MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid2

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017472	TTTA	2	8	1509	1516	25 %	75 %	0 %	0 %	385818463
2	NC_017472	CTAA	2	8	2920	2927	50 %	25 %	0 %	25 %	385818464
3	NC_017472	AATC	2	8	3221	3228	50 %	25 %	0 %	25 %	385818464
4	NC_017472	CTTT	2	8	3334	3341	0 %	75 %	0 %	25 %	385818464
5	NC_017472	TTCT	2	8	3627	3634	0 %	75 %	0 %	25 %	385818464
6	NC_017472	TTCC	2	8	3639	3646	0 %	50 %	0 %	50 %	385818464
7	NC_017472	AATC	2	8	5650	5657	50 %	25 %	0 %	25 %	385818466
8	NC_017472	TTCA	2	8	6947	6954	25 %	50 %	0 %	25 %	385818467
9	NC_017472	AATA	2	8	7481	7488	75 %	25 %	0 %	0 %	385818467
10	NC_017472	TTGA	2	8	7512	7519	25 %	50 %	25 %	0 %	385818467
11	NC_017472	CCAA	2	8	8116	8123	50 %	0 %	0 %	50 %	385818468
12	NC_017472	ATGA	2	8	8347	8354	50 %	25 %	25 %	0 %	385818468
13	NC_017472	ACTT	2	8	8632	8639	25 %	50 %	0 %	25 %	385818468
14	NC_017472	TACA	2	8	9144	9151	50 %	25 %	0 %	25 %	385818468
15	NC_017472	TGAT	2	8	9203	9210	25 %	50 %	25 %	0 %	385818468
16	NC_017472	TCAA	2	8	9432	9439	50 %	25 %	0 %	25 %	385818468
17	NC_017472	ATGG	2	8	9685	9692	25 %	25 %	50 %	0 %	385818468
18	NC_017472	CTTT	2	8	9851	9858	0 %	75 %	0 %	25 %	385818468
19	NC_017472	TATT	2	8	10118	10125	25 %	75 %	0 %	0 %	385818469
20	NC_017472	CAAT	2	8	11249	11256	50 %	25 %	0 %	25 %	385818469
21	NC_017472	AACG	2	8	11329	11336	50 %	0 %	25 %	25 %	385818470
22	NC_017472	ACTT	2	8	11938	11945	25 %	50 %	0 %	25 %	385818470
23	NC_017472	TAAA	2	8	12002	12009	75 %	25 %	0 %	0 %	385818470
24	NC_017472	AATT	2	8	12071	12078	50 %	50 %	0 %	0 %	385818470
25	NC_017472	AACT	2	8	12119	12126	50 %	25 %	0 %	25 %	385818470
26	NC_017472	GCTA	2	8	12282	12289	25 %	25 %	25 %	25 %	385818470
27	NC_017472	TGAC	2	8	12350	12357	25 %	25 %	25 %	25 %	385818470
28	NC_017472	CGAC	2	8	12369	12376	25 %	0 %	25 %	50 %	385818470
29	NC_017472	AGCA	2	8	12383	12390	50 %	0 %	25 %	25 %	385818470
30	NC_017472	TCAT	2	8	12600	12607	25 %	50 %	0 %	25 %	385818470
31	NC_017472	AGAA	2	8	12662	12669	75 %	0 %	25 %	0 %	385818470
32	NC_017472	AATA	2	8	13297	13304	75 %	25 %	0 %	0 %	385818470
33	NC_017472	GGTT	2	8	13308	13315	0 %	50 %	50 %	0 %	385818470
34	NC_017472	ATGT	2	8	13339	13346	25 %	50 %	25 %	0 %	385818470
35	NC_017472	TAAA	2	8	13676	13683	75 %	25 %	0 %	0 %	385818470
36	NC_017472	GGAT	2	8	13845	13852	25 %	25 %	50 %	0 %	385818470
37	NC_017472	TTCA	2	8	13885	13892	25 %	50 %	0 %	25 %	385818470
38	NC_017472	AAAG	2	8	14110	14117	75 %	0 %	25 %	0 %	385818470
39	NC_017472	ATTG	2	8	14178	14185	25 %	50 %	25 %	0 %	385818470
40	NC_017472	TTTA	2	8	14707	14714	25 %	75 %	0 %	0 %	385818471
41	NC_017472	CTAT	2	8	14903	14910	25 %	50 %	0 %	25 %	385818471
42	NC_017472	TGGG	2	8	15281	15288	0 %	25 %	75 %	0 %	385818472
43	NC_017472	CAGG	2	8	15366	15373	25 %	0 %	50 %	25 %	385818472
44	NC_017472	TGTC	2	8	15375	15382	0 %	50 %	25 %	25 %	385818472
45	NC_017472	AATA	2	8	15924	15931	75 %	25 %	0 %	0 %	385818472
46	NC_017472	TTCT	2	8	16479	16486	0 %	75 %	0 %	25 %	385818473
