MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 30892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015697	CTA	2	6	7	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202360
2	NC_015697	ACT	2	6	21	26	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202360
3	NC_015697	AGA	2	6	53	58	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202360
4	NC_015697	TGA	2	6	64	69	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202360
5	NC_015697	ATC	2	6	130	135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202360
6	NC_015697	TAA	2	6	143	148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202360
7	NC_015697	TCG	2	6	179	184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202360
8	NC_015697	TAC	2	6	219	224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202360
9	NC_015697	GTC	3	9	280	288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202360
10	NC_015697	TAT	2	6	294	299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202360
11	NC_015697	GAC	2	6	351	356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202360
12	NC_015697	CAT	2	6	513	518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202360
13	NC_015697	TAG	2	6	953	958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202360
14	NC_015697	AAT	2	6	1082	1087	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202360
15	NC_015697	TAT	2	6	1099	1104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202360
16	NC_015697	TCT	2	6	1892	1897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202361
17	NC_015697	TCA	2	6	1934	1939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202361
18	NC_015697	CAG	2	6	1980	1985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202361
19	NC_015697	ATT	2	6	2137	2142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202361
20	NC_015697	TTC	2	6	2254	2259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202361
21	NC_015697	TCA	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202361
22	NC_015697	TCA	2	6	2381	2386	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202361
23	NC_015697	CTA	2	6	2388	2393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202361
24	NC_015697	CAT	2	6	2461	2466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202361
25	NC_015697	TTA	2	6	2495	2500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202361
26	NC_015697	AAC	2	6	2512	2517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202361
27	NC_015697	AAT	2	6	2690	2695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202362
28	NC_015697	TAA	2	6	2717	2722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202362
29	NC_015697	ATG	2	6	2784	2789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202362
30	NC_015697	CCT	2	6	2883	2888	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202362
31	NC_015697	TTC	2	6	2972	2977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202362
32	NC_015697	GCT	2	6	3042	3047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202362
33	NC_015697	TGT	2	6	3122	3127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202362
34	NC_015697	GGT	2	6	3140	3145	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202362
35	NC_015697	CCA	2	6	3183	3188	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202362
36	NC_015697	ATC	2	6	3200	3205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202362
37	NC_015697	CAA	2	6	3232	3237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202362
38	NC_015697	AAT	2	6	3257	3262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202362
39	NC_015697	AGC	2	6	3367	3372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202363
40	NC_015697	ATG	2	6	3414	3419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202363
41	NC_015697	CAA	2	6	3500	3505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202363
42	NC_015697	AAT	2	6	3525	3530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202363
43	NC_015697	CCA	2	6	3562	3567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202363
44	NC_015697	GTT	2	6	3568	3573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202363
45	NC_015697	GCA	2	6	3607	3612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202363
46	NC_015697	CTT	2	6	3668	3673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202363
47	NC_015697	AAT	2	6	3700	3705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202363
48	NC_015697	ACT	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202363
49	NC_015697	ATA	2	6	3784	3789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202363
50	NC_015697	CTA	2	6	3965	3970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202363
51	NC_015697	TGA	2	6	4063	4068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202363
52	NC_015697	TCA	2	6	4108	4113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202363
53	NC_015697	TAT	2	6	4151	4156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202363
54	NC_015697	AAG	2	6	4203	4208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202364
55	NC_015697	GTT	2	6	4224	4229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202364
56	NC_015697	CTT	2	6	4345	4350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202364
57	NC_015697	ATA	2	6	4394	4399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202364
58	NC_015697	TAT	2	6	4732	4737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202364
59	NC_015697	TCA	2	6	4959	4964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202364
60	NC_015697	TCG	2	6	5033	5038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202364
61	NC_015697	CCA	3	9	5052	5060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202364
62	NC_015697	GCT	2	6	5064	5069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202364
63	NC_015697	TTC	2	6	5252	5257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202364
64	NC_015697	AGC	2	6	5333	5338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202364
65	NC_015697	TAT	2	6	5489	5494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202364
