MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leuconostoc sp. C2 chromosome

Total Repeats: 36111

< Previous12...61626364656667686970717273Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
36001	NC_015734	AAAT	2	8	1866199	1866206	75 %	25 %	0 %	0 %	339492032
36002	NC_015734	GCG	2	6	1866218	1866223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339492032
36003	NC_015734	ATTT	2	8	1866228	1866235	25 %	75 %	0 %	0 %	339492032
36004	NC_015734	A	6	6	1866301	1866306	100 %	0 %	0 %	0 %	339492032
36005	NC_015734	CAA	2	6	1866367	1866372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492032
36006	NC_015734	GCA	2	6	1866476	1866481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492032
36007	NC_015734	TAT	2	6	1866591	1866596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339492032
36008	NC_015734	A	6	6	1866613	1866618	100 %	0 %	0 %	0 %	339492032
36009	NC_015734	TGG	2	6	1866662	1866667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339492032
36010	NC_015734	ACG	2	6	1866746	1866751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492032
36011	NC_015734	TTA	2	6	1866771	1866776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339492032
36012	NC_015734	CGA	2	6	1866785	1866790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492032
36013	NC_015734	GAA	2	6	1866813	1866818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492032
36014	NC_015734	GTT	2	6	1866861	1866866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339492032
36015	NC_015734	GCAC	2	8	1866881	1866888	25 %	0 %	25 %	50 %	339492032
36016	NC_015734	ATT	2	6	1867011	1867016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339492032
36017	NC_015734	TGC	2	6	1867112	1867117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492032
36018	NC_015734	CGT	2	6	1867136	1867141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492032
36019	NC_015734	T	6	6	1867285	1867290	0 %	100 %	0 %	0 %	339492032
36020	NC_015734	CAT	2	6	1867293	1867298	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339492032
36021	NC_015734	A	6	6	1867318	1867323	100 %	0 %	0 %	0 %	339492032
36022	NC_015734	ATG	2	6	1867360	1867365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492032
36023	NC_015734	ATT	2	6	1867382	1867387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339492032
36024	NC_015734	T	8	8	1867391	1867398	0 %	100 %	0 %	0 %	339492032
36025	NC_015734	AAG	2	6	1867429	1867434	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492032
36026	NC_015734	ATG	2	6	1867476	1867481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492032
36027	NC_015734	AT	3	6	1867554	1867559	50 %	50 %	0 %	0 %	339492033
36028	NC_015734	ATT	2	6	1867639	1867644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339492033
36029	NC_015734	T	6	6	1867643	1867648	0 %	100 %	0 %	0 %	339492033
36030	NC_015734	AGA	2	6	1867877	1867882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492033
36031	NC_015734	A	7	7	1867957	1867963	100 %	0 %	0 %	0 %	339492033
36032	NC_015734	TA	3	6	1868008	1868013	50 %	50 %	0 %	0 %	339492033
36033	NC_015734	GATT	2	8	1868087	1868094	25 %	50 %	25 %	0 %	339492033
36034	NC_015734	CAA	2	6	1868121	1868126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492033
36035	NC_015734	AGT	2	6	1868145	1868150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492033
36036	NC_015734	TTA	2	6	1868165	1868170	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339492033
36037	NC_015734	TGA	2	6	1868324	1868329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492033
36038	NC_015734	CAT	2	6	1868350	1868355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339492033
36039	NC_015734	AGA	2	6	1868489	1868494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492033
36040	NC_015734	GCA	2	6	1868504	1868509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492033
36041	NC_015734	ATG	2	6	1868515	1868520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492033
36042	NC_015734	TCT	2	6	1868547	1868552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	339492033
36043	NC_015734	T	7	7	1868552	1868558	0 %	100 %	0 %	0 %	339492033
36044	NC_015734	A	6	6	1868561	1868566	100 %	0 %	0 %	0 %	339492033
36045	NC_015734	GAT	2	6	1868605	1868610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492034
36046	NC_015734	GTGTTT	2	12	1868643	1868654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339492034
36047	NC_015734	GT	3	6	1868753	1868758	0 %	50 %	50 %	0 %	339492034
36048	NC_015734	TGAC	2	8	1868886	1868893	25 %	25 %	25 %	25 %	339492034
36049	NC_015734	CAA	2	6	1868902	1868907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492034
36050	NC_015734	T	6	6	1868911	1868916	0 %	100 %	0 %	0 %	339492034
36051	NC_015734	TGA	2	6	1868918	1868923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492034
36052	NC_015734	GGT	2	6	1868930	1868935	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339492034
36053	NC_015734	ACG	2	6	1869030	1869035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492035
36054	NC_015734	ATT	2	6	1869040	1869045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339492035
36055	NC_015734	ATGA	2	8	1869095	1869102	50 %	25 %	25 %	0 %	339492035
36056	NC_015734	TGAT	2	8	1869147	1869154	25 %	50 %	25 %	0 %	339492035
