MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus amylovorus GRL1118 chromosome

Total Repeats: 4361

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017470	TTTA	2	8	506	513	25 %	75 %	0 %	0 %	385816612
2	NC_017470	GCAA	2	8	551	558	50 %	0 %	25 %	25 %	385816612
3	NC_017470	TCTG	2	8	836	843	0 %	50 %	25 %	25 %	385816612
4	NC_017470	AAAG	2	8	1871	1878	75 %	0 %	25 %	0 %	385816613
5	NC_017470	CCGA	2	8	2345	2352	25 %	0 %	25 %	50 %	385816613
6	NC_017470	ACGC	2	8	2420	2427	25 %	0 %	25 %	50 %	385816613
7	NC_017470	ATTT	2	8	3301	3308	25 %	75 %	0 %	0 %	385816615
8	NC_017470	AATT	2	8	3350	3357	50 %	50 %	0 %	0 %	385816615
9	NC_017470	GTAT	2	8	4424	4431	25 %	50 %	25 %	0 %	385816616
10	NC_017470	ACGA	2	8	4496	4503	50 %	0 %	25 %	25 %	385816616
11	NC_017470	CTAT	2	8	5081	5088	25 %	50 %	0 %	25 %	385816616
12	NC_017470	GCTG	2	8	5580	5587	0 %	25 %	50 %	25 %	385816616
13	NC_017470	CCAC	2	8	6517	6524	25 %	0 %	0 %	75 %	385816617
14	NC_017470	ATTT	2	8	6539	6546	25 %	75 %	0 %	0 %	385816617
15	NC_017470	GTTG	2	8	6589	6596	0 %	50 %	50 %	0 %	385816617
16	NC_017470	CTTG	2	8	6781	6788	0 %	50 %	25 %	25 %	385816617
17	NC_017470	AGAA	2	8	7666	7673	75 %	0 %	25 %	0 %	385816617
18	NC_017470	TTGA	2	8	7781	7788	25 %	50 %	25 %	0 %	385816617
19	NC_017470	GGCA	2	8	10456	10463	25 %	0 %	50 %	25 %	385816621
20	NC_017470	CATG	2	8	10873	10880	25 %	25 %	25 %	25 %	385816621
21	NC_017470	CAGC	2	8	11738	11745	25 %	0 %	25 %	50 %	385816621
22	NC_017470	TGAC	2	8	11763	11770	25 %	25 %	25 %	25 %	385816621
23	NC_017470	TGCT	2	8	11787	11794	0 %	50 %	25 %	25 %	385816621
24	NC_017470	GAAC	2	8	11933	11940	50 %	0 %	25 %	25 %	385816621
25	NC_017470	CAAG	2	8	12581	12588	50 %	0 %	25 %	25 %	385816622
26	NC_017470	TGAT	2	8	12773	12780	25 %	50 %	25 %	0 %	385816623
27	NC_017470	TGAT	2	8	13545	13552	25 %	50 %	25 %	0 %	385816623
28	NC_017470	TGAC	2	8	15084	15091	25 %	25 %	25 %	25 %	385816624
29	NC_017470	CTTA	2	8	15482	15489	25 %	50 %	0 %	25 %	385816625
30	NC_017470	GATG	2	8	15912	15919	25 %	25 %	50 %	0 %	385816625
31	NC_017470	CTAA	2	8	16117	16124	50 %	25 %	0 %	25 %	385816625
32	NC_017470	AAGA	2	8	16177	16184	75 %	0 %	25 %	0 %	385816625
33	NC_017470	GTAA	2	8	16377	16384	50 %	25 %	25 %	0 %	385816625
34	NC_017470	TCGT	2	8	16979	16986	0 %	50 %	25 %	25 %	385816626
35	NC_017470	TCGT	2	8	17300	17307	0 %	50 %	25 %	25 %	385816626
36	NC_017470	TATT	2	8	18081	18088	25 %	75 %	0 %	0 %	385816629
37	NC_017470	AGGA	2	8	19082	19089	50 %	0 %	50 %	0 %	385816629
38	NC_017470	AGAT	2	8	19203	19210	50 %	25 %	25 %	0 %	385816629
39	NC_017470	TTGA	2	8	19509	19516	25 %	50 %	25 %	0 %	385816630
40	NC_017470	TTGC	2	8	22155	22162	0 %	50 %	25 %	25 %	385816634
41	NC_017470	GTAG	2	8	23065	23072	25 %	25 %	50 %	0 %	385816635
42	NC_017470	GTTC	2	8	23359	23366	0 %	50 %	25 %	25 %	385816635
43	NC_017470	CTTT	2	8	23413	23420	0 %	75 %	0 %	25 %	385816635
44	NC_017470	CTTT	2	8	25557	25564	0 %	75 %	0 %	25 %	385816637
45	NC_017470	GATG	2	8	25612	25619	25 %	25 %	50 %	0 %	385816637
