MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 1196

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015975	CAACG	2	10	2533	2542	40 %	0 %	20 %	40 %	347524524
2	NC_015975	GCTTC	2	10	2786	2795	0 %	40 %	20 %	40 %	347524524
3	NC_015975	CTTTT	2	10	3136	3145	0 %	80 %	0 %	20 %	347524525
4	NC_015975	TGCCT	2	10	6879	6888	0 %	40 %	20 %	40 %	347524529
5	NC_015975	AGCTG	2	10	7398	7407	20 %	20 %	40 %	20 %	347524529
6	NC_015975	GAAAA	2	10	7627	7636	80 %	0 %	20 %	0 %	347524529
7	NC_015975	GTTCT	2	10	8449	8458	0 %	60 %	20 %	20 %	347524529
8	NC_015975	ACGGA	2	10	9056	9065	40 %	0 %	40 %	20 %	347524529
9	NC_015975	CTTTG	2	10	11833	11842	0 %	60 %	20 %	20 %	347524533
10	NC_015975	GTTGC	2	10	12159	12168	0 %	40 %	40 %	20 %	347524533
11	NC_015975	TGCAT	2	10	14114	14123	20 %	40 %	20 %	20 %	347524535
12	NC_015975	TTCGA	2	10	15568	15577	20 %	40 %	20 %	20 %	347524535
13	NC_015975	TGAAC	2	10	16696	16705	40 %	20 %	20 %	20 %	347524537
14	NC_015975	CATTG	2	10	17596	17605	20 %	40 %	20 %	20 %	347524537
15	NC_015975	ATCGT	2	10	18352	18361	20 %	40 %	20 %	20 %	347524538
16	NC_015975	AGAAA	2	10	19819	19828	80 %	0 %	20 %	0 %	347524540
17	NC_015975	AACGA	2	10	20914	20923	60 %	0 %	20 %	20 %	347524541
18	NC_015975	ACGAA	2	10	21109	21118	60 %	0 %	20 %	20 %	347524541
19	NC_015975	TCGGT	2	10	22386	22395	0 %	40 %	40 %	20 %	347524544
20	NC_015975	TGTTT	2	10	23210	23219	0 %	80 %	20 %	0 %	347524544
21	NC_015975	TCATG	2	10	24316	24325	20 %	40 %	20 %	20 %	347524545
22	NC_015975	GGCAG	2	10	27073	27082	20 %	0 %	60 %	20 %	347524547
23	NC_015975	GTCAG	2	10	29592	29601	20 %	20 %	40 %	20 %	347524549
24	NC_015975	AAGAA	2	10	29665	29674	80 %	0 %	20 %	0 %	347524549
25	NC_015975	GCAAC	2	10	30319	30328	40 %	0 %	20 %	40 %	347524550
26	NC_015975	GGATT	2	10	31309	31318	20 %	40 %	40 %	0 %	347524551
27	NC_015975	ATCGT	2	10	32317	32326	20 %	40 %	20 %	20 %	347524552
28	NC_015975	TGTTT	2	10	32646	32655	0 %	80 %	20 %	0 %	347524552
29	NC_015975	TTGCC	2	10	32783	32792	0 %	40 %	20 %	40 %	347524552
30	NC_015975	GCTTT	2	10	32843	32852	0 %	60 %	20 %	20 %	347524552
31	NC_015975	TGAAT	2	10	34750	34759	40 %	40 %	20 %	0 %	347524554
32	NC_015975	CATGG	2	10	40494	40503	20 %	20 %	40 %	20 %	347524558
33	NC_015975	GCAAT	2	10	42502	42511	40 %	20 %	20 %	20 %	347524560
34	NC_015975	CTTGT	2	10	42534	42543	0 %	60 %	20 %	20 %	347524560
35	NC_015975	AGATG	2	10	42884	42893	40 %	20 %	40 %	0 %	347524560
36	NC_015975	AAGAA	2	10	47308	47317	80 %	0 %	20 %	0 %	347524563
37	NC_015975	GATCA	2	10	48795	48804	40 %	20 %	20 %	20 %	347524565
38	NC_015975	CAAGA	2	10	50581	50590	60 %	0 %	20 %	20 %	347524567
39	NC_015975	AAAAG	2	10	52159	52168	80 %	0 %	20 %	0 %	347524568
40	NC_015975	AAGCG	2	10	52267	52276	40 %	0 %	40 %	20 %	347524568
41	NC_015975	TTCCG	2	10	53322	53331	0 %	40 %	20 %	40 %	347524569
42	NC_015975	GTGAG	2	10	58731	58740	20 %	20 %	60 %	0 %	347524574
43	NC_015975	TGATT	2	10	63252	63261	20 %	60 %	20 %	0 %	347524578
44	NC_015975	GTTGA	2	10	67530	67539	20 %	40 %	40 %	0 %	347524581
45	NC_015975	AGTCA	2	10	69555	69564	40 %	20 %	20 %	20 %	347524581