47	NC_017472	ATTG	2	8	16522	16529	25 %	50 %	25 %	0 %	385818473
48	NC_017472	ATGG	2	8	17905	17912	25 %	25 %	50 %	0 %	385818475
49	NC_017472	AATT	2	8	17983	17990	50 %	50 %	0 %	0 %	385818475
50	NC_017472	GATT	2	8	18359	18366	25 %	50 %	25 %	0 %	385818475
51	NC_017472	GGAA	2	8	19109	19116	50 %	0 %	50 %	0 %	385818475
52	NC_017472	AGAA	2	8	20823	20830	75 %	0 %	25 %	0 %	385818476
53	NC_017472	TTTC	2	8	20918	20925	0 %	75 %	0 %	25 %	385818476
54	NC_017472	TTTA	2	8	21383	21390	25 %	75 %	0 %	0 %	385818476
55	NC_017472	AGGA	2	8	21718	21725	50 %	0 %	50 %	0 %	385818476
56	NC_017472	TCTA	2	8	23435	23442	25 %	50 %	0 %	25 %	385818477
57	NC_017472	AGAT	2	8	23534	23541	50 %	25 %	25 %	0 %	385818477
58	NC_017472	AAGA	2	8	23577	23584	75 %	0 %	25 %	0 %	385818477
59	NC_017472	AAAG	2	8	24078	24085	75 %	0 %	25 %	0 %	385818478
60	NC_017472	GAAG	2	8	24259	24266	50 %	0 %	50 %	0 %	385818478
61	NC_017472	GTAT	2	8	26688	26695	25 %	50 %	25 %	0 %	385818481
62	NC_017472	TAAA	2	8	27022	27029	75 %	25 %	0 %	0 %	385818481
63	NC_017472	ATGT	2	8	27509	27516	25 %	50 %	25 %	0 %	385818482
64	NC_017472	TAAA	2	8	28087	28094	75 %	25 %	0 %	0 %	385818483
65	NC_017472	TTAA	2	8	28853	28860	50 %	50 %	0 %	0 %	385818483
66	NC_017472	TTTG	2	8	30727	30734	0 %	75 %	25 %	0 %	385818484
67	NC_017472	TATT	2	8	31067	31074	25 %	75 %	0 %	0 %	385818484
68	NC_017472	AATT	2	8	31503	31510	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
69	NC_017472	AATT	2	8	31515	31522	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
70	NC_017472	ATTT	2	8	31719	31726	25 %	75 %	0 %	0 %	385818484
71	NC_017472	AAAT	2	8	31746	31753	75 %	25 %	0 %	0 %	385818484
72	NC_017472	ATTT	2	8	32007	32014	25 %	75 %	0 %	0 %	385818484
73	NC_017472	AATT	2	8	32138	32145	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
74	NC_017472	ATTC	2	8	32196	32203	25 %	50 %	0 %	25 %	385818484
75	NC_017472	TATT	2	8	32230	32237	25 %	75 %	0 %	0 %	385818484
76	NC_017472	ACAA	2	8	32465	32472	75 %	0 %	0 %	25 %	385818485
77	NC_017472	GTCT	2	8	32514	32521	0 %	50 %	25 %	25 %	385818485
78	NC_017472	CAAT	2	8	33454	33461	50 %	25 %	0 %	25 %	385818487
79	NC_017472	TGAT	2	8	34309	34316	25 %	50 %	25 %	0 %	385818488
80	NC_017472	ATAG	2	8	34468	34475	50 %	25 %	25 %	0 %	385818488
81	NC_017472	CGAT	2	8	35670	35677	25 %	25 %	25 %	25 %	385818491
82	NC_017472	AATT	2	8	35823	35830	50 %	50 %	0 %	0 %	385818491
83	NC_017472	AATC	2	8	37183	37190	50 %	25 %	0 %	25 %	385818494
84	NC_017472	GTGC	2	8	37335	37342	0 %	25 %	50 %	25 %	385818494
85	NC_017472	TTCA	2	8	37373	37380	25 %	50 %	0 %	25 %	385818494
86	NC_017472	TCAT	2	8	37407	37414	25 %	50 %	0 %	25 %	385818494
87	NC_017472	TCTT	2	8	38509	38516	0 %	75 %	0 %	25 %	385818495
88	NC_017472	GAAC	2	8	39053	39060	50 %	0 %	25 %	25 %	385818495
89	NC_017472	GCTT	2	8	40095	40102	0 %	50 %	25 %	25 %	385818496
90	NC_017472	TGGC	2	8	40103	40110	0 %	25 %	50 %	25 %	385818496
91	NC_017472	CTGT	2	8	42354	42361	0 %	50 %	25 %	25 %	385818498
92	NC_017472	TTGC	2	8	43663	43670	0 %	50 %	25 %	25 %	385818500
