MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus helveticus H10 chromosome

Total Repeats: 733

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017467	GCAGAA	2	12	1073	1084	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385812839
2	NC_017467	GATGCA	2	12	6289	6300	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385812843
3	NC_017467	GCAAGG	2	12	8676	8687	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	385812844
4	NC_017467	GATCAA	2	12	8837	8848	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385812844
5	NC_017467	TAATTT	2	12	9398	9409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812845
6	NC_017467	AGATAA	2	12	13951	13962	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385812851
7	NC_017467	AGCTGA	2	12	21206	21217	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385812856
8	NC_017467	TGAAGT	2	12	22775	22786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812857
9	NC_017467	TTCATC	2	12	23221	23232	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385812858
10	NC_017467	TAAGAA	2	12	33583	33594	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385812870
11	NC_017467	ATAATT	2	12	33927	33938	50 %	50 %	0 %	0 %	385812870
12	NC_017467	GGACAT	2	12	34253	34264	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385812871
13	NC_017467	TCTTTA	2	12	39107	39118	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385812878
14	NC_017467	TTCTTT	2	12	40157	40168	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385812879
15	NC_017467	AGCAAT	2	12	42434	42445	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385812880
16	NC_017467	CATCCC	2	12	43770	43781	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	385812882
17	NC_017467	AGATGC	2	12	47155	47166	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385812885
18	NC_017467	AGATGA	2	12	54452	54463	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385812890
19	NC_017467	TAAAGT	2	12	56468	56479	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385812893
20	NC_017467	GGAATA	2	12	56517	56528	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385812893
21	NC_017467	TCATGA	2	12	60325	60336	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385812896
22	NC_017467	AAAAAG	2	12	61248	61259	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385812898
23	NC_017467	GCAACT	2	12	61815	61826	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385812899
24	NC_017467	GAATAT	2	12	63936	63947	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385812902
25	NC_017467	TCACCG	2	12	65829	65840	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385812903
26	NC_017467	ATACTT	2	12	68319	68330	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385812906
27	NC_017467	CTTTGA	2	12	69058	69069	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385812906
28	NC_017467	AGACAA	2	12	71913	71924	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385812908
29	NC_017467	TCTTTA	2	12	72787	72798	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385812909
30	NC_017467	AATTTA	2	12	72889	72900	50 %	50 %	0 %	0 %	385812909
31	NC_017467	GCACCA	2	12	73333	73344	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385812909
32	NC_017467	ATTTAA	2	12	74786	74797	50 %	50 %	0 %	0 %	385812910
33	NC_017467	TTTGAC	2	12	75064	75075	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385812910
34	NC_017467	AGTCTT	2	12	75084	75095	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385812910
35	NC_017467	CTTGTT	2	12	75288	75299	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385812911
36	NC_017467	CTTCGT	2	12	75500	75511	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385812911
37	NC_017467	TTACAA	2	12	75599	75610	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385812911
38	NC_017467	ATTGCA	2	12	79874	79885	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385812913
39	NC_017467	ATAAAA	2	12	81000	81011	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	385812914
40	NC_017467	CAAAAA	2	12	101347	101358	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	385812927
41	NC_017467	GATTCA	2	12	104212	104223	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385812930
42	NC_017467	AAATTC	2	12	105909	105920	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385812930
43	NC_017467	TAAGGA	2	12	110896	110907	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385812935
44	NC_017467	AAGACA	2	12	121215	121226	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	385812946
45	NC_017467	ATAAAT	2	12	131243	131254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812956
46	NC_017467	GCTTCA	2	12	131343	131354	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385812956
47	NC_017467	TTTTTC	2	12	131372	131383	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385812956
48	NC_017467	TTCCGA	2	12	132478	132489	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385812958
49	NC_017467	CTTTTT	2	12	132758	132769	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385812959
50	NC_017467	CATAAT	2	12	133202	133213	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385812959
51	NC_017467	TTATTT	2	12	134207	134218	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385812961
52	NC_017467	TATAAA	2	12	134817	134828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812962
53	NC_017467	ACTTCT	2	12	136119	136130	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385812963
54	NC_017467	GTTTTG	2	12	140039	140050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812967
55	NC_017467	TGGCAA	2	12	141127	141138	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385812969
56	NC_017467	TGTTGA	2	12	143265	143276	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385812971
57	NC_017467	CTAAGG	2	12	145046	145057	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385812973
58	NC_017467	TTCTGG	2	12	146095	146106	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	385812974
59	NC_017467	TAAAGA	2	12	151183	151194	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385812978
60	NC_017467	ATTTTG	2	12	151384	151395	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385812979
61	NC_017467	TTGCAG	2	12	151613	151624	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385812979
62	NC_017467	GAATAA	2	12	152638	152649	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385812980
63	NC_017467	AACGCA	2	12	153630	153641	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385812982
64	NC_017467	CAATTT	2	12	153879	153890	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385812982
65	NC_017467	ATTGCC	2	12	154465	154476	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385812982
66	NC_017467	TAACTT	2	12	158939	158950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385812986
67	NC_017467	TAAAGA	2	12	166070	166081	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385812994
68	NC_017467	GTCATC	2	12	166807	166818	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385812994
69	NC_017467	CTAAGA	2	12	169536	169547	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385812996
70	NC_017467	TATTGA	2	12	174151	174162	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385813000
71	NC_017467	CTGAAG	2	12	177784	177795	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385813003
72	NC_017467	GTGGTT	2	12	179638	179649	0 %	50 %	50 %	0 %	385813004
73	NC_017467	CAATAG	2	12	180301	180312	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813004
74	NC_017467	GTAACA	2	12	181017	181028	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813004
75	NC_017467	TGTTAA	2	12	185168	185179	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385813008
76	NC_017467	GTAACT	2	12	185220	185231	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385813008
