MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 34064

< Previous12...57585960616263646566676869Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
34001	NC_015975	GCT	2	6	2057018	2057023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526380
34002	NC_015975	AGC	2	6	2057041	2057046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526380
34003	NC_015975	TTC	2	6	2057056	2057061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526380
34004	NC_015975	CTG	2	6	2057104	2057109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526380
34005	NC_015975	T	7	7	2057344	2057350	0 %	100 %	0 %	0 %	347526380
34006	NC_015975	ATT	2	6	2057548	2057553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347526381
34007	NC_015975	GTT	2	6	2057620	2057625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526381
34008	NC_015975	TAG	2	6	2057670	2057675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526381
34009	NC_015975	TAT	2	6	2057722	2057727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347526381
34010	NC_015975	TGC	2	6	2057757	2057762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526381
34011	NC_015975	GGA	2	6	2057798	2057803	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347526381
34012	NC_015975	GGT	2	6	2057818	2057823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347526381
34013	NC_015975	TCA	2	6	2057841	2057846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526381
34014	NC_015975	GAAG	2	8	2057852	2057859	50 %	0 %	50 %	0 %	347526381
34015	NC_015975	CAT	2	6	2057903	2057908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526381
34016	NC_015975	AAAG	2	8	2057955	2057962	75 %	0 %	25 %	0 %	347526381
34017	NC_015975	ATG	2	6	2057969	2057974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526381
34018	NC_015975	A	7	7	2057997	2058003	100 %	0 %	0 %	0 %	347526381
34019	NC_015975	GCG	2	6	2058004	2058009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526381
34020	NC_015975	ACG	2	6	2058032	2058037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526381
34021	NC_015975	GAT	2	6	2058044	2058049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526381
34022	NC_015975	ATG	2	6	2058151	2058156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526382
34023	NC_015975	TAA	2	6	2058173	2058178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347526382
34024	NC_015975	GAT	3	9	2058209	2058217	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526382
34025	NC_015975	CGA	2	6	2058264	2058269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526382
34026	NC_015975	CTGG	2	8	2058303	2058310	0 %	25 %	50 %	25 %	347526382
34027	NC_015975	TCA	2	6	2058368	2058373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526382
34028	NC_015975	GTCA	2	8	2058480	2058487	25 %	25 %	25 %	25 %	347526382
34029	NC_015975	TGA	2	6	2058526	2058531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526382
34030	NC_015975	TGA	2	6	2058533	2058538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526382
34031	NC_015975	GTCAG	2	10	2058562	2058571	20 %	20 %	40 %	20 %	347526382
34032	NC_015975	TGCC	2	8	2058638	2058645	0 %	25 %	25 %	50 %	347526382
34033	NC_015975	ATTC	2	8	2058651	2058658	25 %	50 %	0 %	25 %	347526382
34034	NC_015975	ATT	2	6	2058815	2058820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347526382
34035	NC_015975	ATG	2	6	2058843	2058848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526382
34036	NC_015975	TTC	2	6	2065001	2065006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526383
34037	NC_015975	CT	3	6	2065023	2065028	0 %	50 %	0 %	50 %	347526383
34038	NC_015975	TCT	2	6	2065044	2065049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526383
34039	NC_015975	TTCGCG	2	12	2065069	2065080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526383
34040	NC_015975	TTG	2	6	2065097	2065102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526383
34041	NC_015975	CAA	2	6	2065105	2065110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347526383
34042	NC_015975	ACC	2	6	2065139	2065144	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347526383
34043	NC_015975	GGC	2	6	2065159	2065164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347526383
34044	NC_015975	ATC	2	6	2065190	2065195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526383
34045	NC_015975	CAT	2	6	2065210	2065215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526383
34046	NC_015975	TGT	2	6	2065219	2065224	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526383
34047	NC_015975	T	7	7	2065232	2065238	0 %	100 %	0 %	0 %	347526383
34048	NC_015975	ATA	2	6	2065306	2065311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347526383
34049	NC_015975	CGGAA	2	10	2065365	2065374	40 %	0 %	40 %	20 %	347526383
34050	NC_015975	TTC	2	6	2065474	2065479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526383
34051	NC_015975	TCA	2	6	2065482	2065487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526383
34052	NC_015975	CTT	2	6	2065522	2065527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347526383
34053	NC_015975	GTC	2	6	2065559	2065564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526383
34054	NC_015975	ATC	2	6	2065589	2065594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526383
34055	NC_015975	GAT	3	9	2065603	2065611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526383
34056	NC_015975	CTG	2	6	2065667	2065672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526383
34057	NC_015975	TGA	2	6	2065689	2065694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347526383
34058	NC_015975	TCA	2	6	2065936	2065941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347526384
34059	NC_015975	TGC	2	6	2065978	2065983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526384
34060	NC_015975	CAG	2	6	2065991	2065996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347526384
34061	NC_015975	ACGCC	2	10	2066006	2066015	20 %	0 %	20 %	60 %	347526384
34062	NC_015975	T	7	7	2066126	2066132	0 %	100 %	0 %	0 %	347526384
34063	NC_015975	GCT	2	6	2066162	2066167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347526384
34064	NC_015975	TTG	2	6	2066200	2066205	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347526384

< Previous12...57585960616263646566676869Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.