MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 chromosome

Total Repeats: 1371

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015428	AAGAA	2	10	1679	1688	80 %	0 %	20 %	0 %	331700396
2	NC_015428	TCTGC	2	10	2964	2973	0 %	40 %	20 %	40 %	331700397
3	NC_015428	AGTCG	2	10	4285	4294	20 %	20 %	40 %	20 %	331700399
4	NC_015428	TCTTT	2	10	8589	8598	0 %	80 %	0 %	20 %	331700401
5	NC_015428	GATTC	2	10	9066	9075	20 %	40 %	20 %	20 %	331700401
6	NC_015428	GGCCA	2	10	12900	12909	20 %	0 %	40 %	40 %	331700407
7	NC_015428	GAATT	2	10	15352	15361	40 %	40 %	20 %	0 %	331700408
8	NC_015428	TTCAT	2	10	16362	16371	20 %	60 %	0 %	20 %	331700409
9	NC_015428	GCAAC	2	10	17951	17960	40 %	0 %	20 %	40 %	331700409
10	NC_015428	TAAAC	2	10	20715	20724	60 %	20 %	0 %	20 %	331700412
11	NC_015428	CAAAG	2	10	22091	22100	60 %	0 %	20 %	20 %	331700413
12	NC_015428	TCGGT	2	10	23346	23355	0 %	40 %	40 %	20 %	331700414
13	NC_015428	GTTAT	2	10	23694	23703	20 %	60 %	20 %	0 %	331700414
14	NC_015428	GTGAT	2	10	27020	27029	20 %	40 %	40 %	0 %	331700419
15	NC_015428	TTTTA	2	10	27871	27880	20 %	80 %	0 %	0 %	331700421
16	NC_015428	GCATG	2	10	28302	28311	20 %	20 %	40 %	20 %	331700423
17	NC_015428	AGAAT	2	10	34615	34624	60 %	20 %	20 %	0 %	331700431
18	NC_015428	TGAAC	2	10	37129	37138	40 %	20 %	20 %	20 %	331700433
19	NC_015428	AAACA	2	10	38431	38440	80 %	0 %	0 %	20 %	331700434
20	NC_015428	TGAAT	2	10	39003	39012	40 %	40 %	20 %	0 %	331700434
21	NC_015428	ATTTA	2	10	44222	44231	40 %	60 %	0 %	0 %	331700440
22	NC_015428	CTTGG	2	10	44433	44442	0 %	40 %	40 %	20 %	331700440
23	NC_015428	ATTGA	2	10	44634	44643	40 %	40 %	20 %	0 %	331700440
24	NC_015428	CAGAT	2	10	48556	48565	40 %	20 %	20 %	20 %	331700443
25	NC_015428	TTACG	2	10	51504	51513	20 %	40 %	20 %	20 %	331700446
26	NC_015428	AAAAG	2	10	54287	54296	80 %	0 %	20 %	0 %	331700447
27	NC_015428	TGGGA	2	10	55475	55484	20 %	20 %	60 %	0 %	331700448
28	NC_015428	TAATG	2	10	55812	55821	40 %	40 %	20 %	0 %	331700448
29	NC_015428	ATTGA	2	10	56700	56709	40 %	40 %	20 %	0 %	331700451
30	NC_015428	GTTGC	2	10	56777	56786	0 %	40 %	40 %	20 %	331700451
31	NC_015428	TGTAA	2	10	58584	58593	40 %	40 %	20 %	0 %	331700453
32	NC_015428	ACTCG	2	10	59312	59321	20 %	20 %	20 %	40 %	331700454
33	NC_015428	ATCAA	2	10	60884	60893	60 %	20 %	0 %	20 %	331700457
34	NC_015428	CTGGA	2	10	61439	61448	20 %	20 %	40 %	20 %	331700457
35	NC_015428	ATTTC	2	10	62136	62145	20 %	60 %	0 %	20 %	331700457
36	NC_015428	AGAAA	2	10	62827	62836	80 %	0 %	20 %	0 %	331700458
37	NC_015428	CTGAC	2	10	64471	64480	20 %	20 %	20 %	40 %	331700460
38	NC_015428	TTTTG	2	10	67845	67854	0 %	80 %	20 %	0 %	331700462
39	NC_015428	GTTGA	2	10	68412	68421	20 %	40 %	40 %	0 %	331700462
40	NC_015428	GGCCG	2	10	70717	70726	0 %	0 %	60 %	40 %	331700465
41	NC_015428	CCTGA	2	10	72475	72484	20 %	20 %	20 %	40 %	331700467
42	NC_015428	GATTT	2	10	73043	73052	20 %	60 %	20 %	0 %	331700467
43	NC_015428	GCTGT	2	10	73380	73389	0 %	40 %	40 %	20 %	331700467