66	NC_015697	CAC	2	6	5509	5514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202364
67	NC_015697	ACC	2	6	5546	5551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202365
68	NC_015697	ACT	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202365
69	NC_015697	CTG	2	6	5700	5705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202365
70	NC_015697	CCA	2	6	5714	5719	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202365
71	NC_015697	CTT	2	6	5745	5750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202365
72	NC_015697	CAA	2	6	5790	5795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202365
73	NC_015697	CTT	2	6	5881	5886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202365
74	NC_015697	TCA	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202365
75	NC_015697	TTA	2	6	5975	5980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202365
76	NC_015697	TCC	2	6	5994	5999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202366
77	NC_015697	GTT	2	6	6016	6021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202366
78	NC_015697	TTC	2	6	6035	6040	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202366
79	NC_015697	TCA	2	6	6094	6099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202366
80	NC_015697	AAC	2	6	6122	6127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202366
81	NC_015697	GTT	2	6	6291	6296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202366
82	NC_015697	ACC	2	6	6473	6478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202367
83	NC_015697	AAC	2	6	6574	6579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202367
84	NC_015697	ACT	2	6	6615	6620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202367
85	NC_015697	TTG	2	6	6676	6681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202367
86	NC_015697	TCA	2	6	6741	6746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202367
87	NC_015697	CTT	2	6	6808	6813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202367
88	NC_015697	TGC	2	6	6836	6841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202367
89	NC_015697	CGA	2	6	6901	6906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202367
90	NC_015697	CAC	2	6	6970	6975	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202367
91	NC_015697	AGG	2	6	7018	7023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338202367
92	NC_015697	CTT	2	6	7135	7140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202367
93	NC_015697	TAA	2	6	7315	7320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202367
94	NC_015697	GTT	2	6	7335	7340	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202367
95	NC_015697	ACC	2	6	7343	7348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202367
96	NC_015697	CAT	2	6	7492	7497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202367
97	NC_015697	TTA	2	6	7651	7656	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202367
98	NC_015697	TCC	2	6	7675	7680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202368
99	NC_015697	AAT	2	6	7724	7729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202368
100	NC_015697	CTT	2	6	7763	7768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202368
101	NC_015697	AGC	2	6	7804	7809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202368
102	NC_015697	ATT	2	6	7930	7935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202368
103	NC_015697	TCT	2	6	8033	8038	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202368
104	NC_015697	TGA	2	6	8084	8089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202368
105	NC_015697	CAT	2	6	8118	8123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202368
106	NC_015697	ATT	2	6	8148	8153	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202368
107	NC_015697	GCT	3	9	8191	8199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202368
108	NC_015697	TAG	2	6	8259	8264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202368
109	NC_015697	GCC	2	6	8303	8308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202368
110	NC_015697	GCC	2	6	8356	8361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202368
111	NC_015697	CTG	2	6	8476	8481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202369
112	NC_015697	TGT	2	6	8533	8538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202369
113	NC_015697	TAG	2	6	8649	8654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202369
114	NC_015697	TAA	2	6	8661	8666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202369
115	NC_015697	AAG	2	6	8735	8740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202369
116	NC_015697	TGT	2	6	8855	8860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202369
117	NC_015697	ATT	2	6	8893	8898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202369
118	NC_015697	TTG	2	6	8902	8907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202369
119	NC_015697	TTG	2	6	8986	8991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202369
120	NC_015697	CTT	2	6	9027	9032	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202369
121	NC_015697	GCG	2	6	9062	9067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338202369
122	NC_015697	ATC	2	6	9089	9094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202369
123	NC_015697	ATA	2	6	9330	9335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202369
124	NC_015697	GTA	2	6	9340	9345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202369
125	NC_015697	ATT	2	6	9347	9352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202369
126	NC_015697	CAA	2	6	9380	9385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202370
127	NC_015697	ATC	2	6	9489	9494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202370
128	NC_015697	TCA	2	6	9541	9546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202370
129	NC_015697	TTC	2	6	9596	9601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202370
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131	NC_015697	CCA	2	6	9647	9652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202371
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