MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55

Total Repeats: 55821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016011	AGC	2	6	26884	26889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547531
502	NC_016011	ATTA	2	8	26895	26902	50 %	50 %	0 %	0 %	347547531
503	NC_016011	CAG	2	6	26954	26959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547531
504	NC_016011	T	6	6	27015	27020	0 %	100 %	0 %	0 %	347547531
505	NC_016011	T	6	6	27024	27029	0 %	100 %	0 %	0 %	347547531
506	NC_016011	CTT	2	6	27077	27082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547531
507	NC_016011	AAT	2	6	27162	27167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547531
508	NC_016011	GAAA	2	8	27186	27193	75 %	0 %	25 %	0 %	347547531
509	NC_016011	ATC	2	6	27213	27218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547531
510	NC_016011	CAC	2	6	27230	27235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547531
511	NC_016011	TTG	2	6	27236	27241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547531
512	NC_016011	GAT	2	6	27243	27248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547531
513	NC_016011	AAT	2	6	27332	27337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547531
514	NC_016011	TGT	2	6	27426	27431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547532
515	NC_016011	ACT	2	6	27472	27477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547532
516	NC_016011	GAAGTG	2	12	27514	27525	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	347547532
517	NC_016011	CCATA	2	10	27557	27566	40 %	20 %	0 %	40 %	347547532
518	NC_016011	AGT	2	6	27574	27579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547532
519	NC_016011	TAA	2	6	27583	27588	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547532
520	NC_016011	AAT	2	6	27639	27644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547532
521	NC_016011	TAAT	2	8	27659	27666	50 %	50 %	0 %	0 %	347547532
522	NC_016011	TA	3	6	27777	27782	50 %	50 %	0 %	0 %	347547532
523	NC_016011	ACAA	2	8	27841	27848	75 %	0 %	0 %	25 %	347547532
524	NC_016011	T	6	6	27879	27884	0 %	100 %	0 %	0 %	347547532
525	NC_016011	A	6	6	27904	27909	100 %	0 %	0 %	0 %	347547532
526	NC_016011	CAA	2	6	27962	27967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547532
527	NC_016011	GGTA	2	8	27970	27977	25 %	25 %	50 %	0 %	347547532
528	NC_016011	AGTAA	2	10	27980	27989	60 %	20 %	20 %	0 %	347547532
529	NC_016011	ACT	2	6	28000	28005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547532
530	NC_016011	ACT	2	6	28105	28110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547532
531	NC_016011	ATA	2	6	28114	28119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547532
532	NC_016011	T	6	6	28122	28127	0 %	100 %	0 %	0 %	347547532
533	NC_016011	TTC	2	6	28129	28134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547532
534	NC_016011	CAAT	2	8	28316	28323	50 %	25 %	0 %	25 %	347547533
535	NC_016011	A	6	6	28329	28334	100 %	0 %	0 %	0 %	347547533
536	NC_016011	AAG	2	6	28405	28410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547533
537	NC_016011	ACT	2	6	28528	28533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547533
538	NC_016011	T	7	7	28604	28610	0 %	100 %	0 %	0 %	347547533
539	NC_016011	CTAA	2	8	28613	28620	50 %	25 %	0 %	25 %	347547533
540	NC_016011	AAT	2	6	28624	28629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547533
541	NC_016011	TTCT	2	8	28633	28640	0 %	75 %	0 %	25 %	347547533
542	NC_016011	TAG	2	6	28648	28653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547533
543	NC_016011	GGA	2	6	28702	28707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347547533
544	NC_016011	AAG	2	6	28732	28737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547533
545	NC_016011	CTC	2	6	28744	28749	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347547533
546	NC_016011	A	6	6	28791	28796	100 %	0 %	0 %	0 %	347547533
547	NC_016011	A	7	7	28800	28806	100 %	0 %	0 %	0 %	347547533
548	NC_016011	AGA	2	6	28826	28831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547533
549	NC_016011	ACT	2	6	28893	28898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547534
550	NC_016011	TAGG	2	8	28918	28925	25 %	25 %	50 %	0 %	347547534
551	NC_016011	GAA	2	6	28984	28989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547534
552	NC_016011	TCA	2	6	28990	28995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547534
553	NC_016011	A	6	6	29006	29011	100 %	0 %	0 %	0 %	347547534
554	NC_016011	TGC	2	6	29012	29017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547534
555	NC_016011	T	6	6	29030	29035	0 %	100 %	0 %	0 %	347547534
556	NC_016011	GCCA	2	8	29072	29079	25 %	0 %	25 %	50 %	347547534
557	NC_016011	CAA	2	6	29098	29103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347547534
558	NC_016011	TCCA	2	8	29174	29181	25 %	25 %	0 %	50 %	347547534
559	NC_016011	ACC	2	6	29198	29203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547534
560	NC_016011	ATA	2	6	29211	29216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547534
561	NC_016011	TAAAA	2	10	29222	29231	80 %	20 %	0 %	0 %	347547534
562	NC_016011	TAA	3	9	29234	29242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547534
563	NC_016011	GAA	2	6	29293	29298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547534
564	NC_016011	T	7	7	29306	29312	0 %	100 %	0 %	0 %	347547534
565	NC_016011	TAA	2	6	29381	29386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547534
