MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 24576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017465	ATTC	2	8	362	369	25 %	50 %	0 %	25 %	385811787
2	NC_017465	ACC	2	6	470	475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811787
3	NC_017465	AGC	2	6	488	493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811787
4	NC_017465	GACC	2	8	495	502	25 %	0 %	25 %	50 %	385811787
5	NC_017465	GTC	2	6	505	510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811787
6	NC_017465	C	6	6	575	580	0 %	0 %	0 %	100 %	385811787
7	NC_017465	CGC	2	6	590	595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811787
8	NC_017465	ATG	2	6	679	684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811787
9	NC_017465	AAC	2	6	796	801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811787
10	NC_017465	CCG	2	6	903	908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811787
11	NC_017465	CGA	2	6	939	944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811787
12	NC_017465	TTC	2	6	952	957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385811787
13	NC_017465	ACA	2	6	1013	1018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811787
14	NC_017465	G	6	6	1100	1105	0 %	0 %	100 %	0 %	385811787
15	NC_017465	GAA	2	6	1168	1173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811787
16	NC_017465	ACG	2	6	1193	1198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811787
17	NC_017465	TGA	2	6	1256	1261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811787
18	NC_017465	CCA	2	6	1284	1289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811787
19	NC_017465	ACG	2	6	1351	1356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811787
20	NC_017465	ACA	2	6	1397	1402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811787
21	NC_017465	TCG	2	6	1445	1450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811787
22	NC_017465	CGG	2	6	1524	1529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811787
23	NC_017465	ACCAC	2	10	1535	1544	40 %	0 %	0 %	60 %	385811787
24	NC_017465	AAG	2	6	1583	1588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811787
25	NC_017465	CGCC	2	8	1590	1597	0 %	0 %	25 %	75 %	385811787
26	NC_017465	CAA	2	6	1847	1852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811788
27	NC_017465	TTC	2	6	1868	1873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385811788
28	NC_017465	GTC	2	6	1911	1916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811788
29	NC_017465	ACA	2	6	1918	1923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811788
30	NC_017465	AGA	2	6	2009	2014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811788
31	NC_017465	GCCC	2	8	2033	2040	0 %	0 %	25 %	75 %	385811788
32	NC_017465	TTC	2	6	2043	2048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385811788
33	NC_017465	AAG	2	6	2061	2066	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811788
34	NC_017465	CAA	2	6	2076	2081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811788
35	NC_017465	CGG	2	6	2131	2136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811788
36	NC_017465	GCT	2	6	2196	2201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811788
37	NC_017465	GCG	2	6	2214	2219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811788
38	NC_017465	GAT	2	6	2441	2446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811788
39	NC_017465	ACG	2	6	2586	2591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811788
40	NC_017465	GGC	2	6	2618	2623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811788
41	NC_017465	CGT	2	6	2635	2640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811788
42	NC_017465	CCA	2	6	2648	2653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811788
43	NC_017465	CGT	2	6	2666	2671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811788
44	NC_017465	GAA	2	6	2742	2747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811788
45	NC_017465	GGAA	2	8	2768	2775	50 %	0 %	50 %	0 %	385811788
46	NC_017465	ACG	2	6	2859	2864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811788
47	NC_017465	GAT	2	6	3394	3399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811789
48	NC_017465	CTG	2	6	3509	3514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811789
49	NC_017465	TGGC	2	8	3577	3584	0 %	25 %	50 %	25 %	385811789
50	NC_017465	GCG	2	6	3606	3611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811789
51	NC_017465	GAGC	2	8	3617	3624	25 %	0 %	50 %	25 %	385811789
52	NC_017465	GCC	2	6	3630	3635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811789
53	NC_017465	CCA	2	6	3657	3662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811789
54	NC_017465	ACC	2	6	3684	3689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811789
55	NC_017465	TTTG	2	8	3736	3743	0 %	75 %	25 %	0 %	385811789
56	NC_017465	CAG	2	6	3857	3862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811789
57	NC_017465	CAA	2	6	3905	3910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811789
58	NC_017465	G	6	6	3958	3963	0 %	0 %	100 %	0 %	385811789
59	NC_017465	AGT	2	6	3967	3972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811789
60	NC_017465	GGC	2	6	4012	4017	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811789
61	NC_017465	ACC	2	6	4026	4031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811789
62	NC_017465	AGA	2	6	4048	4053	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811789
63	NC_017465	GCC	2	6	4128	4133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811789
64	NC_017465	GAG	2	6	4148	4153	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385811789
65	NC_017465	ACC	2	6	4262	4267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811789
66	NC_017465	TGA	2	6	4299	4304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811789
67	NC_017465	GAC	2	6	4340	4345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811789
68	NC_017465	GAC	2	6	4364	4369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811789
69	NC_017465	CAC	2	6	4420	4425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811789
70	NC_017465	CAC	2	6	4460	4465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811789
71	NC_017465	AGG	2	6	4503	4508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385811789
72	NC_017465	CAA	2	6	4522	4527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811790
73	NC_017465	GAA	2	6	4528	4533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811790
74	NC_017465	CTAG	2	8	4552	4559	25 %	25 %	25 %	25 %	385811790
75	NC_017465	ACG	2	6	4565	4570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811790
76	NC_017465	CCAG	2	8	4571	4578	25 %	0 %	25 %	50 %	385811790
