MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus acidophilus 30SC chromosome

Total Repeats: 37009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015214	AAG	2	6	200497	200502	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955909
3502	NC_015214	GGT	2	6	200578	200583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955909
3503	NC_015214	CAA	2	6	200595	200600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955909
3504	NC_015214	TGG	2	6	200673	200678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955909
3505	NC_015214	T	6	6	201037	201042	0 %	100 %	0 %	0 %	325955910
3506	NC_015214	TCT	2	6	201082	201087	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955910
3507	NC_015214	CGAAG	2	10	201122	201131	40 %	0 %	40 %	20 %	325955910
3508	NC_015214	CAT	2	6	201152	201157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955910
3509	NC_015214	CAA	2	6	201192	201197	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955910
3510	NC_015214	CGG	2	6	201212	201217	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955910
3511	NC_015214	ATTG	2	8	201275	201282	25 %	50 %	25 %	0 %	325955910
3512	NC_015214	CAACTG	2	12	201397	201408	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	325955910
3513	NC_015214	TAT	2	6	201416	201421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955910
3514	NC_015214	TAC	2	6	201454	201459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955910
3515	NC_015214	TAC	2	6	201465	201470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955910
3516	NC_015214	CGA	2	6	201535	201540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955910
3517	NC_015214	AGT	2	6	201609	201614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955910
3518	NC_015214	TTA	2	6	201661	201666	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955910
3519	NC_015214	TGA	2	6	201733	201738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955910
3520	NC_015214	TAAC	2	8	201808	201815	50 %	25 %	0 %	25 %	325955910
3521	NC_015214	CAA	2	6	201823	201828	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955910
3522	NC_015214	TAG	2	6	201862	201867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955910
3523	NC_015214	GATT	2	8	201898	201905	25 %	50 %	25 %	0 %	325955910
3524	NC_015214	AGA	2	6	201940	201945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955910
3525	NC_015214	GAA	2	6	201956	201961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955911
3526	NC_015214	CAT	2	6	202038	202043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955911
3527	NC_015214	AGC	2	6	202087	202092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955911
3528	NC_015214	ATT	2	6	202106	202111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955911
3529	NC_015214	TTG	2	6	202128	202133	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955911
3530	NC_015214	TCA	2	6	202152	202157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955911
3531	NC_015214	GCCA	2	8	202201	202208	25 %	0 %	25 %	50 %	325955911
3532	NC_015214	ATT	2	6	202358	202363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955911
3533	NC_015214	TTG	2	6	202386	202391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955911
3534	NC_015214	TAG	2	6	202395	202400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955911
3535	NC_015214	CTT	2	6	202405	202410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955911
3536	NC_015214	ATC	2	6	202496	202501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955911
3537	NC_015214	TCC	2	6	202502	202507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325955911
3538	NC_015214	GTT	2	6	202526	202531	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955911
3539	NC_015214	GTT	2	6	202541	202546	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955911
3540	NC_015214	ATT	2	6	202568	202573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955911
3541	NC_015214	GCCATT	2	12	202577	202588	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	325955911
3542	NC_015214	ACA	2	6	202598	202603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955911
3543	NC_015214	GAA	2	6	202639	202644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955911
3544	NC_015214	GAA	2	6	202646	202651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955911
3545	NC_015214	AGC	2	6	202660	202665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955911
3546	NC_015214	ATC	2	6	202681	202686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955911
3547	NC_015214	ATC	2	6	202730	202735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955911
3548	NC_015214	ATT	2	6	202736	202741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955911
3549	NC_015214	TCT	2	6	202770	202775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955911
3550	NC_015214	ATCGGT	2	12	202796	202807	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325955911
3551	NC_015214	TGA	2	6	202914	202919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955911
3552	NC_015214	CTTG	2	8	202930	202937	0 %	50 %	25 %	25 %	325955911
3553	NC_015214	AGA	2	6	203002	203007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955912
3554	NC_015214	TCAGGT	2	12	203129	203140	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325955912
3555	NC_015214	TAC	2	6	203149	203154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955912
3556	NC_015214	GTA	2	6	203157	203162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955912
