MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 49082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_017473	AT	3	6	225947	225952	50 %	50 %	0 %	0 %	385818752
3502	NC_017473	ACT	2	6	225972	225977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818752
3503	NC_017473	TTTG	2	8	225992	225999	0 %	75 %	25 %	0 %	385818752
3504	NC_017473	TGG	2	6	226157	226162	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818752
3505	NC_017473	CG	3	6	226225	226230	0 %	0 %	50 %	50 %	385818752
3506	NC_017473	TCA	2	6	226231	226236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818752
3507	NC_017473	AGC	3	9	226253	226261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818752
3508	NC_017473	CTT	2	6	226436	226441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818752
3509	NC_017473	GCG	2	6	226608	226613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818752
3510	NC_017473	TTGGCG	2	12	226678	226689	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	385818752
3511	NC_017473	TGAC	2	8	226747	226754	25 %	25 %	25 %	25 %	385818752
3512	NC_017473	TAC	2	6	226791	226796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818752
3513	NC_017473	GTT	2	6	226815	226820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818752
3514	NC_017473	AAC	2	6	226833	226838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818752
3515	NC_017473	GGT	2	6	226839	226844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818752
3516	NC_017473	AAC	2	6	226900	226905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818752
3517	NC_017473	TCCA	2	8	226978	226985	25 %	25 %	0 %	50 %	385818752
3518	NC_017473	GCA	2	6	227054	227059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818752
3519	NC_017473	AGC	2	6	227081	227086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818752
3520	NC_017473	TA	3	6	227110	227115	50 %	50 %	0 %	0 %	385818752
3521	NC_017473	TGA	2	6	227125	227130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818752
3522	NC_017473	GC	3	6	227181	227186	0 %	0 %	50 %	50 %	385818752
3523	NC_017473	GTT	2	6	227274	227279	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818752
3524	NC_017473	GTT	2	6	227390	227395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818752
3525	NC_017473	GCT	2	6	227490	227495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818752
3526	NC_017473	ATC	2	6	227737	227742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818753
3527	NC_017473	ATC	2	6	227773	227778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818753
3528	NC_017473	GTC	3	9	227785	227793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818753
3529	NC_017473	GCCA	2	8	227814	227821	25 %	0 %	25 %	50 %	385818753
3530	NC_017473	GC	3	6	227852	227857	0 %	0 %	50 %	50 %	385818753
3531	NC_017473	CTTCGG	2	12	227880	227891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818753
3532	NC_017473	TGG	2	6	227922	227927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818753
3533	NC_017473	TCA	2	6	227951	227956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818753
3534	NC_017473	CGC	2	6	227968	227973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385818753
3535	NC_017473	GTT	2	6	227989	227994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818753
3536	NC_017473	GCC	2	6	228150	228155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385818753
3537	NC_017473	CTG	2	6	228197	228202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818753
3538	NC_017473	ATC	2	6	228226	228231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818753
3539	NC_017473	GTT	2	6	228261	228266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818753
3540	NC_017473	A	6	6	228338	228343	100 %	0 %	0 %	0 %	385818753
3541	NC_017473	GGA	2	6	228354	228359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385818753
3542	NC_017473	TGG	2	6	228447	228452	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818753
3543	NC_017473	CATT	2	8	228494	228501	25 %	50 %	0 %	25 %	385818753
3544	NC_017473	TTG	2	6	228532	228537	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818753
3545	NC_017473	GC	3	6	228562	228567	0 %	0 %	50 %	50 %	385818753
3546	NC_017473	GCCA	2	8	228573	228580	25 %	0 %	25 %	50 %	385818753
3547	NC_017473	TAC	2	6	228629	228634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818753
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3549	NC_017473	CGG	2	6	228648	228653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818753
3550	NC_017473	TGAT	2	8	228671	228678	25 %	50 %	25 %	0 %	385818753
3551	NC_017473	A	6	6	228699	228704	100 %	0 %	0 %	0 %	385818753
3552	NC_017473	CAC	2	6	228728	228733	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818753
3553	NC_017473	CCAG	2	8	228846	228853	25 %	0 %	25 %	50 %	385818753
3554	NC_017473	TTTGA	2	10	228937	228946	20 %	60 %	20 %	0 %	385818753
3555	NC_017473	TTG	2	6	228961	228966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818753
3556	NC_017473	GTT	2	6	228975	228980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818753
3557	NC_017473	ATT	2	6	228988	228993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818753
3558	NC_017473	GTT	2	6	228997	229002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818753
3559	NC_017473	TGG	2	6	229008	229013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818753
3560	NC_017473	TGT	2	6	229019	229024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818753
3561	NC_017473	TGG	2	6	229031	229036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818753
3562	NC_017473	A	7	7	229368	229374	100 %	0 %	0 %	0 %	385818754
3563	NC_017473	CTTT	2	8	229400	229407	0 %	75 %	0 %	25 %	385818754
3564	NC_017473	GTG	2	6	229438	229443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818754
3565	NC_017473	GTC	2	6	229444	229449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818754
3566	NC_017473	GATT	2	8	229495	229502	25 %	50 %	25 %	0 %	385818754
3567	NC_017473	TGA	2	6	229603	229608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818754
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3569	NC_017473	ATT	2	6	229707	229712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818754
3570	NC_017473	ATTT	2	8	229715	229722	25 %	75 %	0 %	0 %	385818754
3571	NC_017473	CGC	2	6	229778	229783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385818754
3572	NC_017473	TGA	2	6	229835	229840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818754
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3588	NC_017473	AACC	2	8	230712	230719	50 %	0 %	0 %	50 %	385818754
3589	NC_017473	ATG	2	6	230959	230964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818755
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3591	NC_017473	CAC	2	6	231078	231083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818755
3592	NC_017473	TTTG	2	8	231188	231195	0 %	75 %	25 %	0 %	385818755
3593	NC_017473	AGA	2	6	231217	231222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818755
3594	NC_017473	GCG	2	6	231228	231233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818755
3595	NC_017473	TGA	2	6	231275	231280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818755
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3597	NC_017473	T	8	8	231325	231332	0 %	100 %	0 %	0 %	385818755
3598	NC_017473	GT	3	6	231358	231363	0 %	50 %	50 %	0 %	385818755
3599	NC_017473	AGT	2	6	231578	231583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818755
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3601	NC_017473	CAT	2	6	231595	231600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818755
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3604	NC_017473	AATC	2	8	231660	231667	50 %	25 %	0 %	25 %	385818756
3605	NC_017473	TGA	2	6	231706	231711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818756
3606	NC_017473	TGA	2	6	231721	231726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818756
3607	NC_017473	T	7	7	231846	231852	0 %	100 %	0 %	0 %	385818756
3608	NC_017473	GAT	2	6	231863	231868	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818756
3609	NC_017473	CAA	2	6	231880	231885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818756
3610	NC_017473	GTT	2	6	231929	231934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818756
3611	NC_017473	AGTC	2	8	232013	232020	25 %	25 %	25 %	25 %	385818756
3612	NC_017473	ATG	2	6	232061	232066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818756
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3615	NC_017473	ATG	2	6	232250	232255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818756
3616	NC_017473	CGTTT	2	10	232257	232266	0 %	60 %	20 %	20 %	385818756
3617	NC_017473	ATT	2	6	232350	232355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818757
3618	NC_017473	TGC	2	6	232367	232372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818757
3619	NC_017473	GC	3	6	232385	232390	0 %	0 %	50 %	50 %	385818757
3620	NC_017473	AAAC	2	8	232407	232414	75 %	0 %	0 %	25 %	385818757
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