77	NC_017465	CCA	2	6	4637	4642	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811790
78	NC_017465	CAC	2	6	4657	4662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811790
79	NC_017465	TCG	2	6	4676	4681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811790
80	NC_017465	CGA	2	6	4692	4697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811790
81	NC_017465	TGA	2	6	4716	4721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811790
82	NC_017465	TTG	2	6	4733	4738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385811790
83	NC_017465	ATC	2	6	4753	4758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811790
84	NC_017465	CGGG	2	8	4770	4777	0 %	0 %	75 %	25 %	385811790
85	NC_017465	TCC	2	6	4838	4843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385811790
86	NC_017465	CGG	2	6	4866	4871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811790
87	NC_017465	GTC	2	6	4912	4917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811790
88	NC_017465	CGCC	2	8	4950	4957	0 %	0 %	25 %	75 %	385811790
89	NC_017465	TAC	2	6	4969	4974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811790
90	NC_017465	GAC	2	6	5023	5028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811790
91	NC_017465	CCCGGA	2	12	5067	5078	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385811790
92	NC_017465	ACA	2	6	5102	5107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811790
93	NC_017465	AAGGA	2	10	5186	5195	60 %	0 %	40 %	0 %	385811790
94	NC_017465	AAC	2	6	5374	5379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811790
95	NC_017465	CCG	2	6	5519	5524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811790
96	NC_017465	ACCAAG	2	12	5566	5577	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385811790
97	NC_017465	ATG	2	6	5641	5646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811790
98	NC_017465	TCG	2	6	5672	5677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811790
99	NC_017465	AGCA	2	8	5691	5698	50 %	0 %	25 %	25 %	385811790
100	NC_017465	CGC	2	6	5709	5714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811790
101	NC_017465	GC	3	6	5718	5723	0 %	0 %	50 %	50 %	385811790
102	NC_017465	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811790
103	NC_017465	GCTG	2	8	5778	5785	0 %	25 %	50 %	25 %	385811790
104	NC_017465	CCT	2	6	5927	5932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385811790
105	NC_017465	GAA	2	6	5953	5958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811790
106	NC_017465	CGA	2	6	5997	6002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811790
107	NC_017465	CAA	2	6	6012	6017	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811790
108	NC_017465	ATC	2	6	6037	6042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811790
109	NC_017465	TGT	2	6	6083	6088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385811790
110	NC_017465	GAT	2	6	6117	6122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811790
111	NC_017465	GCC	2	6	6150	6155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811790
112	NC_017465	GGT	2	6	6219	6224	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811790
113	NC_017465	AAC	2	6	6293	6298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811790
114	NC_017465	GCC	2	6	6364	6369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811790
115	NC_017465	CGG	2	6	6412	6417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811790
116	NC_017465	GAA	2	6	6427	6432	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811790
117	NC_017465	ATTC	2	8	6552	6559	25 %	50 %	0 %	25 %	385811791
118	NC_017465	GAAC	2	8	6652	6659	50 %	0 %	25 %	25 %	385811791
119	NC_017465	AAG	2	6	6686	6691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811791
120	NC_017465	GCC	2	6	6848	6853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811791
121	NC_017465	TGC	2	6	6897	6902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811791
122	NC_017465	CAA	2	6	6910	6915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811791
123	NC_017465	ACG	2	6	6942	6947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811791
124	NC_017465	TGA	2	6	7086	7091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811791
125	NC_017465	TGA	2	6	7119	7124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385811791
126	NC_017465	GAG	2	6	7241	7246	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385811791
127	NC_017465	GCAA	2	8	7257	7264	50 %	0 %	25 %	25 %	385811791
128	NC_017465	TCG	2	6	7269	7274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385811791
129	NC_017465	ACG	2	6	7371	7376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385811791
130	NC_017465	ACCG	2	8	7379	7386	25 %	0 %	25 %	50 %	385811791
131	NC_017465	CGC	2	6	7415	7420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385811791
132	NC_017465	AAC	2	6	7445	7450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811791
133	NC_017465	TAC	2	6	7550	7555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811791
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259	NC_017465	AAG	2	6	18812	18817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811794
260	NC_017465	GGT	2	6	18886	18891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385811794
261	NC_017465	CAT	2	6	18898	18903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385811794
262	NC_017465	AAC	2	6	18905	18910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811794
263	NC_017465	CGG	2	6	18931	18936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385811794
264	NC_017465	CCGC	2	8	18945	18952	0 %	0 %	25 %	75 %	385811794
265	NC_017465	CTT	2	6	19042	19047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385811794
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275	NC_017465	AAC	2	6	19530	19535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385811795
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281	NC_017465	ACC	2	6	19842	19847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385811795
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286	NC_017465	TACC	2	8	20177	20184	25 %	25 %	0 %	50 %	385811795
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289	NC_017465	ACCA	2	8	20421	20428	50 %	0 %	0 %	50 %	385811795
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294	NC_017465	TACC	2	8	20682	20689	25 %	25 %	0 %	50 %	385811796
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298	NC_017465	CAGT	2	8	20845	20852	25 %	25 %	25 %	25 %	385811796
299	NC_017465	AAG	2	6	20866	20871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385811796
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