MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 34064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015975	TTAA	2	8	235910	235917	50 %	50 %	0 %	0 %	347524726
4002	NC_015975	T	7	7	235929	235935	0 %	100 %	0 %	0 %	347524726
4003	NC_015975	GAC	2	6	235980	235985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524726
4004	NC_015975	GAT	2	6	235987	235992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524726
4005	NC_015975	T	6	6	236091	236096	0 %	100 %	0 %	0 %	347524726
4006	NC_015975	GAT	2	6	236170	236175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524726
4007	NC_015975	TGC	2	6	236254	236259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524726
4008	NC_015975	TCA	2	6	236318	236323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524726
4009	NC_015975	TGA	2	6	236390	236395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524726
4010	NC_015975	CAT	2	6	236430	236435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524726
4011	NC_015975	ATG	2	6	236484	236489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524726
4012	NC_015975	T	7	7	236532	236538	0 %	100 %	0 %	0 %	347524726
4013	NC_015975	TGAC	2	8	236739	236746	25 %	25 %	25 %	25 %	347524727
4014	NC_015975	ATA	2	6	236748	236753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524727
4015	NC_015975	A	6	6	236753	236758	100 %	0 %	0 %	0 %	347524727
4016	NC_015975	CGA	2	6	236838	236843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524727
4017	NC_015975	GAT	2	6	236896	236901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524727
4018	NC_015975	CG	3	6	236955	236960	0 %	0 %	50 %	50 %	347524727
4019	NC_015975	T	6	6	236978	236983	0 %	100 %	0 %	0 %	347524727
4020	NC_015975	TAC	2	6	237055	237060	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524727
4021	NC_015975	AGA	2	6	237062	237067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524727
4022	NC_015975	GAA	2	6	237161	237166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524727
4023	NC_015975	ATC	2	6	237185	237190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524727
4024	NC_015975	CGG	2	6	237195	237200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524727
4025	NC_015975	ATCT	2	8	237209	237216	25 %	50 %	0 %	25 %	347524727
4026	NC_015975	GAA	2	6	237355	237360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524728
4027	NC_015975	ATC	2	6	237425	237430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524728
4028	NC_015975	CAAA	2	8	237528	237535	75 %	0 %	0 %	25 %	347524728
4029	NC_015975	A	6	6	237533	237538	100 %	0 %	0 %	0 %	347524728
4030	NC_015975	TCA	2	6	237542	237547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524728
4031	NC_015975	GAT	2	6	237584	237589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524729
4032	NC_015975	ACG	2	6	237774	237779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524729
4033	NC_015975	CGT	2	6	237812	237817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524729
4034	NC_015975	TTG	2	6	237819	237824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524729
4035	NC_015975	GGA	2	6	237843	237848	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347524729
4036	NC_015975	TGA	2	6	237991	237996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524729
4037	NC_015975	GAC	2	6	238058	238063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524729
4038	NC_015975	ATC	2	6	238146	238151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524729
4039	NC_015975	TGA	2	6	238186	238191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524729
4040	NC_015975	ATC	3	9	238197	238205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524729
4041	NC_015975	TTGA	2	8	238227	238234	25 %	50 %	25 %	0 %	347524729
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4043	NC_015975	GAC	2	6	238271	238276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524729
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4045	NC_015975	TCT	2	6	238330	238335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524729
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4047	NC_015975	ATTT	2	8	238359	238366	25 %	75 %	0 %	0 %	347524729
4048	NC_015975	TGA	2	6	238414	238419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524729
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4050	NC_015975	ATTTTG	2	12	238497	238508	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347524729
4051	NC_015975	GGC	3	9	238548	238556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524729
4052	NC_015975	TCAT	2	8	238599	238606	25 %	50 %	0 %	25 %	347524729
4053	NC_015975	ACA	2	6	238615	238620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524729
4054	NC_015975	CGC	2	6	238638	238643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347524729
4055	NC_015975	GAC	2	6	238653	238658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524729
4056	NC_015975	GATTTT	2	12	238712	238723	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	347524729
4057	NC_015975	GGA	2	6	238733	238738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347524729
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4059	NC_015975	TCA	2	6	238840	238845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524729
