MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid2

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017472	TAGGA	2	10	1875	1884	40 %	20 %	40 %	0 %	385818463
2	NC_017472	TCCAA	2	10	2994	3003	40 %	20 %	0 %	40 %	385818464
3	NC_017472	ATATA	2	10	3849	3858	60 %	40 %	0 %	0 %	385818465
4	NC_017472	GAAAA	2	10	6108	6117	80 %	0 %	20 %	0 %	385818467
5	NC_017472	GCAAT	2	10	6862	6871	40 %	20 %	20 %	20 %	385818467
6	NC_017472	CTAAA	2	10	7831	7840	60 %	20 %	0 %	20 %	385818467
7	NC_017472	AAGAA	2	10	7922	7931	80 %	0 %	20 %	0 %	385818467
8	NC_017472	GCTTT	2	10	8804	8813	0 %	60 %	20 %	20 %	385818468
9	NC_017472	GAAAA	2	10	10158	10167	80 %	0 %	20 %	0 %	385818469
10	NC_017472	ATGGA	2	10	10914	10923	40 %	20 %	40 %	0 %	385818469
11	NC_017472	TTTGT	2	10	15189	15198	0 %	80 %	20 %	0 %	385818472
12	NC_017472	GAACT	2	10	16451	16460	40 %	20 %	20 %	20 %	385818473
13	NC_017472	TCAAA	2	10	19070	19079	60 %	20 %	0 %	20 %	385818475
14	NC_017472	AAGTT	2	10	19258	19267	40 %	40 %	20 %	0 %	385818475
15	NC_017472	CAGAT	2	10	21240	21249	40 %	20 %	20 %	20 %	385818476
16	NC_017472	AATTT	2	10	26595	26604	40 %	60 %	0 %	0 %	385818481
17	NC_017472	CAAAA	2	10	27581	27590	80 %	0 %	0 %	20 %	385818482
18	NC_017472	CAAGA	2	10	28491	28500	60 %	0 %	20 %	20 %	385818483
19	NC_017472	CAATT	2	10	31213	31222	40 %	40 %	0 %	20 %	385818484
20	NC_017472	GTGAA	2	10	31248	31257	40 %	20 %	40 %	0 %	385818484
21	NC_017472	AAATA	2	10	31434	31443	80 %	20 %	0 %	0 %	385818484
22	NC_017472	TAAAT	2	10	32674	32683	60 %	40 %	0 %	0 %	385818486
23	NC_017472	CTTTT	2	10	34147	34156	0 %	80 %	0 %	20 %	385818488
24	NC_017472	ATTTG	2	10	34395	34404	20 %	60 %	20 %	0 %	385818488
25	NC_017472	TTGTT	2	10	34738	34747	0 %	80 %	20 %	0 %	385818488
26	NC_017472	TTACA	2	10	43140	43149	40 %	40 %	0 %	20 %	385818499
27	NC_017472	AAAAT	2	10	48042	48051	80 %	20 %	0 %	0 %	385818503
28	NC_017472	TCTCT	2	10	48298	48307	0 %	60 %	0 %	40 %	385818503
29	NC_017472	GATAG	2	10	48473	48482	40 %	20 %	40 %	0 %	385818503
30	NC_017472	AATTG	2	10	48598	48607	40 %	40 %	20 %	0 %	385818503
31	NC_017472	ATTTT	2	10	48796	48805	20 %	80 %	0 %	0 %	385818503
32	NC_017472	AATGT	2	10	49867	49876	40 %	40 %	20 %	0 %	385818504
33	NC_017472	GCAAA	2	10	51304	51313	60 %	0 %	20 %	20 %	385818506
34	NC_017472	TACTC	2	10	51715	51724	20 %	40 %	0 %	40 %	385818507
35	NC_017472	AAACT	2	10	55027	55036	60 %	20 %	0 %	20 %	385818511
36	NC_017472	TCATG	2	10	55745	55754	20 %	40 %	20 %	20 %	385818512
37	NC_017472	GTACA	2	10	60750	60759	40 %	20 %	20 %	20 %	385818515
38	NC_017472	ACTTT	2	10	64456	64465	20 %	60 %	0 %	20 %	385818520
39	NC_017472	ATGGG	2	10	68144	68153	20 %	20 %	60 %	0 %	385818523
40	NC_017472	GTTTC	2	10	69595	69604	0 %	60 %	20 %	20 %	385818525
41	NC_017472	TTGAT	2	10	70604	70613	20 %	60 %	20 %	0 %	385818528
42	NC_017472	TTTGG	2	10	71382	71391	0 %	60 %	40 %	0 %	385818529
43	NC_017472	TCATG	2	10	73410	73419	20 %	40 %	20 %	20 %	385818530
44	NC_017472	TAAAT	2	10	74471	74480	60 %	40 %	0 %	0 %	385818531
45	NC_017472	TCTGC	2	10	74854	74863	0 %	40 %	20 %	40 %	385818531
46	NC_017472	AAGAA	2	10	75908	75917	80 %	0 %	20 %	0 %	385818532

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.