566	NC_016011	CTG	2	6	29488	29493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547534
567	NC_016011	GAA	2	6	29512	29517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547534
568	NC_016011	ATA	2	6	29699	29704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547535
569	NC_016011	TTA	2	6	29721	29726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547535
570	NC_016011	CAC	2	6	29773	29778	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547535
571	NC_016011	ATT	2	6	29811	29816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547535
572	NC_016011	T	6	6	29834	29839	0 %	100 %	0 %	0 %	347547535
573	NC_016011	ATT	2	6	29843	29848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547535
574	NC_016011	ATT	2	6	29921	29926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547535
575	NC_016011	GTTTAA	2	12	29980	29991	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347547535
576	NC_016011	CAG	2	6	30013	30018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347547535
577	NC_016011	T	6	6	30084	30089	0 %	100 %	0 %	0 %	347547535
578	NC_016011	T	6	6	30098	30103	0 %	100 %	0 %	0 %	347547535
579	NC_016011	ATG	2	6	30105	30110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547535
580	NC_016011	GCG	2	6	30336	30341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347547536
581	NC_016011	AGA	2	6	30398	30403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547536
582	NC_016011	TCT	2	6	30415	30420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547536
583	NC_016011	TGT	2	6	30476	30481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547536
584	NC_016011	TGG	2	6	30500	30505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547536
585	NC_016011	ATG	2	6	30510	30515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547536
586	NC_016011	TGC	2	6	30518	30523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547536
587	NC_016011	TAC	2	6	30562	30567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547536
588	NC_016011	TGG	2	6	30587	30592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347547536
589	NC_016011	GAA	2	6	30615	30620	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347547536
590	NC_016011	GCT	2	6	30621	30626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347547536
591	NC_016011	TAAAAT	2	12	30639	30650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547536
592	NC_016011	TAA	2	6	30706	30711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547537
593	NC_016011	AGT	2	6	30732	30737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547537
594	NC_016011	AAT	2	6	30869	30874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547537
595	NC_016011	T	6	6	30882	30887	0 %	100 %	0 %	0 %	347547537
596	NC_016011	ATT	2	6	30930	30935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547537
597	NC_016011	GATAG	2	10	30946	30955	40 %	20 %	40 %	0 %	347547537
598	NC_016011	CTT	2	6	31010	31015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547537
599	NC_016011	TAG	2	6	31153	31158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547537
600	NC_016011	GAAAA	2	10	31171	31180	80 %	0 %	20 %	0 %	347547537
601	NC_016011	A	7	7	31177	31183	100 %	0 %	0 %	0 %	347547537
602	NC_016011	ATT	2	6	31255	31260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347547537
603	NC_016011	ACC	2	6	31276	31281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547537
604	NC_016011	CCA	2	6	31282	31287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347547537
605	NC_016011	ATG	2	6	31374	31379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547537
606	NC_016011	CTT	2	6	31382	31387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547537
607	NC_016011	TTG	2	6	31395	31400	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347547537
608	NC_016011	T	6	6	31415	31420	0 %	100 %	0 %	0 %	347547537
609	NC_016011	TGGTT	2	10	31427	31436	0 %	60 %	40 %	0 %	347547537
610	NC_016011	AGT	2	6	31441	31446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547537
611	NC_016011	AAAT	2	8	31486	31493	75 %	25 %	0 %	0 %	347547537
612	NC_016011	ATTA	2	8	31552	31559	50 %	50 %	0 %	0 %	347547538
613	NC_016011	TCT	2	6	31706	31711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547538
614	NC_016011	TGTT	2	8	31806	31813	0 %	75 %	25 %	0 %	347547538
615	NC_016011	AGT	2	6	31814	31819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547538
616	NC_016011	ATC	2	6	31873	31878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547538
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618	NC_016011	CTT	2	6	31908	31913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547538
619	NC_016011	CTAA	2	8	32003	32010	50 %	25 %	0 %	25 %	347547538
620	NC_016011	GTA	2	6	32012	32017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347547538
621	NC_016011	T	7	7	32023	32029	0 %	100 %	0 %	0 %	347547538
622	NC_016011	AATA	2	8	32041	32048	75 %	25 %	0 %	0 %	347547538
623	NC_016011	CAGCT	2	10	32051	32060	20 %	20 %	20 %	40 %	347547538
624	NC_016011	ACT	2	6	32084	32089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347547538
625	NC_016011	TTTA	2	8	32098	32105	25 %	75 %	0 %	0 %	347547538
626	NC_016011	TA	3	6	32122	32127	50 %	50 %	0 %	0 %	347547538
627	NC_016011	CTT	2	6	32142	32147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347547538
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629	NC_016011	AAT	2	6	32197	32202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347547538
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