46	NC_017470	TTTG	2	8	27112	27119	0 %	75 %	25 %	0 %	385816638
47	NC_017470	TGGT	2	8	27430	27437	0 %	50 %	50 %	0 %	385816638
48	NC_017470	AAAG	2	8	27739	27746	75 %	0 %	25 %	0 %	385816638
49	NC_017470	CAAA	2	8	27771	27778	75 %	0 %	0 %	25 %	385816638
50	NC_017470	GGTA	2	8	28461	28468	25 %	25 %	50 %	0 %	385816640
51	NC_017470	AAAT	2	8	28694	28701	75 %	25 %	0 %	0 %	385816640
52	NC_017470	TTGT	2	8	28954	28961	0 %	75 %	25 %	0 %	385816641
53	NC_017470	TGTT	2	8	29288	29295	0 %	75 %	25 %	0 %	385816641
54	NC_017470	TCTT	2	8	29436	29443	0 %	75 %	0 %	25 %	385816642
55	NC_017470	GCTT	2	8	29476	29483	0 %	50 %	25 %	25 %	385816642
56	NC_017470	TGGG	2	8	29919	29926	0 %	25 %	75 %	0 %	385816642
57	NC_017470	TTGG	2	8	30811	30818	0 %	50 %	50 %	0 %	385816642
58	NC_017470	TTGA	2	8	30952	30959	25 %	50 %	25 %	0 %	385816642
59	NC_017470	AGGA	2	8	31093	31100	50 %	0 %	50 %	0 %	385816642
60	NC_017470	TTGT	2	8	31886	31893	0 %	75 %	25 %	0 %	385816643
61	NC_017470	ATTT	2	8	31931	31938	25 %	75 %	0 %	0 %	385816643
62	NC_017470	TTAC	2	8	31939	31946	25 %	50 %	0 %	25 %	385816643
63	NC_017470	CGTA	2	8	32152	32159	25 %	25 %	25 %	25 %	385816643
64	NC_017470	TTGA	2	8	32184	32191	25 %	50 %	25 %	0 %	385816643
65	NC_017470	CGCA	2	8	32875	32882	25 %	0 %	25 %	50 %	385816644
66	NC_017470	ATTG	2	8	33385	33392	25 %	50 %	25 %	0 %	385816644
67	NC_017470	CCAC	2	8	33482	33489	25 %	0 %	0 %	75 %	385816645
68	NC_017470	AATC	2	8	33538	33545	50 %	25 %	0 %	25 %	385816645
69	NC_017470	GGTT	2	8	33997	34004	0 %	50 %	50 %	0 %	385816646
70	NC_017470	AAAG	2	8	34581	34588	75 %	0 %	25 %	0 %	385816646
71	NC_017470	TCAA	2	8	34761	34768	50 %	25 %	0 %	25 %	385816646
72	NC_017470	TTCA	2	8	34883	34890	25 %	50 %	0 %	25 %	385816646
73	NC_017470	TCAT	2	8	34909	34916	25 %	50 %	0 %	25 %	385816646
74	NC_017470	GGTA	2	8	35079	35086	25 %	25 %	50 %	0 %	385816646
75	NC_017470	AAAT	2	8	35650	35657	75 %	25 %	0 %	0 %	385816647
76	NC_017470	GGCT	2	8	36129	36136	0 %	25 %	50 %	25 %	385816648
77	NC_017470	GAAT	2	8	36405	36412	50 %	25 %	25 %	0 %	385816648
78	NC_017470	ATTC	2	8	36744	36751	25 %	50 %	0 %	25 %	385816648
79	NC_017470	AAGT	2	8	37520	37527	50 %	25 %	25 %	0 %	385816649
80	NC_017470	GAGC	2	8	38225	38232	25 %	0 %	50 %	25 %	385816650
81	NC_017470	ACCA	2	8	38329	38336	50 %	0 %	0 %	50 %	385816650
82	NC_017470	TAAC	2	8	38517	38524	50 %	25 %	0 %	25 %	385816650
83	NC_017470	CTTT	2	8	38750	38757	0 %	75 %	0 %	25 %	385816651
84	NC_017470	GGTA	2	8	39051	39058	25 %	25 %	50 %	0 %	385816651
85	NC_017470	ACTG	2	8	39357	39364	25 %	25 %	25 %	25 %	385816651
86	NC_017470	GTTT	2	8	39646	39653	0 %	75 %	25 %	0 %	385816651
87	NC_017470	CTTG	2	8	42379	42386	0 %	50 %	25 %	25 %	385816653
88	NC_017470	AAGT	2	8	42411	42418	50 %	25 %	25 %	0 %	385816653
89	NC_017470	CGAT	2	8	43459	43466	25 %	25 %	25 %	25 %	385816654
90	NC_017470	AGAA	2	8	44102	44109	75 %	0 %	25 %	0 %	385816655
91	NC_017470	TACT	2	8	44298	44305	25 %	50 %	0 %	25 %	385816655
92	NC_017470	GATT	2	8	44700	44707	25 %	50 %	25 %	0 %	385816655
