MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 49082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_017473	ATC	2	6	196788	196793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818725
3002	NC_017473	GGC	2	6	196812	196817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818725
3003	NC_017473	ACC	3	9	196827	196835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818725
3004	NC_017473	AAG	2	6	196872	196877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818725
3005	NC_017473	ATG	2	6	196960	196965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818725
3006	NC_017473	GCCA	2	8	197033	197040	25 %	0 %	25 %	50 %	385818725
3007	NC_017473	CTGG	2	8	197049	197056	0 %	25 %	50 %	25 %	385818725
3008	NC_017473	GGA	2	6	197123	197128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385818725
3009	NC_017473	TGAT	2	8	197146	197153	25 %	50 %	25 %	0 %	385818725
3010	NC_017473	GGTT	2	8	197275	197282	0 %	50 %	50 %	0 %	385818725
3011	NC_017473	GTT	2	6	197321	197326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818725
3012	NC_017473	ATG	2	6	197335	197340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818725
3013	NC_017473	AGG	2	6	197518	197523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385818725
3014	NC_017473	GCTG	2	8	197525	197532	0 %	25 %	50 %	25 %	385818725
3015	NC_017473	GAATAA	2	12	197541	197552	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385818725
3016	NC_017473	AAT	2	6	197617	197622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818726
3017	NC_017473	GAA	2	6	197629	197634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818726
3018	NC_017473	TGA	2	6	197685	197690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818726
3019	NC_017473	CTGG	2	8	197707	197714	0 %	25 %	50 %	25 %	385818726
3020	NC_017473	CAAA	2	8	197721	197728	75 %	0 %	0 %	25 %	385818726
3021	NC_017473	ATT	2	6	197779	197784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818726
3022	NC_017473	TGGC	2	8	197816	197823	0 %	25 %	50 %	25 %	385818726
3023	NC_017473	TCCA	2	8	197835	197842	25 %	25 %	0 %	50 %	385818726
3024	NC_017473	ATG	2	6	197869	197874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818726
3025	NC_017473	CGC	2	6	197915	197920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385818726
3026	NC_017473	ACT	2	6	198020	198025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818726
3027	NC_017473	GCA	2	6	198045	198050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818726
3028	NC_017473	CAAA	2	8	198054	198061	75 %	0 %	0 %	25 %	385818726
3029	NC_017473	AAG	2	6	198145	198150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818726
3030	NC_017473	CAAT	2	8	198152	198159	50 %	25 %	0 %	25 %	385818726
3031	NC_017473	CAA	2	6	198318	198323	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818726
3032	NC_017473	AGGCAA	2	12	198324	198335	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385818726
3033	NC_017473	ACTTC	2	10	198347	198356	20 %	40 %	0 %	40 %	385818726
3034	NC_017473	ACTA	2	8	198404	198411	50 %	25 %	0 %	25 %	385818726
3035	NC_017473	GAA	2	6	198602	198607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818727
3036	NC_017473	CAA	2	6	198626	198631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818727
3037	NC_017473	TGA	2	6	198694	198699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818727
3038	NC_017473	A	6	6	198729	198734	100 %	0 %	0 %	0 %	385818727
3039	NC_017473	GTAGA	2	10	198747	198756	40 %	20 %	40 %	0 %	385818727
3040	NC_017473	CAG	2	6	198797	198802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818728
3041	NC_017473	AAG	2	6	198967	198972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818728
3042	NC_017473	ATT	2	6	198973	198978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818728
3043	NC_017473	CAA	2	6	199047	199052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818728
3044	NC_017473	TGT	2	6	199092	199097	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818728
3045	NC_017473	GAT	2	6	199108	199113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818728
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3047	NC_017473	CGA	2	6	199163	199168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818728
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3049	NC_017473	GCA	2	6	199328	199333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818728
3050	NC_017473	GAA	2	6	199420	199425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818728
3051	NC_017473	AAG	2	6	199484	199489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818728
3052	NC_017473	GAA	3	9	199522	199530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818728
3053	NC_017473	GCA	2	6	199570	199575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818728
3054	NC_017473	CGA	2	6	199584	199589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818728
3055	NC_017473	GCTA	2	8	199615	199622	25 %	25 %	25 %	25 %	385818728
3056	NC_017473	CTT	2	6	199644	199649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818728
3057	NC_017473	CGTG	2	8	199672	199679	0 %	25 %	50 %	25 %	385818728
3058	NC_017473	ATT	2	6	199720	199725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818728
3059	NC_017473	AAG	2	6	199811	199816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818728
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3062	NC_017473	AACA	2	8	200004	200011	75 %	0 %	0 %	25 %	385818729
3063	NC_017473	TGA	2	6	200038	200043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818729
3064	NC_017473	GTC	2	6	200044	200049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818729
3065	NC_017473	CGG	2	6	200064	200069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818729
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3069	NC_017473	CGG	2	6	200199	200204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818729
3070	NC_017473	GAA	3	9	200207	200215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818729
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3092	NC_017473	GCG	2	6	201489	201494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818730
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3105	NC_017473	ACTG	2	8	202087	202094	25 %	25 %	25 %	25 %	385818730
3106	NC_017473	ATG	2	6	202101	202106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818730
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3108	NC_017473	GGC	2	6	202196	202201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818730
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3112	NC_017473	GGT	2	6	202451	202456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818730
3113	NC_017473	TTCA	2	8	202520	202527	25 %	50 %	0 %	25 %	385818730
3114	NC_017473	ATG	2	6	202563	202568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818730
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3119	NC_017473	TTG	2	6	202886	202891	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818731
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3121	NC_017473	TTG	2	6	202973	202978	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818731
3122	NC_017473	GCA	2	6	203029	203034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818731
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3483	NC_017473	ATC	2	6	225144	225149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818751
3484	NC_017473	CTG	2	6	225163	225168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818751
3485	NC_017473	GAT	2	6	225219	225224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818751
3486	NC_017473	TGAT	2	8	225229	225236	25 %	50 %	25 %	0 %	385818751
3487	NC_017473	GGC	2	6	225237	225242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818751
3488	NC_017473	TAT	2	6	225249	225254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818751
3489	NC_017473	GCT	2	6	225278	225283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818751
3490	NC_017473	GCT	2	6	225285	225290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818751
3491	NC_017473	GGC	2	6	225324	225329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818751
3492	NC_017473	TGG	2	6	225365	225370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818751
3493	NC_017473	GAT	2	6	225500	225505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818751
3494	NC_017473	GCG	2	6	225564	225569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818751
3495	NC_017473	GCTG	2	8	225607	225614	0 %	25 %	50 %	25 %	385818751
3496	NC_017473	GCC	2	6	225624	225629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385818751
3497	NC_017473	GAA	2	6	225708	225713	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818751
3498	NC_017473	TGA	2	6	225757	225762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818751
3499	NC_017473	GAA	2	6	225777	225782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818751
3500	NC_017473	GGC	2	6	225831	225836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818751

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