MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55

Total Repeats: 1781

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016011	GCCTT	2	10	2415	2424	0 %	40 %	20 %	40 %	347547512
2	NC_016011	TCATT	2	10	6857	6866	20 %	60 %	0 %	20 %	347547515
3	NC_016011	AAACT	2	10	7070	7079	60 %	20 %	0 %	20 %	347547515
4	NC_016011	AAATA	2	10	11114	11123	80 %	20 %	0 %	0 %	347547517
5	NC_016011	AAAGA	2	10	14379	14388	80 %	0 %	20 %	0 %	347547520
6	NC_016011	ATGAA	2	10	17241	17250	60 %	20 %	20 %	0 %	347547522
7	NC_016011	GAATG	2	10	18982	18991	40 %	20 %	40 %	0 %	347547523
8	NC_016011	ATTAA	2	10	20647	20656	60 %	40 %	0 %	0 %	347547526
9	NC_016011	TGGAT	2	10	22337	22346	20 %	40 %	40 %	0 %	347547527
10	NC_016011	ACTTT	2	10	22372	22381	20 %	60 %	0 %	20 %	347547527
11	NC_016011	AAATC	2	10	24230	24239	60 %	20 %	0 %	20 %	347547528
12	NC_016011	TTTCT	2	10	26159	26168	0 %	80 %	0 %	20 %	347547530
13	NC_016011	TCACA	2	10	26807	26816	40 %	20 %	0 %	40 %	347547531
14	NC_016011	CCATA	2	10	27557	27566	40 %	20 %	0 %	40 %	347547532
15	NC_016011	AGTAA	2	10	27980	27989	60 %	20 %	20 %	0 %	347547532
16	NC_016011	TAAAA	2	10	29222	29231	80 %	20 %	0 %	0 %	347547534
17	NC_016011	GATAG	2	10	30946	30955	40 %	20 %	40 %	0 %	347547537
18	NC_016011	GAAAA	2	10	31171	31180	80 %	0 %	20 %	0 %	347547537
19	NC_016011	TGGTT	2	10	31427	31436	0 %	60 %	40 %	0 %	347547537
20	NC_016011	CAGCT	2	10	32051	32060	20 %	20 %	20 %	40 %	347547538
21	NC_016011	TGAAA	2	10	32329	32338	60 %	20 %	20 %	0 %	347547538
22	NC_016011	ACTTT	2	10	32903	32912	20 %	60 %	0 %	20 %	347547539
23	NC_016011	CTAAT	2	10	33498	33507	40 %	40 %	0 %	20 %	347547539
24	NC_016011	TTAAT	2	10	34184	34193	40 %	60 %	0 %	0 %	347547540
25	NC_016011	AAATT	2	10	34328	34337	60 %	40 %	0 %	0 %	347547540
26	NC_016011	GTTTG	2	10	37173	37182	0 %	60 %	40 %	0 %	347547541
27	NC_016011	ATATT	2	10	37672	37681	40 %	60 %	0 %	0 %	347547542
28	NC_016011	TTATT	2	10	40504	40513	20 %	80 %	0 %	0 %	347547544
29	NC_016011	TACTT	2	10	41095	41104	20 %	60 %	0 %	20 %	347547544
30	NC_016011	ATTTT	2	10	45476	45485	20 %	80 %	0 %	0 %	347547549
31	NC_016011	AGATG	2	10	46533	46542	40 %	20 %	40 %	0 %	347547550
32	NC_016011	AAATG	2	10	46605	46614	60 %	20 %	20 %	0 %	347547550
33	NC_016011	GTAGA	2	10	47692	47701	40 %	20 %	40 %	0 %	347547551
34	NC_016011	TTACT	2	10	48680	48689	20 %	60 %	0 %	20 %	347547553
35	NC_016011	AAAAG	2	10	49188	49197	80 %	0 %	20 %	0 %	347547554
36	NC_016011	ATGAA	2	10	49335	49344	60 %	20 %	20 %	0 %	347547554
37	NC_016011	TGCTA	2	10	50858	50867	20 %	40 %	20 %	20 %	347547557
38	NC_016011	CCTTT	2	10	50869	50878	0 %	60 %	0 %	40 %	347547557
39	NC_016011	GTTTT	2	10	51025	51034	0 %	80 %	20 %	0 %	347547557
40	NC_016011	ATTTT	2	10	52539	52548	20 %	80 %	0 %	0 %	347547558
41	NC_016011	CAAAA	2	10	53726	53735	80 %	0 %	0 %	20 %	347547559
42	NC_016011	GCGTG	2	10	61278	61287	0 %	20 %	60 %	20 %	347547564
43	NC_016011	GTTAT	2	10	61756	61765	20 %	60 %	20 %	0 %	347547564
44	NC_016011	CAAAA	2	10	62711	62720	80 %	0 %	0 %	20 %	347547565
45	NC_016011	AACAT	2	10	62812	62821	60 %	20 %	0 %	20 %	347547566
