MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospirillum ferrooxidans C2-3

Total Repeats: 42185

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017094	CTT	2	6	13	18	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383783296
2	NC_017094	GA	3	6	122	127	50 %	0 %	50 %	0 %	383783296
3	NC_017094	GAG	2	6	172	177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383783296
4	NC_017094	ATT	2	6	193	198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383783296
5	NC_017094	TGA	2	6	203	208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383783296
6	NC_017094	AGAA	2	8	277	284	75 %	0 %	25 %	0 %	383783296
7	NC_017094	A	6	6	283	288	100 %	0 %	0 %	0 %	383783296
8	NC_017094	CAG	2	6	355	360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383783296
9	NC_017094	TGT	2	6	408	413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383783296
10	NC_017094	AAT	2	6	460	465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383783296
11	NC_017094	GGA	2	6	499	504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383783296
12	NC_017094	TTCC	2	8	563	570	0 %	50 %	0 %	50 %	383783296
13	NC_017094	TCCT	2	8	598	605	0 %	50 %	0 %	50 %	383783296
14	NC_017094	GAT	2	6	688	693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383783296
15	NC_017094	AG	3	6	714	719	50 %	0 %	50 %	0 %	383783296
16	NC_017094	T	7	7	733	739	0 %	100 %	0 %	0 %	383783296
17	NC_017094	ATT	2	6	775	780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383783296
18	NC_017094	AGG	2	6	920	925	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383783296
19	NC_017094	GAA	2	6	940	945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383783296
20	NC_017094	T	6	6	952	957	0 %	100 %	0 %	0 %	383783296
21	NC_017094	ACC	2	6	1090	1095	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383783296
22	NC_017094	TAC	2	6	1141	1146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383783296
23	NC_017094	TCGG	2	8	1259	1266	0 %	25 %	50 %	25 %	383783296
24	NC_017094	TGG	2	6	1272	1277	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383783296
25	NC_017094	TCAT	2	8	1295	1302	25 %	50 %	0 %	25 %	383783296
26	NC_017094	AT	3	6	1311	1316	50 %	50 %	0 %	0 %	383783296
27	NC_017094	AAG	2	6	1369	1374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383783296
28	NC_017094	ATC	2	6	1458	1463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383783297
29	NC_017094	A	6	6	1520	1525	100 %	0 %	0 %	0 %	383783297
30	NC_017094	GCT	2	6	1527	1532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383783297
31	NC_017094	AC	3	6	1594	1599	50 %	0 %	0 %	50 %	383783297
32	NC_017094	GGA	2	6	1605	1610	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383783297
33	NC_017094	ACG	2	6	1650	1655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383783297
34	NC_017094	GA	3	6	1718	1723	50 %	0 %	50 %	0 %	383783297
35	NC_017094	GCGA	2	8	1750	1757	25 %	0 %	50 %	25 %	383783297
36	NC_017094	A	7	7	1866	1872	100 %	0 %	0 %	0 %	383783297
37	NC_017094	CAT	2	6	1992	1997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383783297
38	NC_017094	TTG	2	6	2007	2012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383783297
39	NC_017094	GCGG	2	8	2022	2029	0 %	0 %	75 %	25 %	383783297
40	NC_017094	A	7	7	2067	2073	100 %	0 %	0 %	0 %	383783297
41	NC_017094	GCTTGA	2	12	2099	2110	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383783297
42	NC_017094	TCGA	2	8	2130	2137	25 %	25 %	25 %	25 %	383783297
43	NC_017094	CTA	2	6	2183	2188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383783297
44	NC_017094	AGG	2	6	2227	2232	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383783297
45	NC_017094	AAG	2	6	2319	2324	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383783297
46	NC_017094	ATGA	2	8	2373	2380	50 %	25 %	25 %	0 %	383783297
47	NC_017094	TGA	2	6	2567	2572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383783297
48	NC_017094	GTAT	2	8	2585	2592	25 %	50 %	25 %	0 %	383783297
49	NC_017094	AGA	3	9	2670	2678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383783298
50	NC_017094	GTAT	2	8	2747	2754	25 %	50 %	25 %	0 %	383783298
51	NC_017094	GCA	2	6	2759	2764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383783298
52	NC_017094	CAT	2	6	2782	2787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383783298
53	NC_017094	TGA	2	6	2817	2822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383783298
54	NC_017094	CTG	2	6	2939	2944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383783298
55	NC_017094	AGT	2	6	2949	2954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383783298
56	NC_017094	TTC	2	6	2963	2968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383783298
57	NC_017094	CAA	2	6	2985	2990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383783298
58	NC_017094	ACTTGA	2	12	3060	3071	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	383783298
59	NC_017094	AGGA	2	8	3080	3087	50 %	0 %	50 %	0 %	383783298
60	NC_017094	ATC	2	6	3107	3112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383783298
61	NC_017094	CTC	2	6	3128	3133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383783298
62	NC_017094	ACC	2	6	3151	3156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383783298
63	NC_017094	GAA	3	9	3289	3297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383783298
64	NC_017094	GAG	2	6	3307	3312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383783298
65	NC_017094	GAGG	2	8	3325	3332	25 %	0 %	75 %	0 %	383783298
66	NC_017094	CGG	2	6	3397	3402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383783298
67	NC_017094	ACC	2	6	3451	3456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383783298
68	NC_017094	TTA	2	6	3548	3553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383783298
69	NC_017094	TCA	2	6	3560	3565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383783298
70	NC_017094	AGC	2	6	3572	3577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383783298
71	NC_017094	GGT	2	6	3630	3635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383783298