44	NC_015428	GGAAA	2	10	73952	73961	60 %	0 %	40 %	0 %	331700468
45	NC_015428	TAATT	2	10	77531	77540	40 %	60 %	0 %	0 %	331700470
46	NC_015428	TTAAA	2	10	78005	78014	60 %	40 %	0 %	0 %	331700471
47	NC_015428	GTGAT	2	10	78254	78263	20 %	40 %	40 %	0 %	331700471
48	NC_015428	TGAAG	2	10	79243	79252	40 %	20 %	40 %	0 %	331700472
49	NC_015428	ACCAA	2	10	79298	79307	60 %	0 %	0 %	40 %	331700472
50	NC_015428	ACATA	2	10	80358	80367	60 %	20 %	0 %	20 %	331700472
51	NC_015428	TCGGA	2	10	83964	83973	20 %	20 %	40 %	20 %	331700476
52	NC_015428	GCCGC	2	10	88186	88195	0 %	0 %	40 %	60 %	331700479
53	NC_015428	TCGGC	2	10	90846	90855	0 %	20 %	40 %	40 %	331700481
54	NC_015428	CGAAT	2	10	93242	93251	40 %	20 %	20 %	20 %	331700483
55	NC_015428	CAACC	2	10	93561	93570	40 %	0 %	0 %	60 %	331700484
56	NC_015428	GATTG	2	10	93609	93618	20 %	40 %	40 %	0 %	331700484
57	NC_015428	TTCGG	2	10	94162	94171	0 %	40 %	40 %	20 %	331700484
58	NC_015428	TTCTG	2	10	95256	95265	0 %	60 %	20 %	20 %	331700486
59	NC_015428	GCTGG	2	10	96598	96607	0 %	20 %	60 %	20 %	331700487
60	NC_015428	GGCCA	2	10	98580	98589	20 %	0 %	40 %	40 %	331700489
61	NC_015428	GCCTG	2	10	99711	99720	0 %	20 %	40 %	40 %	331700490
62	NC_015428	TTGAT	2	10	101867	101876	20 %	60 %	20 %	0 %	331700493
63	NC_015428	TTTGG	2	10	102406	102415	0 %	60 %	40 %	0 %	331700494
64	NC_015428	TCCGC	2	10	103087	103096	0 %	20 %	20 %	60 %	331700494
65	NC_015428	CGGAT	2	10	106516	106525	20 %	20 %	40 %	20 %	331700496
66	NC_015428	ACATT	2	10	108229	108238	40 %	40 %	0 %	20 %	331700498
67	NC_015428	CGGAA	2	10	108356	108365	40 %	0 %	40 %	20 %	331700498
68	NC_015428	CTAGA	2	10	108423	108432	40 %	20 %	20 %	20 %	331700498
69	NC_015428	TTGGT	2	10	110513	110522	0 %	60 %	40 %	0 %	331700500
70	NC_015428	TTGGC	2	10	110903	110912	0 %	40 %	40 %	20 %	331700500
71	NC_015428	TCATT	2	10	112839	112848	20 %	60 %	0 %	20 %	331700502
72	NC_015428	CGAAG	2	10	113192	113201	40 %	0 %	40 %	20 %	331700502
73	NC_015428	GTTCA	2	10	114586	114595	20 %	40 %	20 %	20 %	331700503
74	NC_015428	GTTGG	2	10	119762	119771	0 %	40 %	60 %	0 %	331700506
75	NC_015428	TGGAG	2	10	119929	119938	20 %	20 %	60 %	0 %	331700506
76	NC_015428	GAATG	2	10	124258	124267	40 %	20 %	40 %	0 %	331700510
77	NC_015428	TGATT	2	10	124509	124518	20 %	60 %	20 %	0 %	331700510
78	NC_015428	AAATT	2	10	126933	126942	60 %	40 %	0 %	0 %	331700513
79	NC_015428	AATTA	2	10	126973	126982	60 %	40 %	0 %	0 %	331700513
80	NC_015428	CGTGT	2	10	126997	127006	0 %	40 %	40 %	20 %	331700513
81	NC_015428	GAATC	2	10	127473	127482	40 %	20 %	20 %	20 %	331700514
82	NC_015428	ATTTG	2	10	127861	127870	20 %	60 %	20 %	0 %	331700514
83	NC_015428	GTTTG	2	10	132358	132367	0 %	60 %	40 %	0 %	331700519
84	NC_015428	TTAAC	2	10	132429	132438	40 %	40 %	0 %	20 %	331700519
85	NC_015428	GTGAC	2	10	135488	135497	20 %	20 %	40 %	20 %	331700522
86	NC_015428	CTTGG	2	10	137668	137677	0 %	40 %	40 %	20 %	331700524
87	NC_015428	TTCCA	2	10	138117	138126	20 %	40 %	0 %	40 %	331700524
88	NC_015428	GAGGC	2	10	141414	141423	20 %	0 %	60 %	20 %	331700526
