MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 34064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_015975	TTC	2	6	150215	150220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524646
2502	NC_015975	TCA	2	6	150319	150324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524647
2503	NC_015975	CGA	2	6	150399	150404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524647
2504	NC_015975	GCA	2	6	150456	150461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524647
2505	NC_015975	AGC	2	6	150505	150510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524647
2506	NC_015975	CGT	2	6	150531	150536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524647
2507	NC_015975	TTC	2	6	150581	150586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524647
2508	NC_015975	GCT	2	6	150592	150597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524647
2509	NC_015975	TCG	2	6	150647	150652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524647
2510	NC_015975	ACGC	2	8	150752	150759	25 %	0 %	25 %	50 %	347524647
2511	NC_015975	CGG	2	6	150800	150805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524647
2512	NC_015975	GAA	2	6	151024	151029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524647
2513	NC_015975	A	7	7	151115	151121	100 %	0 %	0 %	0 %	347524647
2514	NC_015975	T	7	7	151146	151152	0 %	100 %	0 %	0 %	347524648
2515	NC_015975	TCT	2	6	151173	151178	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524648
2516	NC_015975	TGT	2	6	151192	151197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524648
2517	NC_015975	TAT	2	6	151244	151249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524648
2518	NC_015975	ATG	2	6	151302	151307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524648
2519	NC_015975	GGC	2	6	151325	151330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524648
2520	NC_015975	TATT	2	8	151341	151348	25 %	75 %	0 %	0 %	347524648
2521	NC_015975	TCGT	2	8	151397	151404	0 %	50 %	25 %	25 %	347524648
2522	NC_015975	GAA	2	6	151414	151419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524648
2523	NC_015975	TGC	2	6	151445	151450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524648
2524	NC_015975	AGC	2	6	151451	151456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524648
2525	NC_015975	GATT	2	8	151480	151487	25 %	50 %	25 %	0 %	347524648
2526	NC_015975	ATT	2	6	151539	151544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524648
2527	NC_015975	GCAA	2	8	151656	151663	50 %	0 %	25 %	25 %	347524648
2528	NC_015975	TTC	2	6	151666	151671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524648
2529	NC_015975	A	6	6	151722	151727	100 %	0 %	0 %	0 %	347524648
2530	NC_015975	ATA	2	6	151757	151762	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524648
2531	NC_015975	ATG	2	6	151767	151772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524648
2532	NC_015975	TTC	2	6	151847	151852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524648
2533	NC_015975	AACG	2	8	151877	151884	50 %	0 %	25 %	25 %	347524648
2534	NC_015975	AAG	2	6	151915	151920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524648
2535	NC_015975	T	6	6	151989	151994	0 %	100 %	0 %	0 %	347524648
2536	NC_015975	CACT	2	8	152020	152027	25 %	25 %	0 %	50 %	347524648
2537	NC_015975	GA	3	6	152052	152057	50 %	0 %	50 %	0 %	347524648
2538	NC_015975	ACA	2	6	152070	152075	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524648
2539	NC_015975	TCC	2	6	152162	152167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347524648
2540	NC_015975	AAGG	2	8	152198	152205	50 %	0 %	50 %	0 %	347524648
2541	NC_015975	CAG	2	6	152273	152278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524648
2542	NC_015975	A	6	6	152279	152284	100 %	0 %	0 %	0 %	347524648
2543	NC_015975	GAT	2	6	152303	152308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524648
2544	NC_015975	T	6	6	152320	152325	0 %	100 %	0 %	0 %	347524648
2545	NC_015975	TGC	2	6	152488	152493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524649
2546	NC_015975	TGC	2	6	152525	152530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524649
2547	NC_015975	CAA	2	6	152541	152546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524649
2548	NC_015975	GTT	2	6	152563	152568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524649
2549	NC_015975	TGA	2	6	152580	152585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524649
2550	NC_015975	ACG	2	6	152618	152623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524649
2551	NC_015975	TG	3	6	152655	152660	0 %	50 %	50 %	0 %	347524649
2552	NC_015975	AGT	3	9	152682	152690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524649
2553	NC_015975	CAG	2	6	152724	152729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524649
2554	NC_015975	CAGTTC	2	12	152733	152744	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347524649
