MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 42283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41501	NC_015697	TGC	2	6	2222929	2222934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204558
41502	NC_015697	TAA	2	6	2222988	2222993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204558
41503	NC_015697	GAAGG	2	10	2223146	2223155	40 %	0 %	60 %	0 %	338204559
41504	NC_015697	GAT	2	6	2223187	2223192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204559
41505	NC_015697	GATC	2	8	2223249	2223256	25 %	25 %	25 %	25 %	338204559
41506	NC_015697	CGAA	2	8	2223275	2223282	50 %	0 %	25 %	25 %	338204559
41507	NC_015697	AGA	2	6	2223294	2223299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204559
41508	NC_015697	GAT	2	6	2223337	2223342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204559
41509	NC_015697	TTG	2	6	2223365	2223370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204559
41510	NC_015697	ATG	2	6	2223389	2223394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204559
41511	NC_015697	TGT	2	6	2223432	2223437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204559
41512	NC_015697	ATT	2	6	2223492	2223497	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204559
41513	NC_015697	AAT	2	6	2223523	2223528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204559
41514	NC_015697	ACA	2	6	2223569	2223574	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204559
41515	NC_015697	AGA	2	6	2223645	2223650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204559
41516	NC_015697	TTA	2	6	2223670	2223675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204559
41517	NC_015697	AATT	2	8	2223741	2223748	50 %	50 %	0 %	0 %	338204560
41518	NC_015697	CCA	2	6	2223780	2223785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204560
41519	NC_015697	ATC	2	6	2223792	2223797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204560
41520	NC_015697	TTG	2	6	2223813	2223818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204560
41521	NC_015697	TAA	2	6	2223842	2223847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204560
41522	NC_015697	T	6	6	2223875	2223880	0 %	100 %	0 %	0 %	338204560
41523	NC_015697	CAG	2	6	2223904	2223909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338204560
41524	NC_015697	TAT	2	6	2223916	2223921	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204560
41525	NC_015697	TGC	2	6	2223935	2223940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204560
41526	NC_015697	TCA	2	6	2223942	2223947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204560
41527	NC_015697	GT	3	6	2223976	2223981	0 %	50 %	50 %	0 %	338204560
41528	NC_015697	ACC	2	6	2224121	2224126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204560
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41530	NC_015697	T	6	6	2224154	2224159	0 %	100 %	0 %	0 %	338204561
41531	NC_015697	AGC	2	6	2224191	2224196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338204561
41532	NC_015697	GGT	2	6	2224197	2224202	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338204561
41533	NC_015697	GCA	2	6	2224267	2224272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338204561
41534	NC_015697	GA	3	6	2224281	2224286	50 %	0 %	50 %	0 %	338204561
41535	NC_015697	CTA	2	6	2224337	2224342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204561
41536	NC_015697	TAC	2	6	2224470	2224475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204561
41537	NC_015697	TCA	2	6	2224483	2224488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204561
41538	NC_015697	CCGC	2	8	2224501	2224508	0 %	0 %	25 %	75 %	338204561
41539	NC_015697	TCA	2	6	2224562	2224567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204561
41540	NC_015697	ACT	2	6	2224591	2224596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204561
41541	NC_015697	CAAA	2	8	2224665	2224672	75 %	0 %	0 %	25 %	338204562
41542	NC_015697	AGGG	2	8	2224694	2224701	25 %	0 %	75 %	0 %	338204562
41543	NC_015697	ACC	2	6	2224757	2224762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204562
41544	NC_015697	AGC	2	6	2224787	2224792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338204562
41545	NC_015697	TTG	2	6	2224913	2224918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204562
41546	NC_015697	TCT	2	6	2224966	2224971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204562
41547	NC_015697	ACTATC	2	12	2224985	2224996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204562
41548	NC_015697	TGT	2	6	2225082	2225087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204562
41549	NC_015697	T	7	7	2225179	2225185	0 %	100 %	0 %	0 %	338204563
41550	NC_015697	ATC	2	6	2225238	2225243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204563
41551	NC_015697	CAT	3	9	2225249	2225257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204563
41552	NC_015697	TTTCA	2	10	2225636	2225645	20 %	60 %	0 %	20 %	338204564
41553	NC_015697	AGT	2	6	2225702	2225707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204564
41554	NC_015697	AAC	2	6	2225717	2225722	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204564
41555	NC_015697	GAA	2	6	2225746	2225751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204564
41556	NC_015697	TAA	2	6	2225794	2225799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204564
41557	NC_015697	CAT	2	6	2225800	2225805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204564
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41559	NC_015697	GAA	4	12	2226070	2226081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204564
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41561	NC_015697	TCAT	2	8	2226288	2226295	25 %	50 %	0 %	25 %	338204564
41562	NC_015697	GTT	2	6	2226377	2226382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338204564
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41565	NC_015697	TAC	2	6	2226746	2226751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204565
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41567	NC_015697	TCT	2	6	2226784	2226789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338204565
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41570	NC_015697	CAT	2	6	2226831	2226836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204565
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41575	NC_015697	TA	3	6	2227023	2227028	50 %	50 %	0 %	0 %	338204565
41576	NC_015697	GA	3	6	2227031	2227036	50 %	0 %	50 %	0 %	338204565
41577	NC_015697	CTG	2	6	2227046	2227051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204565
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41586	NC_015697	TTCA	2	8	2227574	2227581	25 %	50 %	0 %	25 %	338204566
41587	NC_015697	TCA	2	6	2227749	2227754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204566
41588	NC_015697	ATC	2	6	2227779	2227784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204566
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41590	NC_015697	CAC	2	6	2227819	2227824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204566
41591	NC_015697	CCGA	2	8	2227913	2227920	25 %	0 %	25 %	50 %	338204566
41592	NC_015697	CGT	2	6	2227938	2227943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338204566
41593	NC_015697	TAC	2	6	2228041	2228046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204566
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41597	NC_015697	TAT	2	6	2228487	2228492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204567
41598	NC_015697	GAT	2	6	2228574	2228579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204567
41599	NC_015697	GAA	2	6	2228598	2228603	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204567
41600	NC_015697	GAA	2	6	2228608	2228613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338204567
41601	NC_015697	ACC	2	6	2228658	2228663	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338204567
41602	NC_015697	GATTT	2	10	2228685	2228694	20 %	60 %	20 %	0 %	338204567
41603	NC_015697	TGG	2	6	2228699	2228704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338204567
41604	NC_015697	ACTT	2	8	2228743	2228750	25 %	50 %	0 %	25 %	338204567
41605	NC_015697	CAA	2	6	2228751	2228756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204567
41606	NC_015697	TCA	2	6	2228830	2228835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338204567
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41608	NC_015697	TAT	2	6	2229000	2229005	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338204568
41609	NC_015697	CAA	2	6	2229011	2229016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338204568
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41611	NC_015697	GAAT	2	8	2229045	2229052	50 %	25 %	25 %	0 %	338204568
41612	NC_015697	A	6	6	2229060	2229065	100 %	0 %	0 %	0 %	338204568
41613	NC_015697	TAA	2	6	2229084	2229089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338204568
41614	NC_015697	TGA	2	6	2229150	2229155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338204568
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