MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 771

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017465	ACCAC	2	10	1535	1544	40 %	0 %	0 %	60 %	385811787
2	NC_017465	AAGGA	2	10	5186	5195	60 %	0 %	40 %	0 %	385811790
3	NC_017465	GGGCT	2	10	19088	19097	0 %	20 %	60 %	20 %	385811794
4	NC_017465	TGGGG	2	10	21551	21560	0 %	20 %	80 %	0 %	385811797
5	NC_017465	AGCGA	2	10	25214	25223	40 %	0 %	40 %	20 %	385811800
6	NC_017465	CGGAC	2	10	26668	26677	20 %	0 %	40 %	40 %	385811801
7	NC_017465	GACAA	2	10	32197	32206	60 %	0 %	20 %	20 %	385811802
8	NC_017465	CAGGT	2	10	33181	33190	20 %	20 %	40 %	20 %	385811803
9	NC_017465	GGCTT	2	10	35175	35184	0 %	40 %	40 %	20 %	385811805
10	NC_017465	TTGGA	2	10	35572	35581	20 %	40 %	40 %	0 %	385811805
11	NC_017465	ACCCA	2	10	36968	36977	40 %	0 %	0 %	60 %	385811806
12	NC_017465	TGAAG	2	10	38700	38709	40 %	20 %	40 %	0 %	385811806
13	NC_017465	GCCCC	2	10	39456	39465	0 %	0 %	20 %	80 %	385811807
14	NC_017465	GGCGA	2	10	47407	47416	20 %	0 %	60 %	20 %	385811808
15	NC_017465	GGCTT	2	10	47557	47566	0 %	40 %	40 %	20 %	385811808
16	NC_017465	CTGAC	2	10	47743	47752	20 %	20 %	20 %	40 %	385811808
17	NC_017465	GGTCA	2	10	48491	48500	20 %	20 %	40 %	20 %	385811808
18	NC_017465	CAATT	2	10	50891	50900	40 %	40 %	0 %	20 %	385811810
19	NC_017465	ATTGG	2	10	62543	62552	20 %	40 %	40 %	0 %	385811815
20	NC_017465	CAAAG	2	10	63110	63119	60 %	0 %	20 %	20 %	385811815
21	NC_017465	GCGCC	2	10	64836	64845	0 %	0 %	40 %	60 %	385811816
22	NC_017465	CCGGG	2	10	65219	65228	0 %	0 %	60 %	40 %	385811816
23	NC_017465	AGCGA	2	10	67563	67572	40 %	0 %	40 %	20 %	385811817
24	NC_017465	AACGA	2	10	69191	69200	60 %	0 %	20 %	20 %	385811819
25	NC_017465	GGCCG	2	10	72484	72493	0 %	0 %	60 %	40 %	385811821
26	NC_017465	TGATC	2	10	79542	79551	20 %	40 %	20 %	20 %	385811824
27	NC_017465	TGCGG	2	10	80663	80672	0 %	20 %	60 %	20 %	385811825
28	NC_017465	TTCCG	2	10	86634	86643	0 %	40 %	20 %	40 %	385811827
29	NC_017465	GCCGT	2	10	87132	87141	0 %	20 %	40 %	40 %	385811827
30	NC_017465	GCCGT	2	10	87245	87254	0 %	20 %	40 %	40 %	385811827
31	NC_017465	AGTTC	2	10	88359	88368	20 %	40 %	20 %	20 %	385811828
32	NC_017465	CACAT	2	10	94790	94799	40 %	20 %	0 %	40 %	385811831
33	NC_017465	ATTTG	2	10	96374	96383	20 %	60 %	20 %	0 %	385811832
34	NC_017465	GGAAA	2	10	99998	100007	60 %	0 %	40 %	0 %	385811834
35	NC_017465	AAGCC	2	10	100219	100228	40 %	0 %	20 %	40 %	385811835
36	NC_017465	TTGGA	2	10	101017	101026	20 %	40 %	40 %	0 %	385811836
37	NC_017465	CCGCC	2	10	101739	101748	0 %	0 %	20 %	80 %	385811836
38	NC_017465	GGGGT	2	10	105550	105559	0 %	20 %	80 %	0 %	385811840
39	NC_017465	GCTAA	2	10	110303	110312	40 %	20 %	20 %	20 %	385811843
40	NC_017465	CTTTG	2	10	110521	110530	0 %	60 %	20 %	20 %	385811843
41	NC_017465	GGAAG	2	10	110933	110942	40 %	0 %	60 %	0 %	385811843
42	NC_017465	AACGC	2	10	111918	111927	40 %	0 %	20 %	40 %	385811844
43	NC_017465	GTTCC	2	10	112515	112524	0 %	40 %	20 %	40 %	385811844
44	NC_017465	ACTAT	2	10	116638	116647	40 %	40 %	0 %	20 %	385811848
45	NC_017465	GTTTT	2	10	117406	117415	0 %	80 %	20 %	0 %	385811849
