MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 34064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015975	TGA	2	6	27958	27963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524547
502	NC_015975	TGC	2	6	28733	28738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524548
503	NC_015975	ATCA	2	8	28749	28756	50 %	25 %	0 %	25 %	347524548
504	NC_015975	A	6	6	29087	29092	100 %	0 %	0 %	0 %	347524549
505	NC_015975	GAC	2	6	29093	29098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524549
506	NC_015975	AGA	2	6	29137	29142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524549
507	NC_015975	GGA	2	6	29176	29181	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347524549
508	NC_015975	GAT	2	6	29342	29347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524549
509	NC_015975	AT	3	6	29353	29358	50 %	50 %	0 %	0 %	347524549
510	NC_015975	AGC	2	6	29406	29411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524549
511	NC_015975	ATT	2	6	29445	29450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524549
512	NC_015975	TTG	2	6	29471	29476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524549
513	NC_015975	GTCAG	2	10	29592	29601	20 %	20 %	40 %	20 %	347524549
514	NC_015975	GTT	2	6	29621	29626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524549
515	NC_015975	ATC	2	6	29643	29648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524549
516	NC_015975	AAGAA	2	10	29665	29674	80 %	0 %	20 %	0 %	347524549
517	NC_015975	AGC	2	6	29782	29787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524549
518	NC_015975	ATT	2	6	29790	29795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524549
519	NC_015975	ATG	2	6	29796	29801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524549
520	NC_015975	T	6	6	29855	29860	0 %	100 %	0 %	0 %	347524549
521	NC_015975	GAA	2	6	29882	29887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524549
522	NC_015975	A	6	6	29897	29902	100 %	0 %	0 %	0 %	347524549
523	NC_015975	GTT	2	6	29998	30003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524550
524	NC_015975	TCAA	2	8	30058	30065	50 %	25 %	0 %	25 %	347524550
525	NC_015975	A	6	6	30100	30105	100 %	0 %	0 %	0 %	347524550
526	NC_015975	CGG	2	6	30123	30128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524550
527	NC_015975	ATC	2	6	30197	30202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524550
528	NC_015975	GCAAC	2	10	30319	30328	40 %	0 %	20 %	40 %	347524550
529	NC_015975	ATC	2	6	30415	30420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524550
530	NC_015975	GGT	2	6	30475	30480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347524550
531	NC_015975	ATC	2	6	30655	30660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524550
532	NC_015975	CA	3	6	30704	30709	50 %	0 %	0 %	50 %	347524550
533	NC_015975	AGGA	2	8	30710	30717	50 %	0 %	50 %	0 %	347524550
534	NC_015975	TTCC	2	8	30718	30725	0 %	50 %	0 %	50 %	347524550
535	NC_015975	GGCAAG	2	12	30781	30792	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	347524550
536	NC_015975	GGC	2	6	30817	30822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524550
537	NC_015975	A	7	7	31142	31148	100 %	0 %	0 %	0 %	347524551
538	NC_015975	CAG	2	6	31163	31168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524551
539	NC_015975	TGA	2	6	31288	31293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524551
540	NC_015975	GGATT	2	10	31309	31318	20 %	40 %	40 %	0 %	347524551
541	NC_015975	T	7	7	31321	31327	0 %	100 %	0 %	0 %	347524551
542	NC_015975	TGA	2	6	31381	31386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524551
543	NC_015975	AAG	2	6	31714	31719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524552
544	NC_015975	AT	3	6	31758	31763	50 %	50 %	0 %	0 %	347524552
545	NC_015975	ATT	2	6	31993	31998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524552
546	NC_015975	T	6	6	32014	32019	0 %	100 %	0 %	0 %	347524552
547	NC_015975	GGT	2	6	32119	32124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347524552
548	NC_015975	GCAA	2	8	32134	32141	50 %	0 %	25 %	25 %	347524552
549	NC_015975	ATCGT	2	10	32317	32326	20 %	40 %	20 %	20 %	347524552
550	NC_015975	CGGT	2	8	32354	32361	0 %	25 %	50 %	25 %	347524552
551	NC_015975	TGG	2	6	32423	32428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347524552
552	NC_015975	TTC	2	6	32431	32436	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524552
553	NC_015975	ACG	2	6	32563	32568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524552
554	NC_015975	GGA	2	6	32611	32616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347524552
555	NC_015975	GTT	2	6	32638	32643	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524552
556	NC_015975	TGTTT	2	10	32646	32655	0 %	80 %	20 %	0 %	347524552
557	NC_015975	TTC	2	6	32668	32673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524552
558	NC_015975	ACG	2	6	32695	32700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524552
559	NC_015975	TCG	2	6	32726	32731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524552
560	NC_015975	TTGCC	2	10	32783	32792	0 %	40 %	20 %	40 %	347524552
561	NC_015975	GCTTT	2	10	32843	32852	0 %	60 %	20 %	20 %	347524552
562	NC_015975	GAT	2	6	32877	32882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524552
563	NC_015975	TGC	2	6	32883	32888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524552
564	NC_015975	AAG	2	6	32896	32901	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524552
