MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Lactobacillus buchneri NRRL B-30929 plasmid pLBUC01

Total Repeats: 806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015420	TGG	2	6	36791	36796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818948
502	NC_015420	ACC	2	6	36975	36980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818948
503	NC_015420	TGT	2	6	37103	37108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818949
504	NC_015420	AAAC	2	8	37155	37162	75 %	0 %	0 %	25 %	330818949
505	NC_015420	AAT	2	6	37163	37168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818949
506	NC_015420	ATT	2	6	37175	37180	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818949
507	NC_015420	AT	3	6	37207	37212	50 %	50 %	0 %	0 %	330818949
508	NC_015420	AATA	2	8	37213	37220	75 %	25 %	0 %	0 %	330818949
509	NC_015420	TAAAAA	2	12	37257	37268	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	330818949
510	NC_015420	ATT	2	6	37280	37285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818949
511	NC_015420	ACAA	2	8	37286	37293	75 %	0 %	0 %	25 %	330818949
512	NC_015420	AT	3	6	37301	37306	50 %	50 %	0 %	0 %	330818949
513	NC_015420	AGC	2	6	37309	37314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818949
514	NC_015420	ATT	2	6	37339	37344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818949
515	NC_015420	AAAT	2	8	37365	37372	75 %	25 %	0 %	0 %	330818949
516	NC_015420	CCA	2	6	37378	37383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818949
517	NC_015420	TAA	2	6	37393	37398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818949
518	NC_015420	TAC	2	6	37401	37406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818949
519	NC_015420	AAT	2	6	37469	37474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818949
520	NC_015420	CAA	2	6	37491	37496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818949
521	NC_015420	AGC	2	6	37531	37536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818949
522	NC_015420	GCCT	2	8	37553	37560	0 %	25 %	25 %	50 %	330818949
523	NC_015420	AAC	2	6	37664	37669	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818949
524	NC_015420	GAA	2	6	37673	37678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818949
525	NC_015420	A	8	8	37717	37724	100 %	0 %	0 %	0 %	330818949
526	NC_015420	T	6	6	37725	37730	0 %	100 %	0 %	0 %	330818949
527	NC_015420	T	7	7	37738	37744	0 %	100 %	0 %	0 %	330818949
528	NC_015420	AGC	2	6	37780	37785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818949
529	NC_015420	TAT	2	6	37822	37827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818949
530	NC_015420	ATT	2	6	37880	37885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818949
531	NC_015420	TATTT	2	10	37918	37927	20 %	80 %	0 %	0 %	330818949
532	NC_015420	TTCA	2	8	37990	37997	25 %	50 %	0 %	25 %	330818949
533	NC_015420	T	6	6	38014	38019	0 %	100 %	0 %	0 %	330818949
534	NC_015420	AAATA	2	10	38078	38087	80 %	20 %	0 %	0 %	330818949
535	NC_015420	TGA	2	6	38093	38098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818949
536	NC_015420	TTA	2	6	38153	38158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818949
537	NC_015420	A	7	7	38212	38218	100 %	0 %	0 %	0 %	330818949
538	NC_015420	T	6	6	38284	38289	0 %	100 %	0 %	0 %	330818949
539	NC_015420	AAAG	2	8	38305	38312	75 %	0 %	25 %	0 %	330818949
540	NC_015420	TAC	2	6	38319	38324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818949
541	NC_015420	ATA	2	6	38328	38333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818949
542	NC_015420	TTA	2	6	38334	38339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818949
543	NC_015420	CT	3	6	38361	38366	0 %	50 %	0 %	50 %	330818949
544	NC_015420	AAC	2	6	38369	38374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818949
545	NC_015420	GTAAA	2	10	38547	38556	60 %	20 %	20 %	0 %	330818949
546	NC_015420	TAT	3	9	38563	38571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818949
547	NC_015420	TTA	2	6	38890	38895	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818950
548	NC_015420	T	6	6	39009	39014	0 %	100 %	0 %	0 %	330818950
549	NC_015420	CAA	2	6	39045	39050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818950
550	NC_015420	ATA	3	9	39297	39305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818950
551	NC_015420	ATT	2	6	39333	39338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818950
552	NC_015420	GAA	2	6	39375	39380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818950
553	NC_015420	TTGAT	2	10	39393	39402	20 %	60 %	20 %	0 %	330818950
554	NC_015420	GAT	2	6	39431	39436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818950
555	NC_015420	CAAC	2	8	39514	39521	50 %	0 %	0 %	50 %	330818950
556	NC_015420	ATC	2	6	39633	39638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818950
557	NC_015420	TCA	2	6	39710	39715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818950
558	NC_015420	CAA	2	6	39789	39794	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818951
559	NC_015420	TGC	2	6	39811	39816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818951
560	NC_015420	GC	3	6	39818	39823	0 %	0 %	50 %	50 %	330818951
561	NC_015420	CGTA	2	8	39867	39874	25 %	25 %	25 %	25 %	330818951
562	NC_015420	TGG	2	6	41028	41033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330818952
563	NC_015420	ACC	2	6	41212	41217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818952
564	NC_015420	GCATG	2	10	41250	41259	20 %	20 %	40 %	20 %	330818952
565	NC_015420	TCGC	2	8	41301	41308	0 %	25 %	25 %	50 %	330818952
566	NC_015420	CGT	2	6	41385	41390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818952
567	NC_015420	CAG	2	6	41403	41408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818952