46	NC_016011	CAATA	2	10	70412	70421	60 %	20 %	0 %	20 %	347547570
47	NC_016011	GGATG	2	10	70842	70851	20 %	20 %	60 %	0 %	347547571
48	NC_016011	CCAGA	2	10	71053	71062	40 %	0 %	20 %	40 %	347547571
49	NC_016011	ACGGC	2	10	74441	74450	20 %	0 %	40 %	40 %	347547574
50	NC_016011	GTCGC	2	10	74497	74506	0 %	20 %	40 %	40 %	347547574
51	NC_016011	TCAAG	2	10	75335	75344	40 %	20 %	20 %	20 %	347547575
52	NC_016011	TTGTT	2	10	77241	77250	0 %	80 %	20 %	0 %	347547577
53	NC_016011	GCTTT	2	10	80755	80764	0 %	60 %	20 %	20 %	347547580
54	NC_016011	CATTC	2	10	83768	83777	20 %	40 %	0 %	40 %	347547583
55	NC_016011	TGGAT	2	10	85316	85325	20 %	40 %	40 %	0 %	347547584
56	NC_016011	TGAAC	2	10	85568	85577	40 %	20 %	20 %	20 %	347547584
57	NC_016011	TGGTC	2	10	87632	87641	0 %	40 %	40 %	20 %	347547586
58	NC_016011	AAAAT	2	10	87724	87733	80 %	20 %	0 %	0 %	347547586
59	NC_016011	AAGAA	2	10	90217	90226	80 %	0 %	20 %	0 %	347547586
60	NC_016011	TGATT	2	10	92052	92061	20 %	60 %	20 %	0 %	347547588
61	NC_016011	TGACA	2	10	93945	93954	40 %	20 %	20 %	20 %	347547590
62	NC_016011	TTTAA	2	10	95158	95167	40 %	60 %	0 %	0 %	347547591
63	NC_016011	AAAAC	2	10	96267	96276	80 %	0 %	0 %	20 %	347547592
64	NC_016011	AACAA	2	10	96932	96941	80 %	0 %	0 %	20 %	347547593
65	NC_016011	CTACA	2	10	101457	101466	40 %	20 %	0 %	40 %	347547598
66	NC_016011	TCAAA	2	10	102690	102699	60 %	20 %	0 %	20 %	347547599
67	NC_016011	TTTTA	2	10	103340	103349	20 %	80 %	0 %	0 %	347547600
68	NC_016011	AATGA	2	10	104262	104271	60 %	20 %	20 %	0 %	347547600
69	NC_016011	AAATG	2	10	105377	105386	60 %	20 %	20 %	0 %	347547601
70	NC_016011	TATCG	2	10	105477	105486	20 %	40 %	20 %	20 %	347547601
71	NC_016011	GAAAA	2	10	106653	106662	80 %	0 %	20 %	0 %	347547604
72	NC_016011	CAAAA	2	10	115807	115816	80 %	0 %	0 %	20 %	347547610
73	NC_016011	TTTGC	2	10	118265	118274	0 %	60 %	20 %	20 %	347547614
74	NC_016011	GTGTG	2	10	118308	118317	0 %	40 %	60 %	0 %	347547614
75	NC_016011	TTTTA	2	10	118369	118378	20 %	80 %	0 %	0 %	347547614
76	NC_016011	AATTT	2	10	120018	120027	40 %	60 %	0 %	0 %	347547617
77	NC_016011	TTTTA	2	10	124059	124068	20 %	80 %	0 %	0 %	347547619
78	NC_016011	AATTA	2	10	124196	124205	60 %	40 %	0 %	0 %	347547620
79	NC_016011	AAAAT	2	10	125684	125693	80 %	20 %	0 %	0 %	347547620
80	NC_016011	GCAAA	2	10	126820	126829	60 %	0 %	20 %	20 %	347547623
81	NC_016011	AAACA	2	10	127104	127113	80 %	0 %	0 %	20 %	347547623
82	NC_016011	TTTAC	2	10	127188	127197	20 %	60 %	0 %	20 %	347547623
83	NC_016011	TATTT	2	10	128588	128597	20 %	80 %	0 %	0 %	347547624
84	NC_016011	TTCAG	2	10	129551	129560	20 %	40 %	20 %	20 %	347547625
85	NC_016011	TTGGT	2	10	129590	129599	0 %	60 %	40 %	0 %	347547625
86	NC_016011	TGAAA	2	10	132406	132415	60 %	20 %	20 %	0 %	347547626
87	NC_016011	CACGG	2	10	132571	132580	20 %	0 %	40 %	40 %	347547626
88	NC_016011	AATTT	2	10	132830	132839	40 %	60 %	0 %	0 %	347547626
89	NC_016011	GGTGC	2	10	133227	133236	0 %	20 %	60 %	20 %	347547627
90	NC_016011	TTTGG	2	10	134935	134944	0 %	60 %	40 %	0 %	347547629