3557	NC_015214	TGCT	2	8	203172	203179	0 %	50 %	25 %	25 %	325955912
3558	NC_015214	GGC	2	6	203198	203203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955912
3559	NC_015214	TTA	2	6	203228	203233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955912
3560	NC_015214	CAA	2	6	203333	203338	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955912
3561	NC_015214	GAAG	2	8	203377	203384	50 %	0 %	50 %	0 %	325955912
3562	NC_015214	ATG	2	6	203405	203410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955912
3563	NC_015214	AGA	2	6	203434	203439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955912
3564	NC_015214	GGT	2	6	203471	203476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955912
3565	NC_015214	TGA	2	6	203589	203594	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955912
3566	NC_015214	AG	3	6	203607	203612	50 %	0 %	50 %	0 %	325955912
3567	NC_015214	AC	3	6	203636	203641	50 %	0 %	0 %	50 %	325955912
3568	NC_015214	GTT	2	6	203651	203656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955912
3569	NC_015214	GGC	2	6	203711	203716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325955912
3570	NC_015214	AATC	2	8	203802	203809	50 %	25 %	0 %	25 %	325955912
3571	NC_015214	CTTG	2	8	203827	203834	0 %	50 %	25 %	25 %	325955912
3572	NC_015214	CCA	2	6	203903	203908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955912
3573	NC_015214	GCT	2	6	203947	203952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955912
3574	NC_015214	ACC	2	6	203977	203982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955912
3575	NC_015214	GAA	2	6	204004	204009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955912
3576	NC_015214	TGA	2	6	204018	204023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955912
3577	NC_015214	A	6	6	204023	204028	100 %	0 %	0 %	0 %	325955912
3578	NC_015214	A	7	7	204083	204089	100 %	0 %	0 %	0 %	325955913
3579	NC_015214	TGA	2	6	204156	204161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955913
3580	NC_015214	ATCTGG	2	12	204210	204221	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	325955913
3581	NC_015214	ACT	3	9	204226	204234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955913
3582	NC_015214	GTG	2	6	204269	204274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955913
3583	NC_015214	CCA	2	6	204429	204434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325955913
3584	NC_015214	AAGC	2	8	204459	204466	50 %	0 %	25 %	25 %	325955913
3585	NC_015214	AGA	2	6	204471	204476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955913
3586	NC_015214	GGT	2	6	204538	204543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325955913
3587	NC_015214	GTT	2	6	204646	204651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955913
3588	NC_015214	TGA	2	6	204656	204661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955913
3589	NC_015214	A	7	7	204671	204677	100 %	0 %	0 %	0 %	325955913
3590	NC_015214	GAC	2	6	204787	204792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955913
3591	NC_015214	AGA	2	6	204903	204908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955913
3592	NC_015214	TGA	2	6	204969	204974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955913
3593	NC_015214	GAA	2	6	204991	204996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955913
3594	NC_015214	AGC	2	6	204999	205004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325955913
3595	NC_015214	GCT	2	6	205474	205479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955914
3596	NC_015214	T	7	7	205479	205485	0 %	100 %	0 %	0 %	325955914
3597	NC_015214	ATA	2	6	205627	205632	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955914
3598	NC_015214	AGT	2	6	205656	205661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955914
3599	NC_015214	ATTG	2	8	205753	205760	25 %	50 %	25 %	0 %	325955914
3600	NC_015214	GTTTCT	2	12	205785	205796	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	325955914
3601	NC_015214	ACT	2	6	205810	205815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955914
3602	NC_015214	TCT	2	6	205872	205877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955914
3603	NC_015214	T	6	6	205924	205929	0 %	100 %	0 %	0 %	325955914
3604	NC_015214	CTT	2	6	205949	205954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955914
3605	NC_015214	T	6	6	205953	205958	0 %	100 %	0 %	0 %	325955914
3606	NC_015214	CTGC	2	8	205968	205975	0 %	25 %	25 %	50 %	325955914
3607	NC_015214	CTT	2	6	206004	206009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325955914
3608	NC_015214	TCA	2	6	206170	206175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955914
3609	NC_015214	T	6	6	206182	206187	0 %	100 %	0 %	0 %	325955914
3610	NC_015214	AAGC	2	8	206223	206230	50 %	0 %	25 %	25 %	325955914
3611	NC_015214	T	6	6	206388	206393	0 %	100 %	0 %	0 %	325955914
3612	NC_015214	GTT	2	6	206430	206435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955914
3613	NC_015214	AAT	2	6	206539	206544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955914
3614	NC_015214	ATT	2	6	206547	206552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325955914
3615	NC_015214	ACT	2	6	206557	206562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955914
3616	NC_015214	CAT	2	6	206705	206710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955914
3617	NC_015214	AGTTT	2	10	206711	206720	20 %	60 %	20 %	0 %	325955914