46	NC_017465	GTTGC	2	10	117757	117766	0 %	40 %	40 %	20 %	385811849
47	NC_017465	GCTTG	2	10	121081	121090	0 %	40 %	40 %	20 %	385811852
48	NC_017465	GTTAA	2	10	121336	121345	40 %	40 %	20 %	0 %	385811852
49	NC_017465	AATTT	2	10	125375	125384	40 %	60 %	0 %	0 %	385811855
50	NC_017465	AGCCC	2	10	133310	133319	20 %	0 %	20 %	60 %	385811858
51	NC_017465	GATGG	2	10	136061	136070	20 %	20 %	60 %	0 %	385811860
52	NC_017465	GGGAA	2	10	140878	140887	40 %	0 %	60 %	0 %	385811862
53	NC_017465	GCTGG	2	10	142094	142103	0 %	20 %	60 %	20 %	385811863
54	NC_017465	TAATC	2	10	142541	142550	40 %	40 %	0 %	20 %	385811863
55	NC_017465	CCGGA	2	10	145260	145269	20 %	0 %	40 %	40 %	385811865
56	NC_017465	CGATT	2	10	148265	148274	20 %	40 %	20 %	20 %	385811866
57	NC_017465	AACCA	2	10	148326	148335	60 %	0 %	0 %	40 %	385811866
58	NC_017465	ACACG	2	10	155090	155099	40 %	0 %	20 %	40 %	385811868
59	NC_017465	GAAGA	2	10	155880	155889	60 %	0 %	40 %	0 %	385811869
60	NC_017465	GAGAA	2	10	156113	156122	60 %	0 %	40 %	0 %	385811869
61	NC_017465	CGGGG	2	10	159410	159419	0 %	0 %	80 %	20 %	385811871
62	NC_017465	CTAAA	2	10	163769	163778	60 %	20 %	0 %	20 %	385811873
63	NC_017465	GGCCT	2	10	167150	167159	0 %	20 %	40 %	40 %	385811875
64	NC_017465	CTTAG	2	10	181780	181789	20 %	40 %	20 %	20 %	385811877
65	NC_017465	TTGGG	2	10	182882	182891	0 %	40 %	60 %	0 %	385811878
66	NC_017465	GACCC	2	10	184371	184380	20 %	0 %	20 %	60 %	385811879
67	NC_017465	CTTTG	2	10	184601	184610	0 %	60 %	20 %	20 %	385811879
68	NC_017465	GCCCT	2	10	187500	187509	0 %	20 %	20 %	60 %	385811880
69	NC_017465	TCAAA	2	10	193427	193436	60 %	20 %	0 %	20 %	385811883
70	NC_017465	ATTGT	2	10	199917	199926	20 %	60 %	20 %	0 %	385811884
71	NC_017465	GGAAT	2	10	203089	203098	40 %	20 %	40 %	0 %	385811886
72	NC_017465	AAGGA	2	10	203282	203291	60 %	0 %	40 %	0 %	385811886
73	NC_017465	ACCAA	2	10	207542	207551	60 %	0 %	0 %	40 %	385811888
74	NC_017465	TTGGT	2	10	213527	213536	0 %	60 %	40 %	0 %	385811890
75	NC_017465	ACCGG	2	10	213983	213992	20 %	0 %	40 %	40 %	385811890
76	NC_017465	TGCTT	2	10	214151	214160	0 %	60 %	20 %	20 %	385811890
77	NC_017465	GGTCG	2	10	219700	219709	0 %	20 %	60 %	20 %	385811892
78	NC_017465	CCGAT	2	10	219798	219807	20 %	20 %	20 %	40 %	385811892
79	NC_017465	CGATT	2	10	220240	220249	20 %	40 %	20 %	20 %	385811893
80	NC_017465	AGGTC	2	10	223038	223047	20 %	20 %	40 %	20 %	385811895
81	NC_017465	CGGTC	2	10	223723	223732	0 %	20 %	40 %	40 %	385811895
82	NC_017465	AAGCT	2	10	227099	227108	40 %	20 %	20 %	20 %	385811897
83	NC_017465	CGGCG	2	10	227347	227356	0 %	0 %	60 %	40 %	385811897
84	NC_017465	CGGGG	2	10	227543	227552	0 %	0 %	80 %	20 %	385811897
85	NC_017465	GACCC	2	10	230451	230460	20 %	0 %	20 %	60 %	385811899
86	NC_017465	AACCG	2	10	231891	231900	40 %	0 %	20 %	40 %	385811900
87	NC_017465	AACTG	2	10	235935	235944	40 %	20 %	20 %	20 %	385811903
88	NC_017465	CGGCT	2	10	238804	238813	0 %	20 %	40 %	40 %	385811905
89	NC_017465	GGGAA	2	10	239591	239600	40 %	0 %	60 %	0 %	385811906
90	NC_017465	GACAA	2	10	242074	242083	60 %	0 %	20 %	20 %	385811908
