MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 42283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015697	TAA	2	6	162045	162050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202522
3002	NC_015697	A	6	6	162114	162119	100 %	0 %	0 %	0 %	338202522
3003	NC_015697	CAA	2	6	162325	162330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202523
3004	NC_015697	TCA	2	6	162363	162368	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202523
3005	NC_015697	TTC	2	6	162374	162379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202523
3006	NC_015697	CAA	2	6	162412	162417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202523
3007	NC_015697	ATC	2	6	162458	162463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202523
3008	NC_015697	CAA	2	6	162499	162504	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202523
3009	NC_015697	TTA	2	6	162516	162521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202523
3010	NC_015697	TTA	2	6	162537	162542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202523
3011	NC_015697	ATT	3	9	162549	162557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202523
3012	NC_015697	TATTC	2	10	162583	162592	20 %	60 %	0 %	20 %	338202524
3013	NC_015697	A	6	6	162629	162634	100 %	0 %	0 %	0 %	338202524
3014	NC_015697	T	6	6	162643	162648	0 %	100 %	0 %	0 %	338202524
3015	NC_015697	ATC	2	6	162666	162671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202524
3016	NC_015697	CAG	2	6	162712	162717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202524
3017	NC_015697	AAC	2	6	162731	162736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202524
3018	NC_015697	TAA	2	6	162752	162757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202524
3019	NC_015697	CCA	2	6	162765	162770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202524
3020	NC_015697	T	6	6	162787	162792	0 %	100 %	0 %	0 %	338202524
3021	NC_015697	ACC	2	6	162848	162853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202524
3022	NC_015697	TCA	3	9	162880	162888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202524
3023	NC_015697	ACA	2	6	162948	162953	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202524
3024	NC_015697	AGG	2	6	162969	162974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338202524
3025	NC_015697	CTT	2	6	163036	163041	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202524
3026	NC_015697	TCT	3	9	163062	163070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202524
3027	NC_015697	CAA	2	6	163285	163290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202524
3028	NC_015697	GGCC	2	8	163297	163304	0 %	0 %	50 %	50 %	338202524
3029	NC_015697	AAG	2	6	163335	163340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202524
3030	NC_015697	CTT	2	6	163354	163359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202524
3031	NC_015697	CTG	2	6	163363	163368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202524
3032	NC_015697	CG	3	6	163373	163378	0 %	0 %	50 %	50 %	338202524
3033	NC_015697	T	7	7	163394	163400	0 %	100 %	0 %	0 %	338202524
3034	NC_015697	TTC	2	6	163421	163426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202524
3035	NC_015697	CAA	2	6	163453	163458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202524
3036	NC_015697	ATT	2	6	163472	163477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202524
3037	NC_015697	T	6	6	163476	163481	0 %	100 %	0 %	0 %	338202524
3038	NC_015697	GCA	2	6	163755	163760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202525
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3040	NC_015697	CAT	2	6	163875	163880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202525
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3042	NC_015697	CAT	2	6	164019	164024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202525
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3044	NC_015697	TTC	2	6	164134	164139	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202525
3045	NC_015697	TCAA	2	8	164249	164256	50 %	25 %	0 %	25 %	338202525
3046	NC_015697	TGC	2	6	164314	164319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202525
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3048	NC_015697	TCA	2	6	164522	164527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202525
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3052	NC_015697	GCT	2	6	164753	164758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202525
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3056	NC_015697	TTGC	2	8	165000	165007	0 %	50 %	25 %	25 %	338202525
3057	NC_015697	GCT	2	6	165041	165046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202525
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3059	NC_015697	GGA	2	6	165207	165212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338202525
3060	NC_015697	ATC	2	6	165265	165270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202525
3061	NC_015697	AAG	2	6	165283	165288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202525
3062	NC_015697	A	7	7	165385	165391	100 %	0 %	0 %	0 %	338202525
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3064	NC_015697	TACC	2	8	165411	165418	25 %	25 %	0 %	50 %	338202525
3065	NC_015697	ACT	3	9	165479	165487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202525
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3103	NC_015697	ATC	2	6	167027	167032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202526
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3106	NC_015697	CAG	2	6	167161	167166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202526
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3108	NC_015697	GAA	2	6	167340	167345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202526
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3111	NC_015697	CGG	2	6	167428	167433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	338202526
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3113	NC_015697	TCT	2	6	167515	167520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202527
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3119	NC_015697	ACG	2	6	167718	167723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202527
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3121	NC_015697	AGC	2	6	167793	167798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202527
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3240	NC_015697	TGA	2	6	174165	174170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202534
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3479	NC_015697	TTTAAA	2	12	184323	184334	50 %	50 %	0 %	0 %	338202544
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3485	NC_015697	TCA	2	6	184848	184853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202545
3486	NC_015697	ACC	2	6	184874	184879	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202545
3487	NC_015697	ATT	2	6	184883	184888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202545
3488	NC_015697	GTTT	2	8	184902	184909	0 %	75 %	25 %	0 %	338202545
3489	NC_015697	TCA	2	6	184923	184928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202545
3490	NC_015697	T	6	6	184957	184962	0 %	100 %	0 %	0 %	338202545
3491	NC_015697	CTT	2	6	185008	185013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202545
3492	NC_015697	CTT	2	6	185029	185034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202545
3493	NC_015697	TGT	2	6	185073	185078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202545
3494	NC_015697	TTC	2	6	185093	185098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202545
3495	NC_015697	T	6	6	185140	185145	0 %	100 %	0 %	0 %	338202546
3496	NC_015697	TCA	2	6	185167	185172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202546
3497	NC_015697	AAC	2	6	185220	185225	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202546
3498	NC_015697	TCA	2	6	185230	185235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202546
3499	NC_015697	TAA	2	6	185297	185302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202546
3500	NC_015697	GTT	2	6	185305	185310	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202546

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