2555	NC_015975	GAAG	2	8	152831	152838	50 %	0 %	50 %	0 %	347524649
2556	NC_015975	ATG	2	6	152875	152880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524649
2557	NC_015975	TAG	2	6	152927	152932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524649
2558	NC_015975	TTG	2	6	153022	153027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524649
2559	NC_015975	TAG	2	6	153056	153061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524649
2560	NC_015975	AT	3	6	153083	153088	50 %	50 %	0 %	0 %	347524649
2561	NC_015975	TGT	2	6	153243	153248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524649
2562	NC_015975	CTG	2	6	153280	153285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524649
2563	NC_015975	TGT	2	6	153372	153377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524649
2564	NC_015975	CTG	2	6	153409	153414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524649
2565	NC_015975	TAG	2	6	153572	153577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524649
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2568	NC_015975	TGC	2	6	153685	153690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524649
2569	NC_015975	TAA	2	6	153726	153731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347524649
2570	NC_015975	TCC	2	6	153748	153753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347524649
2571	NC_015975	ATT	2	6	154113	154118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524650
2572	NC_015975	GTT	2	6	154173	154178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524650
2573	NC_015975	TGT	2	6	154225	154230	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524650
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2575	NC_015975	GCA	2	6	154243	154248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524650
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2577	NC_015975	ACGATT	2	12	154386	154397	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347524650
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2579	NC_015975	GTT	2	6	154467	154472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524650
2580	NC_015975	TGATAC	2	12	154493	154504	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	347524650
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2584	NC_015975	TAT	2	6	154695	154700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524650
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2591	NC_015975	TTA	2	6	154909	154914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524650
2592	NC_015975	TTTG	2	8	154948	154955	0 %	75 %	25 %	0 %	347524650
2593	NC_015975	AAG	2	6	154998	155003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524650
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2598	NC_015975	T	6	6	155193	155198	0 %	100 %	0 %	0 %	347524651
2599	NC_015975	T	6	6	155211	155216	0 %	100 %	0 %	0 %	347524651
2600	NC_015975	TTG	2	6	155258	155263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524651
2601	NC_015975	TTG	2	6	155343	155348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524651
2602	NC_015975	ATC	2	6	155417	155422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524651
2603	NC_015975	CAT	2	6	155473	155478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524651
2604	NC_015975	T	8	8	155500	155507	0 %	100 %	0 %	0 %	347524651
2605	NC_015975	CTT	2	6	155523	155528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524651
2606	NC_015975	GT	3	6	155537	155542	0 %	50 %	50 %	0 %	347524651
2607	NC_015975	ATT	2	6	155570	155575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524651
2608	NC_015975	T	6	6	155597	155602	0 %	100 %	0 %	0 %	347524651
2609	NC_015975	TG	3	6	155627	155632	0 %	50 %	50 %	0 %	347524651
2610	NC_015975	AAG	2	6	155666	155671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524651
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2612	NC_015975	GTC	2	6	155735	155740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524651
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2614	NC_015975	TTGA	2	8	155819	155826	25 %	50 %	25 %	0 %	347524651
2615	NC_015975	GAAT	2	8	155850	155857	50 %	25 %	25 %	0 %	347524651
2616	NC_015975	TATT	2	8	155865	155872	25 %	75 %	0 %	0 %	347524651
2617	NC_015975	ATC	2	6	155903	155908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524651
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2620	NC_015975	T	6	6	156036	156041	0 %	100 %	0 %	0 %	347524652
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2989	NC_015975	ATG	2	6	176960	176965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524672
2990	NC_015975	CAT	2	6	176988	176993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524672
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2993	NC_015975	ATG	2	6	177782	177787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524673
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