46	NC_015975	TCAAA	2	10	71343	71352	60 %	20 %	0 %	20 %	347524582
47	NC_015975	TTTGT	2	10	71440	71449	0 %	80 %	20 %	0 %	347524582
48	NC_015975	AAGTC	2	10	73003	73012	40 %	20 %	20 %	20 %	347524583
49	NC_015975	GGGTC	2	10	73947	73956	0 %	20 %	60 %	20 %	347524584
50	NC_015975	CAAGT	2	10	78604	78613	40 %	20 %	20 %	20 %	347524589
51	NC_015975	AAGCG	2	10	78962	78971	40 %	0 %	40 %	20 %	347524589
52	NC_015975	ACCAA	2	10	81894	81903	60 %	0 %	0 %	40 %	347524591
53	NC_015975	TCTTT	2	10	87467	87476	0 %	80 %	0 %	20 %	347524596
54	NC_015975	CAGCG	2	10	87596	87605	20 %	0 %	40 %	40 %	347524596
55	NC_015975	GATCA	2	10	87927	87936	40 %	20 %	20 %	20 %	347524596
56	NC_015975	GCGGT	2	10	90113	90122	0 %	20 %	60 %	20 %	347524598
57	NC_015975	CGCAC	2	10	95025	95034	20 %	0 %	20 %	60 %	347524601
58	NC_015975	TTGAA	2	10	96365	96374	40 %	40 %	20 %	0 %	347524602
59	NC_015975	AAACC	2	10	97713	97722	60 %	0 %	0 %	40 %	347524604
60	NC_015975	CGTTT	2	10	101824	101833	0 %	60 %	20 %	20 %	347524608
61	NC_015975	GATCG	2	10	102040	102049	20 %	20 %	40 %	20 %	347524608
62	NC_015975	TTTGA	2	10	102730	102739	20 %	60 %	20 %	0 %	347524609
63	NC_015975	AGAAA	2	10	103223	103232	80 %	0 %	20 %	0 %	347524610
64	NC_015975	TTAGA	2	10	108255	108264	40 %	40 %	20 %	0 %	347524614
65	NC_015975	GGAGT	2	10	110083	110092	20 %	20 %	60 %	0 %	347524616
66	NC_015975	TTGGA	2	10	112036	112045	20 %	40 %	40 %	0 %	347524618
67	NC_015975	GTGTT	2	10	116186	116195	0 %	60 %	40 %	0 %	347524622
68	NC_015975	ATATG	2	10	116258	116267	40 %	40 %	20 %	0 %	347524622
69	NC_015975	TATAT	2	10	117794	117803	40 %	60 %	0 %	0 %	347524623
70	NC_015975	GAGCA	2	10	118055	118064	40 %	0 %	40 %	20 %	347524624
71	NC_015975	CAAGT	2	10	119160	119169	40 %	20 %	20 %	20 %	347524625
72	NC_015975	AAACG	2	10	120130	120139	60 %	0 %	20 %	20 %	347524626
73	NC_015975	ATATA	2	10	120317	120326	60 %	40 %	0 %	0 %	347524626
74	NC_015975	ATTTA	2	10	120528	120537	40 %	60 %	0 %	0 %	347524626
75	NC_015975	TCGTA	2	10	121086	121095	20 %	40 %	20 %	20 %	347524627
76	NC_015975	ATGGT	2	10	122475	122484	20 %	40 %	40 %	0 %	347524628
77	NC_015975	TTGAT	2	10	124013	124022	20 %	60 %	20 %	0 %	347524629
78	NC_015975	TGTGC	2	10	124298	124307	0 %	40 %	40 %	20 %	347524629
79	NC_015975	TATAT	2	10	131112	131121	40 %	60 %	0 %	0 %	347524635
80	NC_015975	TGATT	2	10	132980	132989	20 %	60 %	20 %	0 %	347524636
81	NC_015975	TCATT	2	10	133066	133075	20 %	60 %	0 %	20 %	347524637
82	NC_015975	CTGAG	2	10	133902	133911	20 %	20 %	40 %	20 %	347524637
83	NC_015975	AAAGT	2	10	134245	134254	60 %	20 %	20 %	0 %	347524638
84	NC_015975	TTTCT	2	10	134454	134463	0 %	80 %	0 %	20 %	347524639
85	NC_015975	GCTTC	2	10	137185	137194	0 %	40 %	20 %	40 %	347524640
86	NC_015975	TTGAG	2	10	137347	137356	20 %	40 %	40 %	0 %	347524640
87	NC_015975	CGATG	2	10	139925	139934	20 %	20 %	40 %	20 %	347524641
88	NC_015975	AAAAG	2	10	141304	141313	80 %	0 %	20 %	0 %	347524642
89	NC_015975	CTTGG	2	10	141484	141493	0 %	40 %	40 %	20 %	347524642
90	NC_015975	AAAGC	2	10	144771	144780	60 %	0 %	20 %	20 %	347524643
