MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 plasmid2

Total Repeats: 1244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017472	AAATA	2	10	31434	31443	80 %	20 %	0 %	0 %	385818484
502	NC_017472	CCA	2	6	31486	31491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818484
503	NC_017472	TAA	2	6	31493	31498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818484
504	NC_017472	AATT	2	8	31503	31510	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
505	NC_017472	AATT	2	8	31515	31522	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
506	NC_017472	AAT	2	6	31527	31532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818484
507	NC_017472	CTA	2	6	31537	31542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818484
508	NC_017472	T	6	6	31593	31598	0 %	100 %	0 %	0 %	385818484
509	NC_017472	ATTT	2	8	31719	31726	25 %	75 %	0 %	0 %	385818484
510	NC_017472	AAAT	2	8	31746	31753	75 %	25 %	0 %	0 %	385818484
511	NC_017472	GTA	2	6	31772	31777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818484
512	NC_017472	A	8	8	31792	31799	100 %	0 %	0 %	0 %	385818484
513	NC_017472	AT	3	6	31817	31822	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
514	NC_017472	AGA	2	6	31839	31844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818484
515	NC_017472	T	7	7	31941	31947	0 %	100 %	0 %	0 %	385818484
516	NC_017472	ATTT	2	8	32007	32014	25 %	75 %	0 %	0 %	385818484
517	NC_017472	A	7	7	32046	32052	100 %	0 %	0 %	0 %	385818484
518	NC_017472	TAT	2	6	32091	32096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818484
519	NC_017472	AATT	2	8	32138	32145	50 %	50 %	0 %	0 %	385818484
520	NC_017472	TAA	2	6	32189	32194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818484
521	NC_017472	ATTC	2	8	32196	32203	25 %	50 %	0 %	25 %	385818484
522	NC_017472	TATT	2	8	32230	32237	25 %	75 %	0 %	0 %	385818484
523	NC_017472	AAT	2	6	32295	32300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818485
524	NC_017472	TCT	2	6	32302	32307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818485
525	NC_017472	ACAA	2	8	32465	32472	75 %	0 %	0 %	25 %	385818485
526	NC_017472	GTCT	2	8	32514	32521	0 %	50 %	25 %	25 %	385818485
527	NC_017472	GAA	2	6	32530	32535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818485
528	NC_017472	T	7	7	32579	32585	0 %	100 %	0 %	0 %	385818485
529	NC_017472	ACT	2	6	32586	32591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818485
530	NC_017472	ATA	2	6	32596	32601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818485
531	NC_017472	TAAAT	2	10	32674	32683	60 %	40 %	0 %	0 %	385818486
532	NC_017472	TGA	2	6	32684	32689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818486
533	NC_017472	TTG	2	6	32747	32752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818486
534	NC_017472	GTT	3	9	32759	32767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818486
535	NC_017472	T	6	6	32781	32786	0 %	100 %	0 %	0 %	385818486
536	NC_017472	TGA	2	6	33033	33038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818487
537	NC_017472	TG	3	6	33074	33079	0 %	50 %	50 %	0 %	385818487
538	NC_017472	AC	3	6	33129	33134	50 %	0 %	0 %	50 %	385818487
539	NC_017472	A	6	6	33143	33148	100 %	0 %	0 %	0 %	385818487
540	NC_017472	GTA	2	6	33226	33231	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818487
541	NC_017472	ATG	2	6	33314	33319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818487
542	NC_017472	CAAT	2	8	33454	33461	50 %	25 %	0 %	25 %	385818487
543	NC_017472	GCT	2	6	33473	33478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818487
544	NC_017472	TAT	2	6	33513	33518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818487
545	NC_017472	TTC	2	6	33536	33541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818487
546	NC_017472	GAA	2	6	33562	33567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818487
547	NC_017472	TAC	2	6	33598	33603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818487
548	NC_017472	GAA	2	6	33658	33663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818487
549	NC_017472	ATC	2	6	33704	33709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818487
550	NC_017472	A	7	7	33760	33766	100 %	0 %	0 %	0 %	385818487
551	NC_017472	ATT	2	6	33777	33782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818487
552	NC_017472	T	7	7	33911	33917	0 %	100 %	0 %	0 %	385818488
553	NC_017472	TAA	2	6	33930	33935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818488
554	NC_017472	CTT	2	6	33958	33963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818488
555	NC_017472	ATA	2	6	33967	33972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818488
556	NC_017472	AGG	2	6	34092	34097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385818488
557	NC_017472	CTTTT	2	10	34147	34156	0 %	80 %	0 %	20 %	385818488
558	NC_017472	GGT	2	6	34259	34264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818488
559	NC_017472	TTC	3	9	34282	34290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818488
560	NC_017472	TGAT	2	8	34309	34316	25 %	50 %	25 %	0 %	385818488
561	NC_017472	ATT	2	6	34378	34383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818488
562	NC_017472	ATTTG	2	10	34395	34404	20 %	60 %	20 %	0 %	385818488
563	NC_017472	T	8	8	34407	34414	0 %	100 %	0 %	0 %	385818488
564	NC_017472	ATAG	2	8	34468	34475	50 %	25 %	25 %	0 %	385818488
565	NC_017472	AAT	2	6	34516	34521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818488
566	NC_017472	TTA	2	6	34640	34645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818488
