MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus kefiranofaciens ZW3 chromosome

Total Repeats: 35499

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015602	CTA	2	6	172193	172198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053680
3002	NC_015602	AAG	2	6	172213	172218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053680
3003	NC_015602	AGT	2	6	172224	172229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053680
3004	NC_015602	TCA	2	6	172274	172279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053680
3005	NC_015602	AAG	2	6	172303	172308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053680
3006	NC_015602	AAG	2	6	172312	172317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053680
3007	NC_015602	TACG	2	8	172336	172343	25 %	25 %	25 %	25 %	336053680
3008	NC_015602	AGCA	2	8	172369	172376	50 %	0 %	25 %	25 %	336053680
3009	NC_015602	GGCAA	2	10	172378	172387	40 %	0 %	40 %	20 %	336053680
3010	NC_015602	GTG	2	6	172421	172426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053680
3011	NC_015602	TGCAT	2	10	172584	172593	20 %	40 %	20 %	20 %	336053680
3012	NC_015602	TAG	2	6	172611	172616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053680
3013	NC_015602	ATT	2	6	172684	172689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053680
3014	NC_015602	AGAA	2	8	172741	172748	75 %	0 %	25 %	0 %	336053680
3015	NC_015602	AAG	2	6	172750	172755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053680
3016	NC_015602	TGC	2	6	172915	172920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053681
3017	NC_015602	ATT	2	6	172930	172935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053681
3018	NC_015602	ACAAT	2	10	173017	173026	60 %	20 %	0 %	20 %	336053681
3019	NC_015602	TGT	2	6	173054	173059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053681
3020	NC_015602	TGA	2	6	173060	173065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053681
3021	NC_015602	AT	4	8	173066	173073	50 %	50 %	0 %	0 %	336053681
3022	NC_015602	GA	3	6	173082	173087	50 %	0 %	50 %	0 %	336053681
3023	NC_015602	TCT	2	6	173285	173290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336053682
3024	NC_015602	CTT	2	6	173301	173306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336053682
3025	NC_015602	TTG	2	6	173347	173352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053682
3026	NC_015602	TCT	2	6	173354	173359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336053682
3027	NC_015602	TTG	2	6	173422	173427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053682
3028	NC_015602	TTGA	2	8	173434	173441	25 %	50 %	25 %	0 %	336053682
3029	NC_015602	AGC	2	6	173493	173498	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053682
3030	NC_015602	GCAACT	2	12	173536	173547	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	336053682
3031	NC_015602	AAC	2	6	173550	173555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053682
3032	NC_015602	GAA	2	6	173911	173916	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053683
3033	NC_015602	ATG	2	6	173934	173939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053683
3034	NC_015602	AT	3	6	173983	173988	50 %	50 %	0 %	0 %	336053683
3035	NC_015602	GTT	2	6	174014	174019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053683
3036	NC_015602	GTG	2	6	174063	174068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053683
3037	NC_015602	CAAGG	2	10	174197	174206	40 %	0 %	40 %	20 %	336053683
3038	NC_015602	GTT	2	6	174218	174223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053683
3039	NC_015602	ATT	2	6	174228	174233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053683
3040	NC_015602	TGA	2	6	174243	174248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053683
3041	NC_015602	ATA	2	6	174282	174287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053683
3042	NC_015602	AATC	2	8	174297	174304	50 %	25 %	0 %	25 %	336053683
3043	NC_015602	TGA	2	6	174310	174315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053683
3044	NC_015602	CGT	2	6	174353	174358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053683
3045	NC_015602	CAA	2	6	174407	174412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053683
3046	NC_015602	CGA	2	6	174433	174438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053683
3047	NC_015602	GTTTT	2	10	174522	174531	0 %	80 %	20 %	0 %	336053683
3048	NC_015602	GAA	2	6	174620	174625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053683
3049	NC_015602	GATGA	2	10	174644	174653	40 %	20 %	40 %	0 %	336053683
3050	NC_015602	AAG	2	6	174668	174673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053683
3051	NC_015602	CGC	2	6	174705	174710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336053683
3052	NC_015602	ATG	2	6	174735	174740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053683
3053	NC_015602	CAAGC	2	10	174769	174778	40 %	0 %	20 %	40 %	336053683
3054	NC_015602	GAC	2	6	174851	174856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053683
3055	NC_015602	ACT	2	6	174867	174872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053683
3056	NC_015602	TTGG	2	8	174894	174901	0 %	50 %	50 %	0 %	336053683
3057	NC_015602	GCA	2	6	174985	174990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053684
3058	NC_015602	AGA	2	6	175191	175196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053684
3059	NC_015602	TGA	2	6	175207	175212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053684
3060	NC_015602	CTG	2	6	175223	175228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053684
3061	NC_015602	AGC	2	6	175231	175236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053684
3062	NC_015602	TTA	2	6	175493	175498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053684
3063	NC_015602	CATTA	2	10	175509	175518	40 %	40 %	0 %	20 %	336053685
3064	NC_015602	ATT	2	6	175557	175562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053685
3065	NC_015602	TGG	2	6	175599	175604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053685
3066	NC_015602	CATG	2	8	175644	175651	25 %	25 %	25 %	25 %	336053685
3067	NC_015602	TGA	2	6	175656	175661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053685
3068	NC_015602	TGA	2	6	175671	175676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053685
3069	NC_015602	AAG	2	6	175744	175749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053685
3070	NC_015602	AGA	2	6	176173	176178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053686
3071	NC_015602	CGT	2	6	176210	176215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053686