91	NC_015975	ACGTT	2	10	146384	146393	20 %	40 %	20 %	20 %	347524644
92	NC_015975	TCATC	2	10	147297	147306	20 %	40 %	0 %	40 %	347524645
93	NC_015975	AAGAC	2	10	154249	154258	60 %	0 %	20 %	20 %	347524650
94	NC_015975	AACGT	2	10	157185	157194	40 %	20 %	20 %	20 %	347524653
95	NC_015975	AAGCA	2	10	157508	157517	60 %	0 %	20 %	20 %	347524653
96	NC_015975	TTTTG	2	10	161780	161789	0 %	80 %	20 %	0 %	347524657
97	NC_015975	AAACA	2	10	164096	164105	80 %	0 %	0 %	20 %	347524658
98	NC_015975	GTAAT	2	10	164596	164605	40 %	40 %	20 %	0 %	347524659
99	NC_015975	CAACG	2	10	167209	167218	40 %	0 %	20 %	40 %	347524661
100	NC_015975	AGAGG	2	10	169872	169881	40 %	0 %	60 %	0 %	347524663
101	NC_015975	ATAAG	2	10	172329	172338	60 %	20 %	20 %	0 %	347524666
102	NC_015975	TGCAG	2	10	178089	178098	20 %	20 %	40 %	20 %	347524673
103	NC_015975	TTTTC	2	10	180315	180324	0 %	80 %	0 %	20 %	347524676
104	NC_015975	GATCT	2	10	180504	180513	20 %	40 %	20 %	20 %	347524676
105	NC_015975	AAGAC	2	10	181572	181581	60 %	0 %	20 %	20 %	347524676
106	NC_015975	GAAAC	2	10	183159	183168	60 %	0 %	20 %	20 %	347524677
107	NC_015975	ATAAG	2	10	183426	183435	60 %	20 %	20 %	0 %	347524678
108	NC_015975	CATGA	2	10	183731	183740	40 %	20 %	20 %	20 %	347524679
109	NC_015975	TCGGA	2	10	185351	185360	20 %	20 %	40 %	20 %	347524680
110	NC_015975	CAAAA	2	10	185398	185407	80 %	0 %	0 %	20 %	347524680
111	NC_015975	CAAAA	2	10	185656	185665	80 %	0 %	0 %	20 %	347524680
112	NC_015975	ATCAG	2	10	186063	186072	40 %	20 %	20 %	20 %	347524680
113	NC_015975	ATCAG	2	10	186192	186201	40 %	20 %	20 %	20 %	347524680
114	NC_015975	ATCAG	2	10	186321	186330	40 %	20 %	20 %	20 %	347524680
115	NC_015975	ATCAG	2	10	186450	186459	40 %	20 %	20 %	20 %	347524680
116	NC_015975	ATCAG	2	10	186579	186588	40 %	20 %	20 %	20 %	347524680
117	NC_015975	GTTTT	2	10	188635	188644	0 %	80 %	20 %	0 %	347524682
118	NC_015975	AAACG	2	10	189383	189392	60 %	0 %	20 %	20 %	347524683
119	NC_015975	CAGTT	2	10	193666	193675	20 %	40 %	20 %	20 %	347524689
120	NC_015975	TTCCA	2	10	195015	195024	20 %	40 %	0 %	40 %	347524690
121	NC_015975	AAATG	2	10	195803	195812	60 %	20 %	20 %	0 %	347524691
122	NC_015975	CGGAT	2	10	196070	196079	20 %	20 %	40 %	20 %	347524692
123	NC_015975	GACCA	2	10	197373	197382	40 %	0 %	20 %	40 %	347524693
124	NC_015975	AACAA	2	10	199911	199920	80 %	0 %	0 %	20 %	347524694
125	NC_015975	TTTGA	2	10	200714	200723	20 %	60 %	20 %	0 %	347524695
126	NC_015975	GAAAA	2	10	207121	207130	80 %	0 %	20 %	0 %	347524700
127	NC_015975	TTTTG	2	10	207272	207281	0 %	80 %	20 %	0 %	347524701
128	NC_015975	TGATT	2	10	208209	208218	20 %	60 %	20 %	0 %	347524703
129	NC_015975	TCGGA	2	10	208344	208353	20 %	20 %	40 %	20 %	347524703
130	NC_015975	GTTTT	2	10	208675	208684	0 %	80 %	20 %	0 %	347524703
131	NC_015975	GGTCA	2	10	208963	208972	20 %	20 %	40 %	20 %	347524703
132	NC_015975	CAAGC	2	10	210425	210434	40 %	0 %	20 %	40 %	347524704
133	NC_015975	GGTCT	2	10	210611	210620	0 %	40 %	40 %	20 %	347524704
134	NC_015975	CGTTC	2	10	210862	210871	0 %	40 %	20 %	40 %	347524704
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