91	NC_016011	TGGAA	2	10	135000	135009	40 %	20 %	40 %	0 %	347547629
92	NC_016011	TGTTT	2	10	135959	135968	0 %	80 %	20 %	0 %	347547630
93	NC_016011	TGTGA	2	10	137568	137577	20 %	40 %	40 %	0 %	347547631
94	NC_016011	ATGAA	2	10	140246	140255	60 %	20 %	20 %	0 %	347547633
95	NC_016011	AATGA	2	10	141125	141134	60 %	20 %	20 %	0 %	347547634
96	NC_016011	AAAAT	2	10	142412	142421	80 %	20 %	0 %	0 %	347547635
97	NC_016011	TCATT	2	10	146292	146301	20 %	60 %	0 %	20 %	347547639
98	NC_016011	AAGAT	2	10	150652	150661	60 %	20 %	20 %	0 %	347547642
99	NC_016011	GAATT	2	10	151023	151032	40 %	40 %	20 %	0 %	347547643
100	NC_016011	TTTTA	2	10	151256	151265	20 %	80 %	0 %	0 %	347547643
101	NC_016011	ATTTT	2	10	153614	153623	20 %	80 %	0 %	0 %	347547647
102	NC_016011	AACGA	2	10	153794	153803	60 %	0 %	20 %	20 %	347547647
103	NC_016011	CGGTA	2	10	153821	153830	20 %	20 %	40 %	20 %	347547647
104	NC_016011	AAATA	2	10	154066	154075	80 %	20 %	0 %	0 %	347547647
105	NC_016011	TTATT	2	10	157189	157198	20 %	80 %	0 %	0 %	347547651
106	NC_016011	AAAAG	2	10	157640	157649	80 %	0 %	20 %	0 %	347547651
107	NC_016011	AAGAA	2	10	157655	157664	80 %	0 %	20 %	0 %	347547651
108	NC_016011	TAAAA	2	10	159798	159807	80 %	20 %	0 %	0 %	347547652
109	NC_016011	TTAAT	2	10	160016	160025	40 %	60 %	0 %	0 %	347547653
110	NC_016011	GCTAC	2	10	162768	162777	20 %	20 %	20 %	40 %	347547655
111	NC_016011	AGTGA	2	10	163662	163671	40 %	20 %	40 %	0 %	347547656
112	NC_016011	AAATT	2	10	166241	166250	60 %	40 %	0 %	0 %	347547657
113	NC_016011	TCCAT	2	10	168162	168171	20 %	40 %	0 %	40 %	347547658
114	NC_016011	ATTTC	2	10	170509	170518	20 %	60 %	0 %	20 %	347547659
115	NC_016011	GATAT	2	10	170733	170742	40 %	40 %	20 %	0 %	347547659
116	NC_016011	AAGTA	2	10	171562	171571	60 %	20 %	20 %	0 %	347547659
117	NC_016011	ATTTC	2	10	171829	171838	20 %	60 %	0 %	20 %	347547660
118	NC_016011	AAATT	2	10	173395	173404	60 %	40 %	0 %	0 %	347547661
119	NC_016011	TGGAG	2	10	174348	174357	20 %	20 %	60 %	0 %	347547662
120	NC_016011	AATTT	2	10	176221	176230	40 %	60 %	0 %	0 %	347547665
121	NC_016011	TGGCT	2	10	177191	177200	0 %	40 %	40 %	20 %	347547666
122	NC_016011	GTAAA	2	10	179111	179120	60 %	20 %	20 %	0 %	347547668
123	NC_016011	CATTT	2	10	184334	184343	20 %	60 %	0 %	20 %	347547673
124	NC_016011	TAATT	2	10	184468	184477	40 %	60 %	0 %	0 %	347547673
125	NC_016011	GAAAA	2	10	188094	188103	80 %	0 %	20 %	0 %	347547676
126	NC_016011	AAGGT	2	10	188656	188665	40 %	20 %	40 %	0 %	347547676
127	NC_016011	TGGCT	2	10	189389	189398	0 %	40 %	40 %	20 %	347547676
128	NC_016011	GCAAG	2	10	192370	192379	40 %	0 %	40 %	20 %	347547677
129	NC_016011	AACCG	2	10	194049	194058	40 %	0 %	20 %	40 %	347547677
130	NC_016011	GGGAA	2	10	200248	200257	40 %	0 %	60 %	0 %	347547684
131	NC_016011	AAAAT	2	10	200453	200462	80 %	20 %	0 %	0 %	347547684
132	NC_016011	AATGG	2	10	200713	200722	40 %	20 %	40 %	0 %	347547685
133	NC_016011	TAGAA	2	10	201846	201855	60 %	20 %	20 %	0 %	347547686
134	NC_016011	TGGAA	2	10	202824	202833	40 %	20 %	40 %	0 %	347547686
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