MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 plasmid pLR585

Total Repeats: 165

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015698	ACA	2	6	401	406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202337
2	NC_015698	TAT	2	6	409	414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202337
3	NC_015698	TTA	2	6	557	562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202337
4	NC_015698	GGC	2	6	572	577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338202337
5	NC_015698	GAT	2	6	611	616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202337
6	NC_015698	GCG	2	6	617	622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338202337
7	NC_015698	GGC	2	6	680	685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338202337
8	NC_015698	GCC	2	6	717	722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202337
9	NC_015698	GAA	2	6	772	777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202337
10	NC_015698	TGC	2	6	826	831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202337
11	NC_015698	TGA	2	6	862	867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202337
12	NC_015698	AAG	2	6	912	917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202337
13	NC_015698	TGC	2	6	948	953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202337
14	NC_015698	ATC	2	6	1004	1009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202337
15	NC_015698	CAC	2	6	1081	1086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202337
16	NC_015698	CAT	2	6	1198	1203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202337
17	NC_015698	GCC	2	6	1214	1219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202337
18	NC_015698	CGC	2	6	1245	1250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202337
19	NC_015698	TTA	2	6	1276	1281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202337
20	NC_015698	ATG	2	6	1395	1400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202338
21	NC_015698	GTG	2	6	1408	1413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202338
22	NC_015698	TGC	2	6	1474	1479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202338
23	NC_015698	GGC	2	6	1493	1498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338202338
24	NC_015698	GTC	2	6	1563	1568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202338
25	NC_015698	ATT	2	6	1575	1580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202338
26	NC_015698	TGA	2	6	1606	1611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202338
27	NC_015698	AAG	2	6	1630	1635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202338
28	NC_015698	CCG	2	6	1693	1698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202338
29	NC_015698	GGT	2	6	1773	1778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202338
30	NC_015698	AAC	2	6	2016	2021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202338
31	NC_015698	CCA	2	6	2074	2079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202338
32	NC_015698	ATT	2	6	2112	2117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202338
33	NC_015698	ATT	2	6	2195	2200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202338
34	NC_015698	GGT	2	6	2206	2211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202338
35	NC_015698	GTG	2	6	2223	2228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202338
36	NC_015698	GGC	2	6	2232	2237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338202338
37	NC_015698	CGG	2	6	2255	2260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338202338
38	NC_015698	TCG	2	6	2377	2382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202338
39	NC_015698	CTG	2	6	2395	2400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202338
40	NC_015698	CTA	2	6	2498	2503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202338
41	NC_015698	CTG	2	6	2514	2519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202338
42	NC_015698	CTG	2	6	2539	2544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202338
43	NC_015698	GCT	2	6	2546	2551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202338
44	NC_015698	TTC	2	6	2559	2564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202338
45	NC_015698	GTT	2	6	2850	2855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202338
46	NC_015698	TAT	2	6	2866	2871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202338
47	NC_015698	TGT	2	6	2923	2928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202339
48	NC_015698	TCA	2	6	2994	2999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202339
49	NC_015698	ATT	2	6	3057	3062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202339
50	NC_015698	ATC	2	6	3108	3113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202339
51	NC_015698	TGA	2	6	3234	3239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202339
52	NC_015698	ACA	2	6	3283	3288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202339
53	NC_015698	GCA	2	6	3292	3297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202339
54	NC_015698	AAC	2	6	3301	3306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202339
55	NC_015698	TCG	2	6	3361	3366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202339
56	NC_015698	CAA	2	6	3419	3424	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202339
57	NC_015698	CGG	2	6	3426	3431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338202339
58	NC_015698	CAC	2	6	3433	3438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202339
59	NC_015698	ATT	2	6	3755	3760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202340
60	NC_015698	AAC	2	6	3873	3878	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202340
61	NC_015698	TGA	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202340
62	NC_015698	ATT	2	6	3999	4004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202340
63	NC_015698	CAA	2	6	4059	4064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202340
64	NC_015698	GAT	2	6	4125	4130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202340
65	NC_015698	GTG	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202341
66	NC_015698	ACG	2	6	4525	4530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202341