565	NC_015975	TCG	2	6	32939	32944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524552
566	NC_015975	AT	3	6	33224	33229	50 %	50 %	0 %	0 %	347524553
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568	NC_015975	GAA	2	6	33306	33311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524553
569	NC_015975	TG	3	6	33345	33350	0 %	50 %	50 %	0 %	347524553
570	NC_015975	A	6	6	33379	33384	100 %	0 %	0 %	0 %	347524553
571	NC_015975	CG	3	6	33436	33441	0 %	0 %	50 %	50 %	347524553
572	NC_015975	TCG	2	6	33461	33466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524553
573	NC_015975	AT	5	10	33699	33708	50 %	50 %	0 %	0 %	347524554
574	NC_015975	TCA	2	6	33710	33715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524554
575	NC_015975	GTTGTA	2	12	33716	33727	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	347524554
576	NC_015975	CA	3	6	33827	33832	50 %	0 %	0 %	50 %	347524554
577	NC_015975	A	6	6	33894	33899	100 %	0 %	0 %	0 %	347524554
578	NC_015975	GAA	2	6	33947	33952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524554
579	NC_015975	ACT	2	6	33980	33985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524554
580	NC_015975	ATT	2	6	34034	34039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524554
581	NC_015975	GAA	2	6	34063	34068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524554
582	NC_015975	ACA	2	6	34071	34076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524554
583	NC_015975	ACG	2	6	34085	34090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524554
584	NC_015975	GAA	2	6	34199	34204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524554
585	NC_015975	GTTT	2	8	34212	34219	0 %	75 %	25 %	0 %	347524554
586	NC_015975	TATGAT	2	12	34229	34240	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	347524554
587	NC_015975	GAA	2	6	34271	34276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524554
588	NC_015975	AAG	2	6	34301	34306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524554
589	NC_015975	GTT	2	6	34325	34330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524554
590	NC_015975	TGA	2	6	34345	34350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524554
591	NC_015975	CGTT	2	8	34416	34423	0 %	50 %	25 %	25 %	347524554
592	NC_015975	CTT	2	6	34425	34430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524554
593	NC_015975	GGC	2	6	34445	34450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347524554
594	NC_015975	TGCA	2	8	34501	34508	25 %	25 %	25 %	25 %	347524554
595	NC_015975	TTTG	2	8	34689	34696	0 %	75 %	25 %	0 %	347524554
596	NC_015975	TGA	2	6	34723	34728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347524554
597	NC_015975	TGAAT	2	10	34750	34759	40 %	40 %	20 %	0 %	347524554
598	NC_015975	GGAA	2	8	34839	34846	50 %	0 %	50 %	0 %	347524554
599	NC_015975	AAG	2	6	35731	35736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524555
600	NC_015975	ACA	2	6	35742	35747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524555
601	NC_015975	CAA	2	6	35808	35813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524555
602	NC_015975	TTC	2	6	35837	35842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347524555
603	NC_015975	ACG	2	6	35868	35873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524555
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606	NC_015975	GTT	2	6	35949	35954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347524555
607	NC_015975	GT	3	6	36160	36165	0 %	50 %	50 %	0 %	347524555
608	NC_015975	GC	4	8	36193	36200	0 %	0 %	50 %	50 %	347524555
609	NC_015975	CAA	2	6	36203	36208	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347524555
610	NC_015975	ATT	2	6	36210	36215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347524555
611	NC_015975	CGGACG	2	12	36236	36247	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347524555
612	NC_015975	ATCG	2	8	36285	36292	25 %	25 %	25 %	25 %	347524555
613	NC_015975	GAAG	2	8	36308	36315	50 %	0 %	50 %	0 %	347524555
614	NC_015975	ACGGCG	2	12	36328	36339	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	347524555
615	NC_015975	TGAC	2	8	36343	36350	25 %	25 %	25 %	25 %	347524555
616	NC_015975	GAA	2	6	36369	36374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524555
617	NC_015975	ACG	2	6	36453	36458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524555
618	NC_015975	AGC	2	6	36508	36513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524555
619	NC_015975	AAG	2	6	36604	36609	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347524555
620	NC_015975	ATTG	2	8	36617	36624	25 %	50 %	25 %	0 %	347524555
621	NC_015975	GGCATG	2	12	36726	36737	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347524555
622	NC_015975	GACG	2	8	36738	36745	25 %	0 %	50 %	25 %	347524555
623	NC_015975	TCA	2	6	36746	36751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347524555
624	NC_015975	CGT	2	6	36763	36768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524555
625	NC_015975	TGC	2	6	36800	36805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524555
626	NC_015975	TGC	2	6	36866	36871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347524555
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628	NC_015975	ACG	2	6	36910	36915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524555
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752	NC_015975	CGA	2	6	45706	45711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347524563
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