89	NC_015428	TTGCC	2	10	142597	142606	0 %	40 %	20 %	40 %	331700527
90	NC_015428	TTTTG	2	10	144330	144339	0 %	80 %	20 %	0 %	331700529
91	NC_015428	CTTTG	2	10	146369	146378	0 %	60 %	20 %	20 %	331700530
92	NC_015428	ATATG	2	10	146684	146693	40 %	40 %	20 %	0 %	331700530
93	NC_015428	CCAAC	2	10	146753	146762	40 %	0 %	0 %	60 %	331700530
94	NC_015428	AGCGT	2	10	147935	147944	20 %	20 %	40 %	20 %	331700531
95	NC_015428	GGATT	2	10	149216	149225	20 %	40 %	40 %	0 %	331700533
96	NC_015428	CCTTG	2	10	149284	149293	0 %	40 %	20 %	40 %	331700533
97	NC_015428	CTTGG	2	10	149677	149686	0 %	40 %	40 %	20 %	331700533
98	NC_015428	TTTTG	2	10	150170	150179	0 %	80 %	20 %	0 %	331700534
99	NC_015428	AAATT	2	10	150813	150822	60 %	40 %	0 %	0 %	331700535
100	NC_015428	CACCT	2	10	152750	152759	20 %	20 %	0 %	60 %	331700536
101	NC_015428	CGATT	2	10	155549	155558	20 %	40 %	20 %	20 %	331700539
102	NC_015428	CGATG	2	10	158184	158193	20 %	20 %	40 %	20 %	331700541
103	NC_015428	TGGGT	2	10	160725	160734	0 %	40 %	60 %	0 %	331700544
104	NC_015428	CCAGA	2	10	160921	160930	40 %	0 %	20 %	40 %	331700544
105	NC_015428	GCTTG	2	10	161017	161026	0 %	40 %	40 %	20 %	331700544
106	NC_015428	AGAAA	2	10	162637	162646	80 %	0 %	20 %	0 %	331700546
107	NC_015428	GATAT	2	10	162699	162708	40 %	40 %	20 %	0 %	331700546
108	NC_015428	AAGAA	2	10	163251	163260	80 %	0 %	20 %	0 %	331700546
109	NC_015428	CTTTG	2	10	166427	166436	0 %	60 %	20 %	20 %	331700549
110	NC_015428	GTCGA	2	10	168238	168247	20 %	20 %	40 %	20 %	331700550
111	NC_015428	CATCA	2	10	169852	169861	40 %	20 %	0 %	40 %	331700552
112	NC_015428	ATTAC	2	10	169992	170001	40 %	40 %	0 %	20 %	331700552
113	NC_015428	CAATT	2	10	180191	180200	40 %	40 %	0 %	20 %	331700560
114	NC_015428	ACTGA	2	10	182162	182171	40 %	20 %	20 %	20 %	331700561
115	NC_015428	TGCGC	2	10	185315	185324	0 %	20 %	40 %	40 %	331700562
116	NC_015428	ACGCA	2	10	185389	185398	40 %	0 %	20 %	40 %	331700562
117	NC_015428	ACACC	2	10	187218	187227	40 %	0 %	0 %	60 %	331700564
118	NC_015428	ATGGG	2	10	190886	190895	20 %	20 %	60 %	0 %	331700568
119	NC_015428	TTGAA	2	10	192088	192097	40 %	40 %	20 %	0 %	331700569
120	NC_015428	ACCAA	2	10	196190	196199	60 %	0 %	0 %	40 %	331700571
121	NC_015428	AAATG	2	10	207818	207827	60 %	20 %	20 %	0 %	331700583
122	NC_015428	TACTG	2	10	212475	212484	20 %	40 %	20 %	20 %	331700588
123	NC_015428	TAACT	2	10	212812	212821	40 %	40 %	0 %	20 %	331700588
124	NC_015428	CAAGA	2	10	213980	213989	60 %	0 %	20 %	20 %	331700589
125	NC_015428	TTCCA	2	10	214053	214062	20 %	40 %	0 %	40 %	331700589
126	NC_015428	CCATC	2	10	216311	216320	20 %	20 %	0 %	60 %	331700590
127	NC_015428	ATTTG	2	10	220037	220046	20 %	60 %	20 %	0 %	331700592
128	NC_015428	AGCAA	2	10	224737	224746	60 %	0 %	20 %	20 %	331700595
129	NC_015428	GATGC	2	10	230586	230595	20 %	20 %	40 %	20 %	331700599
130	NC_015428	TCGAC	2	10	231512	231521	20 %	20 %	20 %	40 %	331700599
131	NC_015428	GGTTG	2	10	231922	231931	0 %	40 %	60 %	0 %	331700600
