MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus helveticus H10 chromosome

Total Repeats: 1260

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017467	TGGAA	2	10	400	409	40 %	20 %	40 %	0 %	385812839
2	NC_017467	TATTT	2	10	3636	3645	20 %	80 %	0 %	0 %	385812842
3	NC_017467	ATGAA	2	10	4928	4937	60 %	20 %	20 %	0 %	385812843
4	NC_017467	AGAAT	2	10	5042	5051	60 %	20 %	20 %	0 %	385812843
5	NC_017467	TCATG	2	10	12867	12876	20 %	40 %	20 %	20 %	385812848
6	NC_017467	TAATA	2	10	13623	13632	60 %	40 %	0 %	0 %	385812850
7	NC_017467	TAACT	2	10	14014	14023	40 %	40 %	0 %	20 %	385812851
8	NC_017467	CAATA	2	10	14916	14925	60 %	20 %	0 %	20 %	385812851
9	NC_017467	TGGCT	2	10	21119	21128	0 %	40 %	40 %	20 %	385812856
10	NC_017467	CAAAT	2	10	21643	21652	60 %	20 %	0 %	20 %	385812857
11	NC_017467	AGCCA	2	10	23299	23308	40 %	0 %	20 %	40 %	385812858
12	NC_017467	ATATC	2	10	24217	24226	40 %	40 %	0 %	20 %	385812859
13	NC_017467	GAAAA	2	10	27634	27643	80 %	0 %	20 %	0 %	385812862
14	NC_017467	GCAAA	2	10	28332	28341	60 %	0 %	20 %	20 %	385812862
15	NC_017467	AAGGT	2	10	29072	29081	40 %	20 %	40 %	0 %	385812863
16	NC_017467	GAATG	2	10	34018	34027	40 %	20 %	40 %	0 %	385812871
17	NC_017467	GAAAA	2	10	34078	34087	80 %	0 %	20 %	0 %	385812871
18	NC_017467	TCACT	2	10	34219	34228	20 %	40 %	0 %	40 %	385812871
19	NC_017467	GCAAG	2	10	35319	35328	40 %	0 %	40 %	20 %	385812873
20	NC_017467	GAAGC	2	10	35650	35659	40 %	0 %	40 %	20 %	385812874
21	NC_017467	AATTT	2	10	39748	39757	40 %	60 %	0 %	0 %	385812878
22	NC_017467	AATTT	2	10	44412	44421	40 %	60 %	0 %	0 %	385812883
23	NC_017467	CAAAT	2	10	51391	51400	60 %	20 %	0 %	20 %	385812888
24	NC_017467	GTTTT	2	10	53079	53088	0 %	80 %	20 %	0 %	385812889
25	NC_017467	ATATG	2	10	53228	53237	40 %	40 %	20 %	0 %	385812890
26	NC_017467	ACTAA	2	10	54423	54432	60 %	20 %	0 %	20 %	385812890
27	NC_017467	AAATA	2	10	54615	54624	80 %	20 %	0 %	0 %	385812890
28	NC_017467	AAGAT	2	10	55964	55973	60 %	20 %	20 %	0 %	385812892
29	NC_017467	CAATG	2	10	56342	56351	40 %	20 %	20 %	20 %	385812893
30	NC_017467	ACGCA	2	10	59857	59866	40 %	0 %	20 %	40 %	385812896
31	NC_017467	TAATT	2	10	61084	61093	40 %	60 %	0 %	0 %	385812897
32	NC_017467	GTGCC	2	10	62705	62714	0 %	20 %	40 %	40 %	385812900
33	NC_017467	AATAA	2	10	63453	63462	80 %	20 %	0 %	0 %	385812901
34	NC_017467	ATAGA	2	10	63594	63603	60 %	20 %	20 %	0 %	385812901
35	NC_017467	CTATA	2	10	67230	67239	40 %	40 %	0 %	20 %	385812905
36	NC_017467	TAAAA	2	10	69152	69161	80 %	20 %	0 %	0 %	385812906
37	NC_017467	GCTTT	2	10	69556	69565	0 %	60 %	20 %	20 %	385812907
38	NC_017467	GATCA	2	10	71691	71700	40 %	20 %	20 %	20 %	385812908
39	NC_017467	AAGAA	2	10	72526	72535	80 %	0 %	20 %	0 %	385812909
40	NC_017467	TTTCA	2	10	75618	75627	20 %	60 %	0 %	20 %	385812911
41	NC_017467	GTGAA	2	10	75678	75687	40 %	20 %	40 %	0 %	385812911
42	NC_017467	AAGAT	2	10	81267	81276	60 %	20 %	20 %	0 %	385812914
43	NC_017467	GCTCT	2	10	83223	83232	0 %	40 %	20 %	40 %	385812915
44	NC_017467	TTCAG	2	10	83736	83745	20 %	40 %	20 %	20 %	385812915
45	NC_017467	AAGCA	2	10	84413	84422	60 %	0 %	20 %	20 %	385812916