77	NC_017467	ATATAG	2	12	186833	186844	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385813010
78	NC_017467	TTGAAA	2	12	186878	186889	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385813010
79	NC_017467	TTGATT	2	12	190383	190394	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385813013
80	NC_017467	TGACTA	2	12	194157	194168	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385813014
81	NC_017467	TTTCTT	2	12	195897	195908	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	385813016
82	NC_017467	ATCAAC	2	12	198297	198308	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385813019
83	NC_017467	CGTTGC	2	12	202713	202724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813024
84	NC_017467	ATTCTT	2	12	203798	203809	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385813025
85	NC_017467	GTAATT	2	12	204534	204545	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	385813025
86	NC_017467	CCAAGC	2	12	212448	212459	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385813030
87	NC_017467	GATAAG	2	12	218381	218392	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385813036
88	NC_017467	AAGATG	2	12	218517	218528	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385813036
89	NC_017467	ATGACG	2	12	219177	219188	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385813038
90	NC_017467	TCCGGT	2	12	220717	220728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813039
91	NC_017467	TTGCCA	2	12	223665	223676	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385813040
92	NC_017467	GTCTAA	2	12	223724	223735	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385813040
93	NC_017467	CCTGTT	2	12	223950	223961	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	385813040
94	NC_017467	GGCTAA	2	12	224393	224404	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385813040
95	NC_017467	GAAGCT	2	12	228877	228888	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	385813045
96	NC_017467	AAAGAT	2	12	231236	231247	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	385813047
97	NC_017467	ATAGAC	2	12	231443	231454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813048
98	NC_017467	TTAGTT	2	12	233867	233878	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385813050
99	NC_017467	TCAAGT	2	12	235265	235276	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385813050
100	NC_017467	AAAAGA	2	12	237792	237803	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	385813052
101	NC_017467	GAAACT	2	12	239683	239694	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813055
102	NC_017467	GACAAT	2	12	240548	240559	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813056
103	NC_017467	CGTCAC	2	12	242135	242146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385813057
104	NC_017467	GTATTC	2	12	243255	243266	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385813058
105	NC_017467	TTGATC	2	12	245206	245217	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385813061
106	NC_017467	GCCTAA	2	12	247155	247166	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385813063
107	NC_017467	CAGGTC	2	12	252416	252427	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385813067
108	NC_017467	ACTACA	2	12	256632	256643	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	385813069
109	NC_017467	AAATTG	2	12	260792	260803	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385813070
110	NC_017467	ATAGAG	2	12	261296	261307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385813070
111	NC_017467	CAGATT	2	12	264835	264846	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385813073
112	NC_017467	CGTTAT	2	12	267062	267073	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385813075
113	NC_017467	TCGCCA	2	12	267172	267183	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385813075
114	NC_017467	AAGCTA	2	12	269104	269115	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813077
115	NC_017467	ACTGGT	2	12	269919	269930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	385813078
116	NC_017467	TGGACG	2	12	271118	271129	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385813078
117	NC_017467	TTTTGG	2	12	271969	271980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385813080
118	NC_017467	TGGAAT	2	12	272387	272398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813080
119	NC_017467	TTGAAC	2	12	272452	272463	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385813080
120	NC_017467	TTAAAG	2	12	273130	273141	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	385813081
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227	NC_017467	TGACTT	2	12	567844	567855	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385813360
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343	NC_017467	TTGATT	2	12	930254	930265	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	385813691
344	NC_017467	GAGCAA	2	12	931753	931764	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	385813691
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355	NC_017467	CATCAG	2	12	959563	959574	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385813715
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448	NC_017467	GATCAA	2	12	1262788	1262799	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813997
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450	NC_017467	GCATTA	2	12	1264931	1264942	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385813998
451	NC_017467	AGTACC	2	12	1266656	1266667	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385813999
452	NC_017467	GTATCA	2	12	1269500	1269511	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	385814000
453	NC_017467	AGCCTT	2	12	1270132	1270143	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385814000
454	NC_017467	CATAAT	2	12	1273838	1273849	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385814003
455	NC_017467	ATTACC	2	12	1277543	1277554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814007
456	NC_017467	CATGAC	2	12	1282844	1282855	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385814010
457	NC_017467	ACCTTG	2	12	1284288	1284299	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385814012
458	NC_017467	TTTTCA	2	12	1286066	1286077	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	385814014
459	NC_017467	CATGAA	2	12	1292340	1292351	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385814019
460	NC_017467	AAAGTC	2	12	1308316	1308327	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385814032
461	NC_017467	TAAATC	2	12	1308796	1308807	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	385814033
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466	NC_017467	ATCAAA	2	12	1334678	1334689	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	385814056
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468	NC_017467	GTTGAA	2	12	1336239	1336250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385814057
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470	NC_017467	CTTAAC	2	12	1337206	1337217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385814058
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472	NC_017467	TCACGT	2	12	1340693	1340704	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385814063
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481	NC_017467	CTTCAG	2	12	1356863	1356874	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385814077
482	NC_017467	TGACCA	2	12	1356891	1356902	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385814077
483	NC_017467	ATTTTT	2	12	1357671	1357682	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385814078
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487	NC_017467	TTTCAC	2	12	1361515	1361526	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	385814083
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