93	NC_017472	AATC	2	8	44123	44130	50 %	25 %	0 %	25 %	385818500
94	NC_017472	CTTT	2	8	44153	44160	0 %	75 %	0 %	25 %	385818500
95	NC_017472	GGCA	2	8	44567	44574	25 %	0 %	50 %	25 %	385818500
96	NC_017472	TTTC	2	8	44687	44694	0 %	75 %	0 %	25 %	385818500
97	NC_017472	TACT	2	8	44780	44787	25 %	50 %	0 %	25 %	385818500
98	NC_017472	GAAA	2	8	44875	44882	75 %	0 %	25 %	0 %	385818500
99	NC_017472	AAAG	2	8	44922	44929	75 %	0 %	25 %	0 %	385818500
100	NC_017472	TTTA	2	8	45180	45187	25 %	75 %	0 %	0 %	385818500
101	NC_017472	TAAA	2	8	45341	45348	75 %	25 %	0 %	0 %	385818500
102	NC_017472	TAAA	2	8	45636	45643	75 %	25 %	0 %	0 %	385818500
103	NC_017472	TCAA	2	8	45877	45884	50 %	25 %	0 %	25 %	385818500
104	NC_017472	ATGA	2	8	46527	46534	50 %	25 %	25 %	0 %	385818501
105	NC_017472	AATT	2	8	46736	46743	50 %	50 %	0 %	0 %	385818501
106	NC_017472	TTTG	2	8	48133	48140	0 %	75 %	25 %	0 %	385818503
107	NC_017472	AGTA	2	8	48718	48725	50 %	25 %	25 %	0 %	385818503
108	NC_017472	TTGT	2	8	48731	48738	0 %	75 %	25 %	0 %	385818503
109	NC_017472	ATTT	2	8	49294	49301	25 %	75 %	0 %	0 %	385818504
110	NC_017472	ATTT	2	8	50216	50223	25 %	75 %	0 %	0 %	385818505
111	NC_017472	TCTT	2	8	50489	50496	0 %	75 %	0 %	25 %	385818505
112	NC_017472	ATCA	2	8	51148	51155	50 %	25 %	0 %	25 %	385818506
113	NC_017472	ACAG	2	8	51364	51371	50 %	0 %	25 %	25 %	385818506
114	NC_017472	TGCT	2	8	51488	51495	0 %	50 %	25 %	25 %	385818506
115	NC_017472	TTAA	2	8	51602	51609	50 %	50 %	0 %	0 %	385818506
116	NC_017472	AATG	2	8	53017	53024	50 %	25 %	25 %	0 %	385818509
117	NC_017472	TAAA	2	8	53787	53794	75 %	25 %	0 %	0 %	385818509
118	NC_017472	TCAA	2	8	54093	54100	50 %	25 %	0 %	25 %	385818509
119	NC_017472	TTGA	2	8	54146	54153	25 %	50 %	25 %	0 %	385818509
120	NC_017472	AGAA	2	8	54216	54223	75 %	0 %	25 %	0 %	385818509
121	NC_017472	GGTG	2	8	54426	54433	0 %	25 %	75 %	0 %	385818510
122	NC_017472	TCAT	2	8	55107	55114	25 %	50 %	0 %	25 %	385818511
123	NC_017472	TTGA	2	8	55350	55357	25 %	50 %	25 %	0 %	385818512
124	NC_017472	CTAC	2	8	55483	55490	25 %	25 %	0 %	50 %	385818512
125	NC_017472	CTTT	2	8	55664	55671	0 %	75 %	0 %	25 %	385818512
126	NC_017472	ATGA	2	8	55800	55807	50 %	25 %	25 %	0 %	385818512
127	NC_017472	AACG	2	8	56097	56104	50 %	0 %	25 %	25 %	385818512
128	NC_017472	TAAA	2	8	56169	56176	75 %	25 %	0 %	0 %	385818512
129	NC_017472	GGAC	2	8	57280	57287	25 %	0 %	50 %	25 %	385818513
130	NC_017472	CTTC	2	8	57337	57344	0 %	50 %	0 %	50 %	385818513
131	NC_017472	GATG	2	8	57845	57852	25 %	25 %	50 %	0 %	385818513
132	NC_017472	TCTA	2	8	57952	57959	25 %	50 %	0 %	25 %	385818513
133	NC_017472	TCCA	2	8	58043	58050	25 %	25 %	0 %	50 %	385818513
134	NC_017472	GACA	2	8	58067	58074	50 %	0 %	25 %	25 %	385818513
135	NC_017472	TTCT	2	8	58315	58322	0 %	75 %	0 %	25 %	385818513
136	NC_017472	CCAT	2	8	58447	58454	25 %	25 %	0 %	50 %	385818513
137	NC_017472	CATC	2	8	58483	58490	25 %	25 %	0 %	50 %	385818513
138	NC_017472	CTGT	2	8	58494	58501	0 %	50 %	25 %	25 %	385818513
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.