MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 plasmid pLS1

Total Repeats: 503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015979	ATA	2	6	377	382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
2	NC_015979	TAA	2	6	408	413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
3	NC_015979	ATC	2	6	414	419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533701
4	NC_015979	GAA	2	6	454	459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533701
5	NC_015979	AGC	2	6	649	654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533701
6	NC_015979	GTA	2	6	764	769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
7	NC_015979	ATA	2	6	890	895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
8	NC_015979	TTA	2	6	1174	1179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533701
9	NC_015979	TGA	2	6	1287	1292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
10	NC_015979	TGA	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
11	NC_015979	ATG	2	6	1418	1423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
12	NC_015979	TTA	2	6	1466	1471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533701
13	NC_015979	TGA	2	6	1529	1534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
14	NC_015979	TAA	2	6	1551	1556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533701
15	NC_015979	TGA	3	9	1746	1754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533701
16	NC_015979	AAG	2	6	2377	2382	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533702
17	NC_015979	TTG	2	6	2400	2405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533702
18	NC_015979	GTT	2	6	2480	2485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533702
19	NC_015979	CAT	2	6	2580	2585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533703
20	NC_015979	ATT	2	6	2640	2645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533703
21	NC_015979	GAA	2	6	2737	2742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533703
22	NC_015979	AAC	2	6	2747	2752	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533703
23	NC_015979	AAC	2	6	2793	2798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533703
24	NC_015979	ATT	3	9	4032	4040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533704
25	NC_015979	CTT	2	6	4053	4058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533704
26	NC_015979	ATA	2	6	4148	4153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533704
27	NC_015979	GCA	2	6	4157	4162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533704
28	NC_015979	ATA	2	6	4182	4187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533704
29	NC_015979	ATA	3	9	4223	4231	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533704
30	NC_015979	ATT	2	6	4253	4258	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533704
31	NC_015979	ATT	2	6	4351	4356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533705
32	NC_015979	CCT	2	6	4401	4406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347533705
33	NC_015979	TTC	2	6	4411	4416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533705
34	NC_015979	CTT	2	6	4428	4433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533705
35	NC_015979	TAA	2	6	4501	4506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533705
36	NC_015979	AAC	2	6	4519	4524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533705
37	NC_015979	ACT	2	6	4751	4756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533706
38	NC_015979	TGT	2	6	4757	4762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533706
39	NC_015979	CCA	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533706
40	NC_015979	ATG	2	6	4829	4834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533706
41	NC_015979	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533706
42	NC_015979	TCA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533706
43	NC_015979	CTT	2	6	5784	5789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533707
44	NC_015979	GAT	2	6	5871	5876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533707
45	NC_015979	TGC	2	6	6023	6028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533707
46	NC_015979	ACG	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533707
47	NC_015979	ATA	2	6	6167	6172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533707
48	NC_015979	GCT	2	6	6288	6293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533708
49	NC_015979	CAA	2	6	6305	6310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533708
50	NC_015979	AGA	2	6	6493	6498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533708
51	NC_015979	ATA	2	6	6690	6695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533708
52	NC_015979	CTT	2	6	6817	6822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533708
53	NC_015979	ACT	2	6	6872	6877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533708
54	NC_015979	CTT	2	6	6913	6918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533708
55	NC_015979	CAA	2	6	7013	7018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533708
56	NC_015979	CAA	2	6	7130	7135	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533708
57	NC_015979	TAG	3	9	7167	7175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533708
58	NC_015979	GAG	2	6	7178	7183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347533708
59	NC_015979	TAC	2	6	7321	7326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533708
60	NC_015979	TAT	2	6	7728	7733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533709
61	NC_015979	ACA	2	6	7766	7771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533709
62	NC_015979	TTG	2	6	7787	7792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533709
63	NC_015979	TAT	2	6	7899	7904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533709
64	NC_015979	TGC	2	6	7908	7913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533709
65	NC_015979	AAC	2	6	7946	7951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533709
66	NC_015979	TTC	2	6	7954	7959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533709
