MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 15919

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015978	AGG	2	6	364	369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347533754
2	NC_015978	ACA	2	6	441	446	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533754
3	NC_015978	ATG	2	6	489	494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533754
4	NC_015978	ATT	2	6	537	542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533754
5	NC_015978	AAC	2	6	549	554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533754
6	NC_015978	TGC	3	9	775	783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533754
7	NC_015978	GCT	2	6	893	898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533754
8	NC_015978	AAG	2	6	1050	1055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533754
9	NC_015978	TTC	2	6	1070	1075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533754
10	NC_015978	ACA	2	6	1101	1106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533754
11	NC_015978	CTG	2	6	1122	1127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533754
12	NC_015978	CAT	2	6	1282	1287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533754
13	NC_015978	TTG	2	6	1533	1538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533754
14	NC_015978	TGG	2	6	1612	1617	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533754
15	NC_015978	AAC	2	6	1669	1674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533754
16	NC_015978	TCT	2	6	2005	2010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533755
17	NC_015978	AAC	2	6	2013	2018	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533755
18	NC_015978	ACA	2	6	2060	2065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533755
19	NC_015978	GTG	2	6	2114	2119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533755
20	NC_015978	CTG	2	6	2351	2356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533755
21	NC_015978	AAG	2	6	2366	2371	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533755
22	NC_015978	GTC	2	6	2411	2416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533755
23	NC_015978	ATT	2	6	2457	2462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533755
24	NC_015978	CTG	2	6	2513	2518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533755
25	NC_015978	AGC	2	6	2754	2759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533755
26	NC_015978	TTG	2	6	2776	2781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533755
27	NC_015978	AAT	2	6	2797	2802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533755
28	NC_015978	AGT	2	6	2835	2840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533755
29	NC_015978	GAA	2	6	2878	2883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533755
30	NC_015978	AAG	2	6	2948	2953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533755
31	NC_015978	AAG	2	6	3262	3267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533756
32	NC_015978	TGG	2	6	3332	3337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533756
33	NC_015978	ATG	2	6	3379	3384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533756
34	NC_015978	TCG	2	6	3395	3400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533756
35	NC_015978	GAT	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533757
36	NC_015978	AGC	2	6	3679	3684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533757
37	NC_015978	GAC	2	6	3873	3878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533757
38	NC_015978	TAA	2	6	3910	3915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533757
39	NC_015978	CGG	2	6	3941	3946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347533757
40	NC_015978	AAC	2	6	3954	3959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533757
41	NC_015978	AGC	2	6	4036	4041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533757
42	NC_015978	CGC	2	6	4045	4050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347533757
43	NC_015978	CAA	2	6	4127	4132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533757
44	NC_015978	GAT	2	6	4283	4288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533757
45	NC_015978	ACA	2	6	4339	4344	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533757
46	NC_015978	AGA	2	6	4393	4398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533757
47	NC_015978	GAT	2	6	4427	4432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533757
48	NC_015978	TGA	2	6	4447	4452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533757
49	NC_015978	GAC	2	6	4455	4460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533757
50	NC_015978	ATG	2	6	4661	4666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533758
51	NC_015978	TTG	2	6	4772	4777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533758
52	NC_015978	TGA	2	6	4788	4793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533758
53	NC_015978	TGT	2	6	4824	4829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533758
54	NC_015978	ACA	2	6	4841	4846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533758
55	NC_015978	TTC	2	6	4934	4939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533758
56	NC_015978	GGA	2	6	4945	4950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347533758
57	NC_015978	CGG	2	6	4956	4961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347533758
58	NC_015978	TGG	2	6	4962	4967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533758
59	NC_015978	TGG	2	6	4980	4985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533758
60	NC_015978	GTT	2	6	5008	5013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533758
61	NC_015978	AGT	2	6	5109	5114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533758
62	NC_015978	GAT	2	6	5131	5136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533758
63	NC_015978	GAC	2	6	5211	5216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533758
64	NC_015978	CTT	2	6	5301	5306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533758
65	NC_015978	CAA	2	6	5466	5471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533758
