MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR580

Total Repeats: 72

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015699	ACT	2	6	1977	1982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202353
2	NC_015699	CCGT	2	8	1983	1990	0 %	25 %	25 %	50 %	338202353
3	NC_015699	GC	3	6	1992	1997	0 %	0 %	50 %	50 %	338202353
4	NC_015699	GTT	2	6	2022	2027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202353
5	NC_015699	CTT	3	9	2119	2127	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202353
6	NC_015699	GTC	2	6	2215	2220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202353
7	NC_015699	CCA	2	6	2295	2300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202353
8	NC_015699	CTG	2	6	2311	2316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202353
9	NC_015699	CAG	2	6	2320	2325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202353
10	NC_015699	TGG	2	6	2361	2366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202353
11	NC_015699	CAA	2	6	2473	2478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202353
12	NC_015699	TTTTA	2	10	2958	2967	20 %	80 %	0 %	0 %	338202354
13	NC_015699	A	6	6	2993	2998	100 %	0 %	0 %	0 %	338202354
14	NC_015699	TAA	2	6	3013	3018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202354
15	NC_015699	AAT	2	6	3039	3044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202354
16	NC_015699	TTC	2	6	3056	3061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202354
17	NC_015699	AACT	2	8	3076	3083	50 %	25 %	0 %	25 %	338202354
18	NC_015699	CAT	2	6	3111	3116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202354
19	NC_015699	AAT	2	6	3132	3137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202354
20	NC_015699	AAT	2	6	3153	3158	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202354
21	NC_015699	CCA	2	6	3267	3272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202354
22	NC_015699	TTC	2	6	3341	3346	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202354
23	NC_015699	TCA	2	6	3389	3394	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202354
24	NC_015699	ATC	2	6	3472	3477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202354
25	NC_015699	TCA	3	9	3491	3499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202354
26	NC_015699	ATT	2	6	3521	3526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202354
27	NC_015699	TGGT	2	8	3592	3599	0 %	50 %	50 %	0 %	338202355
28	NC_015699	GTTG	2	8	3606	3613	0 %	50 %	50 %	0 %	338202355
29	NC_015699	CAAGT	2	10	3656	3665	40 %	20 %	20 %	20 %	338202355
30	NC_015699	GTT	2	6	3830	3835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202355
31	NC_015699	GTTTTG	2	12	3847	3858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202355
32	NC_015699	CAT	2	6	3898	3903	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202355
33	NC_015699	GTT	2	6	3914	3919	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202355
34	NC_015699	GTTTTT	2	12	4026	4037	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	338202355
35	NC_015699	TTGGTC	2	12	4129	4140	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	338202356
36	NC_015699	TGG	2	6	4196	4201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202356
37	NC_015699	TGT	2	6	4217	4222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202356
38	NC_015699	TTG	2	6	4300	4305	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202356
39	NC_015699	TGT	2	6	4349	4354	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202356
40	NC_015699	TC	4	8	4365	4372	0 %	50 %	0 %	50 %	338202356
41	NC_015699	CTT	2	6	4389	4394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202356
42	NC_015699	TTCA	2	8	4399	4406	25 %	50 %	0 %	25 %	338202356
43	NC_015699	TAA	2	6	4413	4418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202356
44	NC_015699	CTT	3	9	4531	4539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202356
45	NC_015699	GTTG	2	8	4760	4767	0 %	50 %	50 %	0 %	338202356
46	NC_015699	TGT	2	6	4833	4838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202356
47	NC_015699	ACC	2	6	4888	4893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202356
48	NC_015699	CA	3	6	4970	4975	50 %	0 %	0 %	50 %	338202356
49	NC_015699	TTGT	2	8	4984	4991	0 %	75 %	25 %	0 %	338202356
50	NC_015699	CAC	2	6	4998	5003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202356
51	NC_015699	ATCGA	2	10	5068	5077	40 %	20 %	20 %	20 %	338202356
52	NC_015699	CTTCAA	2	12	5085	5096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202356
53	NC_015699	ATC	2	6	5134	5139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202356
54	NC_015699	CAT	2	6	5166	5171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202356
55	NC_015699	CTT	2	6	5314	5319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202356
56	NC_015699	ACC	2	6	5375	5380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202356
57	NC_015699	ATC	2	6	5402	5407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202356
58	NC_015699	AAT	2	6	5449	5454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202356
59	NC_015699	TGT	2	6	5475	5480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202356
60	NC_015699	TGT	2	6	5483	5488	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202356
61	NC_015699	GAAT	2	8	5492	5499	50 %	25 %	25 %	0 %	338202356
62	NC_015699	CT	3	6	5510	5515	0 %	50 %	0 %	50 %	338202356
63	NC_015699	GAAC	2	8	5527	5534	50 %	0 %	25 %	25 %	338202356
64	NC_015699	T	7	7	5872	5878	0 %	100 %	0 %	0 %	338202357
65	NC_015699	AAAG	2	8	5980	5987	75 %	0 %	25 %	0 %	338202357
66	NC_015699	TAT	2	6	6023	6028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202357
67	NC_015699	AAT	2	6	6036	6041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202357
68	NC_015699	TAAA	2	8	6048	6055	75 %	25 %	0 %	0 %	338202357
69	NC_015699	CGG	2	6	6089	6094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338202357
70	NC_015699	AAG	2	6	6099	6104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202357
71	NC_015699	TCT	2	6	6113	6118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202357
72	NC_015699	ATT	2	6	6130	6135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202357

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.