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4061	NC_015975	TTC	2	6	238893	238898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524729
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4063	NC_015975	TGC	2	6	239236	239241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524730
4064	NC_015975	TGA	2	6	239256	239261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524730
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4067	NC_015975	TTC	2	6	239444	239449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524730
4068	NC_015975	ATG	2	6	239463	239468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524730
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4088	NC_015975	AAGG	2	8	240982	240989	50 %	0 %	50 %	0 %	347524732
4089	NC_015975	A	6	6	241022	241027	100 %	0 %	0 %	0 %	347524732
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4092	NC_015975	GCAA	2	8	241291	241298	50 %	0 %	25 %	25 %	347524733
4093	NC_015975	ATG	2	6	241318	241323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524733
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4101	NC_015975	TAT	2	6	241674	241679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524733
4102	NC_015975	TAA	2	6	241691	241696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524733
4103	NC_015975	TTCG	2	8	241732	241739	0 %	50 %	25 %	25 %	347524733
4104	NC_015975	A	6	6	241802	241807	100 %	0 %	0 %	0 %	347524733
4105	NC_015975	CTG	2	6	241843	241848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524733
4106	NC_015975	AGTC	2	8	241987	241994	25 %	25 %	25 %	25 %	347524733
4107	NC_015975	TAAA	2	8	242015	242022	75 %	25 %	0 %	0 %	347524733
4108	NC_015975	ATG	3	9	242027	242035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524734
4109	NC_015975	T	6	6	242060	242065	0 %	100 %	0 %	0 %	347524734
4110	NC_015975	TTTGA	2	10	242144	242153	20 %	60 %	20 %	0 %	347524734
4111	NC_015975	ATT	2	6	242626	242631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524735
4112	NC_015975	TTG	2	6	242676	242681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524735
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4116	NC_015975	ATGT	2	8	242843	242850	25 %	50 %	25 %	0 %	347524735
4117	NC_015975	TGT	2	6	242961	242966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524735
4118	NC_015975	CTTTG	2	10	243042	243051	0 %	60 %	20 %	20 %	347524735
4119	NC_015975	TTC	2	6	243058	243063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524735
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4121	NC_015975	CCG	2	6	243083	243088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347524735
4122	NC_015975	TGA	2	6	243117	243122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524735
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4153	NC_015975	AATG	2	8	245667	245674	50 %	25 %	25 %	0 %	347524737
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4243	NC_015975	TGA	2	6	250977	250982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524742
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4245	NC_015975	GAA	2	6	251221	251226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524742
4246	NC_015975	TTTG	2	8	251248	251255	0 %	75 %	25 %	0 %	347524742
4247	NC_015975	CTG	2	6	251268	251273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524742
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4251	NC_015975	GCA	2	6	251698	251703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524743
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4253	NC_015975	GCT	2	6	251776	251781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524743
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4486	NC_015975	T	8	8	266923	266930	0 %	100 %	0 %	0 %	347524757
4487	NC_015975	ATG	2	6	267037	267042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524758
4488	NC_015975	GAT	2	6	267066	267071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524758
4489	NC_015975	GAA	2	6	267117	267122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524758
4490	NC_015975	TGC	3	9	267138	267146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524758
4491	NC_015975	CAT	2	6	267156	267161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524758
4492	NC_015975	TCG	2	6	267170	267175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524758
4493	NC_015975	ATG	2	6	267280	267285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524758
4494	NC_015975	GCG	2	6	267286	267291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524758
4495	NC_015975	TTTG	2	8	267323	267330	0 %	75 %	25 %	0 %	347524758
4496	NC_015975	ATA	2	6	267345	267350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524758
4497	NC_015975	CTT	2	6	267407	267412	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524758
4498	NC_015975	ATC	2	6	267484	267489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524758
4499	NC_015975	TTG	2	6	267533	267538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524758
4500	NC_015975	CAT	2	6	267578	267583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524758

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