MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 24023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015978	AAC	2	6	183993	183998	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533917
3002	NC_015978	TGA	2	6	184027	184032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533917
3003	NC_015978	CA	3	6	184179	184184	50 %	0 %	0 %	50 %	347533917
3004	NC_015978	ATG	2	6	184236	184241	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533917
3005	NC_015978	GAA	2	6	184336	184341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533917
3006	NC_015978	AAT	2	6	184368	184373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533917
3007	NC_015978	AAAT	2	8	184454	184461	75 %	25 %	0 %	0 %	347533918
3008	NC_015978	A	6	6	184525	184530	100 %	0 %	0 %	0 %	347533918
3009	NC_015978	TTA	2	6	184598	184603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533918
3010	NC_015978	AT	3	6	184711	184716	50 %	50 %	0 %	0 %	347533918
3011	NC_015978	TGA	2	6	184752	184757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533918
3012	NC_015978	AATAAA	2	12	184804	184815	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	347533918
3013	NC_015978	AACAA	2	10	184818	184827	80 %	0 %	0 %	20 %	347533918
3014	NC_015978	GAT	2	6	184843	184848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533918
3015	NC_015978	AGC	2	6	184856	184861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533918
3016	NC_015978	AGA	2	6	184866	184871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533918
3017	NC_015978	A	7	7	184905	184911	100 %	0 %	0 %	0 %	347533918
3018	NC_015978	TGA	2	6	184958	184963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533919
3019	NC_015978	AGTC	2	8	184982	184989	25 %	25 %	25 %	25 %	347533919
3020	NC_015978	TCG	2	6	185046	185051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533919
3021	NC_015978	CAAT	2	8	185052	185059	50 %	25 %	0 %	25 %	347533919
3022	NC_015978	TAA	2	6	185086	185091	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533919
3023	NC_015978	AGA	2	6	185127	185132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533919
3024	NC_015978	AAT	2	6	185148	185153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533919
3025	NC_015978	TTC	2	6	185182	185187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533919
3026	NC_015978	TAT	2	6	185189	185194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533919
3027	NC_015978	A	6	6	185196	185201	100 %	0 %	0 %	0 %	347533919
3028	NC_015978	ATC	2	6	185213	185218	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533919
3029	NC_015978	AGA	2	6	185230	185235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533919
3030	NC_015978	TCG	2	6	185294	185299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533919
3031	NC_015978	TAC	2	6	185339	185344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533919
3032	NC_015978	TA	3	6	185381	185386	50 %	50 %	0 %	0 %	347533919
3033	NC_015978	ATTT	2	8	185404	185411	25 %	75 %	0 %	0 %	347533919
3034	NC_015978	GA	3	6	185416	185421	50 %	0 %	50 %	0 %	347533919
3035	NC_015978	AAG	2	6	185479	185484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533919
3036	NC_015978	AC	3	6	185505	185510	50 %	0 %	0 %	50 %	347533919
3037	NC_015978	TTC	2	6	185520	185525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533919
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3039	NC_015978	T	6	6	185646	185651	0 %	100 %	0 %	0 %	347533919
3040	NC_015978	AGA	2	6	185693	185698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533919
3041	NC_015978	TAA	2	6	185701	185706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533919
3042	NC_015978	TAT	2	6	185727	185732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533919
3043	NC_015978	AAT	2	6	185736	185741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533919
3044	NC_015978	AAAAC	2	10	185751	185760	80 %	0 %	0 %	20 %	347533919
3045	NC_015978	AGG	2	6	185762	185767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347533919
3046	NC_015978	GTG	2	6	185946	185951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533920
3047	NC_015978	ACT	2	6	186050	186055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533920
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3049	NC_015978	AAT	2	6	186076	186081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533920
3050	NC_015978	A	6	6	186109	186114	100 %	0 %	0 %	0 %	347533920
3051	NC_015978	CTG	2	6	186144	186149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533920
3052	NC_015978	ATC	2	6	186185	186190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533920
3053	NC_015978	ATG	3	9	186206	186214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533920
3054	NC_015978	TAA	2	6	186267	186272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533920
3055	NC_015978	TTG	2	6	186634	186639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533921
3056	NC_015978	ATT	2	6	186652	186657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533921
3057	NC_015978	CAA	2	6	186702	186707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347533921
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3059	NC_015978	ATT	2	6	186754	186759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533921