132	NC_015428	ATTTG	2	10	232795	232804	20 %	60 %	20 %	0 %	331700600
133	NC_015428	TCCGG	2	10	234038	234047	0 %	20 %	40 %	40 %	331700601
134	NC_015428	ATTTA	2	10	235132	235141	40 %	60 %	0 %	0 %	331700602
135	NC_015428	TTGGT	2	10	235477	235486	0 %	60 %	40 %	0 %	331700603
136	NC_015428	GATAC	2	10	235900	235909	40 %	20 %	20 %	20 %	331700604
137	NC_015428	TCGAT	2	10	239356	239365	20 %	40 %	20 %	20 %	331700607
138	NC_015428	AGCAA	2	10	240178	240187	60 %	0 %	20 %	20 %	331700607
139	NC_015428	TTACC	2	10	243618	243627	20 %	40 %	0 %	40 %	331700610
140	NC_015428	AACCA	2	10	245035	245044	60 %	0 %	0 %	40 %	331700611
141	NC_015428	GAAAT	2	10	245909	245918	60 %	20 %	20 %	0 %	331700612
142	NC_015428	TCTAT	2	10	248909	248918	20 %	60 %	0 %	20 %	331700615
143	NC_015428	AAGTT	2	10	250012	250021	40 %	40 %	20 %	0 %	331700617
144	NC_015428	TGGTT	2	10	251453	251462	0 %	60 %	40 %	0 %	331700618
145	NC_015428	CGAAA	2	10	251794	251803	60 %	0 %	20 %	20 %	331700618
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147	NC_015428	CTCAT	2	10	253031	253040	20 %	40 %	0 %	40 %	331700619
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149	NC_015428	AAAGT	2	10	253894	253903	60 %	20 %	20 %	0 %	331700620
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153	NC_015428	TGACG	2	10	262688	262697	20 %	20 %	40 %	20 %	331700628
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156	NC_015428	CATTA	2	10	265655	265664	40 %	40 %	0 %	20 %	331700631
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160	NC_015428	GAATT	2	10	270547	270556	40 %	40 %	20 %	0 %	331700634
161	NC_015428	ATTGG	2	10	271041	271050	20 %	40 %	40 %	0 %	331700634
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166	NC_015428	ATTGG	2	10	281731	281740	20 %	40 %	40 %	0 %	331700647
167	NC_015428	TGAAT	2	10	284604	284613	40 %	40 %	20 %	0 %	331700652
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174	NC_015428	GAACA	2	10	304146	304155	60 %	0 %	20 %	20 %	331700669
175	NC_015428	GCGTA	2	10	304857	304866	20 %	20 %	40 %	20 %	331700669
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248	NC_015428	CCACG	2	10	457582	457591	20 %	0 %	20 %	60 %	331700799
249	NC_015428	TTAAA	2	10	460650	460659	60 %	40 %	0 %	0 %	331700802
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252	NC_015428	TTTTG	2	10	466997	467006	0 %	80 %	20 %	0 %	331700808
253	NC_015428	GAAAT	2	10	468361	468370	60 %	20 %	20 %	0 %	331700810
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255	NC_015428	TGAAA	2	10	476529	476538	60 %	20 %	20 %	0 %	331700818
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257	NC_015428	AATGG	2	10	479061	479070	40 %	20 %	40 %	0 %	331700820
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259	NC_015428	GTGGC	2	10	481900	481909	0 %	20 %	60 %	20 %	331700824
260	NC_015428	ATTGG	2	10	481914	481923	20 %	40 %	40 %	0 %	331700824
261	NC_015428	GTTTT	2	10	482724	482733	0 %	80 %	20 %	0 %	331700825
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