50 %	385821650
49018	NC_017473	CAA	2	6	3033803	3033808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821650
49019	NC_017473	CAT	2	6	3033815	3033820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821650
49020	NC_017473	T	6	6	3033837	3033842	0 %	100 %	0 %	0 %	385821650
49021	NC_017473	TTG	2	6	3034059	3034064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821651
49022	NC_017473	TGT	2	6	3034109	3034114	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821651
49023	NC_017473	GCC	2	6	3034130	3034135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821651
49024	NC_017473	GAA	2	6	3034136	3034141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385821651
49025	NC_017473	TGA	2	6	3034201	3034206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821651
49026	NC_017473	CAA	2	6	3034229	3034234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821651
49027	NC_017473	T	6	6	3034289	3034294	0 %	100 %	0 %	0 %	385821651
49028	NC_017473	TG	3	6	3034377	3034382	0 %	50 %	50 %	0 %	385821651
49029	NC_017473	CACG	2	8	3034474	3034481	25 %	0 %	25 %	50 %	385821651
49030	NC_017473	CTC	2	6	3034490	3034495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385821651
49031	NC_017473	CAA	2	6	3034594	3034599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821651
49032	NC_017473	CCTTG	2	10	3034627	3034636	0 %	40 %	20 %	40 %	385821651
49033	NC_017473	AGC	2	6	3034692	3034697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385821651
49034	NC_017473	TGG	2	6	3034702	3034707	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821651
49035	NC_017473	TCA	2	6	3034713	3034718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821651
49036	NC_017473	CAA	2	6	3034993	3034998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821651
49037	NC_017473	ACA	2	6	3035022	3035027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821651
49038	NC_017473	TCA	2	6	3035076	3035081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821651
49039	NC_017473	CGC	2	6	3035089	3035094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385821651
49040	NC_017473	AGTT	2	8	3035720	3035727	25 %	50 %	25 %	0 %	385821652
49041	NC_017473	ACGT	2	8	3035790	3035797	25 %	25 %	25 %	25 %	385821652
49042	NC_017473	ATG	2	6	3035836	3035841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821652
49043	NC_017473	CGT	2	6	3035925	3035930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821652
49044	NC_017473	TGA	2	6	3036019	3036024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821652
49045	NC_017473	CTT	2	6	3036052	3036057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821652
49046	NC_017473	GTG	2	6	3036132	3036137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821652
49047	NC_017473	TGG	2	6	3036193	3036198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385821652
49048	NC_017473	T	6	6	3036260	3036265	0 %	100 %	0 %	0 %	385821652
49049	NC_017473	TCG	2	6	3036291	3036296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821652
49050	NC_017473	CGG	2	6	3036320	3036325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821652
49051	NC_017473	CAAGC	2	10	3036425	3036434	40 %	0 %	20 %	40 %	385821652
49052	NC_017473	GTT	2	6	3036504	3036509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385821653
49053	NC_017473	T	6	6	3036529	3036534	0 %	100 %	0 %	0 %	385821653
49054	NC_017473	CGCT	2	8	3036538	3036545	0 %	25 %	25 %	50 %	385821653
49055	NC_017473	TTCTTT	2	12	3036556	3036567	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385821653
49056	NC_017473	CTG	2	6	3036628	3036633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821653
49057	NC_017473	ATC	2	6	3036725	3036730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821653
49058	NC_017473	GCT	2	6	3036739	3036744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821653
49059	NC_017473	GTTG	2	8	3036755	3036762	0 %	50 %	50 %	0 %	385821653
49060	NC_017473	CAT	2	6	3036766	3036771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821653
49061	NC_017473	TGA	2	6	3036877	3036882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821653
49062	NC_017473	TCA	2	6	3036992	3036997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385821653
49063	NC_017473	CTT	2	6	3037036	3037041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385821653
49064	NC_017473	GCG	2	6	3037059	3037064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385821653
49065	NC_017473	CTG	2	6	3037072	3037077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821653
49066	NC_017473	TTGA	2	8	3037091	3037098	25 %	50 %	25 %	0 %	385821653
49067	NC_017473	GAT	2	6	3037129	3037134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821653
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49069	NC_017473	GCCA	2	8	3037184	3037191	25 %	0 %	25 %	50 %	385821653
49070	NC_017473	ACA	2	6	3037217	3037222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385821653
49071	NC_017473	TTTGA	2	10	3037324	3037333	20 %	60 %	20 %	0 %	385821653
49072	NC_017473	GCCA	2	8	3037519	3037526	25 %	0 %	25 %	50 %	385821654
49073	NC_017473	CATGA	2	10	3037531	3037540	40 %	20 %	20 %	20 %	385821654
49074	NC_017473	GCCA	2	8	3037558	3037565	25 %	0 %	25 %	50 %	385821654
49075	NC_017473	A	6	6	3037601	3037606	100 %	0 %	0 %	0 %	385821654
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49078	NC_017473	T	6	6	3037819	3037824	0 %	100 %	0 %	0 %	385821654
49079	NC_017473	ATG	2	6	3037845	3037850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385821654
49080	NC_017473	TGC	3	9	3038013	3038021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385821654
49081	NC_017473	ATA	2	6	3038182	3038187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385821655
49082	NC_017473	TTGG	2	8	3038287	3038294	0 %	50 %	50 %	0 %	385821655

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.