MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 chromosome

Total Repeats: 40610

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015428	CAG	2	6	29238	29243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700424
502	NC_015428	AG	3	6	29281	29286	50 %	0 %	50 %	0 %	331700424
503	NC_015428	GAT	2	6	29304	29309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700425
504	NC_015428	ATT	2	6	29313	29318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700425
505	NC_015428	A	6	6	29442	29447	100 %	0 %	0 %	0 %	331700425
506	NC_015428	TGA	2	6	29453	29458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700425
507	NC_015428	ATT	2	6	29519	29524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700425
508	NC_015428	ATG	2	6	29533	29538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700425
509	NC_015428	ATTT	2	8	29584	29591	25 %	75 %	0 %	0 %	331700425
510	NC_015428	GGGC	2	8	29625	29632	0 %	0 %	75 %	25 %	331700425
511	NC_015428	AAG	2	6	29683	29688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700425
512	NC_015428	ATGA	2	8	29698	29705	50 %	25 %	25 %	0 %	331700425
513	NC_015428	TGG	2	6	29897	29902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700426
514	NC_015428	CTT	2	6	30018	30023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331700426
515	NC_015428	CAA	2	6	30199	30204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700426
516	NC_015428	TA	3	6	30233	30238	50 %	50 %	0 %	0 %	331700426
517	NC_015428	TTG	2	6	30367	30372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700426
518	NC_015428	AAGT	2	8	30457	30464	50 %	25 %	25 %	0 %	331700426
519	NC_015428	ATC	2	6	30527	30532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700427
520	NC_015428	ATG	2	6	30556	30561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700427
521	NC_015428	ATC	2	6	30584	30589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700427
522	NC_015428	GAA	2	6	30606	30611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700427
523	NC_015428	AAC	2	6	30630	30635	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700427
524	NC_015428	TTAC	2	8	30714	30721	25 %	50 %	0 %	25 %	331700427
525	NC_015428	ATG	2	6	30775	30780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700427
526	NC_015428	GAA	2	6	30808	30813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700427
527	NC_015428	TTAT	2	8	30815	30822	25 %	75 %	0 %	0 %	331700427
528	NC_015428	TAC	2	6	30945	30950	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700427
529	NC_015428	CAA	2	6	30959	30964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700427
530	NC_015428	AAT	2	6	30973	30978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700427
531	NC_015428	CCA	2	6	30985	30990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331700427
532	NC_015428	TA	3	6	31124	31129	50 %	50 %	0 %	0 %	331700427
533	NC_015428	TGA	2	6	31224	31229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700427
534	NC_015428	TTGG	2	8	31249	31256	0 %	50 %	50 %	0 %	331700427
535	NC_015428	GAT	2	6	31276	31281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700427
536	NC_015428	CAG	2	6	31308	31313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700427
537	NC_015428	ACA	2	6	31378	31383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700427
538	NC_015428	GCG	2	6	31452	31457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700427
539	NC_015428	TAA	2	6	31476	31481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700427
540	NC_015428	TAC	2	6	31705	31710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700427
541	NC_015428	TAC	2	6	31720	31725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700427
542	NC_015428	AAAG	2	8	31815	31822	75 %	0 %	25 %	0 %	331700427
543	NC_015428	CAA	2	6	31846	31851	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700427
544	NC_015428	A	6	6	31933	31938	100 %	0 %	0 %	0 %	331700427
545	NC_015428	A	6	6	31941	31946	100 %	0 %	0 %	0 %	331700427
546	NC_015428	ATC	2	6	32223	32228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700428
547	NC_015428	TGA	2	6	32394	32399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700429
548	NC_015428	AAAC	2	8	32414	32421	75 %	0 %	0 %	25 %	331700429
549	NC_015428	ATG	2	6	32453	32458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700429
550	NC_015428	TTA	2	6	32482	32487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700429
551	NC_015428	GAC	2	6	32494	32499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700429
552	NC_015428	ATA	2	6	32502	32507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700429
553	NC_015428	A	6	6	32541	32546	100 %	0 %	0 %	0 %	331700429
554	NC_015428	AACCGA	2	12	32828	32839	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	331700430
555	NC_015428	GTT	2	6	32855	32860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	331700430
556	NC_015428	A	6	6	32862	32867	100 %	0 %	0 %	0 %	331700430
557	NC_015428	ATA	2	6	32875	32880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700430
558	NC_015428	ATG	2	6	32935	32940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700430
559	NC_015428	CGTT	2	8	32955	32962	0 %	50 %	25 %	25 %	331700430
560	NC_015428	CAT	2	6	32972	32977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700430
561	NC_015428	CTA	2	6	33005	33010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700430
562	NC_015428	GAC	2	6	33114	33119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700430
563	NC_015428	TTAAAA	2	12	33214	33225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700430
564	NC_015428	TGA	2	6	33530	33535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700431
565	NC_015428	TGG	2	6	33591	33596	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700431
566	NC_015428	A	6	6	33625	33630	100 %	0 %	0 %	0 %	331700431