72	NC_017094	GAG	2	6	3730	3735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383783298
73	NC_017094	GAA	2	6	3751	3756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383783298
74	NC_017094	A	6	6	3849	3854	100 %	0 %	0 %	0 %	383783298
75	NC_017094	CCG	2	6	3947	3952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383783298
76	NC_017094	TGG	2	6	4035	4040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383783298
77	NC_017094	ATG	2	6	4061	4066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383783298
78	NC_017094	AGA	2	6	4124	4129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383783298
79	NC_017094	ATC	3	9	4147	4155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383783298
80	NC_017094	GACG	2	8	4158	4165	25 %	0 %	50 %	25 %	383783298
81	NC_017094	GCC	2	6	4263	4268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383783298
82	NC_017094	CTT	2	6	4420	4425	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383783298
83	NC_017094	TCT	2	6	4527	4532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383783298
84	NC_017094	TCT	2	6	4557	4562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383783298
85	NC_017094	GAG	2	6	4639	4644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383783298
86	NC_017094	GTG	2	6	4653	4658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383783298
87	NC_017094	AAG	2	6	4744	4749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383783298
88	NC_017094	ATG	2	6	4787	4792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383783298
89	NC_017094	T	6	6	4837	4842	0 %	100 %	0 %	0 %	383783298
90	NC_017094	CGT	2	6	5053	5058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383783298
91	NC_017094	TGAT	2	8	5104	5111	25 %	50 %	25 %	0 %	383783298
92	NC_017094	GCGATT	2	12	5182	5193	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	383783299
93	NC_017094	G	7	7	5332	5338	0 %	0 %	100 %	0 %	383783299
94	NC_017094	A	6	6	5344	5349	100 %	0 %	0 %	0 %	383783299
95	NC_017094	GTGAT	2	10	5366	5375	20 %	40 %	40 %	0 %	383783299
96	NC_017094	CGG	2	6	5402	5407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383783299
97	NC_017094	ATTG	2	8	5457	5464	25 %	50 %	25 %	0 %	383783299
98	NC_017094	GATC	2	8	5483	5490	25 %	25 %	25 %	25 %	383783299
99	NC_017094	GAG	2	6	5548	5553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383783299
100	NC_017094	ATG	2	6	5554	5559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383783299
101	NC_017094	GAA	2	6	5572	5577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383783299
102	NC_017094	ATG	2	6	5600	5605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383783299
103	NC_017094	GAA	2	6	5614	5619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383783299
104	NC_017094	TCG	2	6	5665	5670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383783299
105	NC_017094	C	7	7	5701	5707	0 %	0 %	0 %	100 %	383783299
106	NC_017094	ACA	2	6	5708	5713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383783299
107	NC_017094	ATC	2	6	5722	5727	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383783299
108	NC_017094	GAT	2	6	5742	5747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383783299
109	NC_017094	TCT	2	6	5775	5780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383783299
110	NC_017094	GACCG	2	10	5790	5799	20 %	0 %	40 %	40 %	383783299
111	NC_017094	AGG	2	6	5843	5848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383783299
112	NC_017094	GGA	2	6	5898	5903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383783299
113	NC_017094	A	6	6	5978	5983	100 %	0 %	0 %	0 %	383783299
114	NC_017094	GGAA	2	8	6048	6055	50 %	0 %	50 %	0 %	383783299
115	NC_017094	TCA	3	9	6098	6106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383783299
116	NC_017094	GTTC	2	8	6137	6144	0 %	50 %	25 %	25 %	383783299
117	NC_017094	CCCTTT	2	12	6185	6196	0 %	50 %	0 %	50 %	383783299
118	NC_017094	A	6	6	6265	6270	100 %	0 %	0 %	0 %	383783299
119	NC_017094	GATCA	2	10	6325	6334	40 %	20 %	20 %	20 %	383783299
120	NC_017094	CCT	2	6	6389	6394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383783299
121	NC_017094	ATT	2	6	6502	6507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383783299
122	NC_017094	GA	3	6	6558	6563	50 %	0 %	50 %	0 %	383783299
123	NC_017094	GATT	2	8	6633	6640	25 %	50 %	25 %	0 %	383783299
124	NC_017094	CGA	2	6	6657	6662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383783299
125	NC_017094	GGA	2	6	6739	6744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383783299
126	NC_017094	GAC	2	6	6775	6780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383783299
127	NC_017094	TCT	2	6	6824	6829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383783299
128	NC_017094	CA	3	6	6945	6950	50 %	0 %	0 %	50 %	383783299
129	NC_017094	CTT	2	6	6952	6957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383783299
130	NC_017094	GAA	2	6	6976	6981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383783299
131	NC_017094	GGA	2	6	7080	7085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383783299
132	NC_017094	GATG	2	8	7173	7180	25 %	25 %	50 %	0 %	383783299
133	NC_017094	GCA	2	6	7199	7204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383783299
134	NC_017094	CGGAG	2	10	7263	7272	20 %	0 %	60 %	20 %	383783299
135	NC_017094	TTG	2	6	7292	7297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383783299
136	NC_017094	GTT	2	6	7414	7419	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383783299
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142	NC_017094	T	6	6	7943	7948	0 %	100 %	0 %	0 %	383783300
143	NC_017094	A	6	6	8004	8009	100 %	0 %	0 %	0 %	383783300
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159	NC_017094	TTGA	2	8	8743	8750	25 %	50 %	25 %	0 %	383783301
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166	NC_017094	TCT	2	6	9362	9367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383783302
167	NC_017094	GGA	2	6	9371	9376	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383783302
168	NC_017094	AGGG	2	8	9425	9432	25 %	0 %	75 %	0 %	383783302
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