MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus sanfranciscensis TMW 1.1304 chromosome

Total Repeats: 24023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_015978	GTT	2	6	295254	295259	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347534026
5003	NC_015978	CGT	3	9	295318	295326	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347534026
5004	NC_015978	TAG	2	6	295357	295362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347534026
5005	NC_015978	CTT	2	6	295366	295371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347534026
5006	NC_015978	GAC	2	6	295399	295404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347534026
5007	NC_015978	AACC	2	8	295452	295459	50 %	0 %	0 %	50 %	347534026
5008	NC_015978	TCC	2	6	295495	295500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347534026
5009	NC_015978	TAT	2	6	295508	295513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347534026
5010	NC_015978	ATT	2	6	295582	295587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347534027
5011	NC_015978	ATG	2	6	295729	295734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347534027
5012	NC_015978	GGTTG	2	10	295776	295785	0 %	40 %	60 %	0 %	347534027
5013	NC_015978	GAT	2	6	295794	295799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347534027
5014	NC_015978	GTA	2	6	295800	295805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347534027
5015	NC_015978	TTG	2	6	295824	295829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347534027
5016	NC_015978	TAT	2	6	295834	295839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347534027
5017	NC_015978	CTA	2	6	295851	295856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347534027
5018	NC_015978	TAT	2	6	295885	295890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347534027
5019	NC_015978	ACA	2	6	295947	295952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347534027
5020	NC_015978	GTTT	2	8	295999	296006	0 %	75 %	25 %	0 %	347534027
5021	NC_015978	ATCTTG	2	12	296048	296059	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	347534027
5022	NC_015978	AAT	2	6	296230	296235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347534028
5023	NC_015978	ACC	2	6	296272	296277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347534028
5024	NC_015978	T	6	6	296353	296358	0 %	100 %	0 %	0 %	347534028
5025	NC_015978	CAATT	2	10	296372	296381	40 %	40 %	0 %	20 %	347534028
5026	NC_015978	CAC	2	6	296422	296427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347534028
5027	NC_015978	AAAT	2	8	296481	296488	75 %	25 %	0 %	0 %	347534028
5028	NC_015978	ACT	2	6	296501	296506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347534028
5029	NC_015978	GTTGAA	2	12	296600	296611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347534028
5030	NC_015978	GAG	2	6	296694	296699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347534028
5031	NC_015978	CAA	2	6	296784	296789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347534028
5032	NC_015978	AAGTA	2	10	296828	296837	60 %	20 %	20 %	0 %	347534028
5033	NC_015978	TAAC	2	8	296841	296848	50 %	25 %	0 %	25 %	347534028
5034	NC_015978	ATG	2	6	296864	296869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347534028
5035	NC_015978	ATG	2	6	296966	296971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347534028
5036	NC_015978	TAA	2	6	297054	297059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347534028
5037	NC_015978	A	6	6	297081	297086	100 %	0 %	0 %	0 %	347534028
5038	NC_015978	GTAAG	2	10	297130	297139	40 %	20 %	40 %	0 %	347534028
5039	NC_015978	ACC	2	6	297142	297147	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347534028
5040	NC_015978	TAA	2	6	297190	297195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347534028
5041	NC_015978	ATA	2	6	297197	297202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347534028
5042	NC_015978	ACT	2	6	297218	297223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347534028
5043	NC_015978	TAA	2	6	297259	297264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347534028
5044	NC_015978	TAA	2	6	297283	297288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347534028
5045	NC_015978	CAT	2	6	297316	297321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347534028
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5047	NC_015978	GCCCAA	2	12	297374	297385	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	347534028
5048	NC_015978	GCA	2	6	297410	297415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347534028
5049	NC_015978	AAG	2	6	297462	297467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347534028
5050	NC_015978	AGA	2	6	297479	297484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347534028
5051	NC_015978	GAT	2	6	297565	297570	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347534028
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5053	NC_015978	ACA	2	6	297689	297694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347534028
5054	NC_015978	GTT	2	6	297781	297786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347534029
5055	NC_015978	T	7	7	297850	297856	0 %	100 %	0 %	0 %	347534029
5056	NC_015978	AATAA	2	10	297896	297905	80 %	20 %	0 %	0 %	347534029
5057	NC_015978	GGT	2	6	297959	297964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347534029
5058	NC_015978	ATC	2	6	297998	298003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347534029
5059	NC_015978	ATC	2	6	298121	298126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347534029
5060	NC_015978	TAT	2	6	298251	298256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347534030
5061	NC_015978	A	6	6	298332	298337	100 %	0 %	0 %	0 %	347534030
5062	NC_015978	TTAA	2	8	298419	298426	50 %	50 %	0 %	0 %	347534030
5063	NC_015978	AATT	2	8	298463	298470	50 %	50 %	0 %	0 %	347534030
5064	NC_015978	GAA	2	6	298602	298607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347534030
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5070	NC_015978	AAT	2	6	298893	298898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347534030
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5073	NC_015978	TAT	2	6	298961	298966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347534030
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5108	NC_015978	A	7	7	300982	300988	100 %	0 %	0 %	0 %	347534031
5109	NC_015978	ATTT	2	8	301026	301033	25 %	75 %	0 %	0 %	347534032
5110	NC_015978	ATCA	2	8	301100	301107	50 %	25 %	0 %	25 %	347534032
5111	NC_015978	TGG	2	6	301110	301115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347534032
5112	NC_015978	ACC	2	6	301118	301123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347534032
5113	NC_015978	AAAC	2	8	301135	301142	75 %	0 %	0 %	25 %	347534032
5114	NC_015978	GAT	2	6	301243	301248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347534032
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5117	NC_015978	GTT	2	6	301427	301432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347534032
5118	NC_015978	T	6	6	301445	301450	0 %	100 %	0 %	0 %	347534032
5119	NC_015978	TCA	2	6	301464	301469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347534032
5120	NC_015978	CCGAT	2	10	301518	301527	20 %	20 %	20 %	40 %	347534032
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5241	NC_015978	A	6	6	306940	306945	100 %	0 %	0 %	0 %	347534038
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5487	NC_015978	TGC	2	6	321009	321014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347534052
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