568	NC_015420	ATA	2	6	41441	41446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818952
569	NC_015420	T	7	7	41496	41502	0 %	100 %	0 %	0 %	330818952
570	NC_015420	AGA	2	6	41648	41653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818952
571	NC_015420	AATT	2	8	41715	41722	50 %	50 %	0 %	0 %	330818952
572	NC_015420	TTG	2	6	41727	41732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818952
573	NC_015420	ATGA	2	8	42034	42041	50 %	25 %	25 %	0 %	330818953
574	NC_015420	CAC	2	6	42103	42108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818953
575	NC_015420	GCT	2	6	42129	42134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818953
576	NC_015420	TAA	2	6	42198	42203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818953
577	NC_015420	CGTT	2	8	42223	42230	0 %	50 %	25 %	25 %	330818953
578	NC_015420	AAC	2	6	42336	42341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818953
579	NC_015420	CTG	2	6	42374	42379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818953
580	NC_015420	ACT	2	6	42416	42421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818953
581	NC_015420	TCT	2	6	42512	42517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330818953
582	NC_015420	ACTT	2	8	42526	42533	25 %	50 %	0 %	25 %	330818953
583	NC_015420	AAG	2	6	42560	42565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818953
584	NC_015420	AAG	2	6	42605	42610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330818953
585	NC_015420	CTG	2	6	42661	42666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330818953
586	NC_015420	TGT	2	6	42701	42706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330818953
587	NC_015420	TGA	2	6	42803	42808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818953
588	NC_015420	GCC	2	6	42868	42873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330818953
589	NC_015420	AGC	2	6	42882	42887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818953
590	NC_015420	AACTGA	2	12	42890	42901	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	330818953
591	NC_015420	CAA	2	6	42912	42917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330818953
592	NC_015420	CCA	2	6	42991	42996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818953
593	NC_015420	TAA	2	6	43041	43046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818953
594	NC_015420	CAC	2	6	43059	43064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818953
595	NC_015420	CCA	2	6	43065	43070	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330818953
596	NC_015420	CAT	2	6	43196	43201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818953
597	NC_015420	CATTT	2	10	43237	43246	20 %	60 %	0 %	20 %	330818954
598	NC_015420	ATTAT	2	10	43312	43321	40 %	60 %	0 %	0 %	330818954
599	NC_015420	ATT	2	6	43336	43341	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818954
600	NC_015420	TAA	2	6	43343	43348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818954
601	NC_015420	ATT	2	6	43351	43356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818954
602	NC_015420	TCTT	2	8	43411	43418	0 %	75 %	0 %	25 %	330818954
603	NC_015420	ATC	2	6	43443	43448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818954
604	NC_015420	AT	3	6	43481	43486	50 %	50 %	0 %	0 %	330818954
605	NC_015420	CTT	2	6	43528	43533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330818954
606	NC_015420	TAA	2	6	43554	43559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818954
607	NC_015420	TA	3	6	43575	43580	50 %	50 %	0 %	0 %	330818954
608	NC_015420	ATT	2	6	43596	43601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818954
609	NC_015420	AT	3	6	43651	43656	50 %	50 %	0 %	0 %	330818954
610	NC_015420	T	6	6	43669	43674	0 %	100 %	0 %	0 %	330818954
611	NC_015420	AAT	2	6	43675	43680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818954
612	NC_015420	T	6	6	43686	43691	0 %	100 %	0 %	0 %	330818954
613	NC_015420	AT	3	6	43739	43744	50 %	50 %	0 %	0 %	330818954
614	NC_015420	ATA	2	6	43754	43759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818954
615	NC_015420	AAT	2	6	43789	43794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818954
616	NC_015420	T	6	6	43870	43875	0 %	100 %	0 %	0 %	330818954
617	NC_015420	GTCATC	2	12	44007	44018	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	330818954
618	NC_015420	ATT	2	6	44088	44093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330818954
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620	NC_015420	TCT	2	6	44120	44125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330818954
621	NC_015420	ATC	2	6	44151	44156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818954
622	NC_015420	CAT	2	6	44165	44170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818954
623	NC_015420	TAA	2	6	44174	44179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818954
624	NC_015420	T	6	6	44225	44230	0 %	100 %	0 %	0 %	330818954
625	NC_015420	AT	4	8	44467	44474	50 %	50 %	0 %	0 %	330818955
626	NC_015420	AGT	2	6	44501	44506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330818955
627	NC_015420	ATAA	2	8	44568	44575	75 %	25 %	0 %	0 %	330818955
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629	NC_015420	ATAA	2	8	44679	44686	75 %	25 %	0 %	0 %	330818955
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760	NC_015420	ACG	2	6	50633	50638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330818961
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763	NC_015420	TCA	2	6	50802	50807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330818962
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784	NC_015420	AAT	2	6	51592	51597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330818963
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