46	NC_017467	TTTGC	2	10	92769	92778	0 %	60 %	20 %	20 %	385812919
47	NC_017467	AGCAT	2	10	93173	93182	40 %	20 %	20 %	20 %	385812919
48	NC_017467	TTTTC	2	10	93425	93434	0 %	80 %	0 %	20 %	385812920
49	NC_017467	AAAGA	2	10	93591	93600	80 %	0 %	20 %	0 %	385812920
50	NC_017467	ATTGA	2	10	95212	95221	40 %	40 %	20 %	0 %	385812921
51	NC_017467	TCTTG	2	10	99484	99493	0 %	60 %	20 %	20 %	385812926
52	NC_017467	CTTTA	2	10	100323	100332	20 %	60 %	0 %	20 %	385812927
53	NC_017467	AATTG	2	10	100358	100367	40 %	40 %	20 %	0 %	385812927
54	NC_017467	ATTTA	2	10	103327	103336	40 %	60 %	0 %	0 %	385812929
55	NC_017467	CAGTG	2	10	107839	107848	20 %	20 %	40 %	20 %	385812932
56	NC_017467	AAAAG	2	10	110728	110737	80 %	0 %	20 %	0 %	385812935
57	NC_017467	ATTTA	2	10	112677	112686	40 %	60 %	0 %	0 %	385812936
58	NC_017467	GTTTA	2	10	113626	113635	20 %	60 %	20 %	0 %	385812938
59	NC_017467	AGAAA	2	10	113666	113675	80 %	0 %	20 %	0 %	385812938
60	NC_017467	TAAAG	2	10	115986	115995	60 %	20 %	20 %	0 %	385812942
61	NC_017467	TTTGT	2	10	117186	117195	0 %	80 %	20 %	0 %	385812943
62	NC_017467	ACAAA	2	10	118387	118396	80 %	0 %	0 %	20 %	385812944
63	NC_017467	ATGCC	2	10	121318	121327	20 %	20 %	20 %	40 %	385812946
64	NC_017467	AACTT	2	10	121856	121865	40 %	40 %	0 %	20 %	385812947
65	NC_017467	AACCA	2	10	126151	126160	60 %	0 %	0 %	40 %	385812951
66	NC_017467	TTCCA	2	10	128493	128502	20 %	40 %	0 %	40 %	385812954
67	NC_017467	CAATA	2	10	130540	130549	60 %	20 %	0 %	20 %	385812955
68	NC_017467	TTAAT	2	10	132133	132142	40 %	60 %	0 %	0 %	385812958
69	NC_017467	AATTT	2	10	132447	132456	40 %	60 %	0 %	0 %	385812958
70	NC_017467	TTAGG	2	10	133736	133745	20 %	40 %	40 %	0 %	385812960
71	NC_017467	TTTCA	2	10	136433	136442	20 %	60 %	0 %	20 %	385812963
72	NC_017467	CAAAA	2	10	136523	136532	80 %	0 %	0 %	20 %	385812963
73	NC_017467	TGATT	2	10	138044	138053	20 %	60 %	20 %	0 %	385812965
74	NC_017467	TTCAT	2	10	138250	138259	20 %	60 %	0 %	20 %	385812965
75	NC_017467	TGCTT	2	10	139027	139036	0 %	60 %	20 %	20 %	385812966
76	NC_017467	ATTAA	2	10	139397	139406	60 %	40 %	0 %	0 %	385812966
77	NC_017467	ATGGA	2	10	142928	142937	40 %	20 %	40 %	0 %	385812971
78	NC_017467	GCAAC	2	10	143195	143204	40 %	0 %	20 %	40 %	385812971
79	NC_017467	ATTTT	2	10	146898	146907	20 %	80 %	0 %	0 %	385812975
80	NC_017467	TAATT	2	10	148376	148385	40 %	60 %	0 %	0 %	385812976
81	NC_017467	TCAAA	2	10	149628	149637	60 %	20 %	0 %	20 %	385812977
82	NC_017467	GAAAT	2	10	150782	150791	60 %	20 %	20 %	0 %	385812978
83	NC_017467	CAATT	2	10	152611	152620	40 %	40 %	0 %	20 %	385812980
84	NC_017467	AGCTT	2	10	155199	155208	20 %	40 %	20 %	20 %	385812982
85	NC_017467	GAAGT	2	10	157540	157549	40 %	20 %	40 %	0 %	385812984
86	NC_017467	TTGGT	2	10	162715	162724	0 %	60 %	40 %	0 %	385812990
87	NC_017467	ATTTA	2	10	164862	164871	40 %	60 %	0 %	0 %	385812992
88	NC_017467	CAAGA	2	10	165157	165166	60 %	0 %	20 %	20 %	385812993
89	NC_017467	TAATT	2	10	169080	169089	40 %	60 %	0 %	0 %	385812995
90	NC_017467	TATGG	2	10	169181	169190	20 %	40 %	40 %	0 %	385812996