93	NC_017470	GGAT	2	8	45230	45237	25 %	25 %	50 %	0 %	385816656
94	NC_017470	GCTT	2	8	45952	45959	0 %	50 %	25 %	25 %	385816657
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97	NC_017470	TATT	2	8	49903	49910	25 %	75 %	0 %	0 %	385816659
98	NC_017470	AGTT	2	8	49998	50005	25 %	50 %	25 %	0 %	385816659
99	NC_017470	CAGA	2	8	50464	50471	50 %	0 %	25 %	25 %	385816659
100	NC_017470	TGAT	2	8	50513	50520	25 %	50 %	25 %	0 %	385816659
101	NC_017470	GCAA	2	8	50840	50847	50 %	0 %	25 %	25 %	385816659
102	NC_017470	TGAA	2	8	51671	51678	50 %	25 %	25 %	0 %	385816659
103	NC_017470	CAGT	2	8	51688	51695	25 %	25 %	25 %	25 %	385816659
104	NC_017470	TGAA	2	8	51809	51816	50 %	25 %	25 %	0 %	385816659
105	NC_017470	TTGT	2	8	52195	52202	0 %	75 %	25 %	0 %	385816659
106	NC_017470	AGCC	2	8	52301	52308	25 %	0 %	25 %	50 %	385816659
107	NC_017470	ATTT	2	8	52361	52368	25 %	75 %	0 %	0 %	385816659
108	NC_017470	ACTT	2	8	52675	52682	25 %	50 %	0 %	25 %	385816660
109	NC_017470	CGCT	2	8	53199	53206	0 %	25 %	25 %	50 %	385816660
110	NC_017470	TCAT	2	8	53220	53227	25 %	50 %	0 %	25 %	385816660
111	NC_017470	TACA	2	8	53640	53647	50 %	25 %	0 %	25 %	385816661
112	NC_017470	TGAA	2	8	53655	53662	50 %	25 %	25 %	0 %	385816661
113	NC_017470	AACC	2	8	53944	53951	50 %	0 %	0 %	50 %	385816661
114	NC_017470	AGAA	2	8	54080	54087	75 %	0 %	25 %	0 %	385816661
115	NC_017470	ATAG	2	8	54725	54732	50 %	25 %	25 %	0 %	385816661
116	NC_017470	CGAA	2	8	55199	55206	50 %	0 %	25 %	25 %	385816662
117	NC_017470	TTTG	2	8	61008	61015	0 %	75 %	25 %	0 %	385816664
118	NC_017470	GCTG	2	8	61100	61107	0 %	25 %	50 %	25 %	385816664
119	NC_017470	CAAT	2	8	61425	61432	50 %	25 %	0 %	25 %	385816664
120	NC_017470	TCAG	2	8	61677	61684	25 %	25 %	25 %	25 %	385816664
121	NC_017470	AATT	2	8	62097	62104	50 %	50 %	0 %	0 %	385816665
122	NC_017470	CAGT	2	8	62133	62140	25 %	25 %	25 %	25 %	385816666
123	NC_017470	AATG	2	8	62410	62417	50 %	25 %	25 %	0 %	385816666
124	NC_017470	CTTG	2	8	62896	62903	0 %	50 %	25 %	25 %	385816666
125	NC_017470	TAAA	2	8	63231	63238	75 %	25 %	0 %	0 %	385816666
126	NC_017470	TTTA	2	8	63868	63875	25 %	75 %	0 %	0 %	385816667
127	NC_017470	CCAT	2	8	66106	66113	25 %	25 %	0 %	50 %	385816670
128	NC_017470	CAGC	2	8	67221	67228	25 %	0 %	25 %	50 %	385816671
129	NC_017470	GTTT	2	8	67304	67311	0 %	75 %	25 %	0 %	385816671
130	NC_017470	TCTT	2	8	68234	68241	0 %	75 %	0 %	25 %	385816673
131	NC_017470	GAAT	2	8	68315	68322	50 %	25 %	25 %	0 %	385816673
132	NC_017470	TTGC	2	8	68493	68500	0 %	50 %	25 %	25 %	385816673
133	NC_017470	CATT	2	8	68516	68523	25 %	50 %	0 %	25 %	385816673
134	NC_017470	ATGA	2	8	69571	69578	50 %	25 %	25 %	0 %	385816674
135	NC_017470	ATTA	2	8	69724	69731	50 %	50 %	0 %	0 %	385816674
136	NC_017470	ATCA	2	8	69908	69915	50 %	25 %	0 %	25 %	385816674
137	NC_017470	AAGA	2	8	70054	70061	75 %	0 %	25 %	0 %	385816675
138	NC_017470	GTTT	2	8	70660	70667	0 %	75 %	25 %	0 %	385816675
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