91	NC_017465	TTAAT	2	10	243808	243817	40 %	60 %	0 %	0 %	385811909
92	NC_017465	AATTG	2	10	245705	245714	40 %	40 %	20 %	0 %	385811910
93	NC_017465	TGATA	2	10	245727	245736	40 %	40 %	20 %	0 %	385811910
94	NC_017465	CGTAC	2	10	247653	247662	20 %	20 %	20 %	40 %	385811911
95	NC_017465	AATGA	2	10	248304	248313	60 %	20 %	20 %	0 %	385811911
96	NC_017465	GCCGA	2	10	253385	253394	20 %	0 %	40 %	40 %	385811913
97	NC_017465	CGGGC	3	15	256245	256259	0 %	0 %	60 %	40 %	385811915
98	NC_017465	AACGA	2	10	257685	257694	60 %	0 %	20 %	20 %	385811916
99	NC_017465	CTACC	2	10	257942	257951	20 %	20 %	0 %	60 %	385811916
100	NC_017465	CTAGG	2	10	258214	258223	20 %	20 %	40 %	20 %	385811916
101	NC_017465	GGGAT	2	10	262574	262583	20 %	20 %	60 %	0 %	385811917
102	NC_017465	TCCCG	2	10	264843	264852	0 %	20 %	20 %	60 %	385811918
103	NC_017465	GGCCG	2	10	268058	268067	0 %	0 %	60 %	40 %	385811920
104	NC_017465	AAAAT	2	10	269249	269258	80 %	20 %	0 %	0 %	385811920
105	NC_017465	GGGAA	2	10	269885	269894	40 %	0 %	60 %	0 %	385811921
106	NC_017465	GAATG	2	10	270228	270237	40 %	20 %	40 %	0 %	385811921
107	NC_017465	GGAAC	2	10	272169	272178	40 %	0 %	40 %	20 %	385811923
108	NC_017465	AATTT	2	10	282615	282624	40 %	60 %	0 %	0 %	385811924
109	NC_017465	TCTGC	2	10	289561	289570	0 %	40 %	20 %	40 %	385811925
110	NC_017465	AAGAA	2	10	292034	292043	80 %	0 %	20 %	0 %	385811927
111	NC_017465	AACCA	2	10	301128	301137	60 %	0 %	0 %	40 %	385811932
112	NC_017465	TTAAT	2	10	301909	301918	40 %	60 %	0 %	0 %	385811933
113	NC_017465	CTAGC	2	10	302458	302467	20 %	20 %	20 %	40 %	385811933
114	NC_017465	TTAAT	2	10	303244	303253	40 %	60 %	0 %	0 %	385811933
115	NC_017465	AAAAT	2	10	303307	303316	80 %	20 %	0 %	0 %	385811933
116	NC_017465	ATGAT	2	10	305279	305288	40 %	40 %	20 %	0 %	385811934
117	NC_017465	TAATA	2	10	305939	305948	60 %	40 %	0 %	0 %	385811935
118	NC_017465	ACCGG	2	10	311821	311830	20 %	0 %	40 %	40 %	385811938
119	NC_017465	ACGGG	2	10	313237	313246	20 %	0 %	60 %	20 %	385811938
120	NC_017465	TTTGC	2	10	315554	315563	0 %	60 %	20 %	20 %	385811939
121	NC_017465	CCGGA	2	10	316154	316163	20 %	0 %	40 %	40 %	385811939
122	NC_017465	AGCCA	2	10	320773	320782	40 %	0 %	20 %	40 %	385811943
123	NC_017465	CGAAC	2	10	325238	325247	40 %	0 %	20 %	40 %	385811945
124	NC_017465	CTTTT	2	10	326175	326184	0 %	80 %	0 %	20 %	385811946
125	NC_017465	ATGGA	2	10	327342	327351	40 %	20 %	40 %	0 %	385811947
126	NC_017465	GATGA	2	10	327705	327714	40 %	20 %	40 %	0 %	385811947
127	NC_017465	TACGT	2	10	342169	342178	20 %	40 %	20 %	20 %	385811952
128	NC_017465	TCACC	2	10	343197	343206	20 %	20 %	0 %	60 %	385811953
129	NC_017465	AATGA	2	10	343677	343686	60 %	20 %	20 %	0 %	385811953
130	NC_017465	TGAAG	2	10	344954	344963	40 %	20 %	40 %	0 %	385811954
131	NC_017465	GCAAA	2	10	345867	345876	60 %	0 %	20 %	20 %	385811954
132	NC_017465	AGCGG	2	10	350088	350097	20 %	0 %	60 %	20 %	385811956
133	NC_017465	ACCAA	2	10	356047	356056	60 %	0 %	0 %	40 %	385811959
134	NC_017465	CACCC	2	10	359559	359568	20 %	0 %	0 %	80 %	385811960
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