3072	NC_015602	GAA	2	6	176228	176233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053686
3073	NC_015602	GCT	2	6	176250	176255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053686
3074	NC_015602	GTT	2	6	176277	176282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053686
3075	NC_015602	GCAG	2	8	176357	176364	25 %	0 %	50 %	25 %	336053686
3076	NC_015602	ATG	2	6	176383	176388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053686
3077	NC_015602	GCT	2	6	176433	176438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053686
3078	NC_015602	AAC	2	6	176448	176453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053686
3079	NC_015602	AAGC	2	8	176472	176479	50 %	0 %	25 %	25 %	336053686
3080	NC_015602	GAT	2	6	176493	176498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053686
3081	NC_015602	GAT	2	6	176508	176513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053686
3082	NC_015602	CTC	2	6	186584	186589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336053687
3083	NC_015602	CTC	2	6	186623	186628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	336053687
3084	NC_015602	TCAG	2	8	186675	186682	25 %	25 %	25 %	25 %	336053687
3085	NC_015602	GCT	2	6	186754	186759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053687
3086	NC_015602	AGG	2	6	186768	186773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	336053687
3087	NC_015602	TGC	2	6	186774	186779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053687
3088	NC_015602	AGC	2	6	186780	186785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053687
3089	NC_015602	GAA	2	6	186813	186818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053687
3090	NC_015602	AAG	2	6	186823	186828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053687
3091	NC_015602	GAA	2	6	187083	187088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053688
3092	NC_015602	A	6	6	187100	187105	100 %	0 %	0 %	0 %	336053688
3093	NC_015602	GCG	2	6	187162	187167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	336053688
3094	NC_015602	T	6	6	187188	187193	0 %	100 %	0 %	0 %	336053688
3095	NC_015602	CAA	2	6	187273	187278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053688
3096	NC_015602	CAA	2	6	187288	187293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053688
3097	NC_015602	CAAG	2	8	187307	187314	50 %	0 %	25 %	25 %	336053688
3098	NC_015602	AAT	2	6	187378	187383	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053688
3099	NC_015602	CAA	2	6	187384	187389	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053688
3100	NC_015602	GACAA	2	10	187453	187462	60 %	0 %	20 %	20 %	336053688
3101	NC_015602	GCTAAG	2	12	187489	187500	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	336053688
3102	NC_015602	TGA	2	6	187512	187517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053688
3103	NC_015602	ATA	2	6	187559	187564	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053688
3104	NC_015602	GAAC	2	8	187576	187583	50 %	0 %	25 %	25 %	336053688
3105	NC_015602	ACT	2	6	187687	187692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053688
3106	NC_015602	AT	3	6	187745	187750	50 %	50 %	0 %	0 %	336053688
3107	NC_015602	ATA	2	6	187817	187822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053688
3108	NC_015602	TAC	2	6	187845	187850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053688
3109	NC_015602	TTA	2	6	187919	187924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053688
3110	NC_015602	TTG	2	6	187967	187972	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053688
3111	NC_015602	ATA	2	6	188060	188065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053688
3112	NC_015602	TAC	2	6	188226	188231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053688
3113	NC_015602	ATA	2	6	188261	188266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053688
3114	NC_015602	TAA	2	6	188628	188633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053689
3115	NC_015602	TTG	2	6	188636	188641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053689
3116	NC_015602	ACT	2	6	188908	188913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053689
3117	NC_015602	TAC	2	6	188952	188957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053689
3118	NC_015602	TGA	2	6	188958	188963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053689
3119	NC_015602	TGA	2	6	189009	189014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053689
3120	NC_015602	ATT	2	6	189126	189131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053689
3121	NC_015602	ATA	2	6	189233	189238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053689
3122	NC_015602	TGT	2	6	189240	189245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053689
3123	NC_015602	GCAA	2	8	189248	189255	50 %	0 %	25 %	25 %	336053689
3124	NC_015602	GGT	2	6	189478	189483	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053689
3125	NC_015602	ACT	2	6	189514	189519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053689
3126	NC_015602	TAC	2	6	189558	189563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053689
3127	NC_015602	TGA	2	6	189564	189569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053689
3128	NC_015602	TAA	2	6	189576	189581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053689
3129	NC_015602	TGA	2	6	189615	189620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053689
3130	NC_015602	ATT	2	6	189732	189737	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053689
3131	NC_015602	ATCA	2	8	189782	189789	50 %	25 %	0 %	25 %	336053689
3132	NC_015602	CAAC	2	8	189841	189848	50 %	0 %	0 %	50 %	336053689
3133	NC_015602	TAA	2	6	189894	189899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053689
3134	NC_015602	TAA	2	6	189966	189971	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053689
3135	NC_015602	ACA	2	6	190019	190024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053689
3136	NC_015602	TGC	2	6	190119	190124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053689
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3138	NC_015602	TCT	2	6	190182	190187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336053689
3139	NC_015602	TTG	2	6	190208	190213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053689
3140	NC_015602	CAG	2	6	190227	190232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053689
3141	NC_015602	CAG	2	6	190301	190306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053689
3142	NC_015602	CTA	2	6	190343	190348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053689
