MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus helveticus H10 chromosome

Total Repeats: 36759

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_017467	ATGA	2	8	237968	237975	50 %	25 %	25 %	0 %	385813053
4002	NC_017467	GTT	2	6	238121	238126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385813053
4003	NC_017467	CTT	2	6	238160	238165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385813054
4004	NC_017467	TCA	2	6	238254	238259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813054
4005	NC_017467	GCA	2	6	238264	238269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385813054
4006	NC_017467	GAA	3	9	238280	238288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813054
4007	NC_017467	TCA	2	6	238293	238298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813054
4008	NC_017467	CAT	2	6	238363	238368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813054
4009	NC_017467	CAT	2	6	238420	238425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813054
4010	NC_017467	TAG	2	6	238447	238452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813054
4011	NC_017467	GTA	2	6	238457	238462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813054
4012	NC_017467	ATG	2	6	238488	238493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813054
4013	NC_017467	TCA	2	6	238527	238532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813054
4014	NC_017467	AAG	2	6	238617	238622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813054
4015	NC_017467	CAT	2	6	238639	238644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813054
4016	NC_017467	ATC	2	6	238658	238663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813054
4017	NC_017467	TTCC	2	8	238675	238682	0 %	50 %	0 %	50 %	385813054
4018	NC_017467	TGC	2	6	238755	238760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813054
4019	NC_017467	TTG	2	6	238802	238807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385813054
4020	NC_017467	TA	3	6	238829	238834	50 %	50 %	0 %	0 %	385813054
4021	NC_017467	TAA	2	6	238891	238896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385813054
4022	NC_017467	AAATC	2	10	238914	238923	60 %	20 %	0 %	20 %	385813054
4023	NC_017467	ATC	2	6	238998	239003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813054
4024	NC_017467	ACT	2	6	239007	239012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813054
4025	NC_017467	GCTA	2	8	239042	239049	25 %	25 %	25 %	25 %	385813054
4026	NC_017467	TTG	2	6	239088	239093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385813054
4027	NC_017467	T	6	6	239119	239124	0 %	100 %	0 %	0 %	385813054
4028	NC_017467	TAA	2	6	239219	239224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385813054
4029	NC_017467	GTC	2	6	239231	239236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813054
4030	NC_017467	T	6	6	239273	239278	0 %	100 %	0 %	0 %	385813054
4031	NC_017467	TTC	2	6	239296	239301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385813054
4032	NC_017467	AC	3	6	239314	239319	50 %	0 %	0 %	50 %	385813054
4033	NC_017467	GCT	2	6	239380	239385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813054
4034	NC_017467	AAC	2	6	239432	239437	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385813054
4035	NC_017467	CTT	2	6	239485	239490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385813054
4036	NC_017467	T	6	6	239498	239503	0 %	100 %	0 %	0 %	385813054
4037	NC_017467	ACC	2	6	239526	239531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385813054
4038	NC_017467	GCA	2	6	239638	239643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385813055
4039	NC_017467	GAT	2	6	239677	239682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813055
4040	NC_017467	GAAACT	2	12	239683	239694	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813055
4041	NC_017467	AGA	2	6	239721	239726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813055
4042	NC_017467	AAT	2	6	239728	239733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385813055
4043	NC_017467	GT	3	6	239744	239749	0 %	50 %	50 %	0 %	385813055
4044	NC_017467	AGA	2	6	239757	239762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813055
4045	NC_017467	TAG	2	6	239826	239831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813055
4046	NC_017467	TGT	2	6	239883	239888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385813055
4047	NC_017467	AGCA	2	8	239942	239949	50 %	0 %	25 %	25 %	385813055
4048	NC_017467	TAA	2	6	239999	240004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385813055
4049	NC_017467	GAA	2	6	240227	240232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813056
4050	NC_017467	GAA	2	6	240347	240352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813056
4051	NC_017467	ACC	2	6	240357	240362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385813056
4052	NC_017467	AGA	2	6	240364	240369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813056
4053	NC_017467	GAA	3	9	240371	240379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813056
4054	NC_017467	AAG	2	6	240401	240406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813056
4055	NC_017467	TGA	3	9	240436	240444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813056
4056	NC_017467	ATT	2	6	240446	240451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385813056
4057	NC_017467	ATG	2	6	240462	240467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813056
4058	NC_017467	AGA	2	6	240472	240477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813056
4059	NC_017467	GAT	2	6	240479	240484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813056
4060	NC_017467	CTG	2	6	240495	240500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813056
4061	NC_017467	TGA	3	9	240523	240531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813056
4062	NC_017467	GACAAT	2	12	240548	240559	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813056
4063	NC_017467	TGA	2	6	240562	240567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813056
4064	NC_017467	GAT	3	9	240611	240619	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813056
4065	NC_017467	GAA	2	6	240623	240628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813056
4066	NC_017467	TAAT	2	8	240631	240638	50 %	50 %	0 %	0 %	385813056
4067	NC_017467	AT	3	6	240880	240885	50 %	50 %	0 %	0 %	385813057
