MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS1

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015979	AC	3	6	2495	2500	50 %	0 %	0 %	50 %	347533702
2	NC_015979	CG	3	6	2626	2631	0 %	0 %	50 %	50 %	347533703
3	NC_015979	CT	3	6	4438	4443	0 %	50 %	0 %	50 %	347533705
4	NC_015979	AT	3	6	5768	5773	50 %	50 %	0 %	0 %	347533707
5	NC_015979	AT	3	6	8553	8558	50 %	50 %	0 %	0 %	347533710
6	NC_015979	AT	3	6	8741	8746	50 %	50 %	0 %	0 %	347533710
7	NC_015979	GC	3	6	9550	9555	0 %	0 %	50 %	50 %	347533713
8	NC_015979	CT	3	6	10021	10026	0 %	50 %	0 %	50 %	347533714
9	NC_015979	GT	3	6	10203	10208	0 %	50 %	50 %	0 %	347533714
10	NC_015979	GC	3	6	13529	13534	0 %	0 %	50 %	50 %	347533718
11	NC_015979	CG	3	6	14256	14261	0 %	0 %	50 %	50 %	347533719
12	NC_015979	CT	3	6	14651	14656	0 %	50 %	0 %	50 %	347533719
13	NC_015979	CT	3	6	18117	18122	0 %	50 %	0 %	50 %	347533721
14	NC_015979	TA	3	6	20157	20162	50 %	50 %	0 %	0 %	347533722
15	NC_015979	CA	3	6	21206	21211	50 %	0 %	0 %	50 %	347533722
16	NC_015979	AG	3	6	23344	23349	50 %	0 %	50 %	0 %	347533724
17	NC_015979	AT	3	6	23436	23441	50 %	50 %	0 %	0 %	347533724
18	NC_015979	AG	3	6	23563	23568	50 %	0 %	50 %	0 %	347533724
19	NC_015979	TA	3	6	23846	23851	50 %	50 %	0 %	0 %	347533725
20	NC_015979	AT	3	6	27820	27825	50 %	50 %	0 %	0 %	347533728
21	NC_015979	CA	3	6	28327	28332	50 %	0 %	0 %	50 %	347533729
22	NC_015979	TA	3	6	29023	29028	50 %	50 %	0 %	0 %	347533730
23	NC_015979	CA	3	6	29810	29815	50 %	0 %	0 %	50 %	347533731
24	NC_015979	TA	3	6	32581	32586	50 %	50 %	0 %	0 %	347533733
25	NC_015979	GC	3	6	33399	33404	0 %	0 %	50 %	50 %	347533733
26	NC_015979	AC	3	6	33929	33934	50 %	0 %	0 %	50 %	347533734
27	NC_015979	TA	4	8	34801	34808	50 %	50 %	0 %	0 %	347533735
28	NC_015979	AT	3	6	35295	35300	50 %	50 %	0 %	0 %	347533735
29	NC_015979	AT	3	6	35736	35741	50 %	50 %	0 %	0 %	347533735
30	NC_015979	AT	3	6	35866	35871	50 %	50 %	0 %	0 %	347533735
31	NC_015979	TA	4	8	36159	36166	50 %	50 %	0 %	0 %	347533735
32	NC_015979	AC	3	6	36389	36394	50 %	0 %	0 %	50 %	347533735
33	NC_015979	AT	3	6	36618	36623	50 %	50 %	0 %	0 %	347533736
34	NC_015979	AT	3	6	37024	37029	50 %	50 %	0 %	0 %	347533736
35	NC_015979	AT	3	6	37257	37262	50 %	50 %	0 %	0 %	347533736
36	NC_015979	AT	3	6	41669	41674	50 %	50 %	0 %	0 %	347533738
37	NC_015979	TA	3	6	43629	43634	50 %	50 %	0 %	0 %	347533740
38	NC_015979	GA	3	6	44056	44061	50 %	0 %	50 %	0 %	347533740
39	NC_015979	CA	4	8	44371	44378	50 %	0 %	0 %	50 %	347533740
40	NC_015979	TA	3	6	44881	44886	50 %	50 %	0 %	0 %	347533740
41	NC_015979	AT	3	6	50406	50411	50 %	50 %	0 %	0 %	347533742
42	NC_015979	TA	3	6	54423	54428	50 %	50 %	0 %	0 %	347533747
43	NC_015979	AT	3	6	55071	55076	50 %	50 %	0 %	0 %	347533748
44	NC_015979	AT	3	6	55155	55160	50 %	50 %	0 %	0 %	347533748
45	NC_015979	AT	3	6	55206	55211	50 %	50 %	0 %	0 %	347533748
46	NC_015979	AG	3	6	56226	56231	50 %	0 %	50 %	0 %	347533750
47	NC_015979	GA	3	6	57242	57247	50 %	0 %	50 %	0 %	347533751

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.