3060	NC_015978	ATA	2	6	186773	186778	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533921
3061	NC_015978	T	7	7	186787	186793	0 %	100 %	0 %	0 %	347533921
3062	NC_015978	TTTC	2	8	186975	186982	0 %	75 %	0 %	25 %	347533921
3063	NC_015978	ATC	2	6	186994	186999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533921
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3065	NC_015978	T	6	6	187117	187122	0 %	100 %	0 %	0 %	347533921
3066	NC_015978	CCT	2	6	187173	187178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347533921
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3069	NC_015978	GTA	2	6	187371	187376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533922
3070	NC_015978	ATC	2	6	187493	187498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533922
3071	NC_015978	TGG	2	6	187592	187597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533922
3072	NC_015978	AGT	2	6	187610	187615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533922
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3074	NC_015978	TA	3	6	187675	187680	50 %	50 %	0 %	0 %	347533923
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3076	NC_015978	TCT	2	6	187822	187827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533923
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3079	NC_015978	T	7	7	187921	187927	0 %	100 %	0 %	0 %	347533923
3080	NC_015978	CTG	2	6	188115	188120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533923
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3083	NC_015978	GAC	2	6	188381	188386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533923
3084	NC_015978	A	6	6	188433	188438	100 %	0 %	0 %	0 %	347533923
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3086	NC_015978	AGTT	2	8	188481	188488	25 %	50 %	25 %	0 %	347533923
3087	NC_015978	CAT	2	6	188500	188505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533923
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3089	NC_015978	A	6	6	188627	188632	100 %	0 %	0 %	0 %	347533923
3090	NC_015978	TTG	2	6	189377	189382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533924
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3092	NC_015978	TGA	2	6	189420	189425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533924
3093	NC_015978	TGA	2	6	189437	189442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533924
3094	NC_015978	TGGT	2	8	189473	189480	0 %	50 %	50 %	0 %	347533924
3095	NC_015978	T	7	7	189504	189510	0 %	100 %	0 %	0 %	347533924
3096	NC_015978	TGA	2	6	189523	189528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533924
3097	NC_015978	TACT	2	8	189537	189544	25 %	50 %	0 %	25 %	347533924
3098	NC_015978	TTG	2	6	189551	189556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533924
3099	NC_015978	TGA	2	6	189621	189626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533924
3100	NC_015978	CAT	2	6	189742	189747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533924
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3103	NC_015978	A	6	6	189818	189823	100 %	0 %	0 %	0 %	347533924
3104	NC_015978	GGT	2	6	189824	189829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347533924
3105	NC_015978	ATT	2	6	189978	189983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347533925
3106	NC_015978	TTC	2	6	190096	190101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533925
3107	NC_015978	GAT	2	6	190159	190164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533925
3108	NC_015978	TCA	2	6	190178	190183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347533925
3109	NC_015978	T	6	6	190198	190203	0 %	100 %	0 %	0 %	347533925
3110	NC_015978	TTTAA	2	10	190262	190271	40 %	60 %	0 %	0 %	347533925
3111	NC_015978	GATGA	2	10	190277	190286	40 %	20 %	40 %	0 %	347533925
3112	NC_015978	ACC	2	6	190309	190314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347533925
3113	NC_015978	TAA	2	6	190338	190343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347533925
3114	NC_015978	T	6	6	190359	190364	0 %	100 %	0 %	0 %	347533925
3115	NC_015978	GCT	2	6	190382	190387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347533925
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3117	NC_015978	CTT	2	6	190410	190415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347533925
3118	NC_015978	AGC	2	6	190426	190431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347533925
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3120	NC_015978	CGGT	2	8	190457	190464	0 %	25 %	50 %	25 %	347533925
3121	NC_015978	TTG	2	6	190501	190506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347533925
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3123	NC_015978	ATG	2	6	190592	190597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347533925
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3491	NC_015978	TGAAAC	2	12	210135	210146	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347533936
3492	NC_015978	AAG	2	6	210152	210157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347533936
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