567	NC_017472	TTGTT	2	10	34738	34747	0 %	80 %	20 %	0 %	385818488
568	NC_017472	GCT	2	6	35142	35147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818489
569	NC_017472	AGC	2	6	35181	35186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818489
570	NC_017472	GGC	2	6	35219	35224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818489
571	NC_017472	ATA	2	6	35235	35240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818489
572	NC_017472	TTC	2	6	35410	35415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818490
573	NC_017472	AGT	2	6	35441	35446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818490
574	NC_017472	TTC	2	6	35469	35474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818490
575	NC_017472	TCT	2	6	35660	35665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818491
576	NC_017472	CGAT	2	8	35670	35677	25 %	25 %	25 %	25 %	385818491
577	NC_017472	CAG	2	6	35707	35712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818491
578	NC_017472	ATC	2	6	35743	35748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818491
579	NC_017472	TAA	2	6	35753	35758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818491
580	NC_017472	AATT	2	8	35823	35830	50 %	50 %	0 %	0 %	385818491
581	NC_017472	ATA	2	6	36069	36074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818492
582	NC_017472	TGA	2	6	36088	36093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818492
583	NC_017472	GAA	2	6	36631	36636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818493
584	NC_017472	TGA	2	6	36688	36693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818493
585	NC_017472	AATC	2	8	37183	37190	50 %	25 %	0 %	25 %	385818494
586	NC_017472	AGT	2	6	37223	37228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818494
587	NC_017472	CAA	2	6	37279	37284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818494
588	NC_017472	GTGC	2	8	37335	37342	0 %	25 %	50 %	25 %	385818494
589	NC_017472	TTCA	2	8	37373	37380	25 %	50 %	0 %	25 %	385818494
590	NC_017472	TCAT	2	8	37407	37414	25 %	50 %	0 %	25 %	385818494
591	NC_017472	GAA	2	6	37459	37464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818494
592	NC_017472	AGT	2	6	37555	37560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818494
593	NC_017472	ATT	2	6	37622	37627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818494
594	NC_017472	TAG	3	9	37650	37658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818494
595	NC_017472	TCA	2	6	37851	37856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818494
596	NC_017472	GTA	2	6	37945	37950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818495
597	NC_017472	CTA	2	6	37952	37957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818495
598	NC_017472	CTT	2	6	37979	37984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818495
599	NC_017472	CTG	2	6	38059	38064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818495
600	NC_017472	TGT	2	6	38075	38080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818495
601	NC_017472	TCT	2	6	38209	38214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818495
602	NC_017472	TTG	2	6	38217	38222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818495
603	NC_017472	TAG	2	6	38306	38311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818495
604	NC_017472	CAG	2	6	38324	38329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818495
605	NC_017472	AAG	2	6	38344	38349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818495
606	NC_017472	TTG	2	6	38458	38463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818495
607	NC_017472	TCTT	2	8	38509	38516	0 %	75 %	0 %	25 %	385818495
608	NC_017472	GAT	2	6	38576	38581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818495
609	NC_017472	ATC	2	6	38622	38627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818495
610	NC_017472	GAA	2	6	38651	38656	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818495
611	NC_017472	TAA	2	6	38669	38674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818495
612	NC_017472	T	7	7	38700	38706	0 %	100 %	0 %	0 %	385818495
613	NC_017472	TTA	2	6	38746	38751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818495
614	NC_017472	TAT	2	6	38804	38809	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818495
615	NC_017472	A	6	6	38842	38847	100 %	0 %	0 %	0 %	385818495
616	NC_017472	CTT	2	6	38860	38865	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818495
617	NC_017472	TAA	2	6	38868	38873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818495
618	NC_017472	C	6	6	38921	38926	0 %	0 %	0 %	100 %	385818495
619	NC_017472	TTC	2	6	38967	38972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818495
620	NC_017472	T	6	6	38980	38985	0 %	100 %	0 %	0 %	385818495
621	NC_017472	T	6	6	39031	39036	0 %	100 %	0 %	0 %	385818495
622	NC_017472	GA	3	6	39043	39048	50 %	0 %	50 %	0 %	385818495
623	NC_017472	GAAC	2	8	39053	39060	50 %	0 %	25 %	25 %	385818495
624	NC_017472	TCA	2	6	39064	39069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818495
625	NC_017472	TAA	2	6	39156	39161	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385818495
626	NC_017472	TCA	2	6	39334	39339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818495
627	NC_017472	TTA	2	6	39358	39363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818495
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629	NC_017472	ATC	2	6	39714	39719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818495
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