36057	NC_015734	CAA	2	6	1869180	1869185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492035
36058	NC_015734	ATT	2	6	1869194	1869199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339492035
36059	NC_015734	TGG	2	6	1869232	1869237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339492035
36060	NC_015734	TGG	2	6	1869259	1869264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339492035
36061	NC_015734	TAT	2	6	1869325	1869330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339492035
36062	NC_015734	ATT	2	6	1869341	1869346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339492035
36063	NC_015734	TGG	3	9	1869370	1869378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339492035
36064	NC_015734	GGC	2	6	1869412	1869417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	339492035
36065	NC_015734	AAG	2	6	1869519	1869524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492035
36066	NC_015734	GAA	2	6	1869554	1869559	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492035
36067	NC_015734	GGT	2	6	1869586	1869591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339492035
36068	NC_015734	CAA	2	6	1869615	1869620	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492035
36069	NC_015734	AGC	2	6	1869676	1869681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492035
36070	NC_015734	CAA	2	6	1869716	1869721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492035
36071	NC_015734	GAT	2	6	1869739	1869744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492035
36072	NC_015734	AAG	2	6	1869768	1869773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492035
36073	NC_015734	AT	3	6	1869970	1869975	50 %	50 %	0 %	0 %	339492036
36074	NC_015734	CAG	2	6	1869999	1870004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492036
36075	NC_015734	TGT	2	6	1870051	1870056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339492036
36076	NC_015734	CAT	2	6	1870164	1870169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	339492036
36077	NC_015734	TTG	2	6	1870177	1870182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339492036
36078	NC_015734	TGTT	2	8	1870228	1870235	0 %	75 %	25 %	0 %	339492036
36079	NC_015734	AATG	2	8	1870292	1870299	50 %	25 %	25 %	0 %	339492036
36080	NC_015734	AT	3	6	1870307	1870312	50 %	50 %	0 %	0 %	339492036
36081	NC_015734	TGC	2	6	1870313	1870318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492036
36082	NC_015734	CTG	2	6	1870360	1870365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492036
36083	NC_015734	GAT	2	6	1870409	1870414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492036
36084	NC_015734	TGT	2	6	1870523	1870528	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339492036
36085	NC_015734	GCA	2	6	1870530	1870535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492036
36086	NC_015734	GAT	2	6	1870554	1870559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492036
36087	NC_015734	CGGT	2	8	1870571	1870578	0 %	25 %	50 %	25 %	339492036
36088	NC_015734	TGAT	2	8	1870585	1870592	25 %	50 %	25 %	0 %	339492036
36089	NC_015734	TGA	3	9	1870661	1870669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492036
36090	NC_015734	T	6	6	1870696	1870701	0 %	100 %	0 %	0 %	339492036
36091	NC_015734	ATTAT	2	10	1870718	1870727	40 %	60 %	0 %	0 %	339492036
36092	NC_015734	T	6	6	1870784	1870789	0 %	100 %	0 %	0 %	339492037
36093	NC_015734	CAG	2	6	1870920	1870925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492037
36094	NC_015734	GTT	2	6	1870939	1870944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	339492037
36095	NC_015734	GTG	2	6	1870947	1870952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	339492037
36096	NC_015734	AGTTG	2	10	1871059	1871068	20 %	40 %	40 %	0 %	339492037
36097	NC_015734	TGA	2	6	1871079	1871084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	339492037
36098	NC_015734	CTAT	2	8	1871128	1871135	25 %	50 %	0 %	25 %	339492037
36099	NC_015734	T	6	6	1871194	1871199	0 %	100 %	0 %	0 %	339492037
36100	NC_015734	CAA	2	6	1871225	1871230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492037
36101	NC_015734	CAA	2	6	1871266	1871271	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492037
36102	NC_015734	TGGC	3	12	1871469	1871480	0 %	25 %	50 %	25 %	339492037
36103	NC_015734	ATTT	2	8	1871541	1871548	25 %	75 %	0 %	0 %	339492037
36104	NC_015734	TGC	2	6	1871575	1871580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	339492037
36105	NC_015734	CAA	2	6	1871754	1871759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	339492037
36106	NC_015734	TTA	2	6	1871771	1871776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	339492037
36107	NC_015734	GAA	2	6	1871780	1871785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	339492037
36108	NC_015734	TGGCAG	2	12	1871793	1871804	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	339492037
36109	NC_015734	CAG	2	6	1871823	1871828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492037
36110	NC_015734	A	6	6	1871865	1871870	100 %	0 %	0 %	0 %	339492037
36111	NC_015734	AGC	2	6	1871881	1871886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	339492037

< Previous12...61626364656667686970717273Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.