67	NC_015979	TTC	2	6	8302	8307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533709
68	NC_015979	AAG	2	6	8342	8347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533709
69	NC_015979	AAT	2	6	8366	8371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533709
70	NC_015979	TAG	2	6	8528	8533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533710
71	NC_015979	AAT	2	6	9177	9182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533711
72	NC_015979	ATT	2	6	9204	9209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533711
73	NC_015979	ATT	2	6	9228	9233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533711
74	NC_015979	ATT	2	6	9431	9436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533712
75	NC_015979	ATG	2	6	9450	9455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533712
76	NC_015979	CGT	2	6	9623	9628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533713
77	NC_015979	TCG	2	6	9727	9732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533713
78	NC_015979	CAC	2	6	9740	9745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533713
79	NC_015979	TCT	2	6	9808	9813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533713
80	NC_015979	TGG	2	6	9830	9835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533713
81	NC_015979	TCC	2	6	9847	9852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347533713
82	NC_015979	GAT	2	6	9901	9906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533714
83	NC_015979	CGA	2	6	9981	9986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533714
84	NC_015979	CAT	2	6	10319	10324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533715
85	NC_015979	ACG	2	6	10337	10342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533715
86	NC_015979	GAT	2	6	10476	10481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533715
87	NC_015979	GCC	2	6	10746	10751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347533715
88	NC_015979	ATT	2	6	11163	11168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533716
89	NC_015979	GAT	2	6	11239	11244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533716
90	NC_015979	AAC	2	6	11281	11286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533716
91	NC_015979	TGA	2	6	11393	11398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533716
92	NC_015979	ATT	2	6	11407	11412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533716
93	NC_015979	CAG	2	6	11464	11469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533716
94	NC_015979	GAC	2	6	11619	11624	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533716
95	NC_015979	CTG	2	6	12061	12066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533717
96	NC_015979	GCT	2	6	12084	12089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533717
97	NC_015979	GGA	2	6	12139	12144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347533717
98	NC_015979	TCA	2	6	12180	12185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533717
99	NC_015979	CCG	2	6	12188	12193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347533717
100	NC_015979	AGG	2	6	12229	12234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347533717
101	NC_015979	GTC	2	6	12269	12274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533717
102	NC_015979	ATG	2	6	12275	12280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533717
103	NC_015979	GTC	2	6	12324	12329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533717
104	NC_015979	AAT	2	6	12332	12337	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533717
105	NC_015979	AAT	2	6	12530	12535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533717
106	NC_015979	TCC	2	6	12562	12567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347533718
107	NC_015979	TCA	2	6	12853	12858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533718
108	NC_015979	TTA	2	6	12925	12930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533718
109	NC_015979	TTC	2	6	12999	13004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533718
110	NC_015979	GGA	2	6	13038	13043	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347533718
111	NC_015979	CAA	2	6	13098	13103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533718
112	NC_015979	CAT	2	6	13166	13171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533718
113	NC_015979	CAT	2	6	13304	13309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533718
114	NC_015979	TCA	2	6	13375	13380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533718
115	NC_015979	GCT	2	6	13441	13446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533718
116	NC_015979	CCG	2	6	13471	13476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347533718
117	NC_015979	GGC	2	6	13503	13508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347533718
118	NC_015979	CGC	2	6	13525	13530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347533718
119	NC_015979	TCG	2	6	13586	13591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533718
120	NC_015979	ATG	2	6	13612	13617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533718
121	NC_015979	AAT	2	6	13671	13676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533718
122	NC_015979	ACC	2	6	13837	13842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533718
123	NC_015979	CGG	2	6	13888	13893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347533718
124	NC_015979	GTA	2	6	13938	13943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533718
125	NC_015979	TGG	2	6	14131	14136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533719
126	NC_015979	CTT	2	6	14169	14174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533719
127	NC_015979	GGT	2	6	14181	14186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533719
128	NC_015979	GAA	2	6	14295	14300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533719
129	NC_015979	GTA	2	6	14345	14350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533719
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