67	NC_015698	ATT	2	6	4540	4545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202341
68	NC_015698	TCA	2	6	4724	4729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202341
69	NC_015698	ATC	2	6	4754	4759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202341
70	NC_015698	CCA	2	6	4776	4781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202341
71	NC_015698	CAC	2	6	4794	4799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202341
72	NC_015698	CGT	2	6	4913	4918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202341
73	NC_015698	TAC	2	6	5016	5021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202341
74	NC_015698	GCT	2	6	5139	5144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202341
75	NC_015698	AGC	2	6	5245	5250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202341
76	NC_015698	AAG	2	6	5572	5577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202342
77	NC_015698	CAA	2	6	5807	5812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202342
78	NC_015698	CAA	2	6	5814	5819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202342
79	NC_015698	GAA	2	6	5917	5922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202342
80	NC_015698	TAA	3	9	6111	6119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202342
81	NC_015698	AAG	2	6	6732	6737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202343
82	NC_015698	CTT	2	6	6743	6748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202343
83	NC_015698	ACC	2	6	6819	6824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202343
84	NC_015698	CAT	3	9	6851	6859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202343
85	NC_015698	TTC	2	6	6894	6899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202343
86	NC_015698	TCT	2	6	6955	6960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202343
87	NC_015698	TGT	2	6	7027	7032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202343
88	NC_015698	CCA	2	6	7060	7065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202343
89	NC_015698	ATT	3	9	7134	7142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202343
90	NC_015698	ACT	2	6	7427	7432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202344
91	NC_015698	ATC	2	6	7488	7493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202344
92	NC_015698	TAG	2	6	7582	7587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202344
93	NC_015698	TCT	2	6	7753	7758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202344
94	NC_015698	GAC	2	6	7838	7843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202344
95	NC_015698	TGC	2	6	7892	7897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202344
96	NC_015698	TCT	2	6	7987	7992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202344
97	NC_015698	GGA	2	6	8029	8034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338202344
98	NC_015698	GCA	2	6	8051	8056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202344
99	NC_015698	ACT	2	6	8057	8062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202344
100	NC_015698	GAA	2	6	8088	8093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202344
101	NC_015698	TTA	2	6	8121	8126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202344
102	NC_015698	TTG	2	6	8163	8168	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202344
103	NC_015698	TTA	2	6	8212	8217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202344
104	NC_015698	TGC	2	6	8354	8359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202344
105	NC_015698	GAT	2	6	8459	8464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202344
106	NC_015698	TGT	2	6	8648	8653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202345
107	NC_015698	TTG	2	6	8674	8679	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202345
108	NC_015698	TTA	2	6	8696	8701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202345
109	NC_015698	AGT	2	6	8744	8749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202345
110	NC_015698	TTG	2	6	8754	8759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202345
111	NC_015698	AAT	2	6	8794	8799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202345
112	NC_015698	ATA	2	6	8854	8859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202345
113	NC_015698	TCA	2	6	9882	9887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202346
114	NC_015698	TTG	2	6	9935	9940	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202346
115	NC_015698	TAG	2	6	9950	9955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202346
116	NC_015698	TAA	2	6	9973	9978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202346
117	NC_015698	TAG	2	6	10096	10101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202346
118	NC_015698	TGA	2	6	10132	10137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202346
119	NC_015698	TAG	2	6	10174	10179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202346
120	NC_015698	TGC	2	6	10218	10223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202346
121	NC_015698	TTG	2	6	10362	10367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202346
122	NC_015698	GTT	2	6	10378	10383	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202346
123	NC_015698	TTG	2	6	10400	10405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202346
124	NC_015698	AGT	2	6	10442	10447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202346
125	NC_015698	GTT	2	6	10642	10647	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202346
126	NC_015698	GTC	2	6	10667	10672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202346
127	NC_015698	GTT	2	6	10705	10710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202346
128	NC_015698	TTG	2	6	10736	10741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202346
129	NC_015698	TGT	2	6	10746	10751	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202346
130	NC_015698	TGC	2	6	10778	10783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202346
131	NC_015698	TTG	2	6	10802	10807	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202346
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.