66	NC_015978	GAA	2	6	5500	5505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533758
67	NC_015978	ACA	2	6	5552	5557	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533758
68	NC_015978	ATT	2	6	5560	5565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533758
69	NC_015978	CGG	2	6	5615	5620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347533758
70	NC_015978	GCT	3	9	5803	5811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533758
71	NC_015978	GAA	2	6	5835	5840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533758
72	NC_015978	TAA	2	6	5856	5861	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533758
73	NC_015978	TAA	2	6	5880	5885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533758
74	NC_015978	ATT	2	6	5913	5918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533758
75	NC_015978	GAA	2	6	6049	6054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533758
76	NC_015978	GAA	2	6	6094	6099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533758
77	NC_015978	TAT	2	6	6179	6184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533758
78	NC_015978	ACC	2	6	6246	6251	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533758
79	NC_015978	GAA	2	6	6304	6309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533758
80	NC_015978	TAC	2	6	6405	6410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533758
81	NC_015978	CGT	2	6	6427	6432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533758
82	NC_015978	ATA	2	6	6452	6457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533758
83	NC_015978	TGA	2	6	6459	6464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533758
84	NC_015978	CGT	2	6	6511	6516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533758
85	NC_015978	TTG	2	6	6706	6711	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533759
86	NC_015978	CGA	2	6	6756	6761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533759
87	NC_015978	ATC	2	6	6850	6855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533759
88	NC_015978	TGC	3	9	6968	6976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533759
89	NC_015978	ATG	2	6	7066	7071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
90	NC_015978	TGA	2	6	7210	7215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
91	NC_015978	TTC	2	6	7252	7257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533759
92	NC_015978	TGG	2	6	7277	7282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533759
93	NC_015978	GAA	2	6	7365	7370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533759
94	NC_015978	TAA	2	6	7421	7426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533759
95	NC_015978	ATG	2	6	7495	7500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
96	NC_015978	TCG	2	6	7538	7543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533759
97	NC_015978	AGT	2	6	7559	7564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
98	NC_015978	AAT	2	6	7569	7574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533759
99	NC_015978	ATT	2	6	7626	7631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533759
100	NC_015978	TTA	2	6	7699	7704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533759
101	NC_015978	ATT	2	6	7803	7808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533759
102	NC_015978	CTG	2	6	7822	7827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533759
103	NC_015978	GAT	2	6	7866	7871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
104	NC_015978	ATT	2	6	8016	8021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533759
105	NC_015978	ATT	2	6	8030	8035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533759
106	NC_015978	TGA	2	6	8057	8062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
107	NC_015978	TCG	2	6	8063	8068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533759
108	NC_015978	GAT	2	6	8181	8186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
109	NC_015978	GTG	2	6	8203	8208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533759
110	NC_015978	CTT	2	6	8456	8461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533759
111	NC_015978	ACT	2	6	8463	8468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533759
112	NC_015978	TGA	2	6	8498	8503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
113	NC_015978	ATG	2	6	8548	8553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
114	NC_015978	TTA	2	6	8563	8568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533759
115	NC_015978	GGT	2	6	8817	8822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533759
116	NC_015978	AGT	2	6	8879	8884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
117	NC_015978	TGA	2	6	8926	8931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
118	NC_015978	TGA	2	6	9002	9007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
119	NC_015978	AGA	3	9	9041	9049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533759
120	NC_015978	GAC	2	6	9051	9056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533759
121	NC_015978	TGA	2	6	9080	9085	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
122	NC_015978	GAT	2	6	9099	9104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533759
123	NC_015978	AAT	2	6	9112	9117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533759
124	NC_015978	ATT	2	6	9340	9345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533760
125	NC_015978	TGA	2	6	9357	9362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533760
126	NC_015978	TGC	2	6	9363	9368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533760
127	NC_015978	TAG	2	6	9380	9385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533760
128	NC_015978	TTG	2	6	9587	9592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533760
129	NC_015978	TGG	2	6	9964	9969	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533761
130	NC_015978	AAC	2	6	9983	9988	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533761
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