MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus helveticus H10 plasmid pH10

Total Repeats: 266

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017468	TAT	2	6	289	294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814793
2	NC_017468	ATT	2	6	311	316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814793
3	NC_017468	AAT	2	6	326	331	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814793
4	NC_017468	CTT	2	6	364	369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814793
5	NC_017468	TGA	2	6	387	392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814793
6	NC_017468	CAG	2	6	393	398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814793
7	NC_017468	AGA	2	6	403	408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814793
8	NC_017468	AGA	2	6	515	520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814793
9	NC_017468	AAG	2	6	536	541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814793
10	NC_017468	CAG	3	9	743	751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814793
11	NC_017468	AAG	2	6	839	844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814793
12	NC_017468	ATT	2	6	881	886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814793
13	NC_017468	ATC	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814793
14	NC_017468	TGA	2	6	1057	1062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814793
15	NC_017468	GCA	2	6	1081	1086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814793
16	NC_017468	CTT	2	6	1093	1098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814793
17	NC_017468	TGA	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814793
18	NC_017468	TCG	2	6	1303	1308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814793
19	NC_017468	GCT	2	6	1365	1370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814793
20	NC_017468	GAA	2	6	1541	1546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814793
21	NC_017468	TCA	2	6	1603	1608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814793
22	NC_017468	CAG	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814793
23	NC_017468	ACT	2	6	2178	2183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814794
24	NC_017468	ACA	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814794
25	NC_017468	AAT	2	6	2216	2221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814794
26	NC_017468	ATA	2	6	2295	2300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814794
27	NC_017468	CAA	2	6	2368	2373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814794
28	NC_017468	GTC	2	6	2934	2939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814795
29	NC_017468	TGT	2	6	3006	3011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814795
30	NC_017468	ATC	2	6	3020	3025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814795
31	NC_017468	CTG	2	6	3062	3067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814795
32	NC_017468	TGC	2	6	3087	3092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814795
33	NC_017468	GAT	2	6	3101	3106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814795
34	NC_017468	ATG	2	6	3147	3152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814795
35	NC_017468	TCA	2	6	3160	3165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814795
36	NC_017468	GTT	2	6	3272	3277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814795
37	NC_017468	AAT	2	6	3390	3395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814795
38	NC_017468	AAG	2	6	3659	3664	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814796
39	NC_017468	TTG	2	6	3890	3895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814796
40	NC_017468	TTC	2	6	4008	4013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814796
41	NC_017468	TTA	2	6	4019	4024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814796
42	NC_017468	TTC	2	6	4038	4043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814796
43	NC_017468	ATC	2	6	4149	4154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814796
44	NC_017468	CAG	2	6	4166	4171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814796
45	NC_017468	CTT	2	6	4172	4177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814796
46	NC_017468	CTT	3	9	4463	4471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814796
47	NC_017468	ATT	3	9	4492	4500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814796
48	NC_017468	TGA	2	6	5130	5135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814797
49	NC_017468	ATG	2	6	5147	5152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814797
50	NC_017468	TTC	2	6	5167	5172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814797
51	NC_017468	TCA	2	6	5439	5444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814797
52	NC_017468	TGA	2	6	5481	5486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814797
53	NC_017468	GGC	2	6	5513	5518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385814797
54	NC_017468	ACC	2	6	5590	5595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385814797
55	NC_017468	CAG	2	6	5827	5832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814797
56	NC_017468	AAG	2	6	5912	5917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814797
57	NC_017468	ATT	2	6	5951	5956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814797
58	NC_017468	GGC	2	6	6006	6011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385814797
59	NC_017468	CAC	2	6	6022	6027	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385814797
60	NC_017468	CAA	2	6	6154	6159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814797
61	NC_017468	CAA	2	6	6247	6252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814797
62	NC_017468	TTA	2	6	6364	6369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814797
63	NC_017468	GGC	2	6	6373	6378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385814797
64	NC_017468	ATT	2	6	6449	6454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814798
65	NC_017468	GCG	2	6	6481	6486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385814798
66	NC_017468	ATG	2	6	6813	6818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814799