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3144	NC_015602	CAG	2	6	190409	190414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053689
3145	NC_015602	ACTGC	2	10	190457	190466	20 %	20 %	20 %	40 %	336053689
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3149	NC_015602	GGT	2	6	190759	190764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053689
3150	NC_015602	AAG	2	6	190879	190884	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053689
3151	NC_015602	ATG	2	6	190886	190891	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053689
3152	NC_015602	CAA	2	6	191184	191189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053689
3153	NC_015602	AGCA	2	8	191206	191213	50 %	0 %	25 %	25 %	336053689
3154	NC_015602	ATC	2	6	191228	191233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053689
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3158	NC_015602	AGC	2	6	191382	191387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053689
3159	NC_015602	CAG	2	6	191423	191428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053689
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3161	NC_015602	AGC	2	6	191564	191569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053689
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3166	NC_015602	TCAG	2	8	192195	192202	25 %	25 %	25 %	25 %	336053689
3167	NC_015602	CGATAA	2	12	192234	192245	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	336053689
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3191	NC_015602	GAT	2	6	193725	193730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053690
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3193	NC_015602	TAA	2	6	193778	193783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	336053690
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3200	NC_015602	AGC	2	6	195525	195530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053691
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3202	NC_015602	AGAA	2	8	195635	195642	75 %	0 %	25 %	0 %	336053691
3203	NC_015602	AGC	2	6	195674	195679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	336053691
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3205	NC_015602	TTGACC	2	12	195728	195739	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	336053691
3206	NC_015602	GTC	2	6	195856	195861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053691
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3209	NC_015602	TGA	2	6	195914	195919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053691
3210	NC_015602	TAGCT	2	10	195963	195972	20 %	40 %	20 %	20 %	336053691
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3215	NC_015602	ATC	2	6	196262	196267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053692
3216	NC_015602	ATG	2	6	196296	196301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053692
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3220	NC_015602	TAT	2	6	196420	196425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053692
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3222	NC_015602	AATT	2	8	196685	196692	50 %	50 %	0 %	0 %	336053693
3223	NC_015602	ATG	2	6	196726	196731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053693
3224	NC_015602	TGA	2	6	196734	196739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053693
3225	NC_015602	CGC	2	6	196775	196780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	336053693
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3227	NC_015602	TGGTT	2	10	196854	196863	0 %	60 %	40 %	0 %	336053693
3228	NC_015602	TAT	2	6	196919	196924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053693
3229	NC_015602	CG	3	6	196934	196939	0 %	0 %	50 %	50 %	336053693
3230	NC_015602	GGT	2	6	197074	197079	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053693
3231	NC_015602	CTT	2	6	197085	197090	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	336053693
3232	NC_015602	ATTT	2	8	197093	197100	25 %	75 %	0 %	0 %	336053693
3233	NC_015602	ATG	2	6	197114	197119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053693
3234	NC_015602	GAA	2	6	197124	197129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053693
3235	NC_015602	GAT	2	6	197149	197154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053693
3236	NC_015602	GAT	2	6	197203	197208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053693
3237	NC_015602	ATG	2	6	197210	197215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053693
3238	NC_015602	TTG	2	6	197317	197322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053693
3239	NC_015602	TTA	2	6	197454	197459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053693
3240	NC_015602	GCT	2	6	197512	197517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053693
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3245	NC_015602	TGAAG	2	10	197736	197745	40 %	20 %	40 %	0 %	336053693
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3483	NC_015602	TTG	2	6	210763	210768	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	336053707
3484	NC_015602	TGC	2	6	210786	210791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053707
3485	NC_015602	GGT	2	6	210802	210807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053707
3486	NC_015602	TCA	2	6	210931	210936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053707
3487	NC_015602	GAA	2	6	210967	210972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053707
3488	NC_015602	ATT	2	6	210994	210999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	336053707
3489	NC_015602	TGC	2	6	211113	211118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	336053707
3490	NC_015602	GCTT	2	8	211131	211138	0 %	50 %	25 %	25 %	336053707
3491	NC_015602	GCTG	2	8	211171	211178	0 %	25 %	50 %	25 %	336053707
3492	NC_015602	GGT	2	6	211249	211254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	336053707
3493	NC_015602	AAG	2	6	211279	211284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	336053707
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3495	NC_015602	GGTT	2	8	211468	211475	0 %	50 %	50 %	0 %	336053707
3496	NC_015602	TCA	2	6	211525	211530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	336053707
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3498	NC_015602	GAT	2	6	211708	211713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053708
3499	NC_015602	CAA	2	6	211714	211719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	336053708
3500	NC_015602	TGA	2	6	211746	211751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	336053708

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