567	NC_015428	GCTG	2	8	33672	33679	0 %	25 %	50 %	25 %	331700431
568	NC_015428	AGCG	2	8	33715	33722	25 %	0 %	50 %	25 %	331700431
569	NC_015428	ATA	2	6	33834	33839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700431
570	NC_015428	TCG	2	6	33868	33873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700431
571	NC_015428	AAT	2	6	33981	33986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700431
572	NC_015428	T	7	7	33986	33992	0 %	100 %	0 %	0 %	331700431
573	NC_015428	CACC	2	8	34055	34062	25 %	0 %	0 %	75 %	331700431
574	NC_015428	GCC	2	6	34114	34119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	331700431
575	NC_015428	TAG	2	6	34222	34227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700431
576	NC_015428	GAT	2	6	34294	34299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700431
577	NC_015428	ATT	2	6	34440	34445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700431
578	NC_015428	GCT	2	6	34472	34477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700431
579	NC_015428	GTTT	2	8	34490	34497	0 %	75 %	25 %	0 %	331700431
580	NC_015428	CTT	2	6	34523	34528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	331700431
581	NC_015428	GGT	2	6	34554	34559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700431
582	NC_015428	CCA	3	9	34597	34605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	331700431
583	NC_015428	AGAAT	2	10	34615	34624	60 %	20 %	20 %	0 %	331700431
584	NC_015428	CGAA	2	8	35528	35535	50 %	0 %	25 %	25 %	331700432
585	NC_015428	CAA	2	6	35608	35613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	331700432
586	NC_015428	A	6	6	35728	35733	100 %	0 %	0 %	0 %	331700432
587	NC_015428	CTA	2	6	35794	35799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700432
588	NC_015428	AATC	2	8	35907	35914	50 %	25 %	0 %	25 %	331700432
589	NC_015428	ATG	2	6	35943	35948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700432
590	NC_015428	TTA	2	6	36024	36029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700432
591	NC_015428	ATCG	2	8	36036	36043	25 %	25 %	25 %	25 %	331700432
592	NC_015428	GAC	2	6	36083	36088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700432
593	NC_015428	ACTA	2	8	36107	36114	50 %	25 %	0 %	25 %	331700432
594	NC_015428	GTA	2	6	36253	36258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700432
595	NC_015428	ACG	3	9	36336	36344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700432
596	NC_015428	ACAA	2	8	37026	37033	75 %	0 %	0 %	25 %	331700433
597	NC_015428	AATA	2	8	37076	37083	75 %	25 %	0 %	0 %	331700433
598	NC_015428	TGAAC	2	10	37129	37138	40 %	20 %	20 %	20 %	331700433
599	NC_015428	AGC	2	6	37188	37193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700433
600	NC_015428	TAA	2	6	37297	37302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700433
601	NC_015428	A	6	6	37379	37384	100 %	0 %	0 %	0 %	331700434
602	NC_015428	CTG	2	6	37453	37458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700434
603	NC_015428	AGC	2	6	37556	37561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	331700434
604	NC_015428	A	6	6	37614	37619	100 %	0 %	0 %	0 %	331700434
605	NC_015428	ATG	2	6	37687	37692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700434
606	NC_015428	TA	3	6	37694	37699	50 %	50 %	0 %	0 %	331700434
607	NC_015428	TAA	2	6	37728	37733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700434
608	NC_015428	CGG	2	6	37735	37740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	331700434
609	NC_015428	TAA	2	6	37821	37826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700434
610	NC_015428	CTG	2	6	37898	37903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700434
611	NC_015428	AGA	2	6	37907	37912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700434
612	NC_015428	ATT	2	6	37927	37932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700434
613	NC_015428	AAG	2	6	37960	37965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700434
614	NC_015428	CTGA	2	8	38050	38057	25 %	25 %	25 %	25 %	331700434
615	NC_015428	TAA	2	6	38094	38099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700434
616	NC_015428	TAA	2	6	38211	38216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	331700434
617	NC_015428	AAGC	2	8	38284	38291	50 %	0 %	25 %	25 %	331700434
618	NC_015428	GAT	2	6	38314	38319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700434
619	NC_015428	GAA	2	6	38380	38385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700434
620	NC_015428	AGA	2	6	38415	38420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700434
621	NC_015428	AAACA	2	10	38431	38440	80 %	0 %	0 %	20 %	331700434
622	NC_015428	ATGCTA	2	12	38474	38485	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	331700434
623	NC_015428	AAG	2	6	38518	38523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700434
624	NC_015428	TGA	2	6	38571	38576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700434
625	NC_015428	ATT	2	6	38696	38701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	331700434
626	NC_015428	CTG	2	6	38711	38716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	331700434
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628	NC_015428	GTG	2	6	38858	38863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	331700434
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747	NC_015428	CAAA	2	8	48861	48868	75 %	0 %	0 %	25 %	331700443
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750	NC_015428	GAT	2	6	48939	48944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	331700444
751	NC_015428	TG	3	6	49018	49023	0 %	50 %	50 %	0 %	331700444
752	NC_015428	AAG	2	6	49041	49046	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	331700444
753	NC_015428	CAT	2	6	49241	49246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	331700444
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