MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 42283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_015697	GTTTG	2	10	238235	238244	0 %	60 %	40 %	0 %	338202606
4502	NC_015697	TGC	2	6	238269	238274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202606
4503	NC_015697	T	6	6	238291	238296	0 %	100 %	0 %	0 %	338202606
4504	NC_015697	AGT	2	6	238377	238382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202606
4505	NC_015697	TGG	2	6	238384	238389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202606
4506	NC_015697	AGC	2	6	238489	238494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202606
4507	NC_015697	T	6	6	238506	238511	0 %	100 %	0 %	0 %	338202606
4508	NC_015697	AGC	2	6	238608	238613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202606
4509	NC_015697	T	6	6	238628	238633	0 %	100 %	0 %	0 %	338202606
4510	NC_015697	TAT	2	6	238724	238729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202606
4511	NC_015697	TTC	2	6	238737	238742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202606
4512	NC_015697	CTC	2	6	238762	238767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202607
4513	NC_015697	ACTT	2	8	238773	238780	25 %	50 %	0 %	25 %	338202607
4514	NC_015697	TTGA	2	8	238802	238809	25 %	50 %	25 %	0 %	338202607
4515	NC_015697	TTC	2	6	238898	238903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202607
4516	NC_015697	AAATGG	2	12	238928	238939	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	338202607
4517	NC_015697	AAT	2	6	239002	239007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202607
4518	NC_015697	TAA	2	6	239012	239017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202607
4519	NC_015697	CTC	2	6	239073	239078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202607
4520	NC_015697	A	6	6	239207	239212	100 %	0 %	0 %	0 %	338202607
4521	NC_015697	CTA	2	6	239364	239369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202607
4522	NC_015697	TGA	2	6	239425	239430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202608
4523	NC_015697	TAAA	2	8	239463	239470	75 %	25 %	0 %	0 %	338202608
4524	NC_015697	T	6	6	239511	239516	0 %	100 %	0 %	0 %	338202608
4525	NC_015697	AATT	2	8	239521	239528	50 %	50 %	0 %	0 %	338202608
4526	NC_015697	TCA	2	6	239537	239542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202608
4527	NC_015697	TTAA	2	8	239576	239583	50 %	50 %	0 %	0 %	338202608
4528	NC_015697	GC	3	6	239752	239757	0 %	0 %	50 %	50 %	338202609
4529	NC_015697	GCA	2	6	239791	239796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202609
4530	NC_015697	ATCC	2	8	239821	239828	25 %	25 %	0 %	50 %	338202609
4531	NC_015697	TGG	2	6	239886	239891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202609
4532	NC_015697	ATT	2	6	239994	239999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202609
4533	NC_015697	CGC	2	6	240056	240061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202609
4534	NC_015697	AAT	2	6	240067	240072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202609
4535	NC_015697	CAT	2	6	240080	240085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202609
4536	NC_015697	CAT	2	6	240209	240214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202609
4537	NC_015697	AGT	2	6	240240	240245	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202609
4538	NC_015697	AGT	2	6	240261	240266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202609
4539	NC_015697	CGTT	2	8	240285	240292	0 %	50 %	25 %	25 %	338202609
4540	NC_015697	TTA	2	6	240308	240313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202609
4541	NC_015697	ACA	2	6	240343	240348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202609
4542	NC_015697	CAAG	2	8	240386	240393	50 %	0 %	25 %	25 %	338202609
4543	NC_015697	CAGT	2	8	240478	240485	25 %	25 %	25 %	25 %	338202609
4544	NC_015697	GCC	2	6	240494	240499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202609
4545	NC_015697	CAA	2	6	240513	240518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202609
4546	NC_015697	TAA	2	6	240537	240542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202609
4547	NC_015697	CAA	2	6	240557	240562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202609
4548	NC_015697	CAA	2	6	240608	240613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202609
4549	NC_015697	TCA	2	6	240667	240672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202609
4550	NC_015697	AAC	2	6	240719	240724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202609
4551	NC_015697	ATA	2	6	240811	240816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202609
4552	NC_015697	TTC	2	6	240840	240845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202609
4553	NC_015697	TGT	2	6	240850	240855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202609
4554	NC_015697	TCC	2	6	240875	240880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202610
4555	NC_015697	T	6	6	240901	240906	0 %	100 %	0 %	0 %	338202610
4556	NC_015697	AAG	2	6	240935	240940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202610
4557	NC_015697	GCA	2	6	241019	241024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202610
4558	NC_015697	ACCA	2	8	241045	241052	50 %	0 %	0 %	50 %	338202610
4559	NC_015697	T	6	6	241081	241086	0 %	100 %	0 %	0 %	338202610
4560	NC_015697	TAT	2	6	241182	241187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202610
4561	NC_015697	ATCC	2	8	241228	241235	25 %	25 %	0 %	50 %	338202610