67	NC_017468	CAG	2	6	6873	6878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814799
68	NC_017468	CAA	2	6	6906	6911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814799
69	NC_017468	AAC	2	6	6996	7001	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814799
70	NC_017468	CAC	2	6	7019	7024	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385814799
71	NC_017468	CAA	2	6	7311	7316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814800
72	NC_017468	ATG	2	6	7334	7339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814800
73	NC_017468	TAA	2	6	7380	7385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814800
74	NC_017468	AAC	2	6	7416	7421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385814800
75	NC_017468	ATA	2	6	7510	7515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814800
76	NC_017468	ATT	2	6	7545	7550	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814800
77	NC_017468	TCA	2	6	7618	7623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814800
78	NC_017468	CTG	2	6	7632	7637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814800
79	NC_017468	GAT	2	6	7667	7672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814800
80	NC_017468	ATT	2	6	7744	7749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814800
81	NC_017468	TAA	3	9	7869	7877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814800
82	NC_017468	CAC	2	6	7929	7934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385814800
83	NC_017468	CAT	2	6	7970	7975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814800
84	NC_017468	TAA	2	6	8021	8026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814800
85	NC_017468	GTT	2	6	8257	8262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814801
86	NC_017468	GTT	2	6	8296	8301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814801
87	NC_017468	CAT	2	6	8332	8337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814801
88	NC_017468	TGT	2	6	8364	8369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814801
89	NC_017468	TTG	3	9	8390	8398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814801
90	NC_017468	TTA	2	6	8415	8420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385814801
91	NC_017468	CTT	2	6	8470	8475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814801
92	NC_017468	TTG	2	6	8520	8525	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814801
93	NC_017468	CCA	2	6	8778	8783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385814801
94	NC_017468	AAT	2	6	8881	8886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814801
95	NC_017468	TGA	2	6	8919	8924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814801
96	NC_017468	GGT	2	6	9035	9040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385814801
97	NC_017468	CTT	2	6	9071	9076	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814801
98	NC_017468	AAT	2	6	9077	9082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814801
99	NC_017468	ATG	2	6	9218	9223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814801
100	NC_017468	TGT	2	6	9285	9290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814801
101	NC_017468	CTC	2	6	9356	9361	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385814802
102	NC_017468	ATA	2	6	9464	9469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814802
103	NC_017468	GTT	2	6	9557	9562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814802
104	NC_017468	AAG	2	6	9928	9933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385814803
105	NC_017468	CGG	2	6	9938	9943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385814803
106	NC_017468	TTG	2	6	9972	9977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814803
107	NC_017468	CTT	2	6	10038	10043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814803
108	NC_017468	TTC	2	6	10074	10079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814803
109	NC_017468	TCA	3	9	10306	10314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814803
110	NC_017468	GTC	2	6	10378	10383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814803
111	NC_017468	TTC	2	6	10563	10568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385814803
112	NC_017468	GTC	2	6	10600	10605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814803
113	NC_017468	TTG	2	6	10626	10631	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814803
114	NC_017468	GCT	2	6	10655	10660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814803
115	NC_017468	ATA	2	6	10684	10689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814803
116	NC_017468	GCA	2	6	10903	10908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385814803
117	NC_017468	CCG	2	6	10920	10925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385814803
118	NC_017468	GCT	2	6	11368	11373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814804
119	NC_017468	TGC	2	6	11415	11420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814804
120	NC_017468	TCA	2	6	11482	11487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814804
121	NC_017468	TAA	2	6	11511	11516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814804
122	NC_017468	TGT	2	6	11574	11579	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814804
123	NC_017468	TTG	2	6	11606	11611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385814804
124	NC_017468	CAT	2	6	11665	11670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814804
125	NC_017468	GAT	2	6	11692	11697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814804
126	NC_017468	GCT	2	6	11779	11784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814804
127	NC_017468	ATC	2	6	11801	11806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814804
128	NC_017468	CAC	2	6	11939	11944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385814804
129	NC_017468	CTG	2	6	12113	12118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385814804
130	NC_017468	AAT	2	6	12162	12167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385814804
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.