91	NC_017467	GATAA	2	10	174386	174395	60 %	20 %	20 %	0 %	385813000
92	NC_017467	ATTTC	2	10	175649	175658	20 %	60 %	0 %	20 %	385813001
93	NC_017467	CATTA	2	10	176792	176801	40 %	40 %	0 %	20 %	385813002
94	NC_017467	ACTTT	2	10	177556	177565	20 %	60 %	0 %	20 %	385813003
95	NC_017467	CATAA	2	10	181286	181295	60 %	20 %	0 %	20 %	385813004
96	NC_017467	TTCTT	2	10	182102	182111	0 %	80 %	0 %	20 %	385813005
97	NC_017467	GGCAA	2	10	185418	185427	40 %	0 %	40 %	20 %	385813008
98	NC_017467	GCTTG	2	10	188185	188194	0 %	40 %	40 %	20 %	385813011
99	NC_017467	ATCTA	2	10	190336	190345	40 %	40 %	0 %	20 %	385813013
100	NC_017467	AAAAG	2	10	191605	191614	80 %	0 %	20 %	0 %	385813013
101	NC_017467	TTTTC	2	10	194389	194398	0 %	80 %	0 %	20 %	385813014
102	NC_017467	GGTTG	2	10	199110	199119	0 %	40 %	60 %	0 %	385813020
103	NC_017467	TAATT	2	10	199737	199746	40 %	60 %	0 %	0 %	385813020
104	NC_017467	GCCAA	2	10	200469	200478	40 %	0 %	20 %	40 %	385813021
105	NC_017467	AATTG	2	10	201131	201140	40 %	40 %	20 %	0 %	385813022
106	NC_017467	CAAAG	2	10	201445	201454	60 %	0 %	20 %	20 %	385813023
107	NC_017467	ATATG	2	10	205976	205985	40 %	40 %	20 %	0 %	385813025
108	NC_017467	ATGGA	2	10	206338	206347	40 %	20 %	40 %	0 %	385813026
109	NC_017467	TACTT	2	10	208583	208592	20 %	60 %	0 %	20 %	385813027
110	NC_017467	TGAAT	2	10	210090	210099	40 %	40 %	20 %	0 %	385813028
111	NC_017467	TTGTT	2	10	210902	210911	0 %	80 %	20 %	0 %	385813028
112	NC_017467	TTAAA	2	10	212333	212342	60 %	40 %	0 %	0 %	385813030
113	NC_017467	GCATA	2	10	214240	214249	40 %	20 %	20 %	20 %	385813031
114	NC_017467	AAAGT	2	10	214440	214449	60 %	20 %	20 %	0 %	385813031
115	NC_017467	AAACC	2	10	215222	215231	60 %	0 %	0 %	40 %	385813032
116	NC_017467	ATTTT	2	10	216195	216204	20 %	80 %	0 %	0 %	385813034
117	NC_017467	AAAAT	2	10	219616	219625	80 %	20 %	0 %	0 %	385813038
118	NC_017467	AATCA	2	10	221485	221494	60 %	20 %	0 %	20 %	385813039
119	NC_017467	CTTTA	2	10	222612	222621	20 %	60 %	0 %	20 %	385813039
120	NC_017467	TTACA	2	10	222815	222824	40 %	40 %	0 %	20 %	385813040
121	NC_017467	TTAAG	2	10	225976	225985	40 %	40 %	20 %	0 %	385813042
122	NC_017467	ATTAC	2	10	226496	226505	40 %	40 %	0 %	20 %	385813043
123	NC_017467	GAAAA	2	10	227281	227290	80 %	0 %	20 %	0 %	385813044
124	NC_017467	GCAAA	2	10	227979	227988	60 %	0 %	20 %	20 %	385813044
125	NC_017467	TGGAA	2	10	229626	229635	40 %	20 %	40 %	0 %	385813046
126	NC_017467	TTTTG	2	10	230387	230396	0 %	80 %	20 %	0 %	385813047
127	NC_017467	CACTA	2	10	234074	234083	40 %	20 %	0 %	40 %	385813050
128	NC_017467	AACTC	2	10	235052	235061	40 %	20 %	0 %	40 %	385813050
129	NC_017467	CAATT	2	10	235500	235509	40 %	40 %	0 %	20 %	385813050
130	NC_017467	CTCAA	2	10	235883	235892	40 %	20 %	0 %	40 %	385813051
131	NC_017467	AAATC	2	10	238914	238923	60 %	20 %	0 %	20 %	385813054
132	NC_017467	AATGT	2	10	241259	241268	40 %	40 %	20 %	0 %	385813057
133	NC_017467	ATGAA	2	10	241308	241317	60 %	20 %	20 %	0 %	385813057
134	NC_017467	TGGTA	2	10	242191	242200	20 %	40 %	40 %	0 %	385813057
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