4068	NC_017467	AGTA	2	8	241004	241011	50 %	25 %	25 %	0 %	385813057
4069	NC_017467	ACT	2	6	241022	241027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813057
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4071	NC_017467	GTG	2	6	241065	241070	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385813057
4072	NC_017467	AAG	3	9	241121	241129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813057
4073	NC_017467	GCA	2	6	241139	241144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385813057
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4081	NC_017467	ATGAA	2	10	241308	241317	60 %	20 %	20 %	0 %	385813057
4082	NC_017467	TTC	2	6	241383	241388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385813057
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4085	NC_017467	CTT	2	6	241543	241548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385813057
4086	NC_017467	GAA	2	6	241591	241596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813057
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4089	NC_017467	TGGT	2	8	241644	241651	0 %	50 %	50 %	0 %	385813057
4090	NC_017467	ACA	2	6	241719	241724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385813057
4091	NC_017467	AGA	2	6	241753	241758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813057
4092	NC_017467	ACA	2	6	241770	241775	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385813057
4093	NC_017467	TGG	2	6	241816	241821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385813057
4094	NC_017467	TTTG	2	8	241899	241906	0 %	75 %	25 %	0 %	385813057
4095	NC_017467	TAC	2	6	241966	241971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813057
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4101	NC_017467	CGTCAC	2	12	242135	242146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	385813057
4102	NC_017467	AAC	2	6	242159	242164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385813057
4103	NC_017467	TGGTA	2	10	242191	242200	20 %	40 %	40 %	0 %	385813057
4104	NC_017467	ATT	2	6	242237	242242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385813057
4105	NC_017467	AGA	2	6	242253	242258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813057
4106	NC_017467	GTC	2	6	242298	242303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813057
4107	NC_017467	GAT	2	6	242512	242517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813058
4108	NC_017467	TGG	2	6	242524	242529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385813058
4109	NC_017467	TGG	2	6	242557	242562	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385813058
4110	NC_017467	TTA	2	6	242669	242674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385813058
4111	NC_017467	GATG	2	8	242680	242687	25 %	25 %	50 %	0 %	385813058
4112	NC_017467	CTT	2	6	242804	242809	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385813058
4113	NC_017467	AGT	2	6	242827	242832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813058
4114	NC_017467	TGG	2	6	242842	242847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385813058
4115	NC_017467	AGA	2	6	242950	242955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813058
4116	NC_017467	ATT	2	6	243014	243019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385813058
4117	NC_017467	TAT	2	6	243049	243054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385813058
4118	NC_017467	ATT	2	6	243080	243085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385813058
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4361	NC_017467	TCT	2	6	261170	261175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385813070
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4364	NC_017467	AAAG	2	8	261268	261275	75 %	0 %	25 %	0 %	385813070
4365	NC_017467	ATAGAG	2	12	261296	261307	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	385813070
4366	NC_017467	GCT	2	6	261331	261336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813070
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4369	NC_017467	ATGA	2	8	261607	261614	50 %	25 %	25 %	0 %	385813071
4370	NC_017467	TCAA	2	8	261644	261651	50 %	25 %	0 %	25 %	385813071
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4453	NC_017467	TTTA	2	8	267246	267253	25 %	75 %	0 %	0 %	385813075
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4470	NC_017467	CAA	2	6	268248	268253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385813076
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4472	NC_017467	TAC	2	6	268439	268444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813077
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4477	NC_017467	TTTG	2	8	268514	268521	0 %	75 %	25 %	0 %	385813077
4478	NC_017467	A	6	6	268599	268604	100 %	0 %	0 %	0 %	385813077
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4484	NC_017467	CAT	2	6	268908	268913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813077
4485	NC_017467	TGA	2	6	269063	269068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813077
4486	NC_017467	TTG	2	6	269073	269078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385813077
4487	NC_017467	AAG	2	6	269091	269096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385813077
4488	NC_017467	AAGCTA	2	12	269104	269115	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385813077
4489	NC_017467	CAT	2	6	269172	269177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813077
4490	NC_017467	GCA	2	6	269256	269261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385813077
4491	NC_017467	TCA	2	6	269273	269278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813077
4492	NC_017467	TGA	2	6	269291	269296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385813077
4493	NC_017467	TCA	2	6	269307	269312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813077
4494	NC_017467	GAATG	2	10	269341	269350	40 %	20 %	40 %	0 %	385813077
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4496	NC_017467	CTG	2	6	269407	269412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385813077
4497	NC_017467	GTT	2	6	269421	269426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385813077
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4499	NC_017467	A	6	6	269502	269507	100 %	0 %	0 %	0 %	385813077
4500	NC_017467	ATC	2	6	269553	269558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385813077

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