4562	NC_015697	TAT	2	6	241284	241289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202610
4563	NC_015697	AT	3	6	241348	241353	50 %	50 %	0 %	0 %	338202610
4564	NC_015697	CCAT	2	8	241362	241369	25 %	25 %	0 %	50 %	338202610
4565	NC_015697	TGCATC	2	12	241588	241599	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	338202611
4566	NC_015697	GCA	2	6	241697	241702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202611
4567	NC_015697	TTG	2	6	241742	241747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202611
4568	NC_015697	TAA	2	6	241956	241961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202612
4569	NC_015697	CTT	2	6	241962	241967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202612
4570	NC_015697	CAT	2	6	241992	241997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202612
4571	NC_015697	GAC	2	6	242015	242020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202612
4572	NC_015697	CTT	2	6	242025	242030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202612
4573	NC_015697	CCA	2	6	242080	242085	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202612
4574	NC_015697	GCA	3	9	242110	242118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202612
4575	NC_015697	AATT	2	8	242162	242169	50 %	50 %	0 %	0 %	338202613
4576	NC_015697	CAG	2	6	242181	242186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202613
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4578	NC_015697	TTC	2	6	242260	242265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202613
4579	NC_015697	TTAAC	2	10	242379	242388	40 %	40 %	0 %	20 %	338202613
4580	NC_015697	CTT	2	6	242452	242457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202613
4581	NC_015697	CTTT	2	8	242472	242479	0 %	75 %	0 %	25 %	338202613
4582	NC_015697	CTT	2	6	242568	242573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202613
4583	NC_015697	TTCC	2	8	242925	242932	0 %	50 %	0 %	50 %	338202614
4584	NC_015697	GGT	2	6	243021	243026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202614
4585	NC_015697	AAAG	2	8	243061	243068	75 %	0 %	25 %	0 %	338202614
4586	NC_015697	TTC	2	6	243076	243081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202614
4587	NC_015697	ATC	2	6	243115	243120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202614
4588	NC_015697	TGT	2	6	243130	243135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202614
4589	NC_015697	CAT	2	6	243153	243158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202614
4590	NC_015697	TAT	2	6	243207	243212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202614
4591	NC_015697	GTT	2	6	243266	243271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202614
4592	NC_015697	AGG	2	6	243314	243319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	338202614
4593	NC_015697	GCT	2	6	243404	243409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202614
4594	NC_015697	ATA	2	6	243454	243459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202614
4595	NC_015697	ATC	2	6	243460	243465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202614
4596	NC_015697	TAA	2	6	243544	243549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202614
4597	NC_015697	AATT	2	8	243643	243650	50 %	50 %	0 %	0 %	338202614
4598	NC_015697	A	6	6	243661	243666	100 %	0 %	0 %	0 %	338202614
4599	NC_015697	CTT	2	6	243699	243704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202614
4600	NC_015697	TTG	2	6	243775	243780	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202614
4601	NC_015697	TGC	2	6	243843	243848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202614
4602	NC_015697	GCT	2	6	243860	243865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202615
4603	NC_015697	CTT	3	9	243867	243875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202615
4604	NC_015697	TCA	2	6	243929	243934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202615
4605	NC_015697	ACTC	2	8	243935	243942	25 %	25 %	0 %	50 %	338202615
4606	NC_015697	TCTT	2	8	243946	243953	0 %	75 %	0 %	25 %	338202615
4607	NC_015697	TTTTC	2	10	244022	244031	0 %	80 %	0 %	20 %	338202615
4608	NC_015697	ATTA	2	8	244080	244087	50 %	50 %	0 %	0 %	338202615
4609	NC_015697	CTA	2	6	244214	244219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202615
4610	NC_015697	GAA	2	6	244283	244288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202615
4611	NC_015697	CTATTT	2	12	244351	244362	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	338202615
4612	NC_015697	CTT	2	6	244373	244378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202615
4613	NC_015697	GAA	2	6	244399	244404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202615
4614	NC_015697	CAA	2	6	244427	244432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202615
4615	NC_015697	T	6	6	244443	244448	0 %	100 %	0 %	0 %	338202615
4616	NC_015697	TAA	2	6	244536	244541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202615
4617	NC_015697	ATT	2	6	244554	244559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202615
4618	NC_015697	TTC	2	6	244734	244739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202615
4619	NC_015697	A	6	6	244740	244745	100 %	0 %	0 %	0 %	338202615
4620	NC_015697	TTAG	2	8	244759	244766	25 %	50 %	25 %	0 %	338202615
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4622	NC_015697	TCT	2	6	244828	244833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202615
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