3618	NC_015214	AAT	2	6	206904	206909	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325955915
3619	NC_015214	AG	3	6	206911	206916	50 %	0 %	50 %	0 %	325955915
3620	NC_015214	ATC	2	6	206968	206973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955915
3621	NC_015214	AATCA	2	10	207066	207075	60 %	20 %	0 %	20 %	325955915
3622	NC_015214	A	6	6	207082	207087	100 %	0 %	0 %	0 %	325955915
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3847	NC_015214	A	6	6	219730	219735	100 %	0 %	0 %	0 %	325955927
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3862	NC_015214	GAA	2	6	220494	220499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955928
3863	NC_015214	T	7	7	220510	220516	0 %	100 %	0 %	0 %	325955928
3864	NC_015214	GTC	2	6	220539	220544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955928
3865	NC_015214	TAC	2	6	220557	220562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955928
3866	NC_015214	TGA	2	6	220624	220629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955928
3867	NC_015214	AAG	2	6	220636	220641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955928
3868	NC_015214	CAA	2	6	220670	220675	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955928
3869	NC_015214	CACT	2	8	220687	220694	25 %	25 %	0 %	50 %	325955928
3870	NC_015214	TCA	2	6	220746	220751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955928
3871	NC_015214	GTT	2	6	220785	220790	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325955928
3872	NC_015214	AGA	2	6	220869	220874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955928
3873	NC_015214	AAC	3	9	220884	220892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955928
3874	NC_015214	TAGC	2	8	221002	221009	25 %	25 %	25 %	25 %	325955928
3875	NC_015214	AGT	2	6	221151	221156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955929
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3878	NC_015214	TGA	3	9	221316	221324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955929
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3881	NC_015214	ATC	2	6	221557	221562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955930
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3883	NC_015214	GCAA	2	8	221600	221607	50 %	0 %	25 %	25 %	325955930
3884	NC_015214	TCA	2	6	221708	221713	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955930
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3888	NC_015214	TCG	2	6	222048	222053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955930
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3893	NC_015214	AAG	2	6	222221	222226	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955930
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3969	NC_015214	TCA	3	9	225249	225257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955933
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3973	NC_015214	AAG	2	6	225327	225332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955933
3974	NC_015214	AAG	2	6	225408	225413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955933
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3976	NC_015214	TAC	2	6	225489	225494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955933
3977	NC_015214	GCAA	2	8	225528	225535	50 %	0 %	25 %	25 %	325955933
3978	NC_015214	CAGC	2	8	225544	225551	25 %	0 %	25 %	50 %	325955933
3979	NC_015214	GAA	3	9	225569	225577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955933
3980	NC_015214	AGA	2	6	225613	225618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955933
3981	NC_015214	AAG	2	6	225624	225629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955933
3982	NC_015214	AAG	2	6	225633	225638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955933
3983	NC_015214	TAC	2	6	225678	225683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955933
3984	NC_015214	GCT	2	6	225711	225716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955933
3985	NC_015214	CAAG	2	8	225733	225740	50 %	0 %	25 %	25 %	325955933
3986	NC_015214	TCA	2	6	225789	225794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955933
3987	NC_015214	ACT	3	9	225825	225833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955933
3988	NC_015214	CAA	2	6	225903	225908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955933
3989	NC_015214	GCTT	2	8	226151	226158	0 %	50 %	25 %	25 %	325955933
3990	NC_015214	CTG	2	6	226204	226209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325955933
3991	NC_015214	ACA	2	6	226213	226218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955933
3992	NC_015214	AAG	2	6	226293	226298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325955933
3993	NC_015214	TAG	2	6	226357	226362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955933
3994	NC_015214	AAC	2	6	226371	226376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955933
3995	NC_015214	AAC	3	9	226404	226412	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955933
3996	NC_015214	ACT	2	6	226413	226418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955933
3997	NC_015214	TAAC	2	8	226429	226436	50 %	25 %	0 %	25 %	325955933
3998	NC_015214	TAC	3	9	226481	226489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325955933
3999	NC_015214	CAA	2	6	226493	226498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325955933
4000	NC_015214	ATG	2	6	226761	226766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325955934

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